Protein

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Genbank accession
AZU99787.1 [GenBank]
Protein name
pre-neck appendage protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MSNVKKVGILPTDPYRRYLPSAFDESMNIYEQIITCIEYVNNLGISFNELVDWLDKVVLQQNEKLKEQDQKIDKLRDEWHIFEDYIVNILLKEKVVEILKEWLADGTLAEIINKDVFDMKADTEWVKSEFTKRGVHYKDFGAKLDGVTDDSDAIIAAHNYANEHNYPVIVKNEKFVLNKNVTVKTSTDLTGSVLTTTYVDPEPIEYNRTFNLFNIEGAELIDLSTRAINPEFIKGATRIPSLKNQPSGALIIKTEQTDIIRDNGGVQSNIMKAECNIMMKNQYGDLAYPLTKNYVDALKFQVFLRPFEHQLEFKFPKVEVKGRIYGIAKVHRNNTSFSGLLMEEINPSATISSIYTLFEYEDCADMEATNISCPIIGREVKTGENGLGYFLLMTRSAKFRGSNLQQISGWSGINGNWMRDISVVDSNMLVVGGHANVYDLTVDRSVIQKNIIAHGGGVIQLLNSQVIGSASPPNNLSGTGAVQTRWDYDGEFEGEIIVENVVLHNASYVVEYSPSTYNCGRTIVLPKTTIRNVHMRNLLKKKGAGVWFRGYRGEYAGNYPQVAIDSLSWDFVGTYTTRFVEFESDVANSLATNKDFKFYFRNIHPPRLSYGDVFNPITAFIHVPKVTNNDTVVYYDIQNCTVNMGLGSTANLDVTIDNSDFYAVNLLAPESVTTNGQPAFINVKNSTVHRGVTNFNVGANTYNRVRLTIASSIFKRLRKTDGSYDPQIGFPIEDFVSYTADNIADARAEIRGDNSARLFGYIDEAIWKIKKDPLRIFV
Physico‐chemical
properties
protein length:778 AA
molecular weight: 87762,30440 Da
isoelectric point:5,56791
aromaticity:0,10540
hydropathy:-0,26504

Domains

Domains [InterPro]
Coil
58–78
Coil IPR012334
IPR011050
138–548
IPR011050
AZU99787.1
1 778
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Bacillus phage DK2
[NCBI] 		2500809 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AZU99787.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK284527 [NCBI]
CDS location
range 18496 -> 20832
strand +
CDS
ATGAGTAATGTTAAAAAAGTTGGTATATTACCAACAGACCCTTATCGTAGATATTTACCAAGCGCTTTTGATGAATCAATGAATATTTACGAACAAATTATTACATGTATTGAATATGTAAACAATCTAGGTATTTCTTTCAATGAACTTGTAGACTGGCTAGATAAAGTTGTATTACAACAAAATGAAAAATTAAAAGAACAAGATCAAAAGATTGACAAGTTACGTGATGAGTGGCATATCTTTGAAGATTACATTGTGAATATTCTTTTAAAAGAAAAAGTAGTAGAAATTTTAAAAGAATGGTTAGCTGATGGGACCTTAGCTGAAATTATCAATAAAGATGTATTTGATATGAAAGCTGATACAGAATGGGTAAAATCAGAATTCACTAAACGTGGTGTTCACTATAAAGATTTTGGAGCTAAATTAGATGGTGTCACAGATGATTCAGACGCTATCATAGCAGCTCATAATTACGCAAATGAGCATAACTATCCTGTTATTGTAAAGAATGAGAAATTTGTTTTAAATAAAAACGTTACTGTAAAAACTTCTACTGATTTAACAGGAAGTGTTTTAACAACAACTTATGTTGATCCGGAACCAATTGAATATAATCGTACTTTTAATTTATTCAATATTGAAGGAGCTGAATTAATTGACTTATCAACTAGAGCTATTAATCCCGAATTTATTAAAGGAGCAACTAGAATTCCTAGTTTGAAAAATCAACCTTCTGGCGCTTTAATTATTAAAACAGAACAAACAGATATCATTCGTGATAATGGTGGTGTTCAATCTAATATTATGAAAGCTGAATGTAATATTATGATGAAAAACCAATATGGTGATCTTGCGTATCCATTAACGAAAAATTATGTTGATGCTTTGAAATTCCAAGTATTCTTGAGACCTTTCGAACATCAATTAGAATTCAAGTTCCCTAAAGTTGAAGTAAAAGGCCGTATTTATGGTATTGCCAAAGTTCACCGAAATAATACATCATTTAGTGGATTATTAATGGAAGAAATTAATCCTAGTGCCACAATCTCAAGCATTTATACACTGTTTGAATATGAAGATTGTGCAGATATGGAAGCAACAAATATTTCATGTCCTATCATTGGTAGAGAAGTTAAAACAGGTGAAAATGGATTGGGGTACTTCTTATTAATGACTCGATCAGCTAAATTTAGAGGTTCAAACCTTCAACAAATTTCTGGTTGGTCTGGAATCAATGGTAACTGGATGAGAGATATTAGTGTAGTTGATTCTAATATGCTTGTTGTTGGTGGACATGCGAATGTTTATGATTTAACTGTTGATCGTTCGGTAATACAGAAAAACATTATTGCTCATGGTGGAGGGGTAATACAGTTACTTAATTCTCAAGTTATTGGTAGTGCTAGTCCTCCGAATAACTTATCTGGTACAGGAGCTGTGCAAACACGATGGGATTATGATGGTGAATTTGAAGGTGAGATCATTGTTGAAAACGTGGTACTTCATAATGCTTCTTATGTTGTTGAATATAGTCCTTCTACTTATAACTGTGGTAGAACAATAGTATTGCCGAAAACAACAATTAGAAATGTTCATATGCGAAACCTTCTTAAAAAGAAAGGCGCTGGTGTATGGTTCCGTGGTTACCGTGGAGAATATGCCGGTAACTATCCACAAGTAGCGATTGATTCCCTATCTTGGGATTTCGTGGGAACATACACAACAAGATTTGTTGAATTTGAAAGTGATGTTGCAAATAGTTTAGCTACAAATAAAGACTTTAAATTCTACTTTAGAAATATTCATCCCCCACGATTATCGTATGGTGATGTTTTCAACCCGATCACAGCGTTTATACATGTTCCGAAAGTAACAAATAATGATACTGTTGTTTATTATGACATTCAGAATTGTACTGTTAATATGGGACTTGGATCGACTGCGAACTTAGATGTCACAATTGATAATTCTGATTTCTATGCAGTTAACTTATTAGCTCCTGAAAGTGTTACAACGAATGGGCAACCAGCATTCATTAATGTTAAGAATTCTACAGTTCATCGCGGTGTAACTAACTTTAATGTTGGCGCAAACACTTATAACCGTGTTCGTTTAACAATTGCTAGTTCTATCTTTAAAAGATTAAGAAAGACTGATGGTTCTTATGATCCACAGATTGGTTTTCCTATTGAAGATTTCGTTTCTTATACCGCTGATAATATTGCTGATGCTAGAGCTGAAATACGTGGGGATAACTCCGCTAGATTGTTTGGATACATTGATGAAGCAATATGGAAAATTAAGAAAGATCCGTTGAGAATATTTGTATAG

Tertiary structure

PDB ID
008b6a9340ae59ed4bf783ae29184c26d8600cb81b888519f99cbc09b8ff4458
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6591
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50