Protein

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Genbank accession
AIX29713.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,76
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MTYSFAPNDQPLYVSEGDYVQFRFIAPNQWNTTNTVTITIGDLTQFWLITTIPEDFTPDPFPFNDVIDADLDTMYTTDIVFRPPDGTPSTSLSGLTPDTQAAVVLGSNLGGGIDNYAMRVDYNGNGSFDTGWIQSGGAITVTNGARIRVRLKSSEFTTQFSRLTLVIGTSSARWDILTLSQPTNEPEPFPDFTDLEDQPTNTYCYSEVIRLQGLISSATINTSGNGEWAISSTSNTSTNADGFQVLSGATFTGNDGTVNNGDYLQLRILSSNNALFPVTTNLSIGDALNGDTWSVETGSNPSTNPNSFSFTNVDDAIEDTLVASDEQPATALGIQGLTDGIQVPVVLVSTNSTKVRIKKNNDSVGVFPTTAGNGDKLTLYLQSSPSFNTPLNMQIKVGDRQIPAWQVRTSLGPDTDADWSPPANRNNQIPESFVSSAPVTVTGINRPITIESIAGYPALISIDFDSPVAGPRTFDPLVNSSFYIVVQAALQLNTPETTTIRLGTGNPNQFVWQVTTYATVPPPSTDAAIWYSRKSKKFDGYPIGTVLPVLKEGVGTYGDLDGGNNDRYPGFVPCDGRSLDKNDYFELYTILAGEYGETTNEFNVPDYRNRKLCGIGIVDSTRGNSAFVPITLGSSKGINDPGAEGGYWYFNRVGARGSNPLDQVQGPPGAVGSLDSDFFSLGTVRLTGLETLTDQVIFEINPNSFVTAQVGGLSSITVAAPTHNHAYISAVTEGNEGEASIPWNQPLGRSMMAGSRYGSPNPDEFDARAPENASSQENTDAIRDAWKNFFGSTLGANFQLELTRYYGSDFDFDDWVEQFPTNFPYNSTIDGSSTAFGPESDDLEYSIQFQTWWISPFSALASANLQYRGPSSGRTTNPTAPNGDTNRYWSGVFDTQPSTFAIDQYLNTAPGTQTRTHTHLITENAVGNPNADFTGGNFDGEGSNQTPYGSGLGGGVDGALLTFNIFWSNRYVVAGAKSPSGGGVSGDGGGQFFSAGVGEWSYRQAGAAQWNNPTDEETRDEDMVGGSGSGMRMRITYQAWPSPGGGSANDTRIRVDQILSAGSGYSVGDVLSTTFWNNIDTTANRIIEVAAIAANGSGGAADKLQVVFTQGQVFSDLTNGTFTYSSSFKRPTPDVEMQPQRQVPIINPFHKTKYIIKAY
Physico‐chemical
properties
protein length:1159 AA
molecular weight: 124637,04890 Da
isoelectric point:4,32473
aromaticity:0,10526
hydropathy:-0,36281

Domains

Domains [InterPro]
IPR037053
533–608
IPR037053
IPR011083
569–610
IPR011083
SSF88874
569–642
SSF88874
AIX29713.1
1 1159
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014e
[NCBI] 		1493510 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX29713.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019094 [NCBI]
CDS location
range 40740 -> 44219
strand +
CDS
ATGACATATTCGTTTGCACCTAACGATCAACCACTTTACGTATCAGAAGGTGATTACGTACAGTTTAGGTTTATTGCACCTAATCAGTGGAACACCACCAATACTGTAACTATTACTATTGGTGATTTAACGCAGTTTTGGTTGATTACAACCATTCCGGAAGATTTTACTCCCGATCCATTTCCGTTTAATGATGTCATTGATGCAGATCTTGATACGATGTATACTACGGATATAGTATTTCGTCCACCGGATGGCACACCATCTACTTCTTTAAGTGGATTAACACCCGACACTCAAGCAGCTGTAGTACTTGGATCTAATCTTGGTGGAGGCATCGATAATTATGCGATGCGTGTTGATTATAATGGCAATGGAAGTTTTGATACGGGGTGGATTCAAAGTGGTGGAGCTATAACTGTAACAAATGGTGCAAGAATTCGAGTTAGGTTAAAATCTTCTGAGTTTACGACACAGTTTTCAAGATTGACACTTGTTATTGGTACATCTAGTGCAAGATGGGATATCTTAACTCTATCACAACCAACAAATGAACCGGAACCATTTCCAGATTTTACAGATTTAGAAGACCAACCGACAAACACATATTGTTATAGTGAGGTCATTAGATTACAGGGATTAATTTCTTCTGCTACTATTAATACCAGTGGCAATGGTGAATGGGCAATTTCATCGACAAGTAATACTTCAACAAACGCAGATGGATTTCAAGTTCTTTCTGGAGCAACTTTTACCGGTAATGATGGAACTGTGAATAATGGTGATTACTTACAGTTAAGAATTTTGAGTTCAAATAATGCTTTATTTCCAGTTACAACTAATCTTTCGATTGGAGATGCTCTCAATGGAGATACTTGGAGTGTAGAAACGGGTTCAAATCCTTCAACTAATCCCAACTCATTCTCATTTACTAATGTAGATGATGCAATTGAAGATACACTTGTGGCATCAGACGAACAACCTGCAACCGCTCTTGGAATTCAGGGATTGACAGATGGTATTCAGGTTCCAGTAGTATTAGTTTCTACTAATTCTACCAAAGTTCGTATTAAGAAAAATAATGATTCTGTTGGAGTATTCCCCACAACAGCAGGAAATGGTGATAAATTAACTCTTTATCTACAATCATCACCTTCGTTTAATACTCCCTTAAACATGCAAATTAAGGTTGGTGATCGACAGATTCCTGCATGGCAGGTAAGAACTAGTCTTGGACCAGATACTGATGCTGATTGGAGTCCACCAGCAAACAGAAATAATCAAATTCCTGAGTCTTTTGTTTCTAGTGCTCCAGTTACTGTTACTGGCATTAATAGACCAATCACAATTGAAAGTATTGCTGGATATCCTGCATTGATTTCTATTGATTTTGATTCTCCTGTAGCAGGTCCAAGAACATTTGATCCTCTTGTAAATTCTTCGTTTTATATTGTAGTACAAGCAGCATTACAACTTAATACACCAGAAACCACAACAATTAGACTTGGTACAGGAAATCCAAATCAATTTGTTTGGCAAGTTACAACATATGCTACAGTTCCACCCCCATCTACTGATGCTGCTATTTGGTACAGTAGAAAATCTAAAAAATTCGATGGGTATCCAATTGGAACAGTTCTTCCTGTTCTTAAAGAAGGTGTTGGTACTTATGGAGATTTAGATGGTGGAAATAATGATAGATATCCTGGATTTGTTCCATGTGATGGTCGTTCATTAGATAAGAATGATTACTTTGAATTGTATACTATTCTTGCTGGGGAGTATGGTGAGACTACTAATGAATTTAACGTTCCTGATTATAGAAACAGAAAATTGTGTGGCATTGGTATTGTAGATAGTACCAGAGGTAATTCGGCATTTGTGCCAATTACTCTAGGATCTTCAAAAGGTATCAATGATCCTGGTGCTGAAGGTGGATATTGGTATTTTAATAGGGTTGGTGCTCGTGGATCAAATCCTTTGGATCAAGTTCAAGGACCTCCTGGTGCTGTAGGAAGTTTAGATAGTGATTTTTTCTCTCTTGGAACAGTTAGACTAACTGGATTGGAAACACTTACTGATCAAGTTATCTTTGAAATTAATCCTAATAGTTTTGTTACAGCACAAGTTGGAGGTCTGTCTTCTATTACTGTTGCCGCTCCTACACATAATCATGCCTATATTTCTGCAGTTACAGAAGGTAATGAGGGCGAAGCTAGTATTCCATGGAATCAACCATTAGGTAGATCTATGATGGCAGGTTCACGATATGGTTCACCAAACCCAGATGAATTTGATGCTAGAGCACCTGAAAACGCAAGTTCACAGGAAAATACAGATGCAATTCGAGATGCATGGAAAAACTTTTTTGGCAGTACTCTTGGTGCTAATTTTCAGTTAGAATTGACAAGATATTATGGTTCTGATTTTGATTTTGATGATTGGGTTGAACAATTCCCTACTAATTTTCCATATAACTCTACTATTGATGGATCTTCGACGGCATTTGGTCCTGAGAGTGATGACCTTGAGTATTCAATCCAATTTCAAACATGGTGGATCTCTCCTTTTAGTGCTTTAGCATCTGCAAATCTTCAATATCGTGGACCCAGTAGTGGGCGTACAACCAACCCTACTGCTCCTAATGGTGATACTAATAGATATTGGAGTGGTGTATTTGATACACAACCATCTACTTTTGCGATCGACCAGTATTTAAATACTGCTCCTGGAACACAAACACGTACTCATACACATTTAATTACAGAAAATGCCGTTGGTAATCCAAATGCTGATTTTACTGGTGGTAATTTTGATGGTGAAGGTAGCAACCAGACACCATATGGATCTGGTCTAGGTGGTGGTGTTGATGGGGCATTATTAACCTTTAATATATTCTGGTCCAATAGATACGTTGTTGCCGGTGCAAAATCTCCATCTGGTGGCGGCGTCAGCGGCGACGGTGGTGGTCAATTTTTCTCAGCAGGTGTTGGTGAGTGGTCTTATAGACAAGCAGGTGCAGCTCAGTGGAATAATCCAACTGATGAAGAAACCAGAGATGAAGATATGGTTGGTGGTTCTGGAAGTGGTATGCGTATGAGAATTACATATCAAGCATGGCCTTCTCCTGGAGGTGGTTCTGCAAACGATACTAGAATACGTGTTGATCAGATTCTAAGTGCTGGTTCTGGTTATAGTGTGGGGGACGTACTCTCTACTACATTCTGGAATAATATTGATACTACTGCTAATAGAATAATTGAAGTAGCTGCAATTGCTGCTAATGGATCTGGTGGTGCTGCCGATAAACTTCAGGTAGTGTTCACTCAGGGTCAGGTTTTTAGTGATCTAACAAACGGGACGTTTACATATTCTAGTAGTTTTAAGAGACCAACTCCTGATGTTGAGATGCAACCACAGAGACAAGTCCCAATTATCAACCCATTTCACAAGACTAAATATATCATCAAGGCGTATTAA

Tertiary structure

PDB ID
18b4fbe6cea1ea1dd5bf7ad5269319baca89730e35bbce9fc73fe51010b0c5b1
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5267
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank