Protein
View in Explore- Genbank accession
- XBO82176.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TSPTFTF
- Protein sequence
-
MSRNLMPKSGAMAPYVVVNRDAAVAGVFSVDGEAGAVVLTSKYLQISKYTTDKAATDASINSINESIGNINTALGGINTTLNTKAAKGANNDITELNALTKAITIAQGGTGAKTLENARSNLQVERLRQQDNGTFVTSPDGKYSLFIYNSGDFGLIDSASAAVSAMKVAFGGTGGTTPKAARKSLNVPVGALAEIIPGGENVLNYVAVAGQSGYYSSGELVVNGPPKQEGWWTYNFHCHGVDINGAAQYGVLHAVGLSGSSWVNVLDGTGNWRGWQEQFNAQTTVQFSNGGTGATSKDGARNNLSIDRFKQSATETMMYAPGVGYRITARPNGEWGNWRDDTGTWIPLAITAGGTGANDAAQARRNFELTEWGLLPSMDSKYPGGFNFDNLNFNSSFTVPPSGGNIIGTRPYLQIPGLEDAWFFLETLVHPDPSYRMQRATLFTGAWRGTVCIRTMDTGSWSLWQQVHGAHGLIASPVYDRATFKSNGITDGGAGCLVGGTIKGGAFTAWRDRPCGILVEHEASDAAYAIWKSVRWGVDWVSGMDAVLWSAGGAQLSMYCRGAEYRFDSGGNASAGQWINTSDIRMKANLKEIDNAREKVKSLIGYTYYKRNTLNEEKDTVYSTEAGVIAQDVQSVLPEAVYKIEPQNEDSMLGVSHAGVNALLVNAFNELNEVVEKQQQEIDELKKLVKQLLDK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 695 AA molecular weight: 74596,43140 Da isoelectric point: 5,66664 aromaticity: 0,09209 hydropathy: -0,27813
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Salmonella phage vB_SenS-AKM_HA2021_32 [NCBI] |
3158841 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XBO82176.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP836394.1
[NCBI]
CDS location
range 27478 -> 29565
strand +
strand +
CDS
ATGTCACGTAATTTAATGCCTAAATCTGGCGCAATGGCGCCTTACGTTGTAGTTAACAGAGATGCTGCGGTTGCTGGTGTTTTCTCTGTTGATGGAGAGGCTGGTGCTGTTGTACTAACTTCCAAGTATCTACAAATCTCTAAGTATACTACTGATAAAGCTGCTACTGATGCATCTATCAATAGTATTAACGAATCAATTGGTAATATTAACACTGCGTTAGGTGGTATTAATACTACTTTAAATACTAAGGCTGCAAAAGGTGCTAATAACGATATAACAGAATTAAATGCACTAACAAAAGCTATTACTATTGCTCAAGGTGGTACAGGGGCAAAAACGTTAGAAAATGCTAGAAGTAACTTACAGGTAGAGCGCCTACGACAACAAGATAATGGAACTTTTGTTACTTCTCCAGATGGTAAGTATTCTTTATTTATTTATAACAGTGGAGATTTCGGGCTAATTGATAGTGCTAGTGCTGCTGTTAGCGCAATGAAAGTTGCATTCGGTGGTACTGGCGGAACTACCCCCAAAGCAGCTAGAAAAAGTCTTAATGTTCCTGTCGGCGCTTTGGCTGAAATTATACCCGGTGGAGAAAACGTATTAAATTACGTTGCGGTTGCAGGTCAAAGCGGGTATTATTCATCTGGTGAATTAGTAGTTAATGGACCACCTAAACAAGAGGGTTGGTGGACATATAATTTTCATTGTCATGGTGTAGATATAAACGGTGCTGCTCAATATGGGGTACTACACGCGGTTGGCTTATCCGGCAGCTCTTGGGTTAATGTTCTAGATGGTACCGGTAACTGGAGAGGATGGCAAGAACAGTTTAATGCTCAAACTACTGTTCAATTTTCTAATGGAGGTACTGGAGCAACTTCTAAAGATGGTGCTAGAAATAATCTAAGTATTGATAGATTCAAGCAATCCGCCACAGAAACTATGATGTATGCTCCTGGAGTTGGGTACAGAATCACTGCAAGACCTAATGGAGAATGGGGTAATTGGAGAGATGATACTGGTACTTGGATTCCATTAGCTATTACAGCAGGTGGTACAGGGGCTAATGATGCTGCTCAAGCCCGAAGAAACTTTGAGTTAACTGAATGGGGCTTACTTCCCTCTATGGATAGTAAGTATCCAGGGGGATTTAATTTTGATAATCTAAACTTTAATTCTAGTTTTACTGTTCCTCCTTCTGGTGGTAATATTATAGGTACCCGTCCTTACCTACAAATACCGGGGCTAGAAGATGCTTGGTTCTTTCTAGAAACCTTAGTACATCCAGATCCTTCTTATAGGATGCAACGTGCGACTTTATTTACAGGGGCGTGGAGAGGTACAGTATGTATTAGAACGATGGATACAGGTTCCTGGAGCTTATGGCAACAAGTACATGGGGCACATGGACTAATTGCTTCTCCTGTGTATGATAGAGCTACGTTTAAAAGTAATGGTATAACTGATGGTGGTGCAGGATGTTTAGTTGGAGGTACAATAAAGGGAGGTGCTTTTACTGCCTGGAGAGATAGACCTTGCGGTATATTAGTGGAACATGAAGCTTCTGACGCAGCCTATGCTATTTGGAAAAGTGTTAGATGGGGTGTGGATTGGGTATCAGGTATGGATGCTGTTTTATGGTCTGCTGGGGGTGCTCAATTAAGTATGTATTGTAGGGGTGCGGAGTATAGATTTGATAGTGGAGGTAATGCTTCTGCAGGTCAATGGATAAATACCTCTGATATACGTATGAAAGCCAATCTTAAAGAAATTGATAATGCTCGTGAAAAAGTTAAATCTCTAATAGGATATACCTATTATAAGAGAAATACTCTTAATGAGGAAAAAGATACTGTCTATAGTACTGAGGCTGGTGTTATAGCTCAAGATGTGCAATCGGTTCTTCCAGAAGCAGTATATAAAATTGAGCCACAAAATGAAGATAGCATGTTAGGAGTATCTCATGCTGGTGTCAACGCTCTCCTAGTTAACGCTTTTAATGAACTTAATGAAGTTGTTGAAAAGCAGCAGCAAGAAATTGATGAACTTAAGAAATTGGTAAAACAATTACTTGATAAGTAA
Tertiary structure
PDB ID
144863f19777237e26d9d3354a8c02636dca13bd00f7dee8f8912f3d15649019
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50