Protein
View in Explore- Genbank accession
- AIA83154.1 [GenBank]
- Protein name
- phage tail protein
- RBP type
-
TSP
- Protein sequence
-
MEVNQTLPTLANGISQQAVHLRNDSFVEEMFDCNVSLVEGITVRAGEDTVIMDAWPVINDNNGNPVDINQGLLWTHTYDTGTGFGDDASKREVHIQVSTTGAWRVYLFSGDLTIPDTFSYGWDEYFYIFDVPSDMPPYSAVSVGDSTFITNRLRTVTKSSVWAHTGHVHKDHSFYWVKRSLLSYGGTDNSDIRNYRYTINTIDIPTSYSSAYGDTDVVAYSLANAGGVGFEVSGSVVYRDDIVAGSSDWVTGDSWGNMASVGWQGRVSKLQDLPNNMGSFYGTKTIVEVTGDEDNEFTGFWAWVENEGDNWSETIEPGISSGLDKSSMPHVFRNVDDGSTHGVFEVQEFEWNDREVGGDESNAMPTIVGGVVRDIFFFKNRLGLLTKNGVVLSEVGLYENLFRTTVTDLLDSDPIDISIDTNIVSDLHYAIPYNNNLLIFGAREQYILSGAKTLTPKNVSVTQSTKYDYNTIIPPVALGANVYFTVNKGFYLQVREYYNVDGTASNESTDITEQVPRLIPNDSELTMVGSEKHDMLFIANDDLTFVYNMAWGSEGKVQSAWHLWTVGGYLTHANASLHMFRRGYPIDGSGNEITTDDFGVGTGELDLSTDIFLGHNPFRIFGDSNYDTWMFPYIGLSEWGFKSGSYEVDDKTGKLQIRKITLFGDSNAHIFIKEKGLSVADPSIAVIENTKTATVMRDSKETSIGIMPVDGEEFSITSINLSGRFNKRAGRAI
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 733 AA molecular weight: 81275,98330 Da isoelectric point: 4,52947 aromaticity: 0,11596 hydropathy: -0,27790
Domains
Domains [InterPro]
IPR058003
3–569
3–569
1
733
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Podophage Lau218 [NCBI] |
2784187 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIA83154.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ183191
[NCBI]
CDS location
range 25156 -> 27357
strand +
strand +
CDS
ATGGAAGTTAATCAAACACTACCAACATTGGCTAATGGCATATCACAACAGGCGGTTCATTTAAGAAATGATAGTTTTGTTGAAGAAATGTTTGACTGTAATGTTAGCCTTGTTGAGGGTATTACAGTAAGGGCTGGAGAGGATACCGTGATAATGGATGCTTGGCCAGTCATTAATGATAACAACGGAAACCCTGTTGATATTAATCAGGGGCTTCTATGGACACATACATACGACACAGGAACAGGTTTTGGTGATGATGCTTCTAAGAGAGAGGTTCATATTCAAGTATCGACAACAGGAGCATGGCGGGTTTATTTGTTTAGTGGTGACTTAACAATTCCTGATACTTTCTCTTATGGGTGGGATGAATACTTCTATATATTCGATGTGCCTTCAGATATGCCACCATACAGTGCCGTTTCGGTTGGAGATAGCACATTCATAACCAACAGATTAAGAACGGTAACAAAATCAAGTGTATGGGCTCATACGGGGCATGTTCATAAAGACCATAGCTTTTATTGGGTAAAAAGGTCTTTGTTGTCATATGGTGGCACTGATAATTCAGATATTAGAAATTATAGATATACAATAAATACGATTGATATTCCAACTTCTTATAGTTCTGCATATGGAGACACCGACGTTGTAGCTTATTCTCTGGCAAACGCTGGTGGTGTTGGTTTTGAAGTAAGTGGTAGTGTTGTATATAGAGATGATATTGTTGCTGGTAGTTCTGATTGGGTTACTGGTGATAGCTGGGGAAACATGGCGAGCGTTGGTTGGCAGGGTAGAGTTTCCAAACTACAAGATTTGCCGAATAATATGGGTTCTTTTTATGGAACAAAAACTATTGTTGAGGTAACTGGTGATGAAGATAATGAATTCACTGGTTTTTGGGCTTGGGTAGAAAACGAGGGTGATAATTGGAGCGAAACAATAGAGCCCGGTATTAGCTCTGGTTTAGACAAAAGCAGTATGCCGCATGTATTTAGAAATGTTGATGATGGATCAACTCATGGTGTTTTCGAGGTTCAAGAATTCGAATGGAACGATAGGGAGGTTGGTGGTGATGAAAGTAATGCGATGCCAACAATTGTAGGTGGTGTTGTTAGAGATATATTTTTCTTTAAAAATAGGCTCGGACTACTAACAAAAAATGGTGTTGTTTTATCAGAAGTAGGATTATATGAAAACCTATTTAGGACAACCGTAACTGATTTATTAGACAGCGACCCAATTGATATTTCGATTGATACCAATATTGTTTCAGACCTACACTATGCTATTCCTTATAATAACAATCTGCTTATTTTTGGTGCAAGAGAACAATATATATTAAGTGGAGCGAAAACGCTTACTCCTAAAAACGTATCTGTTACTCAATCCACAAAATATGATTACAATACAATCATACCACCAGTCGCCCTTGGTGCTAATGTTTATTTTACAGTAAATAAGGGATTCTATTTACAGGTGCGTGAGTATTACAATGTTGATGGAACTGCAAGCAATGAAAGCACAGATATAACAGAACAAGTTCCAAGACTTATTCCTAATGATAGTGAGCTAACAATGGTTGGTTCAGAAAAACACGATATGCTATTTATTGCCAATGATGATCTAACCTTTGTTTATAACATGGCTTGGGGTAGCGAAGGGAAGGTTCAGAGTGCTTGGCATTTATGGACTGTTGGTGGCTATTTAACCCATGCCAATGCCTCACTACATATGTTTAGGCGAGGATATCCAATTGATGGTTCTGGTAATGAAATAACAACTGATGATTTTGGCGTTGGCACTGGAGAGCTTGATTTAAGCACTGATATTTTCTTGGGACATAATCCCTTTAGAATATTTGGTGATAGCAACTATGACACTTGGATGTTCCCATATATTGGACTAAGTGAGTGGGGCTTTAAGAGTGGAAGTTATGAGGTGGATGATAAAACTGGTAAATTGCAAATAAGAAAAATTACTTTATTTGGTGACAGTAATGCTCATATTTTTATAAAAGAAAAAGGACTTAGTGTGGCTGATCCATCAATAGCAGTTATTGAAAATACAAAAACAGCTACCGTCATGAGAGATAGTAAAGAGACATCAATTGGAATAATGCCTGTTGATGGTGAAGAGTTTAGCATAACTTCCATAAATTTAAGCGGAAGATTTAACAAGAGAGCAGGGAGAGCTATATGA
Tertiary structure
PDB ID
705667d03d35e123a455126a22bc7e37fc9353ea1ce205fcec3445d83c42163f
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Sulfur oxidation genes in diverse deep-sea viruses | Anantharaman,K., Duhaime,M.B., Breier,J.A., Toner,B.M. and Dick,G.J. | 2014 | 24789974 | GenBank |