Protein

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Genbank accession
AIX19102.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANENPTLAQGEIGIELDTNRFKIGDGVRGWNTLPYERPIESVANTANTLVKRDADGNFTAGAITATLIGNSATSSRLANPRQIQLSQDLSGSGTFDGSSNLSLAAQLQTLTSLPHYDGTTSSSGQYTKVTVDAKGRITNASQPSSYVDLGLTDVQPIDSDLSAISNLTTTGIIARASAGNMQTRSVQGSSGRISVVNGNAVAGNPTLDLIDTTVALEAEFIAAAGLYNIPTLISVGGDDLPEAANRTVNSTRYTVDQYGRFTSALTIPIATAREGSKYAAYGAGVTYARYDIIEESSGVYQAIASIAAGQGAPTHTDASDAGAWRYLGAALTEQKGLASFAQEDFDVDSNGHVTIAAVGVDNTQLQNNRIGFADGNTLENFELDQELTATSGYRGFNYLNYVKVNDTSGNLLVGANNTGDSGAGELDVNVRSYFSDPDITLDGALNQTLDKTGDGDLTFQLTQDTASNRNFNILTTNAGSGSSNIIITAEDTIQINASEATGKVHVEDYRFQTNYLGTTDATMHLDPGDDRAITGTVRVWGNLQIDGVTTTINSTTLTVDDVTILLGGDTVPTTDDNLDRGIEFNYYDTEARLGFYGWDTSYTDLNSHGGGYRFLHAATNSSEVFTGTDSGIVAGNLKLTTNNNSTSNTTGDFVVAGGAGIGQDVNIGGLVDIDSTLRVHSTSRFDDNMVIQGASKTLQLNNGSGTTRVELQSTTGNASFYGVVDITNNLNINTDKFNVTAASGNTYTAGTLEVTQGSTLNGAVDLNNTLNVSSTVHFEATDEPTFAQNAGTGLWEIQSNDYGSFRFDGGGYIAGDFMFDSDVVINGTILQKESSTEVFNEQNFLRVRRKLESGSVQALNPSYANHTNSNLRIFGGAGIVQDLHIGDDLYIGKVNNGDTVEFTVLGENGNTQIGRSGAGTASVGTLTVYGDTLLDRDLTVNGSQITLGNANTDILTVNSDATFTDNLTVNQSVEFDSTLNVDDNVTFGAQLTVTGTTEFNNTVDVDANFAVRSGSTDKMTVASSSGNIATDGTLVVQGQTTINDSLYIQSSNEFFKIQNGSSVDKFTVDTDNGNTAIIGTLTVSNATQLNNTLGCQGIASFTNTTDQDVVSGSYTADGGVRITSGLGVERNLAVGGDTRFYGTVGFESALDVDNAVDISGNLNISNGNDVSNFTDTTVALKVSGGARISKKMMVGGDFTVYDSSGALNNFFVEKTTGNAELRNNLVVGGDLTVNGTTTTVNSTTLTVDDPIITLGGDSVPTTDDNLDRGVEFRYYDTQARLGFFGYDNNLNRYRFLVEATNSSETFSGTDASLQAGSLQLTSSGTGLDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGPALVIPTTAKINNLNADLLDSMTTDSANTATTVVARDNSGDFAANQITVNNGIGAVAGIQGNATSADALRTARVITVDGVVNGNVSFDGSAAVTITTTYDDDDITALAAQTGTGIMARTAANTYAHRTIAVTGSGIGITNADGISGDPLITITSASTNSANNIVIRDVNGDFAAGTITATLVGDVTGDLTGNADNALQVSTGSGGAGGTMYFAMTNQYGAGSSRTLFANTSTITLDTSGGVGNNTLIVDKVTADLTGNVIGNVTGEVSSLANHDTADLAEGTNLYYTNARAEASFDTKIAAATTTDLTEGTNLYYTDERVDDRVGDLVVGGTGINALYDDGNGALTLTVTQGDIDTDNVTEGSTNIFYTEGRFDASLATKSTDQLTEGANLYYTNTRADDRVNLQTGTNLDLSSKSTSDLSEGTNQYYTEARVQTKLDNAFAQLQAMLTNLATTTTLTLNLSGDPTPGAAVTTLITNNGSGGFTAGTNVATTGGTGTSLTVDTTVDAQGRITAATVNTPGSDYVVNEVVFILNANAGKVLSLNLASLAGGSNYVTGTALATTGGSGSASLTVNITASAGAITNVIINDGGTGYVAGETITIVQPTGADGLNPAAGGSVDVATVATNAGLQLTDVTTMELGAVVTGSESGTTGIITNIDTQAITVDTVDGFFKVGEVVSANDVTTLTLSSFA
Physico‐chemical
properties
protein length:2058 AA
molecular weight: 213209,11080 Da
isoelectric point:4,10545
aromaticity:0,06220
hydropathy:-0,16263

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
4–229
SSF69349
IPR041352
5–42
IPR041352
AIX19102.1
1 2058
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014d
[NCBI] 		1493509 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX19102.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019048 [NCBI]
CDS location
range 81758 -> 87934
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAACTTAGACGTGGTGGTGCTCAGGAATGGGCTAACGAAAACCCGACCCTAGCCCAAGGCGAGATTGGCATTGAACTTGACACTAACCGTTTTAAAATCGGTGATGGTGTTAGGGGATGGAATACTTTGCCCTATGAAAGACCGATTGAGTCCGTAGCAAATACGGCAAACACGCTTGTAAAACGAGATGCTGATGGTAATTTTACCGCTGGTGCAATTACAGCAACTCTAATTGGTAATTCTGCAACTTCTTCACGTCTTGCTAACCCAAGACAGATTCAGTTGTCGCAGGATCTTTCGGGTTCTGGTACTTTTGACGGTTCATCTAACCTATCTCTTGCTGCCCAACTTCAAACTTTAACCTCACTTCCACACTACGACGGAACAACTAGTTCTAGTGGACAGTATACTAAAGTAACTGTTGATGCTAAAGGTAGGATTACTAATGCATCTCAACCTTCGTCTTATGTTGACCTAGGATTGACTGATGTTCAACCTATTGACTCTGACCTGTCTGCTATCTCTAACCTGACAACTACAGGTATTATTGCTAGAGCATCTGCAGGAAACATGCAGACCAGATCTGTACAGGGTTCTTCAGGTAGGATTTCAGTTGTAAATGGTAACGCCGTTGCAGGTAACCCAACGCTTGACCTGATTGATACTACTGTAGCGTTAGAAGCAGAATTTATTGCTGCTGCTGGTCTTTATAATATTCCCACACTTATTTCAGTTGGTGGAGATGATCTGCCCGAAGCAGCAAACAGAACTGTAAACTCAACCAGATATACTGTTGATCAGTATGGTCGTTTCACTTCTGCCCTGACTATTCCTATTGCTACCGCTAGAGAAGGTAGTAAGTATGCTGCATATGGAGCAGGTGTAACGTATGCAAGATATGATATTATTGAAGAAAGTAGTGGAGTATATCAAGCAATCGCTAGTATTGCTGCAGGACAAGGTGCTCCAACTCATACTGATGCTTCAGATGCTGGTGCTTGGAGATATCTCGGTGCTGCACTGACAGAACAGAAAGGACTTGCTTCTTTCGCACAAGAAGATTTTGATGTTGACAGCAATGGACATGTAACTATTGCTGCTGTTGGTGTTGATAATACACAACTACAAAACAATCGTATTGGTTTCGCTGACGGTAATACCCTAGAAAATTTTGAACTGGATCAAGAACTTACTGCAACCTCTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTATGTTAAAGTTAATGATACGAGCGGTAATCTACTCGTTGGCGCTAATAATACGGGGGACAGCGGAGCTGGCGAACTTGATGTTAACGTACGGTCGTACTTCTCTGACCCTGATATTACTCTTGATGGCGCTCTTAATCAGACACTGGATAAGACTGGGGATGGCGACCTAACATTCCAGTTAACTCAGGACACTGCCTCAAATAGAAACTTTAATATTCTGACAACCAATGCTGGTTCTGGATCCAGCAACATTATTATTACTGCTGAAGATACTATACAGATTAATGCGTCAGAAGCAACTGGTAAGGTTCATGTAGAAGATTATAGATTTCAGACAAATTATCTTGGTACTACTGATGCAACTATGCATCTTGATCCAGGTGATGATCGTGCAATCACTGGCACCGTCCGTGTCTGGGGTAACCTTCAGATTGATGGGGTAACAACTACAATCAATTCAACTACACTGACTGTAGATGATGTCACTATTCTACTCGGTGGGGATACTGTACCTACAACTGATGACAATTTAGATCGTGGTATTGAATTCAACTATTATGATACTGAAGCCCGTTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACTAGCTATACTGATTTGAATTCTCATGGTGGTGGATATCGTTTCCTCCATGCTGCTACAAATAGTTCTGAAGTCTTTACTGGTACTGACTCTGGTATTGTTGCTGGTAATCTTAAACTAACTACAAATAATAATTCTACTTCCAATACAACTGGTGACTTTGTAGTTGCTGGTGGTGCTGGTATTGGTCAAGATGTCAACATCGGCGGTCTGGTTGACATTGATAGCACTCTCAGAGTTCATAGTACCTCCCGCTTTGATGACAACATGGTCATCCAAGGTGCTTCTAAGACTCTGCAACTTAATAATGGTAGTGGCACTACTCGTGTTGAACTGCAATCTACCACTGGTAATGCATCATTCTACGGTGTTGTTGATATTACCAACAACCTGAATATTAATACTGATAAGTTTAATGTTACTGCAGCAAGTGGTAACACTTACACTGCTGGAACTCTTGAAGTTACTCAAGGTAGCACACTTAATGGTGCTGTGGACCTCAATAACACACTGAATGTTTCTAGTACTGTTCATTTTGAAGCAACAGATGAACCTACATTCGCACAGAACGCTGGCACTGGTCTTTGGGAAATTCAATCCAATGACTATGGTTCATTCCGATTTGATGGTGGTGGATATATTGCTGGCGACTTTATGTTTGACAGCGACGTTGTTATCAACGGTACTATTCTACAAAAAGAATCCTCTACTGAGGTCTTCAACGAGCAGAACTTCCTGAGAGTTCGTCGTAAGTTGGAATCTGGTTCTGTTCAAGCTCTCAATCCATCTTACGCAAATCATACAAACTCCAACCTTAGAATATTTGGTGGTGCTGGTATTGTACAAGACCTTCACATTGGAGATGACTTATATATTGGTAAGGTTAATAATGGCGACACCGTAGAATTCACAGTTCTGGGTGAGAATGGTAATACTCAAATTGGTCGTTCTGGTGCTGGTACTGCATCGGTTGGTACTTTAACTGTCTATGGTGATACTCTGCTTGATAGAGATCTGACCGTCAATGGTTCTCAGATTACTCTTGGTAATGCAAATACAGATATACTTACAGTAAATTCAGATGCAACCTTTACTGATAACCTAACAGTTAATCAATCAGTTGAGTTTGATAGTACTCTTAATGTTGATGACAATGTTACATTCGGTGCTCAACTAACTGTTACTGGTACAACTGAGTTTAATAATACTGTTGATGTTGATGCCAACTTCGCTGTAAGAAGTGGTAGCACGGACAAGATGACCGTTGCCTCTTCTTCAGGTAACATTGCAACTGACGGTACACTGGTTGTTCAGGGTCAGACAACTATCAATGACTCTCTGTATATACAATCATCTAATGAATTCTTTAAAATTCAGAATGGTAGTTCTGTAGATAAGTTTACTGTTGATACTGATAATGGCAATACTGCTATTATTGGCACTCTAACGGTCTCCAATGCCACTCAACTGAATAATACACTTGGTTGCCAAGGAATCGCTTCCTTTACCAATACAACCGATCAGGACGTTGTTTCAGGGAGTTATACTGCAGACGGTGGTGTTAGGATTACTTCTGGTCTTGGAGTAGAGAGAAACTTAGCAGTTGGTGGAGATACTAGATTCTACGGAACAGTTGGATTTGAGTCTGCTCTTGATGTTGACAATGCTGTTGACATTTCAGGTAACCTGAACATCAGCAATGGTAACGATGTTAGTAATTTTACTGACACTACTGTTGCACTGAAGGTTAGTGGTGGTGCAAGAATCAGTAAGAAAATGATGGTCGGTGGAGATTTCACCGTATATGATTCTTCTGGAGCATTAAATAATTTCTTTGTTGAGAAGACTACAGGTAATGCAGAGTTAAGAAACAACCTGGTAGTTGGTGGAGATCTCACAGTAAATGGTACAACCACAACTGTAAATTCAACCACATTAACAGTGGACGATCCTATCATCACTTTGGGTGGAGATAGCGTTCCTACAACTGATGATAACTTGGATCGTGGTGTTGAATTTAGATACTATGACACTCAAGCGAGATTAGGTTTCTTTGGTTATGACAATAACCTCAATAGATATAGATTCTTAGTTGAAGCTACAAACTCATCAGAAACATTCAGTGGTACTGATGCGTCACTTCAGGCGGGTTCACTGCAACTAACCTCAAGTGGAACTGGACTTGATGTTGATGCTAACGCTAACATTGATGGTACTCTGACTGTAGATGGACAGATCATCTCTCAGGTTTCTTCTGGTCCTGCCCTGGTCATTCCTACCACTGCCAAGATCAACAATCTGAATGCTGATCTTCTGGACAGCATGACTACCGATTCGGCAAATACAGCGACTACTGTTGTTGCTCGTGACAATAGTGGAGATTTTGCTGCGAATCAAATTACAGTTAATAACGGTATTGGTGCTGTTGCAGGTATTCAAGGTAATGCTACATCAGCAGATGCACTGAGAACAGCAAGAGTCATCACAGTTGATGGTGTTGTTAATGGTAACGTATCGTTTGATGGATCGGCAGCAGTAACAATCACCACGACTTATGATGATGACGATATAACTGCTCTTGCTGCTCAGACAGGCACGGGTATTATGGCAAGAACTGCCGCCAATACTTATGCTCATCGTACTATCGCTGTTACTGGTTCTGGTATTGGTATCACTAATGCAGATGGAATCAGTGGTGACCCATTAATTACAATCACTTCTGCAAGCACAAACTCGGCAAATAACATAGTTATTCGTGACGTTAATGGTGACTTTGCTGCTGGAACAATCACAGCAACCTTGGTTGGTGATGTAACTGGTGATCTAACTGGTAATGCAGACAATGCTCTACAAGTTAGCACTGGATCTGGTGGTGCTGGTGGTACTATGTACTTTGCCATGACCAATCAATATGGTGCTGGTTCAAGTAGAACTCTGTTTGCTAATACCAGTACTATTACACTTGATACTTCTGGCGGTGTTGGAAACAATACTCTGATCGTAGATAAGGTTACTGCTGACTTGACTGGTAATGTAATTGGTAACGTAACTGGTGAAGTTTCTTCCCTTGCAAATCATGACACTGCTGATCTAGCAGAGGGAACTAACCTTTACTATACAAATGCTCGCGCTGAGGCATCCTTTGACACCAAGATTGC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Tertiary structure

PDB ID
c0a005507a354d68461b404c7bedf8c8beadab593436be42c496819205e90654
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5148
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank