Protein

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Genbank accession
UVD41259.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,75
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MKLTTFKLFKNTMFTDMQNTLHFNSNSERDNWFDTHFTGSNTITFPYRFNYRYDRGTVKVPMDMESLQGFNYCRFIDGWDGKAYYAFIVKTTYLNDRTTQLDLVIDVVMTYTQGNVLENLQNVEVIRQHLPLQRLRGREEYLRTCNDILPTSTMMFIDPSVFTNNNTDGVQFNDFMYIIQSSVKLNGDFGTEDKPKMQTSIGGTYDGITSAVSLYLVSSTDLDSLLTTLADYPWITQNFKTIVKVPSMFFDLSQLNTVECKGTHLYVLDGNNSSNILTLPFTLTKSKIKEVLGLKDFEDYLVRDQVINCYLTDYRGNQLNFETGKIKDGNTLYATSVLGGFNEIDIYSLEYGQRETSDSRHGFYRDNQMTINTFDNVPVLINNYTLNKANTAYSRQLENSKTISGRINAITNPNNSVKDRLFNAVSVYSNVFAGGLASAPAKGAGLFADEYEYYRSQKAQMNQWKISPPTVSEGGYNNSVLDKTGDYGIWLKVSTINYEELTSLRRYYGAFGHEAMNNDNQIYNINSMSKANWLQFKGNYWIDDIDRELFDQLKTLFEGGVRLWHNYADLASRSELSENNVIA
Physico‐chemical
properties
protein length:583 AA
molecular weight: 66824,00650 Da
isoelectric point:5,23302
aromaticity:0,12864
hydropathy:-0,44974

Domains

Domains [InterPro]
IPR031772
2–114
IPR031772
UVD41259.1
1 583
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Streptococcus phage vB_SbRt-pBovineB21
[NCBI] 		2961980 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UVD41259.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
ON759209.1 [NCBI]
CDS location
range 8058 -> 9809
strand -
CDS
ATGAAACTAACAACATTCAAATTATTCAAAAATACAATGTTCACTGACATGCAAAATACATTGCATTTTAATTCAAATAGTGAGCGGGATAATTGGTTTGATACCCATTTCACTGGTAGCAACACCATAACGTTCCCTTATCGGTTTAATTATCGCTATGACCGAGGAACTGTTAAAGTTCCTATGGATATGGAAAGTTTACAAGGTTTTAACTATTGTCGATTCATTGATGGTTGGGACGGTAAAGCGTACTATGCTTTTATTGTTAAAACTACTTATCTAAATGATAGAACAACACAATTAGACCTTGTTATTGATGTTGTCATGACATACACCCAAGGAAACGTACTGGAAAATCTTCAAAACGTTGAAGTTATCAGACAGCACCTGCCTTTGCAACGCTTAAGAGGACGAGAGGAGTATTTAAGAACATGTAATGACATTTTACCAACATCAACAATGATGTTCATTGACCCATCAGTATTCACCAATAACAACACCGACGGTGTACAGTTCAATGACTTCATGTATATCATTCAATCAAGTGTTAAATTAAATGGTGATTTTGGTACAGAAGACAAACCAAAAATGCAAACATCGATTGGTGGCACTTATGACGGTATTACGTCAGCTGTAAGTCTATACCTTGTATCAAGCACAGATTTAGACAGCTTACTAACAACGTTAGCTGATTATCCTTGGATAACTCAAAATTTTAAAACAATTGTTAAAGTGCCATCAATGTTTTTTGACTTATCACAATTAAACACGGTTGAATGTAAAGGAACACACTTATATGTGTTAGATGGTAACAATAGCTCTAATATATTAACGCTTCCTTTTACTTTAACCAAATCAAAAATTAAAGAGGTATTAGGATTAAAAGACTTTGAAGATTATTTGGTACGAGACCAAGTCATTAATTGCTACCTAACTGACTATCGTGGTAACCAGTTAAATTTTGAAACTGGTAAAATTAAAGATGGTAACACGTTATACGCTACATCTGTTTTAGGTGGTTTTAATGAGATTGATATATATTCGCTTGAATATGGACAACGTGAGACAAGTGATTCAAGACATGGTTTTTACCGTGATAACCAGATGACAATTAACACGTTTGATAATGTACCAGTTTTGATTAATAACTATACGCTTAACAAAGCTAACACAGCTTATTCAAGACAGCTAGAAAATTCTAAGACAATCTCTGGACGTATAAACGCTATTACAAATCCTAATAATTCAGTAAAAGACAGACTATTTAACGCTGTTTCAGTTTACTCAAATGTTTTTGCTGGTGGACTAGCTAGTGCTCCCGCTAAAGGTGCTGGATTGTTCGCTGATGAATATGAGTATTACCGAAGCCAAAAGGCACAAATGAACCAATGGAAGATTTCACCACCTACAGTTTCAGAGGGGGGCTATAATAACAGTGTGCTTGACAAAACTGGTGACTATGGAATTTGGTTGAAAGTATCAACTATTAATTATGAAGAGTTAACAAGCTTGCGCCGATATTATGGTGCTTTTGGACACGAAGCAATGAACAACGATAATCAAATTTATAACATTAATTCAATGTCTAAGGCTAACTGGTTACAGTTCAAGGGAAATTATTGGATTGACGATATTGACCGAGAACTTTTCGACCAACTCAAAACACTATTTGAAGGTGGTGTGAGATTGTGGCACAATTATGCTGATTTGGCATCACGAAGTGAATTAAGTGAAAATAATGTGATTGCTTAG

Tertiary structure

PDB ID
edb33ad3b4114071ee01c3adda29dfa28c3e70b2e2e55bd599898b1ddcffe3d7
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,3876
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of Streptococcus phage vB_SbRt-pBovineB21 Park,S.Y., Kwon,H.M. and Kim,J.H. 2019-03-28 — GenBank