Protein

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Genbank accession
YP_010355572.1 [GenBank]
Protein name
virion structural protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,85
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,97
Protein sequence
MADRFPLIVNAISKKIEEIVSGDNLELTGNGIVVSGDTGAGKYLSSDGTTVFWNSPGDVYLTQTQTLTNKTLETCSLSGSLNNVTNLPNSSLVNSGITINGSTISLGGTVITPDNNTTYAIAAVDGLSANEKILRLTSGGNSGAGINDDIIIGVGAPSTIPSGSNALSLLIDRSGDEITISGTVVDNNTITTLESGTGGSPVTGAVVLSAGNFTTISQSGNNITITGQDTDTVTRLRATTGQSYNPGDFTFLSGGATNVVQGVDGSSNPTITISSTDTVTRLKGGSTGTLTSGDITITGGTNATVSQSGGVITVASTDTNTVTQIAADSNTLSSGDFRFAGGGATSLSQSTSNGVTTITVTSANDDTGASLGASGGLILDNGSFKIKNASNFSGNTILKWDSGNSQIADSLITDDGTTITIGGDLVVSGTQTILNTSVLQVEDNSIELRKGNNLTGSDGGIQLNLTTNSTGAVTSYNQLQWYNAGGYWRSWDGSVDNRFVTENETQVLTNKTLTSPTLTAPSIGAATATSINGLEITTTASAVLEIASSKTVEVSRSLDLTTNQPDVSTSVNFRVGGNVAYTSDTLATFSSTTSTQMRGLITDTTGLDRLVFQTSPNLLTSITTSSTTFSLLNATATSIDFGGATQAMSIGSSSGTTTINNSLEVIKSLTVGTGISDNIVLNGTVNSANADILIRGTLTDPMSVGRGGGGVGSNTRVGVGALQNNSSGSQNTAFGYQALFTNNSGAGNTAFGFEALRACGVGNTNVAIGPLSLRVLTEGDNNIAIGRSTLETASAGNSNVCIGHYAGHSATGSGNVLIGPADNENTTDVTFRPPNPSGNRQLVIGSGTNAWIKGDSNFDVTFDNDVRVVGDTTVEGNLIVNGTQTITKSNIVQISDKNLELAAVVSTQFQATCISGNATINGVTPTTGLIPGMEVQPTTVGFNFPSGTRIVSITGNSVVLNNNAAADGLCSFDAIGPSDLSADGGGITIKSSAGDKTLSWVNQYTAWTSSENFDLASGKQYRINNVNFLTSTQIGPSTGVIALGAGVTTSSLTSVGTLSALTVSGNVSLTGTGYIQLPSGTDAERPGSPAEGMLRWNDTSNVFEGYNGTAWGAIGGAVEVSSSAPSNSVEGDLWYDSDDGRLFVYYNDGSTTQWVDASPNGTPTDLVVSGDITPDVDNSSNLGSPTKRWANIYSADLQLSNEGAANDVDGTWGQYTIQEGEEDLFLINRRSGKKYKFNLTEVN
Physico‐chemical
properties
protein length:1243 AA
molecular weight: 127023,21410 Da
isoelectric point:4,22606
aromaticity:0,05310
hydropathy:-0,11392

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014j
[NCBI] 		1493514 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010355572.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_062735 [NCBI]
CDS location
range 166170 -> 169901
strand +
CDS
ATGGCTGACCGCTTTCCGTTAATTGTTAATGCAATTTCAAAGAAGATTGAGGAAATTGTATCAGGAGACAATTTAGAATTAACTGGCAACGGGATTGTTGTTAGTGGCGATACTGGTGCTGGTAAGTATTTAAGTAGCGATGGAACTACCGTATTCTGGAATTCTCCTGGTGATGTTTACTTAACACAAACACAAACATTAACTAACAAAACGTTAGAAACTTGTTCACTTTCTGGATCTCTTAATAATGTAACAAACCTTCCAAATAGTTCTCTTGTAAACTCTGGAATTACAATTAATGGATCTACTATTTCTCTGGGTGGAACTGTAATAACCCCTGATAATAACACTACTTATGCTATCGCTGCTGTAGATGGATTATCTGCTAATGAGAAAATTTTAAGATTGACATCTGGTGGAAATTCTGGAGCAGGAATTAATGATGATATTATTATTGGAGTAGGAGCTCCTTCAACTATTCCTTCTGGGTCTAATGCTCTTAGTTTACTGATTGATAGATCTGGTGATGAAATAACTATATCTGGTACAGTAGTTGATAATAATACTATTACCACTTTAGAATCTGGTACTGGTGGAAGTCCTGTTACTGGCGCTGTGGTTCTTTCTGCTGGAAATTTCACTACAATATCACAATCTGGTAATAATATTACTATTACTGGTCAAGATACTGATACAGTTACAAGACTAAGAGCAACTACTGGACAATCTTATAACCCCGGAGATTTTACTTTTCTTTCTGGTGGAGCTACAAATGTAGTTCAGGGTGTTGATGGTAGCAGCAACCCAACTATTACAATTAGTTCTACTGATACTGTAACTAGATTGAAAGGTGGTTCAACCGGCACTTTAACTTCTGGTGATATTACTATTACTGGTGGAACAAATGCTACGGTATCTCAGTCGGGAGGTGTGATTACTGTTGCTAGTACAGATACAAATACTGTTACTCAAATTGCTGCTGATTCAAACACACTTAGTTCGGGTGATTTTAGATTTGCGGGTGGTGGCGCTACAAGTTTAAGTCAGAGTACTTCAAACGGTGTAACAACAATTACTGTTACTTCTGCAAATGATGATACTGGTGCTTCTCTTGGTGCTAGCGGCGGTCTTATTCTTGATAATGGTTCCTTTAAAATAAAGAACGCTAGTAATTTTAGTGGTAACACTATTTTAAAATGGGACTCTGGTAATTCTCAGATTGCTGATAGTTTAATTACAGATGATGGAACTACAATTACTATTGGTGGAGACTTAGTTGTCTCTGGTACACAAACCATTCTTAATACATCTGTTCTTCAAGTTGAAGATAATAGTATTGAACTGCGAAAAGGCAATAATCTTACCGGATCTGATGGTGGTATACAACTTAATCTAACAACAAATTCTACTGGTGCTGTCACATCTTACAATCAATTACAATGGTATAATGCTGGTGGATATTGGAGATCTTGGGATGGATCGGTTGATAATCGTTTTGTAACAGAAAATGAAACGCAAGTTCTTACAAATAAAACTCTTACCTCTCCAACATTAACTGCTCCTTCAATTGGTGCTGCAACTGCTACAAGTATTAATGGTCTTGAGATTACTACTACAGCATCTGCGGTTCTGGAGATTGCTTCTTCTAAAACTGTTGAAGTCAGCAGAAGTTTAGACCTTACAACAAACCAACCAGACGTTTCTACTTCTGTCAACTTCAGAGTGGGTGGTAATGTTGCGTATACATCTGATACTCTCGCAACATTTTCTTCCACTACGTCTACACAGATGCGTGGTTTAATCACTGATACTACTGGTCTTGATAGACTTGTTTTCCAAACAAGTCCTAATTTATTAACAAGCATTACCACTTCATCTACGACCTTTTCTCTATTAAATGCTACTGCAACATCTATAGATTTTGGTGGTGCTACTCAAGCAATGAGTATTGGATCTTCGTCTGGTACTACGACAATTAATAATAGTCTAGAGGTTATTAAATCTTTAACTGTTGGTACTGGAATTTCTGATAATATAGTACTCAATGGAACAGTTAATTCTGCTAATGCAGACATTTTAATCAGAGGAACTCTTACTGATCCTATGTCAGTTGGTAGAGGGGGTGGTGGTGTAGGTTCAAACACCAGAGTTGGTGTTGGTGCCCTACAAAATAACAGTTCTGGTTCGCAAAATACTGCTTTCGGTTATCAAGCATTATTTACAAATAATTCTGGTGCAGGTAACACCGCTTTTGGTTTTGAAGCACTTAGAGCTTGTGGTGTTGGTAATACTAACGTTGCCATTGGACCATTATCACTGCGTGTTCTTACTGAAGGGGATAATAATATTGCTATTGGTAGAAGTACTTTAGAAACTGCTTCTGCTGGTAATTCTAATGTTTGTATCGGACATTATGCTGGACATAGTGCTACTGGCAGTGGCAATGTTCTTATTGGTCCAGCAGATAATGAAAATACAACTGACGTTACATTTAGACCACCAAATCCATCTGGTAATAGGCAATTAGTTATTGGATCTGGAACTAATGCTTGGATTAAAGGTGATTCTAATTTTGATGTAACATTTGATAATGATGTTCGTGTTGTTGGTGATACAACCGTTGAGGGTAATTTGATTGTTAATGGTACTCAAACTATTACCAAGTCAAATATTGTACAAATTTCTGATAAGAACCTTGAACTGGCAGCAGTTGTTAGTACTCAGTTCCAAGCAACTTGTATTTCTGGAAATGCTACTATTAATGGAGTTACACCAACTACTGGACTAATTCCTGGAATGGAAGTTCAACCCACAACAGTTGGATTTAACTTCCCATCTGGAACTAGAATTGTTTCTATTACTGGAAACAGTGTTGTTCTCAACAACAACGCAGCAGCTGATGGTTTATGTTCGTTTGATGCTATTGGACCTTCTGATTTATCAGCAGACGGTGGTGGAATTACAATCAAGAGTTCTGCCGGTGATAAAACATTGTCTTGGGTCAACCAATATACTGCTTGGACATCTTCGGAAAACTTTGATCTTGCTAGTGGAAAACAGTATAGAATTAATAATGTCAACTTCTTAACATCTACTCAGATTGGTCCGTCAACTGGAGTTATCGCACTTGGTGCTGGTGTAACAACATCATCTTTGACTTCTGTTGGAACTTTAAGTGCTCTAACAGTATCTGGTAATGTAAGTCTAACGGGAACAGGATATATACAACTACCTTCTGGAACTGATGCTGAAAGACCTGGATCTCCAGCAGAAGGTATGCTACGCTGGAATGATACATCAAATGTATTTGAAGGATATAATGGTACTGCTTGGGGAGCAATTGGTGGTGCTGTAGAAGTTTCAAGTAGTGCTCCTTCTAATTCTGTGGAAGGAGATCTTTGGTATGATTCTGATGATGGTCGTTTGTTTGTATACTATAACGACGGATCCACAACTCAGTGGGTTGATGCCTCACCAAACGGAACACCAACTGATCTAGTTGTTTCTGGAGATATTACTCCAGATGTTGATAATTCAAGTAATCTTGGTTCACCAACTAAGCGTTGGGCAAACATCTACTCTGCTGACCTTCAACTATCTAACGAGGGTGCTGCTAATGATGTAGATGGAACGTGGGGTCAATACACAATTCAAGAGGGTGAGGAAGACCTGTTCCTAATCAATAGGAGGAGTGGTAAGAAGTATAAGTTTAACCTTACGGAGGTAAACTGA

Tertiary structure

PDB ID
21aff5b7f5f583e3cc22fbb18919a8c08957c26e0d5cdafc667fd19387b43f4c
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5320
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank