Protein
View in Explore- Genbank accession
- AOV61127.1 [GenBank]
- Protein name
- baseplate wedge initiator
- RBP type
-
TSP
- Protein sequence
-
MSRTVPGSGASIKPIFDENFGVRAIRVVNGGSGYDSTDPPRLTVTGCGTPDTEALLYPIIDDQSGKIIHVRVLERGRGYDPLRLQFFPEQESPTVIDSLDINRIWQTHPNSSTTGTFLSNTDRLRIVSDNHPKPTWIQAEAAPGGGPLIDRSFDQTFIYRGGKDVPNSNTRSEQNNKAIGILANGGLLHTPEWGTTGNAPTNFAIDSVKYDYVKDNSVYDTVTEGNVRYYHTSKSLDEFKLGNGVFEWGKFTQFTWNVKVENGNIALDVSNVDESLGTVAVGRTVDEIGGGATGEISKVVRNNSNVVTRIYLRLVSTAASFSENDRCLGSTGFTFTISEPPITFNAYYIDFGPDAAKFGNFIPGTFYFSPENISVKRNYLIKFNQSDSTNSNHPIRFSTTPDGTHNETPGTLYYTSTGSSSAPAADYESEYMPIFMMNADESSRIYYYCLNHPNMAGQDGDEGFMTLSTDTSAETLTNTYYVEDYFGSGATLDYSRFTDGHSKIIGMSYDGYPIYGPYGYNASGNAVREVSSHRLRSTAELPGTRPAVNSASTTTYAVTVSSGEFLFDGSRPNFLSLGRGKTFIFNQDHASNDGKILFFSETEDGWHPSSSIGTTSFLYDLGVTYTLDGSAVTYAAYIAGFDAATQRRIQIVVPVTAPSTLYVFGYQTSGLGLRTVQSGYLLGDLVQDYIYDSSVGTLDEFNGKFAVTPDYPNGTYAYFMTEDGSGNPVYPYVIGRKFYGTPIFEGGAVPEVVTDFPDGAAGDVVLDDDGKVSYIKMTKNGDNYYGTTKARILGGQGSGATGTSTVQTVTGLTLLNSGRSYSSAPTVVFEGGGGQDAQGLAKIDTTGKVTSVSIADGGEFYQEPPYVLLTGGGGIGAKAVATIDQGQISSITVTDTGEGYTSAPNVIFTRLVNLKRKTRARQANNAKNIYLTGLTKDVTTSDDVIYVKNTSAFPGSGEFILDYETISYTSKTDEKFAGITRGVNFNYDQRVILDDGQNDDAGVSTYNFNVGDRLIRRVESASNKIAKVYDWNPNTRELLLTFEIDELAFIDGGIPSSEEATVQFDAGVASSSGSNVTPHVVIVEEGSTITTLTVPIAILENKNFEDNDEQDGAGDGIPDLVNTGTDFENQLNLDGGIYNSLYGIEETQGGTNTTLLAVGDSVKDASVPFKFANIATAGGLSEGREHVALVNLTLDALDGNGQNFSVNEVITGDISGVRGTVVSWNATTKVLQVKDVVPFNTGNVNVGEGGYLYKFSEKSTVVDVYIQNAGTNYSGTPTLAFENIGDIRATGTVNMTIAGDQVESINITNGGYGYVQSVDNTYDLHPELTFTNAGGDSTGSGVVAYAILGGEKVSGNNGAQYRIKSIEYVSTVRSK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1375 AA molecular weight: 147772,68420 Da isoelectric point: 4,59085 aromaticity: 0,10400 hydropathy: -0,30633
Domains
Domains [InterPro]
IPR008972
361–458
361–458
1
1375
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Synechococcus phage S-CAM22 [NCBI] |
1883365 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOV61127.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU686208
[NCBI]
CDS location
range 70592 -> 74719
strand +
strand +
CDS
ATGTCTAGAACTGTTCCTGGATCGGGTGCCTCTATCAAACCAATTTTTGATGAAAATTTTGGTGTCCGTGCAATACGAGTAGTAAATGGTGGATCTGGATATGACTCTACAGATCCACCTAGATTGACAGTAACTGGTTGTGGTACTCCAGATACTGAGGCATTACTATACCCTATAATTGATGATCAATCTGGAAAAATTATTCACGTAAGAGTTCTTGAGAGAGGTCGTGGTTATGACCCTCTACGATTACAATTTTTTCCAGAACAAGAATCTCCAACAGTCATAGATTCACTTGATATTAATAGAATTTGGCAGACGCATCCAAATTCTTCCACTACAGGAACTTTTTTATCAAATACCGATAGACTTAGGATAGTATCTGATAATCACCCCAAACCAACTTGGATTCAAGCAGAAGCAGCACCTGGAGGTGGTCCTTTAATTGACAGATCTTTTGATCAAACATTCATTTACCGTGGCGGTAAAGATGTTCCTAATTCAAATACCAGATCAGAACAAAATAATAAAGCAATTGGTATTCTTGCTAATGGTGGTCTCTTACATACTCCAGAGTGGGGAACTACTGGAAATGCACCAACTAATTTTGCTATAGATTCAGTAAAGTATGATTATGTTAAAGATAACAGTGTATATGATACTGTAACTGAAGGAAATGTAAGGTATTATCACACAAGTAAATCATTAGATGAGTTTAAACTTGGTAATGGTGTTTTCGAGTGGGGAAAATTCACTCAGTTTACTTGGAATGTAAAAGTTGAAAATGGTAATATTGCTTTAGATGTTAGTAATGTAGATGAATCTCTTGGTACGGTTGCTGTTGGTAGAACTGTTGATGAAATTGGTGGTGGTGCAACAGGAGAAATTTCAAAGGTTGTAAGAAATAATTCTAATGTTGTAACACGAATTTATTTACGATTAGTATCTACAGCGGCTTCTTTTTCTGAAAATGATAGATGTTTAGGATCCACTGGATTTACATTTACAATTTCAGAACCACCAATAACATTTAACGCATATTATATTGATTTTGGTCCCGATGCTGCAAAATTTGGTAATTTTATACCAGGAACATTTTATTTTTCTCCAGAAAATATTTCAGTAAAGAGAAATTATCTGATTAAATTTAATCAATCTGATTCTACTAATAGCAATCATCCGATTAGATTTAGTACAACTCCTGATGGTACTCATAACGAAACTCCTGGCACTCTTTACTACACAAGCACTGGATCATCATCAGCACCAGCAGCAGATTACGAAAGTGAATATATGCCCATATTCATGATGAATGCTGATGAAAGTAGTAGGATCTATTACTATTGTTTGAATCATCCAAATATGGCTGGTCAAGATGGTGATGAAGGATTTATGACTCTCAGCACAGATACTAGTGCTGAAACTTTAACTAATACTTACTACGTCGAAGATTATTTTGGTTCTGGTGCAACTTTAGATTATAGTCGTTTTACTGATGGACACTCTAAAATTATTGGTATGTCCTACGATGGATATCCAATTTACGGTCCTTATGGATATAATGCTAGTGGAAATGCTGTTAGAGAAGTTTCCTCGCATCGTTTAAGAAGTACAGCAGAACTTCCTGGTACAAGACCTGCTGTAAATTCTGCAAGTACAACAACTTATGCAGTAACTGTTTCTAGTGGTGAATTTCTTTTTGATGGTTCTAGACCTAATTTCTTGTCTTTAGGTAGAGGAAAGACATTTATCTTTAATCAGGATCATGCGTCAAATGACGGAAAAATTTTATTTTTCTCGGAGACCGAAGATGGGTGGCATCCTTCTAGCAGTATTGGAACCACTTCTTTTCTGTACGATTTGGGAGTTACTTATACACTAGATGGTTCTGCAGTAACTTATGCTGCATATATTGCTGGATTTGATGCGGCAACACAAAGAAGAATTCAAATTGTTGTACCAGTAACAGCACCATCCACTTTGTATGTTTTTGGATATCAAACTAGTGGTCTTGGTTTGAGAACAGTTCAGAGTGGATATCTTCTTGGAGATTTGGTTCAAGATTACATTTATGATTCTAGTGTTGGTACGCTTGACGAATTCAATGGTAAGTTTGCAGTAACTCCAGACTATCCAAATGGAACTTATGCATATTTCATGACAGAAGATGGCAGTGGAAATCCTGTCTATCCATATGTTATTGGACGTAAATTCTATGGCACACCTATTTTTGAGGGTGGTGCTGTTCCTGAAGTTGTTACAGATTTTCCTGATGGTGCTGCTGGAGATGTTGTCTTAGACGACGATGGGAAAGTATCTTACATTAAGATGACTAAAAATGGTGACAATTATTATGGAACTACAAAAGCAAGAATTTTAGGTGGACAAGGATCTGGTGCTACAGGAACATCCACTGTTCAAACAGTTACAGGTTTGACTCTTCTGAATTCTGGTAGAAGTTACTCTAGTGCTCCTACAGTTGTTTTTGAAGGTGGTGGTGGACAAGATGCTCAAGGACTAGCAAAAATTGATACTACTGGAAAGGTCACTTCCGTTTCTATTGCAGATGGAGGAGAATTTTATCAAGAACCGCCTTATGTTCTTTTAACTGGAGGTGGTGGTATTGGAGCAAAAGCAGTTGCTACAATCGATCAGGGTCAAATCTCTAGTATTACTGTAACTGATACTGGTGAGGGATATACATCTGCCCCAAATGTAATATTCACTAGATTGGTAAATCTCAAGCGTAAAACTAGAGCTCGTCAGGCAAATAATGCTAAAAACATTTACTTAACTGGTCTTACTAAAGATGTAACCACATCAGATGATGTAATTTATGTAAAGAATACTAGTGCATTCCCTGGATCAGGTGAATTTATCCTAGATTATGAAACTATTTCATACACTAGTAAAACAGATGAAAAATTTGCTGGTATTACTAGAGGAGTAAACTTTAATTATGACCAGAGAGTTATCCTTGATGATGGTCAAAATGATGATGCTGGAGTTTCCACATATAACTTTAATGTTGGGGATCGATTAATTCGTAGAGTTGAAAGTGCAAGCAATAAAATTGCTAAAGTTTATGATTGGAATCCTAATACTAGAGAACTTTTACTAACATTTGAAATTGATGAACTGGCATTTATTGATGGTGGTATTCCATCTAGTGAAGAAGCTACAGTTCAATTTGATGCTGGTGTTGCTTCAAGTTCTGGTTCCAATGTTACTCCACACGTAGTTATTGTTGAAGAAGGATCTACAATCACAACTTTGACAGTTCCTATTGCAATTTTAGAAAATAAAAATTTTGAAGACAATGATGAACAAGATGGTGCTGGCGACGGTATCCCAGATTTAGTAAATACTGGAACAGACTTTGAAAATCAACTCAACCTTGATGGTGGTATCTATAATTCTCTATATGGTATCGAAGAGACTCAGGGTGGAACTAATACAACATTATTAGCAGTTGGTGACAGTGTTAAAGATGCTAGTGTACCATTCAAATTTGCAAATATTGCTACAGCAGGCGGACTTAGTGAAGGAAGAGAGCACGTCGCTCTTGTCAATTTAACTTTAGATGCTCTTGACGGTAATGGTCAAAACTTCAGTGTTAATGAAGTTATTACTGGAGATATATCTGGAGTTCGTGGAACAGTTGTTTCATGGAATGCAACAACTAAAGTTCTTCAGGTCAAAGATGTTGTTCCCTTTAACACTGGGAATGTCAATGTTGGAGAAGGAGGATATCTTTATAAATTCTCCGAAAAAAGCACAGTTGTTGATGTCTATATTCAAAATGCAGGAACAAACTATTCTGGCACACCTACATTGGCATTTGAAAATATTGGCGATATTAGAGCAACAGGAACTGTTAATATGACAATAGCAGGTGACCAGGTGGAATCTATCAATATCACAAATGGCGGATATGGATATGTTCAATCTGTAGATAATACTTATGATCTTCATCCAGAACTTACATTTACAAATGCTGGCGGAGATAGCACTGGATCTGGTGTTGTAGCATATGCTATTTTGGGTGGAGAAAAGGTTTCTGGAAACAACGGAGCGCAATATAGAATCAAGAGCATTGAATATGTCTCAACTGTCCGTTCCAAATGA
Tertiary structure
PDB ID
a69eef7e380fdb7828023a3a01b1abcacdd313ca1adcecd4bc82c56847308c55
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50