Protein

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Genbank accession
XAO54250.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,87
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MQVQVLLHSVLLSSSRQLLLEFKRTQSGLVLMVLLVHSTLLVVHGILQITPQYQTYHTVLESGLLINTLGASAPFLQEVLMADYRIQDLDTITGVLQDNDYLLVKIAKRANTVGDEDRKMPYLDFLTSIGLQKYVLKAGDSITGPQTLSNGIAIRGSTTASVVDLLKVDASGFTIVGSQQNTLQFQSQAVMTVMHNNTVYKLYSEFNKPTATEVGAYSKSETYNRTEADAAFVKVAGDTMVGPLVLSGPAQTYLRLTSTSASQDSGFKTFDIAFSNAGDVAFNTTNSAGLKVGAVSLPKGVTGTVYTTGNRPTGSDLNMYTKSEVYSKVETYAKTEVYAKTETYSRAEAAKSGANSDITSITGLTTMLPINQGGTGAPSGAAALSNLMGSSPLRLKANGVNALDAVTVQQMSAITDVDSFDLNKTYATVGAVGTQNYGGEYRSTTIIGTAKQQTAVFSSAYETGVIEAASIRVLNATGTTTGELRVIAGNGNVMMQNGALFGSRNADGTMPGYLGVVSGGVRLGHLNMPLSLVANTPIKYTNDMLGVRVQQSTDLLSKYGGTVNSVIEDQGGLQRAGAQFRVWIDGNGVRQAQLIVTGDSGSNPRFFTFGQNGGFTADGNVVGTTFNLKGSAQGAFLGGDGNISSTIYVGGNIKAELNAKASYGNIQYRTSNRIYAGSLNGNGPFRVPMSGGYGNLGGRTLMFYGNQGGTMCCATATVNLNGAVQRVVLWGDSAFQFQLIDGGANIEFTRVTNYTLQEVYIHL
Physico‐chemical
properties
protein length:763 AA
molecular weight: 80708,01720 Da
isoelectric point:7,65112
aromaticity:0,07864
hydropathy:-0,03604

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Yersinia phage vB_YenM_P778
[NCBI] 		3141559 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XAO54250.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP693300.1 [NCBI]
CDS location
range 42273 -> 44564
strand +
CDS
ATGCAGGTTCAGGTTCTGTTGCATTCGGTGCTGCTATCTTCTTCAAGACAACTGCTGCTGGAGTTCAAGCGTACACAGTCTGGGCTGGTGCTAATGGTGTTGTTGGTTCATTCAACGTTGTTGGTGGTGCATGGGATACTGCAAATAACACCTCAGTATCAAACCTACCATACCGTATTAGAATCTGGACTATTGATTAATACTCTGGGGGCTTCGGCCCCCTTTTTACAAGAGGTCTTAATGGCTGATTATAGAATTCAAGATTTAGACACAATTACAGGTGTCTTACAAGATAATGACTACCTGCTTGTTAAGATTGCTAAGAGAGCAAACACAGTAGGTGATGAAGATAGAAAGATGCCCTATTTAGACTTCTTGACATCTATTGGGTTACAAAAGTATGTTTTAAAAGCTGGTGACTCTATTACTGGCCCACAGACACTGAGTAATGGTATTGCAATCAGAGGTTCTACTACAGCAAGTGTTGTTGACTTATTGAAAGTAGACGCTTCAGGTTTTACTATTGTTGGTTCTCAGCAGAATACTCTTCAGTTCCAGTCACAAGCTGTTATGACAGTTATGCACAATAACACAGTCTACAAACTCTACTCAGAGTTCAATAAACCAACAGCTACAGAGGTTGGTGCCTACTCTAAAAGTGAAACCTACAATAGGACAGAGGCCGATGCAGCATTTGTTAAAGTTGCTGGGGACACTATGGTTGGCCCACTAGTTCTATCTGGCCCTGCACAGACTTACTTAAGACTCACATCTACAAGTGCAAGTCAAGATAGTGGTTTCAAAACTTTCGACATTGCTTTCTCAAATGCTGGTGATGTAGCTTTCAACACTACCAACTCCGCAGGTTTAAAAGTTGGGGCAGTATCACTACCCAAAGGTGTGACAGGTACTGTTTACACAACAGGTAACAGACCAACTGGTTCTGACTTAAACATGTACACTAAGTCTGAAGTTTACTCAAAAGTGGAGACATATGCAAAGACAGAGGTCTACGCAAAAACTGAGACTTACAGTCGTGCAGAAGCTGCTAAATCTGGTGCAAACAGTGATATCACATCTATTACTGGTCTGACAACAATGCTACCAATTAACCAAGGTGGTACTGGAGCACCAAGTGGAGCAGCAGCATTAAGCAACCTTATGGGTTCATCACCACTGAGACTTAAAGCTAATGGTGTGAATGCTCTGGACGCTGTTACTGTGCAGCAGATGTCAGCGATTACAGATGTTGACAGTTTTGACCTTAACAAAACCTATGCAACTGTTGGTGCCGTTGGAACGCAGAACTATGGTGGTGAGTACAGGTCAACGACTATTATTGGCACTGCTAAACAGCAGACAGCAGTTTTCTCATCAGCATATGAGACTGGTGTTATCGAGGCTGCAAGTATCCGAGTTCTTAATGCAACTGGAACTACGACTGGTGAGCTGCGTGTTATTGCTGGTAATGGTAATGTTATGATGCAGAATGGCGCACTCTTTGGAAGCCGTAACGCAGATGGTACAATGCCCGGATATCTTGGTGTTGTTAGTGGCGGGGTGAGGTTAGGTCATCTTAACATGCCATTGAGTCTGGTTGCAAACACACCTATCAAATACACTAATGATATGCTTGGTGTTAGAGTCCAGCAATCCACGGATTTGCTTAGTAAGTATGGTGGGACAGTAAACTCGGTAATTGAAGACCAAGGTGGCTTACAGCGTGCTGGTGCACAATTCAGAGTGTGGATTGACGGCAATGGTGTACGACAGGCACAGTTAATCGTCACAGGTGACTCTGGCTCTAATCCTCGTTTCTTCACATTTGGTCAGAATGGTGGTTTCACTGCTGATGGTAACGTTGTTGGTACAACATTCAACTTAAAAGGCTCTGCTCAGGGTGCTTTCCTTGGCGGTGACGGTAATATTTCAAGCACAATCTATGTGGGAGGAAATATCAAGGCAGAGCTGAATGCTAAGGCTTCCTATGGTAACATCCAGTACCGTACAAGTAATAGAATCTACGCAGGTTCACTTAACGGGAATGGGCCATTCAGAGTCCCAATGTCCGGTGGTTATGGGAACCTAGGCGGGAGAACACTGATGTTCTACGGCAACCAAGGTGGCACAATGTGCTGTGCTACTGCAACTGTCAACCTTAATGGTGCTGTGCAGCGTGTTGTACTTTGGGGAGACTCTGCATTCCAATTCCAGTTGATTGATGGGGGAGCCAACATTGAGTTCACAAGAGTTACAAACTACACTCTTCAAGAAGTCTATATCCACCTTTAA

Tertiary structure

PDB ID
123a702049e60b4034416b949da54e533814a2df4e5e1f83bb1cd7cc955e7c80
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5242
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genome sequence of Yersinia phage vB_YenM_P778 Hammerl,J.A. 2003-08 — GenBank