Protein

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Genbank accession
XFC52626.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,65
Protein sequence
MADSIKRKFRGAEGFDAAGEKIVNVATADRTVLSDGVNVEFLIQENTLQQYDETRGYTSGFAVIYDNRIWVSNRDIPKPAGAFNELYWTSVRTDAKWKVVSSGTTILKSGEFISVDTAKGNDMIFTLPNNPQDGDTIMLKDIGNKTGTVGVVINASVQDIVLRDPTNKVRSVRMTHPLSQYVFVFSNRLWNLYVSDYARYARIVTPSAVVQAQSNDFIVRRYTSPGPIRVTLPKFANTGDIINFTDLDGKNPQFHMIVSTFDDNTNIGVVGQKSVEVRTSGDGFIVYDASESIWRIWEGDLRARMRVITDNVTLIPNDVVTVFGVNNTTQKTIDITLPTDIAIGDTVTIAMNYMRKGQKVNIRAATGDKIASSIQLLQFPKRSEYPPDAAWVMNDVLTFDGTASYVPVIQLSYIENAGSKYWIVADNAPTVERVDSKDNTTRQRLGVIALASQAQANVDYENNPEKELAITPETLANRIATKIRRGIARLVTLAEIQAPTTGPHLDDVIVTPAMLNEKTATEERRGVAETATQAEANGSTDDERIVTPKKLHNRIASETLTGILKLVRTVGTAAGIGRDTKGTNVYDYDNNIDAVTPKSLFQFKSTEQAQGGVYLATQNEVIAGGPAQPGFPVVVTPQTLHGKTSTDSRIGLIQIAKQAEVDAGTDYTKAVTPKTLNDRKAREDLSGIAEIATQAEFDTGTDDVRIVTPLKVKTRFNSTDRTSVVALSGLVEQGTLWDHYTLDIKEASETQRGTAALSTQVQVDAGTDDKTIVTPKKLQAKKATETTEGIIQVANQTETVAGTIANKAVSPKNLKYIAQEEKTWESTIARRGFVKLSEKALTFKGDATNGSGRLLPGDLINEPALTDLPKEGYAVSPYEMNRALQYFLPAKAKAVDSDLLDGLDSLQFVRRDIDQVVNGKITFKKDLTLEAPLVSSSTAKFTTVNATISVDIGDSLGNSRINLNTLANGWNVESLSNGTTLTINADTNVLTLNRNGNVTVAQTLTAMNKVDANKGFSVEGGTMVINPSSTEIVFGTQSKQVTLQNKDAKTFSVVDPSGTYTILNTKNAFEITAQGFVKKAGDSMTGPLQIQAPLTVQIPEGRVAPDVKPSDDNPASWSASITTAAIYNKLPGFGVPVMEKDDEGQDTGFVDHYEYVKGPGVLTQHGIGKTAVYQIWAPRPTVAELNHNAQTFWIRNFNIVTGEWDEFGKMYTSVQRPTAGEIGAVSTSGSAFNNLTIRDWLQIKNVRIVPNETTRTVDFIWIDE
Physico‐chemical
properties
protein length:1264 AA
molecular weight: 137821,32220 Da
isoelectric point:5,44202
aromaticity:0,07041
hydropathy:-0,29478

Domains

Domains [InterPro]
IPR048391
1116–1211
IPR048391
XFC52626.1
1 1264
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Enterobacter phage vB_EluM_RZH
[NCBI] 		3447540 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XFC52626.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ140450 [NCBI]
CDS location
range 16134 -> 19928
strand -
CDS
ATGGCAGATTCAATCAAACGCAAGTTTCGTGGCGCAGAAGGCTTCGATGCTGCGGGTGAAAAAATAGTCAACGTTGCTACTGCTGACCGCACGGTGTTATCCGATGGCGTCAACGTTGAATTCCTTATCCAAGAAAATACATTACAACAATACGATGAAACTCGTGGCTACACTTCAGGCTTCGCAGTAATTTATGACAACCGCATTTGGGTTTCAAATCGCGACATTCCAAAGCCAGCTGGCGCATTCAATGAGCTTTATTGGACTTCAGTTCGTACAGATGCAAAATGGAAAGTAGTATCAAGCGGAACAACCATTCTTAAATCAGGTGAATTTATCTCAGTCGATACCGCTAAAGGTAATGACATGATTTTCACTCTGCCGAATAATCCACAAGATGGCGATACCATTATGCTGAAAGATATCGGCAATAAAACTGGTACCGTTGGTGTAGTAATCAATGCATCTGTTCAGGATATTGTTCTTCGTGACCCGACGAATAAAGTTCGTTCTGTTCGTATGACGCATCCACTGTCTCAATATGTGTTTGTGTTCAGTAATAGACTGTGGAATCTTTATGTTTCAGATTACGCTCGCTACGCTCGCATTGTAACTCCAAGCGCAGTTGTTCAAGCTCAGTCAAACGACTTTATTGTGCGTCGTTATACTTCTCCTGGTCCAATTCGTGTAACTTTACCTAAGTTTGCAAATACCGGAGATATCATCAACTTTACTGACCTCGATGGAAAGAACCCTCAATTCCATATGATTGTTAGTACATTTGATGATAATACTAACATTGGTGTTGTTGGACAGAAATCTGTAGAAGTTCGTACGTCAGGAGATGGATTCATCGTTTATGATGCATCAGAATCTATTTGGCGTATCTGGGAAGGTGATTTACGTGCTCGTATGCGAGTAATCACTGATAACGTAACTCTTATCCCTAACGATGTTGTTACTGTTTTCGGTGTAAATAACACTACTCAAAAAACTATTGATATTACTTTGCCAACGGATATCGCAATCGGTGATACTGTTACAATTGCGATGAACTATATGCGCAAAGGTCAAAAGGTAAATATCAGAGCTGCAACTGGCGATAAAATTGCATCAAGTATTCAATTACTTCAATTCCCTAAACGCTCAGAGTATCCACCTGATGCTGCATGGGTAATGAATGATGTTCTTACTTTTGATGGAACCGCATCGTATGTTCCAGTTATTCAATTGTCTTATATTGAAAATGCTGGTTCAAAATATTGGATTGTTGCAGATAATGCTCCAACAGTAGAACGTGTAGATTCAAAAGATAATACTACTCGTCAGCGTCTTGGTGTTATTGCTCTTGCTTCTCAAGCTCAGGCTAACGTGGACTATGAAAATAATCCAGAGAAAGAATTAGCAATTACTCCAGAAACTTTAGCAAACCGTATTGCTACTAAAATTCGTCGTGGTATTGCTCGTCTGGTTACCTTAGCTGAAATTCAGGCTCCGACTACTGGTCCACATCTGGATGATGTTATTGTTACTCCAGCTATGCTGAATGAAAAAACAGCTACCGAAGAAAGACGTGGTGTTGCTGAAACTGCTACTCAAGCCGAAGCAAATGGTTCAACTGATGATGAAAGAATTGTTACTCCGAAGAAATTGCATAACCGAATTGCTTCTGAGACCTTAACTGGTATTCTTAAATTAGTAAGAACTGTTGGAACTGCAGCGGGTATTGGAAGAGATACGAAAGGTACTAACGTTTATGACTATGATAACAACATTGATGCGGTAACTCCAAAATCATTGTTCCAATTCAAGTCTACTGAGCAAGCTCAGGGCGGTGTTTATCTTGCGACTCAAAACGAAGTAATTGCTGGTGGTCCAGCTCAACCTGGTTTCCCAGTAGTTGTTACTCCACAAACGCTTCATGGCAAAACTTCAACTGATTCAAGAATCGGTTTAATTCAGATTGCTAAACAAGCTGAAGTCGATGCTGGTACAGATTATACAAAAGCAGTTACTCCTAAAACTCTTAATGACCGTAAGGCTCGTGAAGATTTAAGCGGTATTGCTGAAATTGCTACTCAAGCTGAATTTGATACCGGAACGGACGATGTACGCATCGTAACTCCATTAAAGGTTAAAACTCGTTTCAATTCAACTGATAGAACATCTGTTGTTGCTCTGTCTGGATTAGTTGAGCAAGGAACCTTGTGGGACCATTATACATTAGATATCAAAGAAGCATCTGAGACTCAGCGCGGCACCGCTGCACTGTCTACTCAGGTTCAAGTTGATGCTGGTACTGATGACAAGACAATTGTTACGCCTAAGAAATTACAGGCTAAGAAAGCAACAGAAACTACCGAAGGTATTATTCAAGTTGCTAATCAGACTGAAACTGTAGCTGGTACAATTGCTAATAAAGCAGTTTCTCCTAAGAATCTGAAGTATATTGCTCAAGAAGAAAAAACTTGGGAATCTACTATTGCTCGCCGTGGTTTCGTTAAATTGTCTGAAAAAGCATTAACATTCAAAGGAGATGCTACTAATGGTTCAGGTCGTCTGTTACCTGGCGATTTAATTAACGAACCTGCTTTAACTGATTTGCCTAAAGAAGGTTATGCAGTATCTCCATATGAGATGAACCGTGCACTGCAATACTTCTTACCAGCTAAAGCAAAAGCTGTTGATTCTGATTTACTCGACGGATTAGATTCTTTACAATTCGTTCGCCGCGATATTGACCAGGTAGTTAATGGTAAAATCACGTTTAAGAAAGACTTGACTCTAGAAGCTCCTCTGGTGTCCTCTAGTACTGCCAAGTTCACTACCGTGAATGCTACTATATCAGTTGATATTGGTGATTCTCTGGGTAATTCTAGAATCAATTTGAATACCTTGGCGAATGGTTGGAACGTTGAATCTCTGTCAAATGGAACTACTTTAACAATCAATGCAGATACTAATGTGTTGACCTTAAATCGTAACGGAAACGTTACGGTAGCTCAAACACTTACTGCTATGAATAAAGTGGATGCCAATAAGGGCTTTTCTGTGGAAGGTGGTACAATGGTTATCAATCCTTCCTCAACTGAAATTGTCTTTGGTACTCAATCTAAGCAAGTAACATTGCAAAATAAAGATGCTAAGACATTCTCAGTAGTAGACCCTTCTGGTACTTACACTATTCTGAACACTAAAAATGCTTTTGAAATAACGGCTCAAGGGTTCGTTAAGAAAGCAGGCGATTCAATGACTGGGCCTCTTCAGATTCAAGCTCCTTTAACGGTGCAAATTCCTGAAGGTAGAGTTGCTCCTGATGTTAAACCATCAGATGATAACCCAGCTTCTTGGTCAGCATCAATTACAACGGCAGCGATTTATAATAAGCTTCCTGGTTTTGGTGTTCCAGTAATGGAAAAAGATGACGAAGGTCAAGACACTGGATTTGTGGACCATTATGAGTATGTAAAAGGTCCTGGTGTATTAACTCAGCATGGTATTGGAAAAACTGCGGTTTACCAGATTTGGGCTCCTCGTCCAACTGTAGCAGAATTGAACCACAATGCTCAGACTTTCTGGATTCGTAACTTTAACATCGTAACTGGTGAATGGGACGAATTTGGTAAAATGTACACCTCAGTTCAGCGTCCAACTGCTGGAGAAATCGGTGCTGTATCAACATCCGGTTCAGCGTTCAATAACTTGACAATCCGTGACTGGTTACAAATTAAGAACGTTCGCATTGTTCCTAATGAAACCACTCGTACTGTCGATTTCATTTGGATTGACGAATAA

Tertiary structure

PDB ID
d26421d5e23f053ed21ccbb37d8b74bdf2dd0995d268e62f741079a38c79fedf
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2288
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50