Protein

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Genbank accession
AXC43070.1 [GenBank]
Protein name
L-shaped tail fiber
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,81
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MSRNLMPKSGAMAPYVVVNRDAAVAGVFSIDGEAGAVVLTSKYLQISKYNTDKAATDASINSINESIGNINTALGGINTTLNTKAAKGANNDITELNALTKAIKISQGGTGGTTPKTARKGLNVPVGALAEVVPDGDNVLNYVAVAGQSGYYSSGELVVNGPPKQEGWWTYNFHCHGVDINGVAQYGILRAVGLSGSSWINVLDGTDNWRGWQEQFNAQTTVQISNGGTGAQSVGQARSNFGIGETDIPVFGGIALDAKNSSTSGILYLRNKNPEGAQISYSRVYNEIQGGVAKITLQVTREGADTNYYQFDEHGNALNYNSITIGRGIGNALGDNSLVIGDVNTGFKWGGDGVLQGYCNGSNVVSWDSQNMHIDGLLSVWPIDNNANGIRVSGARTGGDNALIGGQIAGGGWNGWRDRASGLLVELSGDDAASNIFKAVRWGGDWAAGLDVVRYGAGGCEAHLNIRGATYTFNDAGYASAVQWVNTSDIRLKANLKEIESAKEKVKSIKGYTYFKRNNLDEDEHSIYSEEAGVIAQDVQAVLPEAVYKISNSEYLGVSYSGITALLVNAFNELNEVVEKQQQEIDELKKLVKQLLDK
Physico‐chemical
properties
protein length:598 AA
molecular weight: 63506,67470 Da
isoelectric point:5,10820
aromaticity:0,08027
hydropathy:-0,26388

Domains

Domains [InterPro]
IPR036388
476–596
IPR036388
IPR030392
488–548
IPR030392 Coil
IPR030392
488–585
IPR030392
AXC43070.1
1 598
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage S124
[NCBI] 		2231351 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AXC43070.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH370375.1 [NCBI]
CDS location
range 24949 -> 26745
strand +
CDS
ATGTCACGTAATTTAATGCCTAAATCCGGCGCAATGGCGCCTTACGTTGTAGTTAATAGAGACGCCGCGGTTGCCGGCGTTTTCTCTATTGATGGAGAAGCTGGTGCTGTTGTGCTAACTTCTAAATATCTACAAATTTCAAAGTATAATACTGATAAAGCTGCTACCGATGCATCTATCAATAGTATTAACGAATCAATTGGTAATATCAACACTGCGTTAGGTGGTATTAATACTACTTTAAATACTAAAGCTGCTAAAGGTGCCAATAACGATATTACAGAATTAAATGCACTTACTAAAGCTATTAAAATTTCTCAAGGTGGTACGGGTGGAACTACTCCTAAAACTGCAAGAAAAGGCCTTAATGTCCCTGTTGGTGCCTTGGCTGAGGTAGTACCTGATGGGGATAACGTATTAAACTATGTAGCTGTTGCTGGTCAGAGTGGGTATTATTCCTCTGGTGAATTAGTAGTTAACGGACCTCCTAAACAAGAAGGTTGGTGGACGTATAACTTCCACTGTCATGGAGTAGACATAAATGGTGTGGCACAATATGGTATACTTCGTGCAGTTGGATTGTCTGGTAGTTCCTGGATTAACGTTCTTGATGGTACTGATAACTGGAGAGGATGGCAGGAACAATTTAATGCTCAGACTACTGTTCAAATCTCTAATGGAGGTACTGGCGCTCAGAGTGTAGGGCAAGCAAGAAGTAATTTTGGAATTGGGGAAACTGATATACCTGTTTTTGGTGGTATTGCTCTTGATGCCAAAAATAGTAGTACATCCGGTATTCTTTATCTAAGAAACAAGAATCCAGAAGGTGCACAGATTTCATACTCTAGAGTTTATAATGAAATTCAGGGTGGAGTTGCAAAAATAACACTTCAAGTAACCAGAGAAGGTGCAGACACAAATTATTATCAGTTTGATGAACATGGAAATGCGTTGAACTATAACTCCATAACAATAGGTCGTGGTATTGGTAACGCTCTTGGTGATAATTCCTTGGTTATTGGTGATGTTAATACAGGATTTAAATGGGGTGGTGATGGGGTTTTACAAGGTTATTGCAATGGTAGCAATGTTGTGTCTTGGGATTCTCAAAATATGCATATTGATGGACTTCTTTCAGTATGGCCTATTGATAATAATGCTAATGGTATTAGGGTTTCAGGGGCTAGAACTGGTGGCGATAATGCGTTAATTGGGGGTCAAATTGCTGGCGGCGGCTGGAATGGTTGGCGAGATCGCGCATCTGGTCTACTTGTTGAACTATCAGGTGATGATGCCGCATCAAACATATTCAAGGCTGTTAGGTGGGGCGGTGATTGGGCTGCTGGTCTTGATGTTGTAAGATATGGTGCTGGAGGTTGTGAGGCGCATCTTAATATAAGAGGTGCAACTTACACATTTAATGATGCTGGGTATGCGTCTGCTGTTCAGTGGGTTAACACATCCGATATTCGCCTGAAAGCAAATCTAAAAGAGATTGAAAGCGCTAAAGAAAAAGTGAAATCGATTAAGGGTTATACTTATTTTAAGCGTAATAATCTTGATGAAGATGAACACTCTATTTATTCTGAGGAAGCGGGTGTAATAGCTCAGGATGTGCAGGCTGTTTTGCCGGAGGCTGTTTATAAAATCTCTAACAGTGAGTATTTAGGTGTAAGTTATAGTGGTATTACCGCTCTCCTAGTTAACGCTTTTAATGAACTTAATGAAGTTGTTGAAAAGCAGCAGCAAGAAATTGATGAACTTAAGAAATTGGTAAAACAATTACTTGATAAGTAA

Tertiary structure

PDB ID
c110ecfa24f22e7f5041e0184d5742f2595c8f7766b240c0f40a49c93ddf90d0
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7291
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50