Protein

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Genbank accession
YP_009621692.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MADYKLSELNSIGTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKTVFDPTGSSEINIGDVLKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNTFSGTQNIQGDANLLRLRNQNANNAQYIEGVNLDGSARWWVGIGSNGSDEVKLYNNKYNSVLTVASNISVNKSLAITGQVQPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLAANNTFSGLNTFSTSVSISSNAAAIMLKNKAVDESLFIQAKDVENNNLWYIGKGGANDNITFYDYKGDTSIVLNSSGAAFNKTVKITGQVQPSDWDNIDSRYIPAATLSTIARTNAQNTFKSGQTIVADGQALLLRSATDSPSLYVRGQNQSGTNKWYVGFSTSNVLGLSNEASGTTLTLDSAGINSNKNLNITGQVKPSDFSNLDARYFTQSASDSRYLRIRSTNFNNGNDDKWAKIATVVMPPSASTAVIEVFGGSGYNYGFPYQASKTEIVLRAGGDSPKGLNIVAWKNSENLIITDIGYVNTSGDTYDIYCRVGPFQNDTTSRVQSSSNASVQLFEAPQTFDDAPQGIVKGTIARYYTSMQKPTPSDIGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKTTNTTGAHTHQFGGYINSFYGDSSHTSFQPGGGAWTQAAGDHSHSVGIGAHSHTVSGNTGSTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:812 AA
molecular weight: 87334,28870 Da
isoelectric point:7,18078
aromaticity:0,09236
hydropathy:-0,37537

Domains

Domains [InterPro]
IPR048388
159–247
IPR048388 G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 SSF88874
G3DSA:6.20.80.10
159–218
G3DSA:6.20.80.10 IPR048388 IPR048388 IPR005003 IPR005003 IPR005003
YP_009621692.1
1 812
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage BPS17W1
[NCBI] 		2060124 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009621692.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_042097.1 [NCBI]
CDS location
range 48451 -> 50889
strand -
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATCGGTACAATCCGTTCAGATGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGATTTCTTAGCATCTTTTAAACTTGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGCACTATGACAGGTGACTTAGGAATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGACAGTATTTGACCCAACAGGCTCTTCTGAGATTAATATTGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATTAATGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCTGCAACTGTCTATCATACTCTTAATAAGCCAAGTCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGACGCAAGATATGCAAGACTTGCTGTTACAAACACATTCTCTGGGACTCAGAACATTCAAGGTGATGCTAACTTACTTCGCCTTAGAAACCAAAATGCAAATAATGCACAATATATTGAAGGTGTAAACCTAGATGGTTCGGCTAGATGGTGGGTTGGTATTGGTAGTAATGGCTCTGACGAAGTAAAGCTGTACAATAACAAATACAACTCAGTCTTGACTGTTGCAAGTAATATCTCTGTTAATAAGTCTTTAGCAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCAGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACAGTTGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGCTAATAACACTTTTAGTGGTTTAAATACATTCAGTACTAGTGTTAGTATTAGCTCTAATGCTGCTGCTATCATGCTAAAAAATAAAGCTGTTGATGAGTCTTTGTTCATCCAAGCAAAAGATGTTGAAAACAATAACCTGTGGTATATTGGTAAAGGTGGTGCAAATGACAATATCACATTTTATGATTACAAGGGCGACACTTCTATTGTATTAAACTCGTCTGGTGCTGCATTCAACAAGACTGTAAAAATCACTGGTCAAGTCCAACCTTCAGATTGGGATAACATTGACTCTAGATATATTCCGGCAGCAACATTAAGTACGATTGCAAGAACTAATGCACAAAATACTTTTAAATCTGGGCAGACAATTGTAGCAGATGGTCAAGCACTATTGTTAAGAAGTGCAACTGATAGTCCCTCTCTCTATGTTAGAGGCCAAAACCAATCTGGAACTAATAAATGGTATGTTGGATTTAGTACTTCAAATGTTCTTGGATTATCAAATGAAGCCTCTGGCACGACATTGACATTGGATTCAGCAGGTATTAATTCTAATAAGAATTTAAATATCACTGGTCAAGTTAAACCTTCAGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAAAGTGCTAGTGATAGTAGATACCTGAGAATCAGAAGTACTAACTTCAATAATGGAAACGATGACAAGTGGGCTAAAATTGCTACTGTTGTAATGCCGCCTTCCGCATCTACTGCGGTGATTGAAGTGTTTGGTGGGTCAGGTTATAACTATGGTTTCCCTTACCAAGCTAGTAAAACGGAAATTGTTCTCAGAGCAGGGGGTGATAGCCCAAAAGGTTTAAATATTGTTGCTTGGAAAAACTCGGAGAATCTCATTATTACGGATATCGGTTATGTTAATACATCTGGTGATACTTATGACATTTACTGTAGAGTTGGTCCATTCCAAAATGACACAACATCAAGAGTTCAATCTTCTAGCAATGCAAGTGTGCAATTGTTTGAAGCCCCACAAACATTTGATGATGCTCCACAAGGTATTGTAAAGGGTACAATTGCAAGATACTACACAAGTATGCAAAAACCAACCCCTTCAGATATCGGTGCATACACTAAAGCTGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGATTCAACAGACCTTAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACCGCACTTCCTGGATTAACTTGGACGTACCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCAGGATTGCAGCAGCGAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGAGGTTCAGATTCTGTTACATTAGCAGTTGGAAACTTGCCTTCACACACTCATAGTTTCTCTGCGACAACCTCTAGCTTTGACTACGGTACTAAAACCACTAACACTACTGGTGCTCATACTCACCAGTTCGGCGGTTATATCAACTCGTTCTATGGAGACTCCAGTCACACCTCATTTCAGCCTGGAGGTGGTGCGTGGACACAGGCCGCTGGCGACCATTCCCACTCTGTAGGTATTGGTGCTCACAGCCACACAGTTAGTGGTAACACTGGTAGTACAGGCTCTGGTTCGGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTACAAGTTAATGGCTTGGGTGAGAACTGCTTAA

Tertiary structure

PDB ID
7ce9f22a7b8323283a0ee3d36be3de9a38b9b4261141678595a11a10e506394b
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6953
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Salmonella phage assemble Han,H., Li,X., Wang,X., Zheng,S., Zhang,C., Zou,Y. and Zou,J. 2024 — GenBank