Protein
View in Explore- Genbank accession
- APU01545.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TSPTSPTFTF
- Protein sequence
-
MAELKSSSTAGGSLVWTQTNLPVSPQDGKIFYKDMELVDSKNNQTIAGKKDFTTGATVPTPVLANDATNKSYVDGKDSTSVKSVRGTAPIRVTTGVNPTVSIDAATPTASGSMSAGDKAKLDNHPFNVVNKDGDTVNGNLATTGNFSAQGKITSTANAGIENMDDVYAQRMVLSGSQGYFQAGKKDRDVNDQKMVFSGWFGTPLSQYRISMATGIQPQVLQGGVNYDILHRGNMPTPEDIKAMAIYDRPTGDDCNNAILPGNYGIFANTANTPFGIGPSGSTLLVTRWGNGANSQIFFPYGSDRVFVRRQHISVWQPWFELYSTSNKQPVGGMGLGVGDAPNALTITGNVRDFNLAKINGTFTIEGSWANGVNNTANAEGHAGILQISQRSIDNLTVQKYTTWLTGQGVNHHREFTRIWINDTEGWNNWLPSGTWESVNTYRTGILRLNNQTNDDSVYPYVSYTKEKYRDTIAPGTYYTVGEISFRAGSSNRYDPHSGDQLSRILGMVTNTATAGEYDGSLFLASRLRRTDGTVADSSTLAINRDLGVEFTHAAKKVQINTGRVTADEFFQNTAQSSLANSSTRKDYVDAEVATKVSKAGDTMTGSLTLPTAKPLYFGAGNNTYLTRSGDDLFVAAIAGTTGKVVIEGKVNPQVRIGTSNYNIYHAGNKPTSTELGVVNIAGDVMTGNLIVDVGTTAEPQVGVRRSGRRLYMADNGVTVGLYNIIGGSFINTFMISRNINDGNITVGSDSNNTIIRGAGNLKHGTADIYTTSNKPSPADIGTLTTAQINAELAKQVSKTGDTMSGALTTTQVNATNNYAFVSSIAQTHGMYLGNTASDKRLILGGGNPTIGAVHIRPHGIGVETSQTIFNTDGTITNGATPTEPGHLTNKVYVDGQISQQVSKSGDTMTGQLLIQTANNAPIQLKSTTAGVVTPQYIVANDSTGAQRWYIGQASANSPDVLLYSTGNGTYLRLESNQVSFNKNPISTALQGTAAGSLVRRDFLESSLSIQTPNNAIKIPVANLNDYQTPGYYYQDSNANAVSGSNYPTPQAGALVVTKAAGVIQEYTIYGTGARYVRAFYTNVWSSWALVYDSTRPPGATAVGALPIAGGTLTGGYLQIRGSSNPMLELHQPGQAAAVMYLTPTGQFRLGSGNGAGGETNVRMTVEPNGNVYSAGSITSAGYMLEGGARVYSPNNPQPSLTPTQIGNALASMSYDAVGQYAMLLLYVDKGNWLVPGTVVPGSQLRYSTAEGKDPGGAPPGNWRLHGRTNQGGQWRGWNVSLWQRVS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1286 AA molecular weight: 136814,36120 Da isoelectric point: 8,47529 aromaticity: 0,08087 hydropathy: -0,34347
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Aeromonas phage 65.2 [NCBI] |
1932896 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
APU01545.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KY290955.1
[NCBI]
CDS location
range 127600 -> 131460
strand +
strand +
CDS
ATGGCAGAATTGAAGAGTTCATCTACTGCTGGGGGTAGTCTTGTTTGGACACAAACAAACTTACCGGTATCCCCTCAAGATGGGAAAATATTCTACAAGGATATGGAGTTGGTAGATAGCAAAAATAATCAGACTATCGCCGGAAAAAAAGATTTTACTACAGGGGCTACTGTTCCTACTCCTGTATTAGCTAATGACGCTACAAATAAATCATATGTGGATGGTAAGGATTCCACATCAGTTAAATCCGTTCGCGGAACCGCCCCTATTAGAGTAACTACAGGAGTTAACCCGACTGTATCTATTGATGCAGCAACCCCAACGGCTTCTGGTTCTATGAGCGCGGGTGATAAAGCTAAATTAGACAATCATCCATTTAACGTAGTTAATAAAGATGGAGATACAGTAAACGGTAATTTGGCTACTACCGGCAATTTCTCTGCACAAGGGAAGATTACCTCAACTGCTAACGCCGGTATTGAAAATATGGACGATGTATATGCACAACGCATGGTATTATCTGGTTCACAAGGATATTTTCAAGCTGGTAAAAAAGATAGAGATGTTAACGACCAAAAGATGGTATTTTCTGGCTGGTTTGGTACACCACTATCACAATATAGAATCAGTATGGCTACTGGGATTCAACCCCAAGTTCTTCAGGGCGGTGTAAACTATGATATTCTTCATCGTGGGAATATGCCAACTCCTGAAGATATTAAAGCAATGGCTATTTATGATCGCCCAACTGGTGATGATTGTAATAACGCAATATTACCCGGTAACTATGGTATCTTTGCTAATACAGCAAACACTCCTTTCGGGATAGGACCTAGCGGTTCTACTCTGCTTGTAACTCGTTGGGGAAATGGCGCTAACTCTCAGATATTCTTTCCATACGGATCGGATAGAGTGTTTGTTCGTCGTCAACATATTAGTGTTTGGCAGCCTTGGTTTGAGTTGTATTCAACTTCTAACAAGCAACCTGTTGGTGGTATGGGTCTTGGTGTTGGTGATGCACCGAACGCTCTGACAATCACAGGTAACGTTCGTGATTTCAACTTGGCTAAGATTAACGGTACTTTTACTATTGAAGGTTCCTGGGCAAATGGAGTTAATAACACTGCTAACGCTGAGGGTCATGCAGGTATATTGCAAATATCTCAACGTTCTATTGATAATCTAACAGTTCAAAAATATACGACTTGGTTAACAGGTCAAGGTGTAAATCACCATAGAGAGTTTACCCGTATATGGATTAATGATACTGAGGGTTGGAATAACTGGTTACCTTCCGGTACTTGGGAATCTGTGAACACATACAGAACTGGGATACTTCGTCTTAATAACCAAACTAATGATGACTCTGTATACCCTTATGTGTCTTATACCAAAGAGAAGTATCGCGATACTATCGCTCCGGGGACTTATTATACCGTAGGTGAAATATCATTCCGTGCAGGATCTTCTAATAGATACGATCCGCACTCAGGGGATCAATTATCCAGAATATTGGGAATGGTAACGAATACCGCCACGGCTGGGGAATATGATGGATCCTTGTTCTTAGCTTCCAGACTTCGTAGAACTGATGGAACCGTTGCAGATAGTTCTACTCTTGCTATTAACCGAGACTTGGGTGTTGAATTTACTCATGCTGCCAAAAAAGTACAGATTAATACTGGTAGAGTTACTGCTGATGAATTTTTCCAAAATACCGCACAAAGTAGTTTGGCAAACAGTTCAACCCGTAAAGATTATGTAGATGCAGAAGTAGCGACTAAGGTTTCTAAGGCTGGTGATACCATGACAGGATCCCTAACCTTACCTACTGCAAAACCCCTTTACTTTGGTGCTGGTAATAATACTTATCTAACCCGCTCAGGTGACGATCTGTTTGTTGCTGCAATTGCGGGTACAACCGGTAAAGTCGTTATAGAGGGTAAAGTTAATCCACAAGTTCGTATAGGTACTTCCAATTATAATATATACCATGCTGGTAATAAACCAACTTCAACTGAATTGGGTGTAGTTAATATTGCTGGTGATGTTATGACTGGTAACCTTATTGTGGATGTAGGAACTACTGCTGAACCACAAGTGGGTGTTAGAAGATCTGGACGTAGATTATATATGGCTGATAACGGAGTTACCGTAGGCTTGTATAATATAATTGGCGGATCGTTCATAAATACCTTTATGATTTCCCGAAACATAAATGATGGTAATATTACTGTGGGTTCTGACAGTAATAACACAATTATTCGTGGTGCTGGTAATCTTAAACATGGTACTGCGGATATATATACAACCTCTAATAAGCCATCTCCTGCTGATATTGGTACTCTAACAACCGCCCAAATAAATGCGGAATTAGCAAAGCAAGTTAGTAAAACTGGCGATACCATGAGTGGGGCATTAACTACTACTCAAGTAAATGCAACTAATAACTATGCGTTTGTATCAAGTATAGCACAAACCCACGGTATGTATCTTGGTAATACTGCTTCCGATAAGAGATTGATTCTTGGTGGTGGTAATCCAACTATTGGTGCGGTTCATATTCGTCCACACGGTATAGGTGTTGAAACTAGTCAAACCATATTCAATACTGACGGAACAATTACCAACGGTGCAACTCCAACAGAACCCGGTCATTTGACTAATAAGGTTTATGTGGATGGTCAAATATCGCAACAGGTATCTAAATCTGGCGATACCATGACTGGTCAACTGTTAATACAAACTGCAAATAATGCACCAATACAGTTGAAGAGTACCACTGCTGGGGTTGTTACACCTCAATATATAGTAGCTAACGACTCTACTGGTGCGCAACGTTGGTATATAGGACAAGCTAGTGCGAATTCCCCTGATGTACTTTTGTATAGCACCGGAAACGGAACTTACCTTCGTCTTGAATCAAACCAAGTATCATTCAACAAAAACCCAATATCAACAGCGTTACAGGGTACTGCTGCCGGTTCTCTGGTTCGCCGAGATTTTCTTGAGAGTTCATTGTCGATTCAAACGCCGAATAATGCTATCAAAATTCCTGTTGCCAACTTAAATGACTATCAAACACCCGGATATTACTATCAGGATTCCAACGCAAATGCGGTTTCTGGAAGTAACTACCCAACACCTCAAGCCGGTGCTTTGGTAGTTACTAAAGCGGCTGGTGTAATCCAAGAATATACTATTTACGGAACCGGTGCTCGTTATGTTCGAGCGTTTTATACCAACGTTTGGTCATCATGGGCACTCGTATATGATTCAACTCGTCCACCCGGAGCTACGGCGGTAGGAGCACTTCCGATAGCCGGTGGTACTCTAACTGGCGGTTATTTGCAAATACGGGGTAGTTCAAACCCTATGCTGGAATTACACCAGCCGGGTCAAGCTGCCGCTGTGATGTATTTGACACCAACCGGTCAATTTAGACTGGGTTCAGGAAACGGGGCGGGTGGTGAAACTAATGTTCGTATGACTGTTGAGCCAAACGGTAATGTGTATTCCGCTGGGTCTATAACAAGTGCGGGATATATGTTAGAAGGTGGTGCTCGTGTTTATTCTCCGAATAACCCACAACCGAGTCTAACACCAACCCAAATCGGTAACGCTTTGGCGAGTATGTCTTATGACGCGGTTGGTCAATATGCAATGCTCTTGCTGTATGTTGATAAAGGTAATTGGTTGGTTCCCGGTACTGTGGTTCCCGGTTCACAACTACGTTATTCAACTGCGGAAGGTAAAGATCCGGGCGGCGCACCTCCGGGAAACTGGAGACTGCATGGACGTACAAATCAGGGCGGTCAATGGCGTGGTTGGAACGTTTCTTTGTGGCAACGTGTTAGCTAA
Tertiary structure
PDB ID
7c030462d0ae6131259d0be068b7b558370c1b2fef38fa6eb204622d25a27970
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50