Protein

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Genbank accession
YP_010355640.1 [GenBank]
Protein name
short tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MPLTRLDNLISSKTGKYLYVSPDDFNATDALSNRGNSPVTPFKSIQRAFLEIARYSYLPGFGNDRFDQFSIMLMPGIHYIDNRPGLVDTSGIDTFGFDQANNEWTDNSILDISNPDNVLYKFNNTEGGAIIPRGSSLVGYDLRRTVVRPLYVPDPASVTVPRSAIFNVTGGCYFWQFTLKDGQTTAESPLYNSLEGTGEVYYDPNDFTRKTAPNYSHHKLTVFEYADTEELGLFYRKIAKSFSDYQPTIDDPGEFDFRIQENRIVGPLSDSRVIESLTLNDATTIPSIAASTSEIEVTTKVDHGYFAGQFVAISNTDIDSVLEGIFPIIRIDQNDPRKFTYEVAEVVSAIGTGIAAGQTVSVDTTPALGQNAQTLAEVDSVESASPYVFNVSIRSTWGICGIWANGLKATGFKSMVIAQYTGVSLQKDDRAFIRYDEYSNTWNQASLTDAFATVPYHAKGDSYWKDDWRTFHVKASEDAFIQNVSIFAVGFADHFLMESGGDMSITNSNSNFGNTSLHAIGFKGFAFNQDKGGFLTDIIPPKQVETGSANFKRTQYYTIDIQGTIQSKTNFTRLYLGSEDITEPINRPAVTIGGYRLGAKSGERLYVKLDPLTAGGTEEFNAALEPTGFVKYIAAPSILNPSGFSINSTYADAANLIESNRRMIQEEVFGYILEKYPRLQNISYVNPGRDPQANRYFDARNLIVNNRQEIINETLASLSAYSPTASISTVDIGEMVDAVAEDLRDGGNYNTITLIQTYFAGDGSLSKYNGQQEELLWAFNRARDLCKQAIANLLSVKADLYDPSGTLPDLSLKTNNPCGPVTNGKTGSQAEIDGDTTDGVTIDLSNKDAKRYKTTYNLIQSNKDYVLDNSLAEISTYDTSPFFTFPGDPAESATSRFKTAYRFIRRNKADAQAYAVGQIQTLYPTFTFPGNSSAKCSRDLGFFIDAIGMDIFLGGNAWTRAFITKYFDNSGNWVVGGLQGEELQSVAGFNAVRDYLQDAISNQLSSGYQDLTVSEGEAIYGDGNGDISNIDSNACSDVQNALGSLTSIATQVIGDGNILSLTDPGNANYVTPTVRTLTAGEIKCRRDIGHIVDAVQQDLWFGGNAYSIAAAKAYFNRFGLPISNGLVSEEAEGIVAFKRAADAINLAINNQLYYWDQTITLDTTGDPAIVSDMNADAYNLVLKNKEYIAEEAYLRMQAAYPGYVPQATNTKQDCLDDVYSILEEVMYDVKFGGNAKTYDSAEIYTTNVMPYFGPSKRRKDFTPTTVSYDPATGLSVFTIPGHDMTQGGYIKVDTNGVVFTCSMDGNQTQHASPSADDPYAGQWMQITAADASTITVNVGASQANQFWTPTNAVYNSTTGDMEITIGNHSLSVTEGIVLADNSFTFTCDQDGNVEQKTYPRPGQDPWAGKSIAITAVSATTITVNVGDAGSAAGVPHTFITAATDAVKHLPQSAHTFVSAATDCIHYGIAAATFIDPERDEAAEVFTQVKNLVPSIIRNQVINSSPSNSEVQYVDSTVTTDWDSPTCVSVISATQSNLDTIIQAIGTDNGGVGDISGITRTAPVQPQNLIQNGVNQGYTAGNCSDVVSSVNTLISIVCDAISAGSLTTLPTLNNGEWDCANVRSTIETLFDIANDAFVLSSLSELPVLNRGSFTTDASVSKCFRDVSYIVDAVVSDLRLGGNINSVQAGEAYYVGNQLEYIDGEKTETIDAWNYVGQMATAAMRNFDVLAFNCSTTAGSAIVNINDTRGILIGMTVAEYDNTDVVNPAYVNGLLQSGSTQVSSTIPLNTYVKRIVSGTQIELGVANSRLDSGSTITALQTSSSVDLYFDLPNGQWANTLPKTDPSVIQDTLTSPTQRECAGTADAIETLVGNITTIINSGLGSVDRQEQTASISAFASRATVFTINTSGVGASNPHNFETGTPVRLVPRPRFDVAKGQYVDVDKRLVRLPNGFETNKTYYVIAPGRRTQPEDYSTTTFFNGSDQTKLMLSTSRENAAAGIYIYSSESESIDANVEIDIYQFILDEKYDLHNYKTKLTNSINAGIQTDVSHIFDTPFASVTPQKVFFRDLDGGRIPLVSTTYASDADVAIQNSQDSNFGRIDPTKEFYARYQNDSVITIHKTHADAINNVNPITFTSGQTQTFQVFSNKRRAPFAYDPAFSNGIITTGKWFVRCVDESSSTDNIFFRIQQSDYGDRPRSTDMWFTRLEDDRGADDRTYKLRYVIPKYLENARDPINGFVIKTRTDDTRKLVPQKVVLKPVAGTVYGARFENKRNPGEFIGFTQTEYDAQSLTLGDSYDPYKKVTGSGLEYRMFAKFSSGIQATIQSGRYVEDTLDPNIKYLELTLFDHGIDTLNFSGLRNESFTTVKISAPQGGEWVVNKTASVSANQVQWTGNSSGLANIHAYYTVGGQHYLIIKNVRGGKLEFSEYYNTRFEQGSTFADMLEDQDMGKSLPLKTLIAKNYPQYFYKQNGSNVYTITPGDRIQDDAGIEYYVDSVEDAGVIEDTFYVFSYETLQRRIAGQQDGIYYLSCLRGNISPFPTGAGVAENFKKFKFSQPVSSLYPLDYKNDPLWFQKNGTTAEELNVASQLLDPPPTFSAADNYTQGLVTTNDFKNSVTRELVEDLIDQPAFNENNYIAKAIEAQVGNATSGSEDRKIPIAGDSTVLTDQRYYVELRRPSIARAGNHTFEYLGFGPGNYSTGLPARQEIVLSPDEDFYAQSKKEDGGIVFYTGLNSNGDLYIGNRKINAITGEETFLERATLQSSADDDEDIGNLVTSFDTPVTFNQNITVVGGDGSQQNVFQSPLIISVQDNDLTEVRDALIIRSNVSSVDPVTGDEQDESLDRTNFAPPTLGDIRISKNRIQAAVFGFNARGKGQAYEFKTHITNGVPSNISPNNSNLVAQNGNRLISNQFVDFGGVAAKAGDVLFKGKEIGKTGSLGWVFSNYFTQIPNNNIFTIEFDGTNVVKLTFKDNLGVDIPNSAIGITSGSQIRLNDYIDSRLTNVWTVFSPNGDAFDLTNNYVHFQVNDNITIETLSWNGSGGVLSSAPAGTNPSVDFSNSSWKEQGVIGAETLRTETENIGDYKLGVNTIARSDHAASQNAFISNETEPRANLDVVGNTFISGKKILSYLTETSIIHVETNQDNAFLVGGDSANPSDISTLRVMTTNSGRLGVNTAVNDTVNPINNLDRNFVVIGDSRFSDDANFQADIEVNGGDITTTNNAFNFINSNAQILNFAGDGQILNLMNNQTVDQSIAIGNSTTRQTILVGEATQTGTLKIHRNTDDATVDIATVSNNATSECKITLGGAWATQADATSYTKIGTFYTGVAGNLEIGTGWGAGTSESRLYAQTRVVNLFDGDQTNTVNLATNATTFTLGSTGGTTFIRNTLNVLASTIVEGNIRLDGGLNAGIIKVGRGKFGTTIVPHLIGGVENPNIDFYKYETTGKVIDTAGVSQWGSTSFLVAGGQIASVDTITNNGANNRTPGTYSFLSATSSGAGSGSTFTIIVRFDYTIDLSIESPGEGYADNEILTITDAQLGGGGGGDLTFQVNGTNSAGTSYYLPISQPVVGDFQVGDLLFLDRANTASPDSIGTGANVITGLRDEAKSEILRIIGIANIANPSDPNGYRLIVSRGAEGTGTYTDHPDGCVIAKFTKQGNASYITGSDLDDNGELDDPLTGIGAATGDVNIGVAEFGGTISLLDYIRLSSSEFVSIVELISTSPQSLIVNDGGNPAADVFKVESTTGDTYIFGDIFAGVGFNKFTVDSGTGNTITQGSLTTNNTITLRGSTFAAIKGNPNYIEPGELGGPLPYGDSQLFKLTPQGNTEFLTLSNGGRDGVVEAVTFQVDTATGSIYSTGDLEFYGTDITGVADLSEPRLIFNNSSGDFTTYGSLSALGTGTSTFGGPVIVGGDLTVNGGDLTVNSNGTTIFDVANDGAVTVAGISDYFSQTGGRKWVYTASSVVECDANVNYFINCTGNTLVKLPPNPLMGDMVRIIDIGGALTYNISMVVRADNGNGIQGETSNTGTAMLTGISPSELANYNAGELVVQTPRASFGLVYAGTTSAAGGPGAPTSLKGWYLMDV
Physico‐chemical
properties
protein length:4075 AA
molecular weight: 440118,02790 Da
isoelectric point:4,52708
aromaticity:0,09620
hydropathy:-0,25337

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014e
[NCBI] 		1493510 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010355640.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_062736.1 [NCBI]
CDS location
range 19130 -> 31357
strand +
CDS
ATGCCATTAACACGTCTGGATAACCTTATCAGCAGCAAAACTGGTAAGTATCTTTATGTTTCTCCTGATGATTTCAACGCTACAGATGCGTTATCTAATAGAGGTAACTCACCCGTAACACCATTCAAGAGCATCCAACGTGCTTTTCTAGAGATTGCAAGATATTCGTATCTTCCTGGATTTGGTAATGACAGGTTTGACCAGTTCAGCATTATGCTGATGCCTGGTATTCACTACATTGATAACCGTCCTGGTCTTGTAGATACTAGTGGTATTGATACATTTGGTTTCGATCAAGCAAATAATGAGTGGACTGATAATTCCATTCTTGATATCTCTAATCCTGATAACGTTCTTTATAAGTTTAACAACACTGAGGGTGGTGCTATCATCCCTAGAGGTTCATCTCTTGTAGGTTATGACCTCCGCCGTACAGTTGTTCGTCCTCTATACGTTCCCGATCCTGCTTCTGTAACTGTTCCTCGTTCCGCTATCTTTAACGTAACAGGTGGTTGCTACTTCTGGCAGTTTACTTTGAAGGATGGTCAGACTACTGCAGAATCTCCTTTATATAATTCATTGGAAGGAACTGGTGAAGTATACTACGATCCCAATGATTTTACTAGAAAGACTGCTCCCAACTATTCTCACCACAAACTAACTGTATTTGAATATGCAGATACAGAGGAACTAGGTCTATTCTACAGAAAGATTGCTAAAAGTTTCTCTGATTATCAACCAACAATTGATGATCCTGGCGAATTTGATTTTAGAATTCAGGAGAACCGAATTGTTGGACCTCTATCTGACTCTAGAGTTATTGAGTCATTAACACTTAACGATGCTACAACTATTCCTAGTATTGCTGCATCTACATCTGAGATTGAAGTAACAACTAAGGTAGACCACGGATATTTTGCTGGTCAGTTTGTTGCTATCTCAAACACTGATATTGATAGTGTTCTCGAAGGTATCTTTCCTATCATTAGGATCGATCAAAATGACCCACGTAAGTTTACTTACGAAGTTGCTGAAGTTGTTAGCGCAATTGGTACAGGTATTGCTGCTGGTCAAACTGTTAGTGTTGATACTACACCAGCACTCGGTCAGAACGCTCAGACACTCGCTGAAGTTGATAGTGTAGAGTCTGCCTCTCCATATGTCTTTAACGTATCGATCCGCTCTACGTGGGGTATTTGTGGCATCTGGGCAAACGGTCTGAAGGCGACTGGATTCAAATCCATGGTCATAGCTCAATATACGGGCGTTTCGCTTCAGAAAGATGACAGAGCATTCATCCGTTATGATGAGTATTCTAACACCTGGAACCAAGCATCACTAACTGATGCGTTTGCGACTGTTCCTTATCACGCTAAGGGCGATTCTTATTGGAAGGATGACTGGAGAACCTTCCACGTTAAAGCATCAGAAGATGCATTCATCCAGAACGTTTCTATCTTCGCTGTTGGTTTCGCTGATCACTTCCTAATGGAAAGTGGTGGTGATATGTCCATCACGAACTCAAACTCCAACTTTGGTAATACATCACTTCATGCTATTGGTTTCAAAGGTTTCGCCTTTAACCAAGACAAAGGTGGTTTCCTTACTGACATCATTCCACCTAAGCAAGTTGAAACTGGTTCTGCAAACTTTAAGAGAACTCAATATTACACTATTGATATTCAAGGAACTATTCAAAGTAAAACCAACTTTACTAGGTTGTATCTTGGTAGTGAAGACATTACCGAACCAATTAACCGTCCTGCTGTAACAATTGGTGGTTATAGACTTGGTGCAAAATCTGGTGAAAGACTATATGTTAAACTAGATCCATTGACTGCAGGTGGTACAGAAGAGTTTAATGCTGCTCTAGAACCAACAGGTTTTGTTAAGTATATTGCTGCTCCTTCTATTCTTAATCCATCCGGATTCTCAATCAATAGCACTTATGCTGATGCTGCTAACCTGATTGAAAGCAACCGTCGCATGATTCAGGAGGAAGTATTTGGATATATTCTAGAGAAGTATCCAAGACTACAGAACATTTCTTATGTTAATCCTGGTCGCGATCCTCAGGCAAACAGATACTTTGATGCTCGTAATTTAATTGTTAATAATAGACAAGAAATTATTAATGAAACTCTTGCTTCTTTAAGTGCTTATAGTCCCACTGCTTCTATTTCTACTGTAGACATCGGTGAGATGGTTGATGCAGTTGCAGAAGACCTTAGAGATGGTGGAAACTACAATACTATCACATTAATTCAAACATACTTTGCTGGAGATGGATCTCTTTCTAAGTATAATGGACAACAGGAAGAACTTCTCTGGGCGTTTAATAGAGCTCGCGACCTTTGTAAGCAAGCAATTGCAAACTTATTAAGTGTCAAGGCAGATTTGTATGATCCAAGTGGAACACTACCTGATCTATCACTTAAAACTAATAACCCATGTGGTCCTGTTACAAATGGTAAGACAGGTTCTCAAGCAGAAATAGATGGTGATACAACAGATGGTGTTACTATTGATCTTTCTAATAAAGATGCCAAGAGATATAAGACCACTTATAATTTGATTCAATCAAACAAAGATTATGTTCTTGACAACTCATTAGCAGAGATTTCTACTTATGATACGTCTCCATTCTTTACGTTCCCTGGTGATCCTGCAGAGTCTGCTACTTCTAGATTTAAGACTGCATACAGATTTATCCGTCGTAATAAAGCAGATGCACAAGCATATGCTGTCGGACAAATTCAAACATTGTATCCAACATTTACATTCCCAGGTAATAGCAGTGCCAAGTGTAGTAGAGACTTAGGTTTCTTTATTGATGCTATTGGAATGGATATTTTCCTTGGTGGCAATGCTTGGACTAGAGCATTTATTACCAAGTATTTTGATAATTCTGGCAATTGGGTAGTAGGTGGTCTTCAAGGTGAAGAACTTCAAAGTGTTGCTGGTTTCAATGCTGTCAGAGATTATTTGCAAGATGCTATTTCTAACCAACTATCATCTGGTTATCAAGATTTAACTGTAAGTGAAGGTGAAGCTATCTATGGGGACGGCAACGGAGATATTTCAAATATAGATTCAAATGCTTGTAGTGATGTTCAAAATGCTCTCGGATCTTTAACATCCATTGCGACTCAGGTTATTGGTGATGGTAATATATTAAGTCTTACAGATCCTGGTAATGCAAACTATGTAACTCCAACAGTTAGGACTCTTACTGCTGGTGAAATTAAATGCCGTAGAGATATCGGACATATTGTTGATGCTGTACAGCAAGATCTTTGGTTTGGTGGCAATGCTTACTCTATTGCTGCTGCCAAAGCATACTTCAATAGATTTGGTCTGCCAATTTCTAATGGTTTGGTTAGTGAAGAAGCTGAGGGTATCGTTGCTTTCAAACGTGCCGCTGATGCTATCAACCTAGCAATTAATAACCAACTATACTATTGGGACCAGACTATCACTCTTGATACTACTGGTGATCCTGCAATTGTATCTGATATGAATGCAGATGCATACAACCTTGTTCTTAAGAACAAGGAATATATTGCAGAAGAAGCATATCTTCGTATGCAAGCAGCATATCCTGGATACGTTCCTCAAGCAACAAACACTAAGCAAGACTGTCTAGATGATGTTTACAGTATCTTAGAAGAAGTCATGTATGACGTTAAGTTTGGTGGAAACGCTAAAACTTATGACTCTGCAGAGATTTACACTACCAATGTAATGCCTTACTTTGGTCCTAGTAAGAGAAGAAAGGATTTTACTCCTACAACTGTATCATATGATCCAGCAACTGGACTGTCTGTATTCACTATTCCTGGTCATGATATGACACAGGGTGGATACATTAAAGTTGATACTAATGGTGTCGTCTTTACATGTTCTATGGATGGCAACCAGACACAACATGCATCACCAAGTGCTGACGATCCTTATGCTGGTCAGTGGATGCAGATTACTGCAGCTGATGCATCAACCATTACAGTCAATGTTGGCGCATCTCAAGCAAACCAGTTCTGGACTCCAACCAACGCAGTATATAACTCCACGACAGGTGATATGGAAATCACCATCGGTAATCATTCGTTGAGTGTTACTGAGGGTATTGTTCTTGCTGACAATTCATTCACATTTACATGTGATCAAGACGGTAATGTAGAGCAAAAAACTTATCCACGTCCTGGTCAAGATCCTTGGGCAGGTAAGTCTATTGCAATCACTGCTGTCAGTGCCACCACGATCACCGTCAACGTTGGTGATGCAGGATCTGCTGCTGGTGTGCCACATACATTTATTACCGCTGCTACAGACGCTGTTAAGCATCTCCCACAATCAGCACATACATTTGTATCTGCAGCAACAGATTGCATTCACTATGGTATTGCTGCAGCAACCTTTATTGATCCTGAGCGTGATGAAGCGGCAGAAGTCTTCACTCAAGTTAAAAACCTTGTTCCTTCTATTATTAGAAATCAGGTAATCAATAGTAGTCCTAGTAATTCGGAAGTTCAGTATGTTGACAGCACTGTCACTACTGACTGGGATTCTCCTACATGTGTATCTGTTATTAGTGCAACACAATCTAACCTTGATACTATTATCCAAGCAATTGGAACAGATAATGGTGGTGTTGGTGATATTAGTGGTATTACTAGAACTGCTCCAGTTCAACCACAAAACCTGATTCAAAATGGTGTAAACCAAGGATACACTGCAGGCAATTGTTCTGATGTTGTTTCCAGTGTTAATACACTTATTAGTATTGTTTGTGATGCTATCAGCGCAGGATCTTTAACCACACTACCAACTCTAAACAATGGTGAGTGGGATTGTGCTAACGTGCGTTCTACTATTGAAACTTTGTTTGATATTGCAAATGATGCGTTTGTGCTATCCAGTCTATCTGAACTTCCTGTTCTTAATCGTGGTTCATTCACTACTGATGCATCAGTATCTAAGTGTTTCCGTGATGTATCTTA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Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank