Protein

View in Explore
UniProt accession
A0A8S5M310 [UniProt]
Protein name
Head fiber protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
Protein sequence
MSMDFGKLNFAVGFNRTSAFPLDANSYFESYTDAVTAAAGAAVVGSSDSAYYIGQLIIVNESGKFGLYQIGADKTLVKFGQASSADDLKSQLDELKARVDGLDNSKADWFGGTAPVDKNGEIVTIGAAGSITASGIKIVNSAVNNSTTEVPTSKAVQTYVASQVASAVQYLGTVSALTGLSTTAGKGDFYRLSAAVAGGHAGDLVIAEKDNPAQLIDGTNWSLIHGEEVGVEAINAGDGIKVITTGEGSSEAQPTIAMKPATTTTIGGIIVGTNLTVDATGKLSAIDTTYEDATTTTHGLMSTADKSKLDGIAEGANKTIVDASLNATSTNPVENKAVHAEFNSVRTALADASSDLQSKIDNHTTLIGNKVDKVKGKGLSTNDYTTEEKNKLASLKNYILPIASVDELGGVLVHSLENPGGEVSTPKSTTNRDYGIKIDQDGNLWVTIPWTDTKYTLPVASEGALGGIKVGYSGTTAKTYAVKLDANNKAYVEVPWQNTTYTNGNGLTLTGTAFSLNVASSAMHGGIKLYNDKLNKEITPQAASEVNGRYYRIQLDNANRAFVNVPWTDTTYTLPTAKQDELGGIKLEYAPMTGTATINAETTTAGRFYAINVDKDGYAFVNVPWTDTKYTLPIATDQVLGGIKSGNKANNFVAGSAGEGQTGNVPNYEAEVVVNPTTGKATVNLEAMAGPETQWSIVAGQTVFGIRQVSTDKLVQGTNTLIINGGGAAW
Physico‐chemical
properties
protein length:730 AA
molecular weight: 76196,77390 Da
isoelectric point:4,90762
aromaticity:0,06986
hydropathy:-0,18301

Domains

Domains [InterPro]
Coil
85–105
Coil
A0A8S5M310
1 730
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Siphoviridae sp. ctOkv13
[NCBI] 		2826314 Uroviricota > Caudoviricetes >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
DAD76574.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
BK014805 [NCBI]
CDS location
range 7587 -> 9779
strand +
CDS
ATGTCAATGGATTTTGGTAAATTAAATTTTGCTGTTGGTTTCAATAGAACATCTGCTTTCCCTCTTGATGCGAACAGTTATTTTGAAAGTTATACAGATGCTGTTACCGCAGCCGCAGGTGCCGCAGTTGTAGGTAGCTCTGACAGTGCTTACTATATTGGTCAATTAATTATCGTTAATGAATCAGGTAAATTTGGTTTATATCAAATTGGTGCAGATAAAACATTAGTTAAATTTGGTCAAGCAAGCAGTGCAGATGATTTAAAATCTCAATTAGATGAATTAAAAGCAAGAGTTGACGGTTTAGACAACTCTAAAGCAGATTGGTTTGGAGGAACTGCTCCAGTCGATAAAAATGGAGAGATCGTTACTATCGGTGCTGCAGGAAGTATAACTGCATCTGGTATTAAAATTGTTAATTCAGCAGTTAATAATAGTACTACAGAAGTTCCAACTTCTAAGGCAGTTCAAACTTACGTTGCAAGTCAAGTTGCAAGTGCAGTTCAATATTTAGGCACAGTATCCGCTTTAACGGGTTTATCAACAACTGCAGGTAAAGGCGACTTTTATCGTTTAAGTGCAGCAGTTGCAGGTGGTCATGCAGGAGACTTAGTTATTGCAGAAAAAGATAATCCTGCTCAATTAATTGATGGTACAAACTGGTCTCTTATTCATGGTGAAGAAGTTGGTGTTGAAGCTATTAATGCCGGTGATGGTATTAAAGTTATTACTACTGGTGAAGGTAGTTCTGAAGCTCAACCTACTATCGCAATGAAACCGGCTACAACTACTACTATTGGTGGTATAATTGTAGGCACAAACTTAACAGTTGATGCAACTGGAAAACTTTCTGCAATAGATACTACTTATGAGGATGCTACTACAACTACTCATGGTTTAATGAGTACTGCAGATAAATCTAAATTAGACGGAATTGCAGAAGGCGCTAATAAAACTATCGTAGACGCTTCATTAAATGCTACTTCAACTAATCCAGTTGAAAATAAAGCAGTACATGCAGAATTTAATAGTGTTAGAACAGCATTAGCAGATGCATCAAGTGATTTACAAAGCAAAATTGATAATCATACAACTTTAATTGGAAATAAAGTAGATAAAGTTAAAGGAAAAGGATTATCTACTAACGATTATACAACTGAAGAAAAGAATAAATTAGCAAGCTTAAAGAATTATATTTTACCAATTGCAAGCGTTGATGAATTAGGTGGAGTTTTAGTTCATTCTTTAGAGAATCCTGGAGGAGAGGTATCTACTCCAAAATCAACGACTAATCGAGACTATGGTATAAAAATTGATCAAGACGGCAATTTATGGGTAACTATTCCTTGGACAGATACTAAATATACTTTACCAGTAGCTAGTGAAGGTGCTCTTGGTGGTATTAAAGTTGGTTATAGCGGAACTACAGCAAAAACTTATGCAGTAAAATTAGATGCAAATAATAAGGCATATGTAGAAGTTCCTTGGCAAAACACTACTTATACTAATGGTAACGGTTTAACTTTAACTGGAACTGCTTTCAGTTTGAATGTTGCAAGCAGTGCAATGCATGGTGGTATTAAACTTTATAATGACAAATTAAATAAAGAAATTACCCCTCAAGCAGCAAGTGAAGTAAATGGTAGATATTATAGAATTCAATTAGATAATGCAAATAGAGCATTTGTTAATGTTCCTTGGACAGATACTACTTATACTTTACCAACTGCAAAACAAGATGAACTAGGTGGTATTAAATTAGAATATGCACCTATGACAGGAACTGCAACTATTAATGCAGAAACTACTACTGCTGGACGTTTCTATGCAATTAATGTTGATAAAGATGGTTATGCATTTGTTAATGTTCCTTGGACAGATACTAAGTATACTTTACCTATTGCAACAGATCAAGTTCTTGGTGGTATCAAATCAGGAAATAAAGCTAATAACTTCGTAGCAGGCTCAGCCGGCGAAGGCCAAACAGGCAATGTTCCTAATTATGAAGCAGAAGTTGTAGTTAATCCTACTACTGGAAAAGCAACTGTTAACCTTGAAGCAATGGCTGGACCAGAAACACAATGGAGTATCGTAGCAGGTCAAACTGTTTTCGGAATTAGACAAGTATCAACAGATAAACTTGTACAAGGCACTAATACTTTAATTATTAATGGCGGCGGAGCTGCTTGGTAA

Tertiary structure

PDB ID
3f0b604e214f7e7009e1cab7488c74a06fec49954228e9a912f940896a99360c
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6176
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50