Protein
View in Explore- Genbank accession
- WWQ71080.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TSPTSPTSPTF
- Protein sequence
-
MGYFQMTRNVEELFGGVITAPHQIPFTYKSNVGGETFLSLPFHPVTGVITINGGMQVPLDNFEIEGNTLNLGRALSKGDVVYCLFDKILSPEDTAKGIRIYKFQAVGGETEFTPDFTSYGVQSLYIGGEYKTPEIEYSYNSTTGKVSLQTALTAGVWVVAEMSVKQPNISPLFDRSVQEIARSANVKDSEVIISTDTTQVLNGKKVIFSVNEQKSYGLPTLPTNVYIQSVANGKLTYNPGSVIIDLLAPPSAAVEDIKAQLLQDTGTGMVGTKLLLAGAVYRSLTSKLGDSISVTDFGAKGDGATDDTASFQAAIQAAKLSPYIGKGVFVPAGTYCVSGVVLDCGILLHGEGKSCSILRPLTDGATCLHATVEMAIIEQLEFRSLQGKESQSTGISIEAPLITVSDCAFTFLKHGIITPSGKGAGELIIRHNRFAASGFGAALLGGNINTLFLQNTFSDCNIGLFSTDEAASGDVKKITEGITLNGDRFYACGNASADQSAIEVIDTRWITLNSVMSDLAYGNAFRATNVKHVRITGGYYSSNHSTNKSCMVIRGECDNFLLDGTMLSDSRFFCLEVYKYQGNTPKNAVLDKVVFQLNNIDPSQTGDLLVNSASLIASKCSFQSDKAGSITIIDNETGGSKVTTHECAFAGGVQLGVSTCKFSSKDSPTHPDFQAGIVSIASGSSEVTVPLTTQAVSGATAVGIFTVNAIGKNEPVWGDVTGGGLLIKQATTNPTTIAYTYQLVYA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 746 AA molecular weight: 79085,53440 Da isoelectric point: 5,19192 aromaticity: 0,08177 hydropathy: 0,05000
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Salmonella phage SeKF_19 [NCBI] |
3113357 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WWQ71080.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR863360.1
[NCBI]
CDS location
range 146609 -> 148849
strand +
strand +
CDS
ATGGGGTATTTTCAAATGACCAGAAATGTAGAAGAATTATTCGGCGGCGTAATCACAGCTCCCCACCAGATTCCTTTCACGTATAAATCAAATGTTGGTGGAGAAACTTTCCTTTCTTTGCCGTTTCATCCCGTCACTGGTGTTATCACAATCAACGGTGGTATGCAAGTTCCGTTAGACAACTTTGAAATCGAAGGAAATACATTGAATCTCGGACGCGCATTGTCCAAAGGCGATGTTGTGTATTGCTTATTCGATAAAATTCTTTCGCCAGAAGATACAGCCAAAGGTATCCGCATATACAAATTTCAGGCCGTAGGAGGCGAAACCGAGTTCACTCCTGATTTCACATCTTATGGAGTCCAATCTCTTTATATCGGTGGCGAGTACAAAACACCCGAAATTGAATATTCCTATAACAGCACGACAGGAAAAGTATCTTTACAAACTGCACTGACTGCAGGTGTTTGGGTAGTCGCTGAAATGTCTGTTAAACAACCGAATATCAGTCCGTTGTTTGACCGCAGTGTTCAAGAAATCGCCCGTTCAGCTAACGTAAAGGATTCTGAAGTAATTATTAGTACTGATACTACTCAAGTGCTTAATGGTAAAAAGGTTATTTTCTCCGTTAATGAACAGAAGTCTTATGGCTTACCCACATTACCTACCAACGTATACATTCAGTCCGTTGCCAATGGCAAACTGACATATAATCCTGGTTCCGTGATTATTGATCTATTAGCTCCACCTTCAGCAGCAGTGGAAGATATAAAGGCACAGTTACTCCAGGATACTGGTACAGGTATGGTAGGAACTAAGCTGTTGCTTGCTGGGGCTGTTTATCGCTCACTCACTAGTAAGCTTGGGGATAGCATTAGTGTTACTGACTTTGGGGCCAAAGGGGATGGTGCTACAGATGATACTGCTTCTTTTCAAGCAGCAATCCAAGCAGCAAAATTATCCCCTTACATTGGAAAAGGTGTATTTGTTCCGGCAGGTACTTACTGTGTCTCAGGTGTAGTACTGGATTGCGGTATTCTTCTTCATGGTGAAGGTAAGTCCTGTAGTATTCTACGACCTTTAACGGATGGGGCTACTTGCCTACACGCTACTGTTGAGATGGCAATTATAGAGCAACTAGAGTTCCGTTCTCTACAAGGTAAGGAATCCCAATCCACTGGAATTAGTATTGAAGCCCCTTTGATTACTGTTTCTGATTGTGCGTTTACTTTCCTTAAGCACGGTATCATTACCCCATCTGGTAAGGGGGCTGGCGAATTAATTATTCGTCATAACCGTTTTGCTGCCTCTGGGTTTGGAGCAGCTTTACTAGGGGGTAACATTAATACCCTATTTCTTCAAAACACGTTTAGCGATTGTAATATTGGACTGTTCTCTACCGATGAAGCAGCTTCTGGGGATGTTAAGAAGATAACCGAGGGTATTACTCTCAATGGTGATCGCTTCTATGCATGTGGTAACGCGTCAGCAGACCAGTCAGCTATTGAGGTAATTGACACTCGTTGGATTACCCTTAACTCGGTAATGTCCGACTTGGCATATGGTAATGCTTTCCGAGCAACCAACGTTAAACACGTCCGTATTACTGGGGGTTATTACTCATCCAACCATAGTACTAATAAGTCATGTATGGTTATTCGGGGTGAGTGTGACAACTTCTTACTGGATGGAACCATGCTATCTGATAGTCGCTTCTTTTGCTTGGAGGTTTATAAGTATCAAGGAAATACACCTAAAAATGCGGTACTGGATAAAGTAGTTTTCCAGCTTAATAATATTGACCCGTCGCAAACTGGTGATTTGCTTGTTAACTCTGCTAGCTTGATTGCCTCTAAGTGTAGCTTCCAATCAGACAAGGCAGGTAGTATCACTATCATAGATAACGAGACAGGTGGTAGTAAGGTAACTACCCATGAATGTGCCTTTGCTGGTGGTGTACAGTTGGGTGTGTCTACTTGTAAGTTCTCTTCCAAGGATAGTCCTACTCACCCAGATTTCCAGGCAGGGATTGTATCAATTGCCTCTGGTTCCAGTGAAGTTACTGTCCCACTGACTACGCAAGCCGTGTCTGGTGCAACTGCTGTCGGAATATTTACAGTGAACGCTATTGGTAAGAATGAACCGGTTTGGGGTGATGTCACCGGTGGGGGTTTGTTAATTAAGCAAGCAACCACTAATCCAACCACCATTGCATATACTTATCAGCTTGTTTATGCATAA
Tertiary structure
PDB ID
be216dc63492bc82f3ff01c03b70a7241a063eb2523d4de70e948500307fdfb9
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50