Protein

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Genbank accession
ADO98719.1 [GenBank]
Protein name
baseplate wedge initiator
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MATRIKLKRSTVAATVPTTSNLVDGEIALNIADKKLYARNGSNIIEVANQKPNTGEVVTTMLSTDITNGQGNTFYVASVGSNNDTLANGGDNGKHPDTPFLTITKALATATSGDTIIVAPGEYQEAFPMTVPDGITLRGTNLRSTSVKPTSITNDNNAFILSGDCHVSDLTIKDFYYNSGADEGYAFVVVSNMNSTKSPYVERVTVNTKGSVTSGSDPYGYAQGDAGRGAKLDGANLAGASLQSSVLFNECTFITPNQVGLKLTNGIRVEWLNCFNYFASIGIEGVQGATGRAGSGNTRLKFGGTSGTFSTSEVAYQLEDSFQSGTYARSGSTITLTRTAHGLVSNDYIYADHISGAGTDNFYQVTKVDNDTVTYTDSSASGTTSGNVTYKKAVARGVVSSNDGTYVFITGKGSGEFVTVTKSPKTLSRFGDSQLDTAQKKFGTASILLDGTEDNVKVPTSEDFGFGTANWCIEAFIRPGSVTGTQRIFDLRDGSATDTAPTMYLNGTALHYAVGNTSQINGGTLSTNTWYHVAVARSGGTTKLFLDGTELGTYTDSNDYGSTTPVVIGSDYQASPTEAFNGHVDEVRISKGAARFTAGFTPTTSEYSADNNTVLLLHANGTDGSTTFTDVSGGTSDIRSSGGDSATSVITADYSAFGAELRSVASACVYGQKGVQADGSGVKLILTAHNFGYVGSGQDFTNDPSLAVQNNEVVELNSGKVLYSSTDQDGDFRVGDAFSVDQETGNVSFQATSTAQAAANITLSDATGTTNIFPAYIETGNLRFAGNSMTSTTGQVIVDPSGEEDFVVNAETIVKEAVYFDVNKSISFGSVVQGALKIAGFGGSTVFGSSEASNFSTRSFVVLKNGLGGVNLTGAGTGYVGGQQPIEVSTNPFQGATATATLGSTGTLKAFTLSNRGSGYTVNPQVVLSGAGGGEATTQLGGAGDIRGVLIDQGGSGYTASVSAAIDAPPQNIFTGGGTYTDSNNASQPIVDTTANTIYIPDHTFETGMIATYDGTTGGGTVVGGLTHNTQYYIIRVDKDFIKVALNLTNANNGTAISFSGEGTETQFFIGATATMNVSQTGGVIDTVSVATAGSGYGSSAPAVTITDSSGTGASISAVVGYSVNTVDVGIVGSYTSAPSVSFTLGAGDTTGSGAAASATLGFAIASVTLDTQGLGYRNKPTLAIDGTPTNPAVIDVTLNEQEGRVGSLTVTDGGVGYETTPNLTFTGGGGENAQLTADIQSVIGSITSSGSGYTPGVYNQIAFTGGSPTNVATATFTIPGLTGAITAGSGYVDGTYTDVGLRSTPTATYTVTQATRDKLGISSVTGTFAVGNTVTGSVSNAQGTVTYVASDNTFLYITTNSGTFQDGGAENVTNGSGASATLDTVNTGSFRYFIDLGSGAQEAPSFTLLDDNTYRFDTSDSSNTGHPLEFGSAQNLFQRQYGTPGQAGSYYEVTLGAVSATTTSITYQCQTHGGGMAEDATVTIAAGAAGQGGNGMLATIVVASGAVTSVTVTTQGAGYAIGDTLLLDNADVGGSGSGFAYLLNANNTGVASVTNISLVGDGYNIGDVLSVDDSTVGGGGGSGFQYTVSNVGFCTAIAVTQEGNAFEQSDTLVLGPVGGPNVVQGSGLTVTIASINATKQLEMTQLGVLTLGPTGGTQLALQPDGQIQATIGAATTYSISASGNALFTTISGTTGTFSGVLSAQSTSTFTGLATFNGGITTAGATTLVQTTVKLADGAAGTPSLAFDNSTTTGLFLSSNNVIGVSIAGNAKFTLDDTLGLDAPQLQVDSTLGSSTPFFKVDPTNNNVLVGPSTNQLSLDNANTLKSVGSNVEIPLNFETKGGGDFVFKGGADKSFNITDGTSNVVSVDTATGTAQFSGNLDAGLLRVRQNVVANNSQTAARSFGQILAVSVTGSGSGYTDGTYTATATTSNGIGTGCTVTVTVSGGDFSAVTVVAKGQNYKVGDSILITAAGGGTGKSVTVTDIDGQGVVIKPTAGASVLCDTTGSLVIPAGTTNQRPVAEDRITGAIRFNSTQLQFEGFNGTDFVSLGGVRDVDQDTYILTEASPGSDEDTFEFYAAGVNNLSLNNTTLTFRQNMTATKYDGSMTATIDGGYTLNGTTFGINPYTVSNLGSSVFLVRSKNDIEVTGGLRLRNVPSQGVASSIDAATIVQTATAYTASQTFTAIATIAQIEGVGLTVDVTTNGAGTITSIAINAGGTGYENGETIQIAGTSLGGQTPANDVTFKLDAITSGSAAITRLDVLQQEYVTQLDAKPLINLDATGSEAGWKINRGWAAGTSSYLTVFDSTATFMELDDCRVEGGQLASFPSTASIVAFDKSQFKGSKTLVTIESDDNKVHMLEVTVVCASNGTTAHATVTNSLTSDNDLMDATVSVVGSNVTISLNKSSAATSSSNFTGRFTTTKVKA
Physico‐chemical
properties
protein length:2425 AA
molecular weight: 246960,53000 Da
isoelectric point:4,39527
aromaticity:0,07464
hydropathy:-0,04524

Domains

Domains [InterPro]
IPR011050
96–386
IPR011050 G3DSA:2.60.120.200
IPR013320
443–593
IPR013320
PF13385
450–593
PF13385
ADO98719.1
1 2425
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Eurybiavirus PHM1
[NCBI] 		3428631 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADO98719.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071101 [NCBI]
CDS location
range 70324 -> 77601
strand +
CDS
ATGGCAACGAGAATCAAGCTAAAGAGATCGACAGTAGCAGCGACAGTCCCGACGACTTCTAATTTAGTAGACGGTGAAATAGCTCTTAATATAGCGGATAAGAAATTATACGCTAGAAACGGATCAAATATAATAGAGGTCGCCAACCAGAAACCTAATACTGGTGAGGTGGTGACTACCATGCTGTCTACGGACATCACGAATGGTCAAGGAAATACTTTTTACGTTGCTTCAGTTGGTTCAAATAATGATACTCTTGCTAATGGTGGTGATAATGGTAAACATCCAGATACACCATTTCTAACAATTACAAAGGCACTGGCGACTGCTACATCAGGTGATACAATCATAGTTGCACCTGGCGAATATCAGGAAGCATTCCCAATGACAGTTCCTGATGGTATTACATTACGTGGAACTAATTTAAGATCTACATCTGTAAAACCAACATCTATTACAAACGATAATAACGCATTTATATTATCTGGAGACTGTCACGTTTCCGATTTAACAATTAAAGATTTTTACTACAACAGTGGTGCTGACGAAGGATATGCATTTGTTGTAGTCTCAAATATGAACTCTACAAAGAGTCCATATGTCGAAAGAGTTACAGTCAATACAAAAGGTAGTGTTACATCTGGTTCAGATCCATATGGATATGCACAAGGAGACGCAGGACGTGGTGCTAAGTTAGATGGTGCTAATCTTGCAGGAGCATCCTTACAGTCTTCTGTATTATTCAATGAGTGCACATTCATTACACCTAATCAGGTTGGTCTAAAACTTACCAATGGTATACGTGTAGAGTGGTTAAATTGCTTCAATTATTTTGCATCTATTGGTATAGAAGGTGTTCAAGGTGCTACTGGTAGAGCTGGATCGGGTAATACAAGATTAAAATTTGGTGGAACATCAGGAACATTCTCTACATCAGAGGTTGCATATCAATTAGAGGATAGTTTCCAGTCAGGAACTTATGCTAGATCTGGTTCTACAATAACTCTGACAAGAACTGCACATGGTTTAGTATCTAACGACTACATCTATGCAGATCATATTAGTGGTGCAGGAACTGATAATTTTTATCAGGTCACAAAGGTAGACAATGACACAGTTACATACACTGATAGTTCTGCATCTGGAACCACATCTGGTAATGTTACTTACAAAAAGGCAGTTGCACGTGGTGTAGTCTCAAGTAATGATGGAACATATGTATTCATTACTGGTAAAGGAAGTGGTGAGTTCGTAACTGTAACTAAATCTCCTAAGACTTTAAGTAGATTTGGTGACTCGCAGTTAGATACAGCACAAAAGAAATTTGGAACAGCATCTATATTATTAGACGGAACAGAAGATAACGTAAAGGTTCCTACATCCGAAGACTTTGGATTTGGTACAGCAAACTGGTGTATAGAAGCATTCATAAGACCTGGTAGTGTAACAGGCACACAAAGAATCTTTGACCTTAGAGATGGTTCTGCTACAGATACAGCACCTACAATGTATCTTAATGGAACTGCATTACATTACGCAGTAGGAAATACATCACAGATAAACGGTGGAACATTATCAACTAACACTTGGTATCACGTTGCAGTAGCAAGAAGTGGAGGAACCACAAAATTATTCTTGGACGGAACTGAGTTAGGAACATATACAGATAGTAATGACTATGGATCTACAACTCCTGTTGTTATAGGTTCTGACTATCAGGCATCTCCAACAGAGGCATTTAATGGACATGTTGATGAAGTAAGAATTAGTAAAGGTGCTGCTCGTTTTACTGCAGGATTTACCCCTACAACAAGCGAATACTCAGCAGATAACAATACAGTGCTATTACTCCATGCGAATGGCACAGACGGTTCTACGACCTTTACAGACGTCTCTGGTGGAACATCTGATATTAGATCTAGCGGTGGTGATTCTGCTACATCTGTTATCACTGCTGACTACTCAGCGTTTGGTGCTGAATTACGTTCTGTGGCATCTGCATGTGTATACGGACAGAAAGGTGTTCAAGCAGATGGTTCTGGTGTAAAACTTATACTTACTGCACACAACTTTGGTTATGTTGGATCTGGTCAAGACTTTACTAATGACCCATCTCTTGCTGTTCAAAATAATGAGGTAGTAGAACTCAATAGTGGTAAGGTATTATATTCTTCTACAGACCAAGATGGTGATTTTAGAGTTGGTGATGCATTTTCTGTAGACCAAGAGACTGGTAACGTATCTTTCCAAGCAACATCAACAGCTCAGGCAGCAGCAAACATTACATTGAGCGATGCTACTGGAACAACTAATATTTTCCCTGCATACATTGAAACAGGTAACTTAAGATTTGCGGGTAACAGCATGACCTCTACCACAGGTCAGGTAATCGTTGACCCCTCTGGTGAAGAAGACTTTGTTGTTAACGCTGAAACAATCGTTAAAGAAGCAGTTTATTTTGATGTCAATAAGTCAATATCATTTGGTAGTGTTGTTCAAGGTGCTCTAAAAATTGCAGGATTTGGTGGATCTACAGTATTTGGATCATCAGAAGCATCTAACTTCTCTACAAGATCATTTGTTGTTCTTAAAAATGGTTTAGGAGGTGTCAATTTAACTGGTGCAGGAACAGGATATGTTGGTGGACAGCAACCAATAGAAGTTTCAACAAACCCATTCCAAGGTGCAACTGCGACTGCAACTCTTGGTTCAACTGGAACGTTAAAAGCATTTACATTATCAAACAGAGGAAGTGGTTATACTGTAAACCCACAAGTAGTTCTTAGTGGAGCTGGTGGTGGTGAAGCAACAACTCAGTTAGGTGGTGCAGGAGATATACGTGGTGTTCTAATTGATCAAGGTGGATCAGGATATACAGCATCTGTTTCAGCAGCTATAGATGCACCTCCTCAGAATATTTTTACTGGTGGTGGCACATACACAGACTCCAATAACGCTTCTCAACCTATTGTTGATACAACTGCAAACACAATTTACATTCCAGATCATACCTTTGAGACAGGAATGATAGCAACTTATGATGGAACAACTGGCGGTGGAACAGTCGTCGGTGGTCTTACTCATAACACTCAGTATTATATAATTCGTGTTGATAAAGATTTTATTAAAGTTGCATTAAACTTAACTAATGCTAATAATGGAACAGCAATATCATTCTCAGGAGAAGGAACTGAAACACAATTTTTCATAGGTGCAACAGCAACAATGAACGTTTCTCAAACTGGTGGTGTTATTGATACTGTTTCAGTTGCTACCGCAGGATCTGGATATGGTTCAAGTGCACCCGCAGTTACTATTACTGACTCTTCGGGAACTGGTGCAAGCATATCAGCTGTGGTTGGATATTCAGTTAACACTGTTGATGTAGGTATTGTAGGATCATATACATCTGCACCTAGTGTGTCATTTACTCTTGGAGCTGGAGATACAACTGGATCAGGTGCTGCTGCAAGTGCAACTCTTGGATTTGCTATTGCATCTGTTACTTTAGACACTCAAGGTTTAGGTTATAGAAACAAACCAACATTAGCTATTGATGGAACTCCAACAAACCCTGCTGTTATTGACGTAACATTAAATGAGCAAGAAGGTAGAGTAGGATCATTAACAGTTACTGACGGTGGAGTGGGATATGAGACAACTCCAAACCTAACATTTACAGGTGGTGGTGGTGAAAATGCCCAACTTACAGCAGATATACAATCTGTTATAGGTAGTATTACATCAAGTGGATCTGGATATACACCTGGCGTATATAATCAAATTGCATTTACAGGTGGATCTCCAACAAACGTTGCTACTGCTACGTTTACAATTCCTGGTCTTACTGGTGCGATTACTGCAGGATCTGGTTATGTAGACGGAACTTACACTGACGTTGGACTTAGAAGCACTCCAACTGCAACATATACTGTAACACAAGCAACAAGAGATAAATTAGGAATTTCTAGTGTCACTGGAACATTTGCAGTAGGTAATACTGTTACTGGTTCTGTTTCTAATGCACAGGGAACAGTTACTTATGTTGCAAGTGATAATACATTTTTATACATCACTACTAACTCTGGAACATTCCAAGATGGTGGAGCAGAAAATGTAACAAATGGTTCTGGTGCATCTGCTACCCTAGACACTGTAAATACAGGATCATTCAGATATTTCATTGATCTAGGATCTGGTGCTCAAGAAGCACCTAGTTTTACATTACTAGACGATAACACATATAGATTTGATACTAGTGACTCTAGTAACACTGGTCACCCCTTAGAATTTGGATCAGCTCAAAATTTATTTCAGAGACAATATGGAACACCTGGTCAAGCAGGATCTTATTATGAAGTAACTCTTGGTGCAGTATCTGCTACTACCACATCTATTACATACCAATGCCAAACACACGGTGGCGGTATGGCAGAAGACGCTACTGTCACGATTGCTGCAGGAGCTGCAGGACAAGGTGGTAATGGAATGTTGGCAACGATTGTTGTAGCAAGTGGAGCAGTTACCAGTGTAACAGTTACCACACAGGGAGCTGGATATGCTATTGGTGATACATTACTATTAGATAATGCTGACGTTGGTGGATCTGGATCTGGTTTTGCATATCTACTAAACGCTAACAACACAGGTGTCGCCTCTGTTACAAACATATCTCTAGTGGGAGATGGTTATAATATTGGTGATGTTCTTTCTGTAGACGACTCTACAGTTGGTGGTGGAGGTGGATCTGGTTTCCAATATACAGTATCTAACGTAGGTTTCTGTACAGCGATAGCGGTAACTCAAGAAGGTAATGCATTTGAACAATCAGATACTTTAGTATTAGGACCTGTCGGAGGTCCTAACGTTGTTCAAGGAAGTGGTTTAACAGTAACCATTGCGTCTATCAATGCTACTAAACAGTTAGAGATGACTCAGTTAGGTGTTCTAACTTTAGGACCTACTGGAGGAACTCAACTAGCATTACAACCTGATGGACA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Tertiary structure

PDB ID
5d3faa048ef54861fac67aea2ecfd475702fe9d9221a55ca09e228f1f9b54ed2
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6569
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Cyanophage M4-247 Henn,M.R., Sullivan,M.S., Osburne,M.S., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Erlich,R., Young,S.K., Koehrsen,M., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Borenstein,D., Chen,Z., Engels,R., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heiman,D., Hepburn,T., Howarth,C., Jen,D., Larson,L., Lewis,B., Mehta,T., Park,D., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., Walk,T., White,J., Yu,Q., Coleman,M.L., Huang,K.H., Weigele,P.R., DeFrancesco,A.S., Kern,S.E., Thompson,L.R., Fu,R., Hombeck,B., Chisholm,S.W., Haas,B., Nusbaum,C., Galagan,J. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank