Protein
View in Explore- Genbank accession
- YP_011891986.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MTDKLIRELLIDVKQKGATRTAKSIENVSDALENAAAASELTNEQLGKMPRTLYSIERAADRAAKSLTKMQASRGMAGITKSIDGIGDKLDYLAIQLIEVTDKLEIGFDGVSRSVKTMGNDVAAATEKVQDRLYDTNRALGGTARGFNDTAGAAGRASRAIGNTSGSARGATRDFAAMAKIGGSLPIMYAALASNIFVLQSAFEQLKLGDQLNRLEKFGVIVGTQTGTPVQTLARSLQEAAGYAISFEEAMRQASSASAYGFDAEQLNKFGLVARRAAAVLGVDMTDALNRVIKGVSKQEIELLDELGVTIRLNDAYADYVKQLNAANTGITYNVNSLTTFQKQQAYANAVIAESTKRFGYLDEVLRATPWEQFAANADAALRKIQQAAAKYLGPVIDAINTVFYTSQASISAEAARAQEKTNRQIDPTNVGAVALSLAASEEGYNKALDMYKESLDKRNKLKSEFDKRMEQADFYTKLAIRQVGEGIPIGLAAAGASEANKQFVAETAAMGLQVTRLGKEVEDSTENLNAWKSAYQAAGAAAAKANPQFQKQINLQRDSTDPGAVYDFNSTVLKGLTEQQKAYNQTKKTASDLANDIQNVAQNTDTAAKTSATLADAIKNIESLSLGTGKSADEYVKNLNLGYNTLSEMKTASQALSEYVKLTGNETKNQLAVQQKIADVYNQTKDKEKAQEAGRRLELQQLEEQEAALRRVLQTNQGNKAVEKEIEKIQLEKLKLTNQGMEAQKKVKDYTDKILGVDREIALLNNRTMTDTQYRLAQLNLELTVEKEKYEWYTKQADKQKEAEQSRRAQAQIEREIWKFRQDQIASMAAGREEEQQRQFTAKPLMGNAERLQEQLKLYEDLKQKTLGNAAAQAEYNKKIAETRAQLAGLRAQRNAEMQASVGSSLGAVYTPTTGLSGEDKDFADMGNRMASYDQAISKLSELNSEATAVAQSMGNLTNAMIQFSMGSLDTTSTIAAGMQTVASMIQYSTSQQVSAIDQAIAAEQKRDGKSEASKAKLKKLEAEKLKIQQDAAKKQIIIQTAVAVMQAATAVPYPFSIPLMVAAGLAGALALAQASSASGMSSIADSGADTTSYLTLGERQKNIDVSMSANAGELSYIRGDKGIGGANSFVPRAEGGNMYPGVSYQMGEHGTEVVTPMVPMKATPNDELKTSSNSTSGRPIILNISAMDAASFREFASSNSSALRDAVELALNENGASLKTLGNS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1226 AA molecular weight: 132267,26170 Da isoelectric point: 6,22798 aromaticity: 0,05465 hydropathy: -0,42072
Domains
Domains [InterPro]
IPR056207
1–81
1–81
1
1226
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage IME178 [NCBI] |
2860371 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_011891986.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_104190.1
[NCBI]
CDS location
range 78982 -> 82662
strand -
strand -
CDS
ATGACTGATAAGCTAATACGAGAATTACTAATAGACGTTAAACAGAAGGGGGCAACTCGTACTGCAAAGTCTATTGAAAACGTATCTGATGCGTTGGAAAATGCTGCTGCTGCTTCCGAACTGACAAATGAGCAGTTAGGTAAAATGCCCAGAACTCTTTATTCCATTGAGAGGGCAGCAGACAGAGCAGCGAAAAGTCTTACTAAAATGCAAGCTAGTAGGGGTATGGCTGGTATCACTAAATCCATTGATGGTATTGGTGATAAGCTAGACTACCTGGCTATCCAGCTTATTGAAGTAACAGATAAACTAGAAATTGGATTCGATGGAGTTTCTAGATCTGTTAAAACAATGGGTAATGATGTTGCAGCTGCAACAGAAAAAGTCCAGGATAGATTATATGATACTAATAGAGCATTAGGTGGCACAGCTAGGGGTTTTAATGATACTGCTGGTGCCGCTGGTAGAGCTTCTAGAGCTATTGGTAATACTTCTGGTTCAGCACGTGGTGCAACTCGTGATTTTGCGGCAATGGCTAAGATCGGTGGTAGTTTACCTATTATGTACGCAGCTCTTGCTTCCAACATCTTCGTTTTGCAATCAGCATTTGAACAACTTAAACTAGGTGATCAGCTAAATCGTCTAGAAAAATTTGGTGTTATAGTAGGTACTCAGACAGGTACTCCTGTTCAGACCCTTGCTAGATCACTACAAGAAGCTGCTGGATATGCTATTTCTTTTGAGGAAGCAATGAGACAGGCATCTTCAGCATCTGCTTATGGATTTGATGCCGAACAACTTAATAAATTTGGTTTAGTAGCTCGTCGTGCTGCTGCTGTTCTTGGTGTTGATATGACTGATGCACTTAACCGTGTAATTAAGGGCGTATCTAAACAAGAAATCGAACTTCTGGATGAACTTGGTGTCACCATCCGTCTTAATGACGCATATGCTGATTATGTTAAACAGTTAAATGCTGCAAACACAGGTATAACATATAATGTTAATAGTCTTACCACTTTCCAGAAACAACAAGCATACGCTAACGCGGTAATTGCTGAATCTACTAAGCGGTTTGGCTACCTAGATGAAGTACTACGTGCAACTCCATGGGAGCAATTTGCTGCTAATGCAGATGCTGCACTAAGAAAAATACAACAAGCTGCTGCTAAGTATTTAGGGCCGGTAATTGATGCTATCAATACAGTATTTTATACATCTCAGGCTTCTATATCTGCGGAGGCAGCTAGAGCTCAAGAAAAAACTAATAGACAGATAGACCCTACCAACGTTGGTGCTGTTGCTTTAAGTTTAGCTGCTTCTGAAGAAGGCTATAATAAAGCTCTAGATATGTATAAGGAATCTCTTGATAAGCGTAATAAGCTAAAATCTGAGTTCGATAAACGAATGGAACAAGCAGATTTCTATACAAAACTAGCTATACGTCAAGTTGGCGAAGGTATTCCTATTGGTCTTGCAGCAGCAGGTGCTTCGGAGGCCAATAAGCAATTTGTAGCAGAAACTGCAGCTATGGGTCTACAAGTAACTAGACTTGGTAAGGAAGTAGAGGATTCTACAGAGAACCTCAATGCTTGGAAATCAGCGTATCAAGCTGCTGGAGCTGCTGCTGCAAAAGCTAATCCACAGTTTCAGAAACAGATTAATCTACAGAGAGATTCTACAGATCCTGGCGCTGTATACGATTTTAACTCTACTGTATTAAAAGGACTAACTGAGCAGCAGAAAGCGTACAATCAGACTAAGAAAACTGCTAGTGACTTAGCTAATGATATACAGAACGTTGCTCAGAATACAGATACTGCTGCTAAAACTAGTGCTACTTTAGCAGATGCTATAAAAAACATAGAATCTCTATCTCTAGGTACTGGTAAGAGTGCTGATGAATATGTTAAAAATCTTAACCTAGGCTACAATACTCTGTCTGAAATGAAAACTGCGTCTCAGGCCTTATCTGAGTACGTTAAACTAACTGGTAATGAGACTAAGAACCAGTTAGCAGTTCAACAGAAGATAGCTGACGTATACAATCAAACTAAAGATAAAGAAAAGGCACAGGAAGCCGGTAGGCGTTTAGAACTCCAACAGTTAGAAGAGCAAGAAGCTGCTTTACGCCGTGTACTTCAAACTAATCAGGGAAATAAAGCTGTTGAGAAAGAAATTGAAAAAATTCAGCTGGAGAAACTTAAACTTACCAATCAGGGTATGGAGGCTCAGAAGAAGGTTAAGGATTACACAGATAAAATTCTGGGTGTAGATCGTGAGATAGCCCTCTTAAATAACCGTACTATGACAGATACTCAGTATCGTCTAGCACAGTTAAATCTTGAATTGACCGTTGAAAAAGAGAAGTACGAATGGTACACAAAACAAGCTGATAAACAGAAAGAGGCGGAACAGTCTAGACGTGCTCAAGCCCAAATTGAACGTGAAATCTGGAAATTCCGCCAAGATCAGATTGCTTCAATGGCTGCTGGTAGAGAGGAAGAACAGCAAAGACAATTTACTGCTAAACCATTAATGGGAAATGCGGAGCGCTTACAGGAACAGCTAAAATTATATGAAGACTTAAAGCAGAAAACATTAGGTAATGCTGCGGCACAAGCGGAATATAATAAAAAGATAGCTGAAACTAGGGCACAACTAGCAGGTTTAAGGGCACAGAGAAATGCGGAGATGCAAGCTTCTGTTGGATCTTCTTTAGGTGCTGTGTACACTCCTACAACTGGACTATCTGGAGAAGATAAAGATTTTGCTGATATGGGAAATAGAATGGCTTCTTATGATCAGGCAATTTCTAAACTATCTGAGTTAAATTCCGAAGCAACTGCTGTAGCTCAAAGCATGGGTAATTTAACCAATGCTATGATTCAGTTCTCTATGGGGTCTTTAGACACTACTTCCACGATCGCAGCAGGTATGCAGACTGTGGCCTCTATGATTCAATATAGTACTAGTCAACAGGTTAGTGCAATTGATCAGGCTATTGCAGCAGAGCAGAAACGTGATGGTAAATCAGAAGCATCTAAAGCTAAGTTGAAGAAACTAGAAGCTGAAAAGTTGAAGATTCAACAAGACGCAGCTAAGAAGCAGATCATCATCCAAACTGCAGTAGCTGTAATGCAAGCGGCGACAGCTGTACCGTACCCGTTCTCTATTCCTTTGATGGTGGCGGCAGGTTTGGCAGGTGCCTTAGCTCTTGCTCAAGCATCTTCTGCATCTGGTATGTCAAGTATTGCAGATTCTGGAGCGGATACAACTAGTTACTTAACCTTAGGAGAGCGTCAAAAGAATATAGATGTGTCTATGTCTGCTAACGCAGGTGAATTATCTTATATTCGAGGCGATAAAGGTATAGGCGGTGCTAACTCCTTCGTTCCTCGTGCTGAGGGTGGTAATATGTACCCTGGGGTTAGCTATCAAATGGGTGAGCATGGTACAGAAGTAGTTACCCCTATGGTTCCTATGAAAGCTACACCTAATGATGAGCTAAAAACTTCATCTAACTCAACTTCAGGAAGACCTATCATCCTGAATATTAGTGCTATGGATGCTGCAAGTTTCAGAGAATTTGCTTCTAGTAATAGTAGTGCTCTAAGAGACGCAGTAGAATTAGCTCTGAATGAGAACGGTGCTAGTCTGAAAACATTAGGAAATTCTTAA
Tertiary structure
PDB ID
10bb4b9ddd678fd7c0eb748697ee63c031ae8700a5dc0c4c694fc78c310a22cd
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50