Protein

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Genbank accession
AIX30792.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MPLNKLENFIKNTDGRTLYVNPNDLNATDSITNQGTSLTEPFRTIQRALIESARFSYVRGDDNDLIERTTIMVYPGEHPIDNRPGFGIKTVGNSPVAVTPSGELIDPFQAFNLTDASNFDIESSNNVLYRFNSIHGGVIVPRGTSIVGMDLRKTKIRPIYVPNPTDDSVDYSAIFRITGTCYFWQFTIFDGNENGVVFTDPRDFSENNQSRPTFSHHKLTAFEYADGVNPAVESGFELTDLAMYYSKLSNAYNEASGRPIDEKYPSDPGGFSPQRPEFEIVGAFATDPINITRLISGDGFVPDAVITVDTQVPHELNTGTPIKIRGVAISDYNISTKVSAVLSPTRFTYNLSFVRPNLPAEPSVSSATVTVETDTVTGASPYIFNCSMRSVWGINGMHADGAKATGFRSMVVAQFTAISLQKDDRSFVTYNKQARRYDGINVNKTVRGAELSAQSSSTNSATVYHLDPDAIYRPDWGTTHIKMSNDAVIQIVSVFAIGFNQHFASIGGADASITNSNSNFGQFALKADGFKNDAFLKDDKGFLTSFVSPKSAYNPETDDIEIIDWINIDFDLTRSIAFANQLYLTGYTNAEDKPPVVNQGFRIGANYKESLIQRTTVGAGADVTSSVRMCDNILGPGNNQANGSSVARKVYQVLAGPINNTLSLGVHGLLNGESVRVFSSTGDLPENLERGALYYANVVDGENIRIATSESNALNNIFLNIYGGVELRVESRVNDKEAGERGHPVQYDYTNQNWFVHTDANSDIYQYIVANPTSTDGIDFVSIFKRFGDNRALEDKLYRLRYVIPKESRNAKPPTPGYVLQASATTGARNNDDFILQDIGINDYEYNRNPRYVVSCTVIANEVEVRSEIPHNLNVGDKIKIVNVASTNNTGASQIKGFNGEFLVTRVINSREFRYDITDVNGFSRNPGTFTNNINERNILLPRFERKDLQSNVFVYRIETITDFLEGERDGIYHLFLLNGSNPVTETFTDIQYNQPVEDLYPQMDPDNLIQNPPATTTFAKRAPLGDVTIDEQQNSITKESVDKIYKTLNVGIIETATDGTVGAGGTRTTTLTFQREHEFNSVYSYTTLVGGGGYTDGTFYDVKLLSEFGTVWGGASAVVTVTAGTVTAVTIMDPGSGYSAGQTLFIDGTTIGGGTNATISITQADLEDNKHSILQISGGALYNPDSYVVMTSVEDQSSVGVARTSGSPAIIPGMYAYPADSGTGISSTTYNSDTGLTTLVSTGSAGFGLQRGNTFVVFSSNYSYLGKFFVSNVPTPDTLEFYSYRDLGTVSIVGKTGLDVNDANTGSLGENVGVRATPLYDNGVFYLEQSSGTGTQLTVRAEDGGVAGNVDSKMYLGRYFQMGSEIIRVASKNFDGANNNIVTVIRGALGTVVSNLPINTKVKAIRPSALELRRPSILRASGHTFEYLGYGPGNYSTSLPQLQVKQLPDDEIYLVQAQELSCGQVVYTGMSDNGDFYIGNTKYSATSGTQSTFDVPIPTVAGQPGSSNNVVFDEVIINRRLFVSGGETNEVQSQFDGPVKFTQSVTIQNNLFVTGTTQLNRIEITSTENATSSANGGALTIRGGAAIGKDFYVGGEMYTNAYQIEDTSAVLEIGTNQSSKDISVGGSTDTDRVVFNTTKLATGEGAEEVVNADAGVVVEGGLVVRDVIIAKEFRGAGTGGGPGTILLWGGSTSALPDRYLLCNGATLNKNTYNKLFEAIGYIHGGSGNSFKLPDLRNRFIPGAGSSYAVAAKGGDDSVVLTETQMPRHTHSTSAVNAPHTHPVSFTSGAANAPHKHPAGTGGGGNHNHPSGGTGGGGNHNHPSGGXNNTGNHGHPYSAPGQSKTDVANSNEKNVTSNVNASGAGTGGGGAHSHSVSVNSTSSAHNHPVSVNSGSSAHNHPVSVNSANAPHSHPISGNAGSANAPHVHPIGNTGGTASFDNRPKYYALCYIIQSE
Physico‐chemical
properties
protein length:1955 AA
molecular weight: 209625,82820 Da
isoelectric point:5,20898
aromaticity:0,08854
hydropathy:-0,31807

Domains

Domains [InterPro]
IPR037053
1682–1737
IPR037053
SSF88874
1683–1823
SSF88874
IPR011083
1684–1741
IPR011083
AIX30792.1
1 1955
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014f
[NCBI] 		1493511 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX30792.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019098.1 [NCBI]
CDS location
range 19200 -> 25067
strand +
CDS
TTGCCCCTTAATAAGTTAGAGAATTTCATTAAGAATACGGATGGACGTACTCTGTATGTTAATCCAAACGATCTTAATGCTACTGATAGTATTACAAACCAAGGCACTTCCCTTACAGAACCCTTCAGAACTATTCAGAGGGCGTTAATTGAGAGTGCGCGTTTCTCATATGTGCGTGGTGATGATAATGATCTCATCGAGAGAACCACCATCATGGTGTATCCCGGTGAGCATCCTATCGATAACCGTCCTGGTTTCGGTATTAAGACAGTAGGTAATAGTCCGGTAGCGGTAACTCCTTCAGGTGAATTGATTGATCCGTTCCAAGCATTTAACCTGACTGATGCTAGTAACTTTGATATTGAGTCTAGTAATAACGTTCTCTATAGATTTAACAGTATCCACGGTGGTGTGATTGTTCCCCGTGGTACTTCTATCGTAGGTATGGATCTACGTAAGACAAAGATTCGTCCGATATATGTTCCCAACCCCACTGATGATTCAGTAGATTACTCAGCGATCTTCCGTATCACAGGTACTTGCTACTTCTGGCAGTTCACCATCTTCGATGGTAATGAGAATGGTGTAGTATTCACTGATCCAAGAGATTTCTCTGAGAATAACCAGTCCAGACCCACTTTCTCACACCACAAACTAACAGCATTTGAATACGCTGATGGTGTTAACCCAGCGGTAGAATCAGGGTTTGAACTTACTGACCTTGCTATGTATTATAGTAAGTTGTCTAACGCATATAATGAAGCATCTGGTCGTCCTATTGATGAGAAGTATCCATCAGATCCTGGTGGTTTTTCACCACAACGTCCTGAGTTTGAGATTGTTGGTGCATTCGCAACTGACCCAATCAATATCACTCGTTTAATCTCTGGTGATGGTTTTGTCCCTGATGCTGTCATCACAGTAGATACACAGGTCCCACATGAACTAAACACTGGAACACCAATTAAGATTCGTGGTGTTGCCATCAGTGACTATAATATCTCTACAAAAGTATCTGCAGTTCTTAGTCCTACTAGGTTTACGTATAACCTATCATTCGTAAGACCTAACCTACCAGCAGAACCTTCAGTATCCTCTGCAACTGTAACCGTTGAGACTGATACTGTAACAGGTGCTTCACCATACATCTTTAACTGTTCGATGAGATCAGTTTGGGGTATCAATGGAATGCACGCCGATGGTGCCAAAGCAACTGGATTCCGTTCCATGGTTGTTGCTCAGTTCACCGCGATCTCCCTTCAAAAAGATGATAGATCCTTCGTTACTTATAATAAACAGGCACGTAGATACGATGGTATCAATGTCAATAAGACTGTAAGGGGTGCTGAACTATCTGCACAGTCATCTTCTACCAACTCAGCAACTGTATACCACCTAGATCCTGACGCTATCTATCGTCCTGACTGGGGTACAACTCACATCAAGATGAGTAATGATGCAGTCATTCAGATTGTGTCTGTATTCGCTATTGGTTTCAATCAACACTTTGCTTCTATTGGTGGAGCTGATGCATCAATCACAAACTCTAACTCCAACTTTGGTCAGTTTGCACTGAAAGCTGATGGATTCAAGAATGATGCTTTCCTCAAAGATGATAAAGGTTTCCTAACATCATTTGTTTCTCCTAAGAGTGCGTATAACCCAGAAACTGATGATATTGAGATCATTGACTGGATCAACATTGACTTTGATCTAACTCGTAGTATTGCCTTTGCTAATCAACTCTATCTGACTGGTTATACTAACGCGGAAGATAAACCACCAGTAGTTAATCAGGGTTTCCGAATTGGTGCCAACTACAAAGAGAGTCTCATTCAGAGAACAACAGTTGGTGCTGGTGCAGATGTAACCTCATCAGTAAGAATGTGTGATAATATTCTCGGTCCTGGTAACAATCAAGCCAATGGTAGTAGTGTTGCTAGGAAAGTATATCAAGTTCTAGCAGGACCTATCAACAATACCCTCTCACTGGGTGTTCATGGACTACTTAATGGTGAGAGTGTAAGAGTATTCTCATCAACAGGTGACCTACCTGAGAACCTAGAAAGAGGTGCCCTATACTACGCAAATGTGGTTGATGGTGAGAATATTCGTATTGCTACTTCCGAGTCTAATGCACTCAACAACATCTTCCTCAACATCTATGGTGGTGTTGAACTTCGTGTTGAGTCTAGAGTTAATGATAAGGAAGCAGGTGAAAGAGGTCATCCCGTTCAGTATGACTACACTAACCAGAACTGGTTTGTTCATACTGATGCCAATAGTGATATCTATCAGTATATTGTAGCCAACCCAACCTCTACAGATGGTATTGACTTTGTATCCATATTCAAGAGATTTGGTGATAACAGGGCACTAGAAGACAAACTATATCGCCTCAGGTATGTTATTCCTAAGGAGTCAAGGAACGCAAAACCACCTACCCCTGGTTATGTTCTACAAGCATCAGCAACAACAGGTGCTAGGAATAACGATGACTTTATCCTACAGGATATTGGTATCAATGACTATGAATATAACAGAAACCCACGTTATGTTGTAAGTTGTACTGTTATTGCTAATGAAGTTGAGGTTCGTAGTGAGATTCCACACAACTTGAATGTTGGTGATAAGATTAAAATAGTGAATGTTGCCAGTACAAATAACACTGGCGCATCACAAATCAAAGGTTTCAATGGTGAGTTCCTAGTTACTAGAGTTATCAACTCTCGTGAGTTTAGGTATGATATTACTGATGTAAATGGTTTTAGTAGAAATCCTGGTACCTTTACCAACAACATCAATGAAAGAAACATTCTTCTACCTCGTTTTGAGAGAAAGGATCTACAGAGTAATGTATTCGTATATCGTATTGAAACTATCACTGATTTCCTAGAAGGTGAGAGAGATGGTATCTACCATTTATTCCTTCTTAATGGTTCTAACCCAGTAACAGAGACATTCACTGATATCCAATACAATCAACCTGTGGAAGATTTATATCCACAGATGGATCCTGATAACCTTATTCAGAACCCCCCTGCAACCACAACGTTTGCTAAGAGGGCACCCCTAGGTGATGTTACTATTGATGAACAACAGAACTCCATTACTAAAGAGTCTGTTGATAAAATATACAAGACACTTAATGTTGGTATCATTGAGACTGCTACTGATGGCACTGTTGGTGCTGGTGGAACACGTACAACCACACTAACATTCCAAAGAGAGCACGAGTTCAACTCTGTGTATAGTTACACCACACTAGTTGGTGGTGGTGGATATACTGATGGTACTTTCTATGATGTTAAACTACTCAGTGAGTTTGGCACAGTATGGGGAGGTGCTTCTGCTGTTGTTACTGTTACTGCTGGTACAGTTACCGCAGTTACTATCATGGATCCTGGTTCAGGTTATTCTGCAGGTCAGACACTATTCATCGATGGAACTACAATTGGTGGTGGTACTAACGCTACTATTAGTATTACTCAGGCAGACTTAGAGGATAACAAGCATAGTATCCTACAGATTTCTGGTGGTGCTTTGTATAACCCAGATTCATATGTAGTGATGACCAGTGTTGAGGATCAGTCTTCAGTTGGTGTTGCTAGAACTTCTGGAAGTCCTGCTATTATTCCTGGTATGTACGCATATCCAGCAGATAGTGGAACAGGTATTTCTTCAACTACATATAACTCCGATACAGGTTTAACAACACTAGTATCTACAGGTAGTGCTGGTTTTGGTCTTCAGAGGGGTAACACTTTCGTTGTATTCAGTAGTAACTATAGCTATCTCGGTAAGTTCTTTGTATCTAATGTTCCAACTCCAGATACATTGGAGTTCTACTCATACCGAGATCTAGGAACTGTATCTATTGTAGGTAAGACAGGTTTAGATGTAAATGATGCTAACACTGGTTCCTTAGGTGAGAACGTGGGTGTTAGAGCTACACCACTATATGATAACGGTGTATTCTATCTTGAACAGTCTTCAGGTACTGGAACACAACTAACAGTTAGGGCTGAAGATGGTGGTGTGGCTGGTAATGTAGACTCTAAGATGTACCTAGGAAGATACTTCCAAATGGGTTCTGAGATTATCAGAGTTGCTAGTAAGAACTTTGATGGAGCCAATAACAATATCGTAACTGTTATCCGTGGTGCTCTTGGTACCGTTGTTAGCAACCTTCCCATTAATACTAAGGTGAAGGCAATCAGACCTTCCGCACTAGAACTTAGAAGACCTTCTATTCTACGTGCCTCAGGTCACACCTTTGAATATCTTGGTTATGGTCCTGGTAACTATTCCACTTCATTACCACAACTACAGGTTAAGCAACTCCCAGATGATGAAATTTACCTAGTACAGGCTCAGGAACTATCCTGTGGTCAGGTTGTTTATACTGGTATGAGTGATAATGGTGACTTCTATATCGGTAATACCAAGTATTCCGCAACCTCAGGAACACAATCAACCTTTGATGTTCCCATCCCAACTGTTGCTGGTCAACCAGGTAGTTCTAATAATGTTGTGTTTGATGAAGTTATCATCAACCGTCGTCTATTCGTATCTGGTGGTGAAACTAATGAGGTTCAGTCACAGTTTGATGGTCCTGTTAAGTTTACCCAGTCTGTTACTATTCAGAACAATCTTTTCGTAACTGGTACAACTCAACTCAATAGAATTGAGATCACCAGTACAGAGAACGCAACCAGTTCTGCTAATGGTGGAGCACTAACTATCAGAGGTGGTGCTGCTATTGGTAAAGACTTCTATGTTGGTGGTGAAATGTACACCAACGCATATCAAATAGAAGATACAAGTGCAGTTCTTGAAATTGGTACTAACCAGTCATCTAAGGATATCTCTGTTGGTGGTTCAACTGATACAGATAGAGTTGTTTTTAATACAACTAAACTAGCAACAGGTGAAGGTGCTGAAGAGGTAGTTAACGCAGACGCTGGTGTTGTTGTTGAGGGTGGATTAGTTGTTCGTGA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Tertiary structure

PDB ID
48fe8d9d8c58a7125cfbb059d8f3675cdc69f96a7aeb776cecd6e42721d0f02e
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7883
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50