Protein
View in Explore- Genbank accession
- CAO2433611.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTFTF
- Protein sequence
-
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAIFDPTGSSEITIGDVLKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYSRLAANNTFRGTQAILSDNEALIVKNITQGMPLYIRGQDADGTNRWYLGNDNKGTDNLVLKNVKYGAYVAILANLISVNKSIQINGQVQPSDFSNLDARYFTQTAANQRFAQLVGNNTFSGLNTFNQLSVFKKDGEAIRLQNANAAQPLYIKAIDSTGVNRWYIGNSNEGDNVALENYKTSGKITVGTSVNINKTLTVTGQVQPSDWTNIDSRYVLIGSYANLAKKNEANTFTLQQNIQSDGEALRIYSKAQNNSSYIVGKNTDNTNKWFIGCGTNGSGTASFHNYLTGARIDLADEILLSKSLQITGQVKPSDWGNLDARYFTQTAANSRFMLASNTGQYTATDWNAVPWDAKTGLYNIMNGGGSQMIFHMYQAVGSCRSAQLRFNYKNGGMFYRSSRDGFGFEADWSKIYTEAQKPTPSELGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKNTNTTGAHTHSVSGSTSSAGNHNHSISWIGQNSTHYSGGGGGKIGTGPGYTDAAGAHTHSVSGTAGSAGNHAHSVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 780 AA molecular weight: 84045,96400 Da isoelectric point: 8,89794 aromaticity: 0,09103 hydropathy: -0,42795
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAO2433611.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OZ346164.1
[NCBI]
CDS location
range 20474 -> 22816
strand +
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATTGATACAATTCGTTCAGACGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGATTTCTTAGCATCTTTTAAACTAGAAAGGTTTGTTCAGATTGCTGGTAGCACTATGACTGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAATCTTTGACCCAACAGGCTCTTCTGAGATTACTATTGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATCAACGCAAATGGCCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCGGCAACTGTTTATCATACTCTGAATAAGCCAAGTCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATACTCAAGATTAGCTGCAAATAACACCTTTAGAGGTACTCAAGCTATTCTCTCTGATAATGAAGCCCTCATTGTTAAGAATATTACACAAGGGATGCCACTCTATATTCGTGGTCAAGATGCAGATGGCACTAACAGATGGTATCTAGGCAATGATAATAAAGGCACAGACAACCTTGTTTTAAAAAACGTTAAATATGGTGCATACGTAGCGATTTTAGCTAACCTAATCTCTGTGAATAAATCAATTCAAATCAATGGTCAAGTTCAACCTTCTGACTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACAGCAGCTAATCAGAGATTTGCGCAGCTAGTTGGTAATAACACATTCAGTGGTTTAAACACATTCAACCAACTAAGTGTTTTCAAAAAAGATGGTGAAGCAATTAGGCTACAGAATGCCAATGCTGCACAACCATTGTACATTAAGGCGATTGATAGCACAGGTGTCAACAGATGGTACATTGGTAATAGTAACGAAGGTGATAACGTAGCTCTAGAAAACTACAAAACTAGTGGCAAGATTACTGTAGGGACAAGTGTTAATATCAATAAAACACTAACTGTAACTGGTCAAGTTCAACCTTCTGACTGGACTAACATTGACTCTCGTTATGTTCTTATCGGTTCATACGCAAATCTTGCTAAGAAGAATGAAGCTAACACATTCACTTTACAGCAGAATATTCAATCTGATGGTGAAGCATTAAGAATCTACAGCAAGGCTCAGAATAATTCTTCTTACATTGTTGGTAAGAATACTGATAACACAAATAAGTGGTTTATCGGTTGTGGTACTAATGGTTCTGGTACGGCATCATTCCATAACTACTTGACTGGTGCAAGAATTGATTTAGCTGACGAAATTCTTCTGTCTAAATCTCTACAGATTACTGGACAGGTAAAACCTTCTGATTGGGGTAACTTGGATGCAAGGTACTTCACGCAGACAGCAGCTAACTCAAGATTCATGTTGGCATCAAATACTGGTCAGTACACTGCTACAGACTGGAATGCTGTCCCTTGGGATGCTAAAACAGGGCTGTACAACATCATGAATGGTGGTGGTTCGCAGATGATTTTCCACATGTATCAAGCAGTTGGTTCATGTCGTTCTGCACAACTACGTTTTAACTACAAAAATGGTGGAATGTTTTACAGGTCGTCAAGGGATGGTTTTGGTTTTGAAGCAGATTGGTCTAAGATTTATACAGAAGCACAGAAACCAACCCCTTCAGAGCTTGGTGCATACACTAAAGCTGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGACTCTACAGACCTTAACAAAATCTATCCAGTGGGTATTGTGACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTGCCTGGTCTAACTTGGACGTATCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCAGAATTGCAGCAGCAAACGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGACTCTGTGACGTTAGCTGTTGGGAACTTGCCTTCACACACTCACAGTTTTTCTGCGACTACCTCATCGTTTGACTACGGAACAAAAAACACTAACACGACTGGTGCTCACACACACTCTGTAAGTGGCTCTACTTCATCTGCTGGTAACCACAACCATTCCATTTCGTGGATTGGTCAGAACTCTACACACTACTCTGGTGGTGGTGGTGGTAAAATCGGTACAGGTCCGGGTTACACTGATGCTGCTGGTGCGCACACCCACTCTGTAAGTGGTACTGCTGGTTCTGCTGGTAACCACGCTCACAGTGTTGGTATTGGTGCTCACAGTCATACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCCGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTATAAGTTAATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA
Tertiary structure
PDB ID
7a688eb0a9d107d1501c74a9be1ff98e5ba33efec7f0fa61baf4f2c0c153a384
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50