Protein

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Genbank accession
QHR74191.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHIRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITMGDVLKAFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYSRLAANNTFRGTQNILSDNETIIVKNITQGMPLYIRGQDADGTNRWYLGNDNKGTDNLVLKNVKSGAYVAILGSLITVNKSIQITGQVQPSDWSNLDTRYFTQTAANQRFAQLVGNNTFRGINNFVGEFNITRDNAVLVVKNATAATGLYLLGQKADGTNKFYLGTDDSDSVVNLHNYITSTTISLSNVITTTKTVKITGQVQPSDWTNIDSRYISAGTLSNLAKLSDVNTFRIAQIINQNGSLLQLKNTTQDKELYFAGHNADGVRRWYIGNGEPSNPERFIIHNDRTATTIYMQDDFLLNKTVKITGQVQPSDWSNLDARYFTQAAANQRFMYAGSTGEATEQNADGVAWNAKTGLYNVTSTNADYTALVFQMYQGVTSSTACAQLKFQYKNGGMWYRTSVASKGFEAKWSKVYTEAQKPTPSELGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKNTNTTGAHAHSVSGSTSSAGNHNHSISWIGQNSKHYSGGGGGSIGVGPGYTDANGAHTHSVSGTAASAGNHAHSVGIGAHTHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:784 AA
molecular weight: 84659,76570 Da
isoelectric point:8,74999
aromaticity:0,08801
hydropathy:-0,40179

Domains

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage bumzen
[NCBI] 		2696388 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QHR74191.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN850635.1 [NCBI]
CDS location
range 27945 -> 30299
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATTGATACAATTCGTTCAGACGACCTCCTTCATATCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCGTCTTTTAAACTAGAAAGATTTGTCCAGATTGCTGGTAGCACTATGACGGGTGACTTAGGAATTGTCAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTATTTGACCCTACAGGTTCTTCTGAGATTACTATGGGGGATGTTTTAAAGGCTTTTAAAATCAATGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCTGCAACTGTTTATCATACTCTTAATAAGCCAAGTCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATACTCAAGATTGGCTGCAAATAACACCTTTAGAGGTACTCAAAATATTCTATCTGATAATGAAACTATTATTGTTAAGAATATTACACAAGGAATGCCGCTGTATATTCGCGGTCAAGATGCAGATGGTACTAACAGGTGGTATCTAGGTAATGATAACAAAGGTACAGACAATCTTGTTTTAAAAAATGTTAAATCTGGTGCATATGTAGCTATTTTGGGTAGCTTAATCACTGTGAACAAATCTATCCAGATTACTGGTCAAGTTCAACCTTCTGATTGGTCTAACTTAGATACTAGATACTTTACTCAGACAGCAGCTAATCAGAGATTTGCACAGCTAGTTGGTAATAACACCTTCAGGGGTATTAACAATTTTGTAGGAGAGTTCAATATCACCAGAGATAACGCTGTGCTAGTCGTTAAGAATGCCACTGCTGCAACTGGACTGTACTTGCTGGGGCAGAAGGCTGATGGGACAAACAAGTTCTACTTAGGGACTGATGACTCTGATTCTGTAGTTAATCTACATAACTACATCACAAGCACAACCATCTCTTTGTCAAATGTGATTACCACTACTAAGACTGTGAAAATCACTGGACAAGTTCAACCTTCAGATTGGACTAACATTGACTCTAGATACATCTCAGCAGGAACTTTGAGTAATCTTGCTAAGTTAAGTGATGTAAACACTTTTAGGATTGCACAGATTATTAATCAGAATGGTTCATTGTTACAGCTAAAGAATACTACACAAGACAAAGAGCTATACTTTGCTGGTCATAATGCTGATGGTGTTAGAAGGTGGTACATTGGGAATGGGGAACCATCCAACCCAGAAAGATTTATTATCCATAACGACAGAACTGCAACTACGATTTATATGCAAGATGATTTCTTGCTGAATAAAACTGTTAAAATTACTGGTCAAGTTCAACCATCTGATTGGTCTAACTTAGATGCTAGATACTTCACTCAGGCAGCAGCTAATCAGAGATTTATGTATGCAGGTTCTACAGGAGAAGCTACAGAGCAGAATGCAGATGGTGTGGCATGGAACGCTAAAACAGGCTTATATAATGTAACCTCAACAAATGCTGATTACACAGCACTTGTGTTTCAAATGTATCAGGGGGTGACCTCTTCTACTGCCTGTGCGCAATTAAAGTTCCAGTATAAAAACGGTGGAATGTGGTACAGAACATCTGTAGCTAGTAAAGGTTTTGAAGCTAAGTGGTCTAAGGTTTACACAGAGGCTCAGAAACCAACCCCTTCAGAGCTTGGTGCATACACTAAAGCAGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGACTCTACAGACCTTAATAAAATCTACCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTGCCTGGTCTAACTTGGACGTACCTTAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCAGAATTGCAGCAGCAAACGGTTCAGATGTTGCTACAACAGGTGGTTCAGACTCTGTGACGTTAGCTGTTGGTAACTTACCATCACACACTCACAGTTTTTCTGCTACCACTTCATCTTTTGACTACGGAACAAAAAACACTAACACGACTGGTGCTCACGCTCACTCTGTAAGTGGCTCTACTTCATCTGCTGGTAACCACAACCATTCCATTTCGTGGATTGGTCAGAACTCTAAACACTACTCTGGTGGTGGTGGTGGTAGTATTGGTGTAGGACCGGGTTACACCGATGCTAACGGTGCTCACACCCACTCTGTAAGTGGTACTGCCGCTTCTGCTGGTAACCATGCTCACAGTGTAGGTATCGGTGCTCACACCCATACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTACAAGTTAATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA

Tertiary structure

PDB ID
cdbab6ec7ef7ddf20023e0e3da6e677c219aff5a69bbb9bed5a364e32ca24fae
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6913
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment Olsen,N.S., Forero-Junco,L., Kot,W. and Hansen,L.H. 2020 — GenBank