Protein

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Genbank accession
XEN38916.1 [GenBank]
Protein name
side tail fiber protein Stf
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,68
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKVAGVNPTAAQLAEGELAINLKDRTLFTKDDLGNIISLGFAKGGDINGNVTQNGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWANQHLNKAPIFTDLSSTTATSEYHPLFKQRYKDGTFSLGTLVNEGSMKMHYIDETGTSKYWTFNRNGNFQVDSGNLLVSNGYLVTQSNIETKAGSLIGPKVITKNINVSTKSWDTNIDTAYDLVSLPTWQYTPTETDLDTNGINYLRKFRGHVSSAIFHEIADARSGKPQNISYWTGRNAEVYQWSYTTDGRMSVANSIGVGLADVGSQGRYPLATFGKGIAIGDNDTGVKWVRDGVIDLVANGISAGTILNNGINSTKKLMVGYSRDSGSTWDYPNNNQAMFTARTDVDGNNNGDGQTHIGYNSNSKMYHYFRGTGRMAVGMSQGLLVEPGILDISTGSNTLSLRADGTVASVQTLKLNNGLYFNGDGTNASLVFKAASGIDGTKQIMWEGGTRAGQNKSYVTVKAWGNSFNVSGDRNRETVFEVADGQGYYFYSQRVAPTGSETVGPVVTQINGQLNARGSIITDGSLRVNGLSTLSGQVTMDNGLVLSGGGSITGQVKIGNTADAFRIYNAEYGAIFRRSEASLHIIPTLKDAGESGGISNLRPLSISLNNGMVQMRHSVTLGDDGAGGNMITVDNDNKLVVVTSNSRISPNFRMQIGQSAYIDAECTDAVRPAGAGSFASQNNENVRAPFYMNIDRTDTSTYVPIVKQRYVQNNSCYSIGTLINGGNFRVHYHEGGDGVSTGAIIKDLGWEFNKNGDFYSPGKLGAGNVRIGTDGNITGGSGNFANLNTTINNLKTDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPEGYAIMEGQTFDVGLYPKLAAVYPSGSLPDMRGQTIKGKPSGRAVLSTEADGVKSHSHSASASSTDLGTKTTSSFDYGTKTTSSFDYGTKTSNNTGAHTHSLSGSTNTAGAHSHTSALYAGSNNAPGTGSIRGSAGGGNTLGTSSSGAHSHSISGTAASAGAHAHTVGIGAHSHTVGIGAHSHTVAIGSHGHTITVNATGNTENTVKNVAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1078 AA
molecular weight: 114014,52670 Da
isoelectric point:8,09022
aromaticity:0,08163
hydropathy:-0,36939

Domains

Domains [InterPro]
IPR051934
733–1078
IPR051934
SSF88874
837–1077
SSF88874
IPR037053
844–897
IPR037053 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003
IPR011083
849–896
IPR011083
XEN38916.1
1 1078
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage PNJ-9
[NCBI] 		3239045 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XEN38916.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ100635.1 [NCBI]
CDS location
range 7523 -> 10759
strand -
CDS
ATGGCTACATTAAAACAGATACAATTTAAAAGAAGCAAAGTGGCAGGAGTTAATCCTACTGCAGCACAATTAGCCGAAGGCGAATTAGCGATAAACTTAAAAGATCGAACTCTTTTTACTAAAGATGACCTCGGTAATATTATTAGCCTAGGCTTTGCTAAGGGTGGGGATATTAACGGTAATGTAACCCAAAATGGTGATTATTTACAAAACGGCACATATAATCTTAATGGAAATCAGTTTGTTTATGCAGGAAAATATATTGAATTTTTACCTAAAACAGCCGGTAATGGTGCGTGGGCAAATCAACACCTAAATAAAGCTCCTATTTTTACCGACTTAAGTTCTACTACTGCTACTTCTGAATACCATCCGCTGTTTAAGCAGCGTTATAAAGACGGTACTTTCTCATTAGGGACCTTGGTAAATGAAGGCTCAATGAAGATGCATTATATCGATGAAACAGGCACTTCGAAATATTGGACCTTTAACCGTAATGGTAATTTTCAAGTTGATTCCGGAAATTTATTAGTATCTAATGGATATTTAGTTACTCAAAGTAATATTGAAACTAAAGCTGGTTCTTTAATTGGTCCTAAAGTTATTACCAAAAATATCAATGTGAGCACTAAATCTTGGGACACTAATATTGATACTGCATATGATTTAGTTTCATTACCGACTTGGCAATATACTCCAACCGAAACAGATTTGGATACTAATGGTATAAACTACCTTCGTAAATTCCGCGGACATGTTTCTTCTGCTATTTTCCATGAAATTGCTGATGCTCGTTCAGGTAAACCACAGAATATTTCATATTGGACTGGGCGCAATGCTGAAGTTTATCAATGGTCTTATACCACCGACGGGCGTATGTCTGTTGCTAATTCGATAGGTGTAGGTCTTGCCGATGTCGGCTCCCAAGGGCGTTATCCTTTGGCCACATTTGGTAAAGGTATTGCAATTGGTGATAATGACACTGGTGTTAAATGGGTTCGTGACGGTGTTATTGATTTGGTTGCGAATGGTATTTCTGCCGGCACTATTCTTAATAATGGTATTAACAGTACTAAAAAATTGATGGTTGGTTATAGTCGAGATTCTGGTTCTACTTGGGATTACCCAAATAACAACCAAGCAATGTTTACTGCGCGTACCGATGTTGATGGTAATAATAACGGTGACGGTCAGACTCATATCGGTTATAACAGTAATTCTAAAATGTATCACTATTTCCGTGGTACAGGTCGTATGGCTGTTGGTATGTCCCAAGGTCTCCTTGTTGAACCAGGAATTTTAGATATTAGCACTGGTTCAAATACATTAAGTTTGCGTGCTGATGGTACCGTCGCTTCTGTTCAAACATTAAAGCTTAATAATGGATTATATTTTAATGGTGATGGAACTAATGCTTCTCTAGTTTTTAAAGCAGCTTCAGGTATTGACGGCACTAAGCAAATCATGTGGGAAGGCGGTACTCGAGCAGGTCAGAATAAGAGTTATGTAACTGTTAAAGCATGGGGTAATTCATTTAACGTATCCGGCGATCGTAATCGTGAAACAGTTTTTGAAGTAGCTGACGGACAAGGATATTATTTTTATTCTCAGCGCGTAGCTCCAACCGGTTCAGAAACTGTGGGACCTGTTGTAACACAAATTAATGGACAACTGAATGCAAGAGGGAGCATTATCACCGATGGAAGTCTTAGAGTTAATGGATTAAGTACATTATCCGGACAAGTTACTATGGATAACGGGCTTGTTTTATCCGGTGGTGGTTCTATTACCGGTCAAGTTAAAATCGGTAATACCGCAGATGCTTTCCGTATTTACAATGCTGAATATGGAGCTATTTTCCGTCGTTCTGAAGCGTCTTTGCATATTATACCTACACTTAAAGATGCAGGTGAAAGTGGTGGAATAAGTAATCTCCGCCCGCTTAGTATTAGCCTTAATAATGGTATGGTGCAAATGCGTCATTCTGTTACGTTAGGCGATGATGGTGCTGGTGGTAATATGATTACTGTGGACAACGATAACAAACTTGTTGTTGTTACTAGTAATAGTCGCATTTCTCCTAATTTCAGAATGCAGATAGGTCAGTCGGCGTACATCGATGCAGAATGTACTGATGCTGTTCGCCCAGCCGGAGCGGGTTCATTTGCTTCCCAGAATAATGAAAACGTTCGTGCTCCTTTCTATATGAATATTGATAGAACAGATACAAGCACTTATGTTCCTATTGTGAAACAAAGATACGTTCAAAATAATAGTTGCTATTCTATTGGTACTTTAATTAATGGTGGTAACTTTAGAGTTCATTATCACGAAGGTGGCGATGGCGTTTCTACTGGCGCAATTATAAAGGATTTAGGTTGGGAATTTAATAAAAACGGTGATTTTTACTCTCCTGGTAAATTAGGCGCTGGTAATGTTCGTATTGGTACTGATGGTAATATCACCGGTGGTTCTGGCAATTTTGCTAACTTGAATACCACAATAAATAACCTTAAGACGGATATTGTCTCAAGTTATCCAATTGGTGCTCCGATTCCTTGGCCTACTGATACACCTCCTGAAGGTTATGCCATAATGGAAGGTCAAACATTTGATGTTGGCTTGTATCCTAAGTTAGCTGCGGTGTATCCTTCCGGCTCTCTGCCTGATATGCGCGGGCAAACTATCAAGGGTAAACCATCTGGGCGTGCTGTATTAAGTACAGAAGCAGACGGTGTTAAGTCACATAGTCATAGTGCAAGTGCATCAAGCACGGATTTGGGTACTAAGACCACATCAAGCTTTGACTATGGTACTAAGACGACAAGTAGTTTCGACTATGGTACTAAGACCAGTAATAATACTGGTGCTCATACGCATAGTTTGAGCGGTTCCACAAACACCGCCGGTGCGCACAGCCACACAAGCGCTCTTTATGCGGGAAGTAACAACGCTCCTGGTACTGGTTCTATAAGAGGATCCGCCGGTGGTGGTAATACGCTTGGAACTTCTTCTTCTGGGGCACATTCGCACTCTATATCTGGTACTGCTGCAAGCGCAGGCGCTCACGCACATACTGTGGGTATTGGTGCCCACTCCCATACTGTTGGTATTGGTGCTCATTCTCATACTGTTGCAATCGGTTCCCATGGACATACAATAACTGTAAATGCCACAGGAAATACAGAAAACACAGTTAAAAACGTTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA

Tertiary structure

PDB ID
ae145762656efd5bbecf16dcfcda86ede71ad3fa0629f645ccc5ff86fc74a556
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4967
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence analysis of novel Escherichia coli phage PNJ-9 Fu,K.L., Cui,J.Q. and Tang,F. 2019-10-08 — GenBank