Protein

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Genbank accession
QFR59721.1 [GenBank]
Protein name
tail protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,70
Protein sequence
MAGTAKPKDYVYNQLHDYEVTIMTNLSPQDVDTRLTETREEFSAEHDRLWNSLDDERISRIAGDETNAQSLQQNVDALLSNESRLSTEVVQREEGDLRNIKSLTELAKALSDYRIKTDLEINNEKIAREQLGIDLNTRVDNFISTFDHKFLLVYQTIENLRIETHSSLSLFDERIKKYEEMLQDITTDSIQITMDNGEINMGAWTILSQARQWDLEILGKFKDYQTSTNQDIEDALKDIQDNLPIEQDIIDKAIDALSNATVIQELDNKITGNIGTTNLLYEALIKEASDRQNEMILYSQTIANELQANQDALLAEVRSESEARVDALQREASIRQQELLNEALERSAEIDERIKDIEGGVTTDLTEAYRRIDEVNEKAENYKADSDRKLQELNDEADQIHSDISAEQDARIAAIKKVEDGLTQEIAFRKEGDNASMLAIDNYKTSNDLALANVREELATNVTATTANATAIQALDTQLVIVGDEATAAKNLAASATQKAETALNETSSLASQMTTVNASIDGIQNDLADKADAAAFNNLKAQVTDLDGVVQTTASDVTALKTQVSDIDSTVTGQASAISELNSTQTAHGENLTQLNNSTTALRSELDIVKEDMSQKVGVTAFNELKTEVDRHDNSITVISQDVTNLSASLDTVTATLETKAEAGAVSALQSKVESIDGKVVSNSESILRLDGQVATIEEGLNNKLDASVIQSYYTKVETDQVVAGEISEYDTNLYIGGQNLWSVVDNPLVNVNGTSTKSVINSAEEHYRTTVNTFNASSVCQAVIHNALVDTGYIFKQGDDFTLSFEVRAVRNSKIASLYFYMGGQGVNLVNNQNVTTDWVRVVLPVKANGILTSNDSQMFGTSLRSSDGWAVNDWIEFRHVQLQRGKKATEYQKASAKILQTATANATAISGIKSSIENLDGRITSNSNSITSLSNDVTQINNELSTKASSDALNDLKSTVEVMDGKVTSNAQNVVQLTNDVTQIKGDIQNMATSSALEALDSRVVTAEGKLESQQSSITKLQGDLATTASDVSKKADASALNALDQRVVQTEAKVVSQGTSITNLQNNVSTLNSELAKKADSSALTSLSSRVSANEDSITSQGSTLTSLQNSISSVGVNLVALADQLKTVSMTSTAGESYITWSLTDPALKPDTFYTLSFWALRTPNVKSVESFLIASSGAHHKSSYVTVGTTNLVRYSVTFKTNANATGVTYSLRFDLNGSSDGNNATLTVQKPQLEEGQVVTYWKPSTYDKADASALSTLQNTVTQQGNALTSNSNAITTLQNNVSTLNDSLATKADASALSILDSKVVAIDGKVTSNTASLTALSNAVTNGSNNLLFNTLYNNLSYILANGNHSVAIDSATYARSKVLKITATGPGQDGVHQALMTASVATVPSATDPLVLSFFAKADTSVSVRIQLFGGVGLQSIALTNTWTKYTISTLRKTAAHLDTTTLYLSLLSAGVAYFTNVQLERGTIPTSYSAASTETGNLIAANSTALSSLSSTVTQHGNALTSQGNSITSLNNSLVITNSNVEKAQNTANNAAAAAATAQNTADTKADASAFNALSNAVSNQGDTISSQGSAITALNNTLNSLSVGSTNLLPGTDLSTHTSKDGTFKSGNMISATATTAGSVDMLALKSTVELLAGEYVVSFWAKAETAGTQFGVYFYNPNTTVSGVGSNGASSSRADGQIIFTLTTVMTKYFVKYKQSGNTSKKDVLFRIQAPASGTNKVWLALPQLEEGNVVTDWSPSTNDIASSAAVNSLSSTVKQQGDTIVSQGNSITTLNNNITTINGTLSTKADSSALAALDGRVTQTENGLTTTNTDIVRLQSAIQSQGDALNLDPNFKEGLKFIITGELATGNSVVAGSYGESGGSGLRVTKANDAGTSNTNTLVRVPTTGVWLKAGRTYRATVRARKVSGTAGLLLRWIRASDNVAVAVRQVTATDTTNFVDFSLDYAPTSDVFAWFGVWVYPNACVIDYSSIRLIDRTSSVENSATASALSSLTTRVSDVEGVNTSQSNSITSLNNSVTVIRSDLDTKASNSAVSSLESRVIDAENSLTSQSTQLTTLKSGIDAAAVIGTNMLINTAEPSSANAPKTSDGVSSVSGMLVSYGVDTVFTINSTSAERYYRMTSPVNASAVLKPGNTYTISADMRGNVLPVRWRIISFANNAWADIAVKVLSTITSNQYTRQSCTFTIPANATNLIMSFQSESTVVGNTLSVRRLKLEAGSNATLWEQPTSEIATTKALNLLDTRVVSIDGKVTSHSSSITRLETDVSDSSAKLDVVAESVNGMSASYFVKTDVDGLVSGFGLYNDGVGSAFGVNADYFYIGRGSGGKKPFIVTTTPQTIDGVTYPVGTWISVALIANATIGSAHIADAAITTAKIANAAITNAKIASLDAGKINTGTLDAARIGADSITADKLQVDELSAISANLGTLITYKDPSQPLKARMVIQGSLITVYDDNNKLRVRMGLW
Physico‐chemical
properties
protein length:2479 AA
molecular weight: 264320,73480 Da
isoelectric point:4,77456
aromaticity:0,05204
hydropathy:-0,20633

Domains

Domains [InterPro]
PTHR34491
31–1135
PTHR34491 G3DSA:1.20.5.340 G3DSA:2.60.120.260 Coil
Coil
68–88
Coil Coil Coil G3DSA:1.20.5.340 G3DSA:1.20.5.340 G3DSA:1.20.5.340 IPR008979
Coil
1065–1085
Coil
QFR59721.1
1 2479
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Acinetobacter phage VB_ApiP_XC38
[NCBI] 		2655002 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QFR59721.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN508356 [NCBI]
CDS location
range 39109 -> 46548
strand +
CDS
ATGGCAGGGACTGCCAAACCCAAGGACTATGTGTATAATCAGCTGCATGATTATGAGGTAACTATTATGACTAATTTATCCCCACAAGACGTAGATACTCGCTTAACTGAGACTCGTGAAGAGTTTTCAGCTGAGCATGATCGTCTATGGAATAGTTTGGATGATGAACGCATCTCTCGTATTGCAGGGGATGAGACTAACGCTCAGTCACTACAACAGAACGTAGATGCTTTGTTGTCTAACGAATCACGATTGTCTACAGAAGTAGTACAACGTGAAGAAGGTGATTTAAGAAATATTAAATCATTAACTGAATTAGCGAAAGCTCTTTCGGATTATCGGATTAAAACTGATTTAGAAATTAACAATGAAAAGATTGCTAGAGAACAACTGGGTATTGATTTAAATACCCGTGTAGATAACTTCATCTCTACTTTTGATCATAAGTTTCTATTGGTTTATCAAACAATTGAAAATCTTCGTATAGAAACACACTCATCTTTATCTTTGTTTGATGAGCGCATCAAGAAGTACGAAGAAATGCTTCAGGATATTACTACAGACTCAATTCAGATCACTATGGATAATGGTGAGATCAATATGGGTGCTTGGACAATTCTGTCTCAGGCTCGTCAATGGGACTTGGAAATCCTAGGCAAGTTTAAGGACTACCAGACTTCTACAAACCAGGATATTGAAGACGCTCTTAAAGATATTCAGGATAACCTGCCTATTGAACAGGATATTATTGATAAAGCAATTGATGCCTTGTCTAACGCTACTGTTATTCAGGAGTTGGATAATAAGATTACAGGTAACATAGGAACTACTAACTTACTGTATGAAGCATTAATTAAAGAAGCCTCTGACCGTCAAAATGAGATGATTCTATACTCACAAACTATCGCTAATGAATTACAGGCAAATCAAGATGCCTTGTTAGCAGAAGTAAGAAGTGAGTCAGAAGCACGTGTTGATGCTTTACAGCGTGAAGCTTCTATTAGACAGCAAGAGCTGCTTAATGAAGCACTAGAGCGCTCTGCAGAAATTGATGAGCGTATCAAAGATATCGAAGGTGGTGTAACTACTGACTTAACAGAAGCTTATCGCCGTATCGATGAAGTAAACGAAAAGGCTGAAAACTATAAAGCAGATTCTGATCGTAAACTTCAAGAATTAAATGATGAAGCAGATCAGATCCACTCTGACATATCTGCTGAACAAGATGCTCGTATTGCAGCTATTAAGAAAGTAGAAGATGGTTTAACACAAGAAATTGCCTTCCGTAAGGAAGGTGATAATGCTTCTATGCTTGCCATTGATAACTATAAGACATCTAACGATTTAGCTCTTGCTAACGTACGAGAAGAGTTGGCTACTAACGTTACAGCTACTACAGCTAACGCTACAGCTATTCAAGCTTTGGATACTCAATTAGTTATTGTAGGTGATGAAGCTACTGCTGCCAAAAATTTAGCTGCTAGTGCTACTCAGAAAGCAGAAACTGCTCTTAATGAGACTTCTTCATTAGCTTCTCAGATGACTACTGTTAATGCTTCTATTGATGGTATTCAGAATGATTTAGCTGATAAAGCGGATGCTGCAGCGTTTAACAATTTAAAAGCGCAAGTGACAGATCTTGATGGTGTAGTACAAACCACAGCTTCAGATGTTACTGCCCTTAAGACGCAGGTATCAGATATTGATAGTACAGTCACTGGTCAGGCTTCTGCTATTTCAGAACTTAATAGTACTCAAACTGCACATGGTGAAAATCTAACTCAGCTAAATAACAGCACTACTGCCTTAAGATCTGAACTTGATATTGTTAAAGAAGACATGTCTCAGAAGGTAGGTGTAACTGCATTTAATGAGCTTAAAACAGAAGTAGATAGGCATGATAATAGCATCACTGTTATATCTCAGGATGTTACTAATCTAAGTGCTAGCCTTGATACTGTTACTGCAACTTTAGAGACTAAAGCAGAAGCAGGTGCTGTATCTGCACTACAATCTAAAGTCGAATCCATTGATGGTAAAGTAGTATCTAACTCAGAGTCTATTCTTAGATTAGATGGGCAAGTAGCTACTATTGAAGAGGGCTTAAATAATAAGCTAGACGCTTCTGTTATTCAGTCTTACTACACTAAGGTGGAGACTGATCAAGTAGTAGCAGGGGAGATTTCTGAGTACGATACAAACTTGTATATTGGTGGGCAGAACCTTTGGTCTGTTGTAGATAATCCGCTAGTTAATGTAAACGGTACATCAACTAAATCGGTAATAAACAGTGCTGAGGAGCACTACCGTACTACGGTAAATACTTTTAATGCTTCTAGTGTATGTCAAGCAGTGATACATAATGCACTTGTAGATACTGGTTATATTTTTAAACAAGGTGATGACTTCACTTTATCTTTTGAAGTAAGAGCTGTACGTAACTCTAAAATAGCTTCTTTGTATTTTTATATGGGTGGTCAAGGAGTTAACCTTGTTAATAACCAAAATGTAACTACTGATTGGGTACGCGTAGTATTGCCAGTAAAAGCTAATGGAATACTTACATCTAATGATTCTCAGATGTTTGGTACTAGCCTACGATCCTCTGATGGGTGGGCAGTTAATGACTGGATTGAGTTTCGTCATGTACAGCTGCAACGTGGTAAAAAGGCTACTGAATATCAGAAGGCTTCAGCTAAAATTCTACAAACAGCTACTGCTAATGCTACTGCAATTAGCGGTATTAAATCCTCTATTGAAAACCTAGATGGTCGTATTACGTCTAACAGTAATAGCATTACTAGTCTCAGCAATGATGTCACTCAGATTAATAATGAACTATCTACTAAAGCTAGTTCTGATGCTTTAAATGATCTTAAATCTACTGTTGAAGTTATGGATGGAAAGGTTACATCTAACGCTCAGAATGTAGTTCAGTTAACTAACGATGTTACTCAAATTAAAGGTGATATTCAGAACATGGCTACATCTAGTGCTTTAGAAGCATTGGATAGTCGTGTAGTAACTGCAGAAGGTAAGCTTGAATCTCAACAGTCTTCTATTACTAAGCTACAAGGTGACTTGGCAACTACTGCTTCTGATGTTAGTAAGAAAGCAGATGCTTCAGCATTGAATGCCTTAGATCAACGTGTTGTTCAAACAGAAGCTAAAGTTGTTTCACAAGGTACTTCAATAACAAACCTTCAAAATAATGTCTCTACTCTTAATAGTGAACTTGCAAAGAAAGCAGATTCAAGTGCCCTTACTTCTTTAAGCTCCCGTGTATCTGCTAATGAAGATAGTATTACATCCCAAGGAAGTACCCTTACTAGTTTGCAAAACTCTATAAGCAGTGTTGGGGTAAACTTAGTTGCTCTTGCTGATCAGTTAAAAACTGTATCAATGACTTCAACTGCAGGCGAAAGCTATATCACTTGGTCTTTAACAGATCCTGCGCTTAAACCAGACACTTTCTACACTTTGTCATTTTGGGCATTACGCACCCCTAACGTAAAGAGCGTTGAATCCTTCTTAATTGCTAGTAGTGGTGCACATCACAAATCAAGTTATGTGACAGTTGGGACAACGAATCTTGTTCGATATTCAGTAACATTTAAAACCAATGCTAATGCTACTGGTGTTACTTATTCACTACGCTTTGATCTTAACGGTTCTAGTGATGGCAATAATGCGACATTAACAGTTCAGAAACCTCAGCTAGAGGAAGGACAAGTTGTAACGTACTGGAAACCATCTACTTACGATAAAGCAGATGCCAGTGCGCTAAGCACCCTTCAAAACACAGTTACGCAACAAGGTAATGCGTTAACTTCAAATAGTAATGCTATTACTACCTTACAAAATAACGTGAGTACCCTTAACGACTCTTTAGCAACTAAAGCTGATGCATCTGCATTAAGCATATTAGATTCTAAGGTTGTTGCTATTGATGGTAAAGTTACGTCTAATACCGCATCTCTTACTGCGTTAAGTAATGCAGTAACCAACGGTAGTAATAACTTATTATTTAATACCTTGTATAACAACTTATCCTATATATTAGCTAATGGTAACCATAGTGTAGCAATAGACAGTGCAACGTATGCGCGATCTAAGGTTTTAAAGATTACTGCTACAGGCCCTGGGCAAGATGGTGTACATCAGGCTCTAATGACTGCAAGTGTTGCTACTGTTCCTAGTGCTACTGATCCTCTTGTCTTATCGTTTTTTGCAAAAGCAGATACCTCAGTATCTGTTAGGATTCAGCTTTTTGGTGGTGTTGGTCTTCAAAGTATTGCATTAACTAATACATGGACAAAGTACACTATCTCTACTCTAAGAAAGACAGCAGCGCATCTAGATACAACTACTTTGTATTTATCGTTGCTTTCTGCAGGTGTTGCATATTTTACTAATGTTCAGTTAGAGAGAGGAACAATACCAACTTCATATTCAGCAGCTTCTACTGAAACAGGTAATTTAATTGCTGCAAACTCTACTGCACTTTCTTCTTTAAGCTCTACTGTTACTCAGCACGGGAACGCATTAACAAGCCAAGGTAATTCTATTACCTCTCTTAATAATAGTCTGGTAATTACAAACAGTAATGTAGAGAAAGCACAGAATACTGCTAATAATGCAGCAGCAGCAGCAGCTACAGCTCAAAATACGGCAGATACAAAAGCAGACGCTTCAGCCTTTAATGCCTTGTCTAATGCTGTGTCAAATCAAGGTGATACTATATCTTCACAGGGTAGTGCTATTACAGCGTTGAATAACACATTGAATAGCTTATCAGTTGGTTCAACTAACTTATTACCTGGCACTGACTTATCTACTCATACGAGTAAAGATGGTACTTTTAAGAGTGGTAATATGATTTCAGCTACTGCTACAACAGCAGGTAGTGTTGATATGCTTGCACTTAAATCTACTGTTGAACTGCTTGCTGGAGAATATGTAGTAAGTTTCTGGGCTAAAGCAGAAACTGCAGGTACTCA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Tertiary structure

PDB ID
49b62ea377e8739ae8fdf98ca57e63e94d6ae007c96625ee27f3bade4308149a
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4530
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The characteristics and genome analysis of VB_ApiP_XC38, a novel N4-like phage Infecting Acinetobacter pittii Cheng,M. 2020-05-25 — GenBank