Protein

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Genbank accession
AIA83253.1 [GenBank]
Protein name
phage fiber protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,84
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MISEKFFNDVEADKVFSSDFEIITPNHCNVFVKVYDWTTHVVSWELVNVGEYDIINNAVVFHGSLTLITFSGGEWTGDLKVVVATTIEDLDINPSDCSILAEMQAEIQVLATIADDIKELGLVETGVFQTVADNIGDINTIANFEFSYTGIWETIFNNLTNGAIQGVFESIDNVNIVADNIGSVNLVGSNIGVVIDVGLNLGNITTVVGMEANINTLIPHIANIGVVSTNIDNVNLVGNDIDNINTIAESLVVYTGGTNVTIVDGVISSVDTNTTYTDAEIKTKYENNTDTNSFTDIEKTKLSGVDDSANNYVHPANHTIAEVTGLQTALDGKTTEAYVTTQITNLIDASPDALNTLNELAGALNDDANFAGTMTTALAGKVDDSQVLTNVPLGAVFTDTTYSVGDGGLSEVSFTSTDNTKLDGIESGATGDLTGAEIKVLYESEDNTNVLSDFNLAKLVAIEQNATGDLTEQEHYNMLWNISVTPATYDFNIFKDADQTKLAGIEANATGDMTDAEVKTAYENNAETNVFTDAQVTKLAGIEALAGVTDTTSVTSAGALMDSEVTNLADVKAFDTTDYATSAQGTKADGALLRAGGLVSGDIAFVDNVPASFGNNSNLVIKYDTTNAIIKEQTSSDGLLIQSKLLKLTDNIDVCGFVLQQL
Physico‐chemical
properties
protein length:662 AA
molecular weight: 70286,76280 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,06647
hydropathy:0,03761

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lauvirus lau218
[NCBI] 		1465639 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host root
[NCBI] 		1

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIA83253.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ183193 [NCBI]
CDS location
range 26694 -> 28682
strand +
CDS
ATGATAAGTGAAAAGTTTTTTAATGACGTTGAGGCGGACAAGGTATTCTCTTCTGATTTTGAAATCATTACCCCAAACCACTGTAATGTGTTTGTTAAGGTTTATGACTGGACGACACACGTTGTTAGTTGGGAATTGGTAAATGTCGGTGAATATGATATTATTAATAATGCAGTAGTATTCCATGGGTCTTTGACCTTAATCACATTTAGTGGTGGAGAATGGACTGGAGATCTAAAGGTTGTTGTTGCTACTACTATTGAAGACCTTGACATTAACCCAAGTGACTGCTCTATTCTTGCAGAAATGCAAGCAGAAATACAAGTATTGGCTACGATAGCTGATGATATTAAAGAGTTGGGATTAGTTGAAACAGGTGTATTCCAAACTGTTGCTGATAATATTGGCGATATTAACACAATAGCTAATTTTGAATTCAGTTATACTGGTATTTGGGAAACAATTTTTAACAACCTAACCAATGGTGCTATTCAAGGAGTATTTGAAAGTATAGATAATGTTAATATTGTCGCTGATAATATTGGTAGTGTTAATTTAGTAGGATCAAACATTGGTGTTGTTATTGATGTTGGACTAAACCTTGGCAACATTACTACTGTTGTAGGTATGGAAGCAAACATAAACACCCTTATTCCTCATATAGCTAATATTGGTGTTGTTTCTACTAATATTGATAATGTAAATCTTGTTGGTAACGACATTGATAACATTAATACTATTGCTGAAAGCTTAGTCGTTTATACTGGTGGAACTAATGTAACTATCGTTGATGGTGTTATTAGCTCTGTTGATACAAATACTACTTATACAGATGCTGAAATTAAAACCAAGTATGAAAACAACACAGATACAAATAGCTTTACAGATATTGAAAAGACAAAACTATCAGGTGTTGATGATAGTGCTAATAATTATGTTCATCCAGCCAACCATACAATTGCCGAAGTAACAGGACTACAAACAGCTTTAGATGGGAAGACCACAGAGGCCTATGTAACCACACAAATTACAAACCTTATTGATGCTTCGCCTGATGCCTTAAACACCCTAAATGAGCTTGCTGGGGCCCTTAACGACGATGCTAACTTCGCTGGAACTATGACTACTGCATTAGCAGGAAAAGTAGATGATAGTCAAGTATTAACCAATGTTCCGTTAGGGGCTGTATTTACTGATACTACTTATTCAGTAGGCGATGGTGGTTTAAGTGAGGTGAGCTTTACTTCTACCGACAATACAAAGCTTGATGGCATTGAGTCAGGAGCTACAGGTGATTTAACTGGTGCTGAAATTAAGGTTTTATATGAGAGTGAGGACAATACAAATGTCCTTAGTGATTTTAATCTCGCTAAGTTGGTTGCCATTGAGCAGAATGCTACTGGTGATTTAACAGAACAAGAGCATTATAATATGCTTTGGAATATATCTGTAACCCCTGCCACCTATGACTTTAATATCTTTAAAGATGCTGATCAAACTAAGTTAGCTGGTATTGAAGCCAATGCTACTGGTGATATGACTGATGCAGAAGTTAAAACAGCTTATGAAAACAATGCAGAAACTAATGTATTTACAGATGCACAAGTAACCAAACTTGCAGGTATTGAAGCTTTAGCAGGTGTAACAGATACGACAAGTGTAACTTCTGCTGGTGCTTTAATGGACTCCGAAGTAACAAATCTTGCAGATGTTAAAGCATTTGATACTACTGATTATGCCACTTCTGCTCAAGGGACAAAGGCTGATGGTGCGCTTCTTCGAGCTGGTGGTTTGGTAAGTGGCGATATTGCTTTTGTGGATAATGTTCCGGCATCTTTTGGAAATAATAGTAATTTAGTTATTAAATATGATACAACTAATGCTATAATTAAGGAACAAACTTCATCAGATGGTTTGCTTATACAATCTAAATTGTTAAAATTAACTGATAATATTGATGTCTGTGGATTTGTATTACAGCAACTCTAA

Tertiary structure

PDB ID
1ef4834fbd5a570989ff216ecc17f826cd739bd2957032350384de07418460d8
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5887
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Sulfur oxidation genes in diverse deep-sea viruses Anantharaman,K., Duhaime,M.B., Breier,J.A., Toner,B.M. and Dick,G.J. — — GenBank