Protein

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Genbank accession
CAR63408.1 [GenBank]
Protein name
putative short tail fibre
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,69
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,84
Protein sequence
MSRNIRSNYLTDKVTFGASTMPIGSIVPIFKADDDKVADNGVVTQLGSVVAGAGGGSGYFTDLGTISGYPTGPVELTIAPGNLSVGNDEITYPNHPFIDGDKITVVEAEQAPNIAKLGGSIQSFTVTNGGSGYTTPPNIQVTDNGSGPVSAGSFSVVINNGSVTQINVLNGGEGYQFPQVSFTGGGGGAGAAATAQLSPGGDGGVQFERGFTFYVQYVDASTFRIGRSNADILAGKYYNVTDLGSAGTFKLASTTGFGLRVGIAANLDGSVNFATIKSPGYGYEDGDVVYILQPGSDGLARVEIVSTVSDTGDNPEEQYPGFLYCDGGEYNAQDYPLLYEILSNDYGGTGGTYNPSDFGQTSAVTFKVPDYKTRKLVGAGGGVSGGGSPVSGNVISTVGATGGKWFFSKNDQEALYDIGNIVISGYDNVTDFVAGTLTGDVTIKIGPLQEKLISAVPEHEHAILTSEAPEAGAFEGAGFFADDHSAGFKNGNGQVNFFLPSGGVPLFHTHGIVDYVIPDPNASTYGNVSGIGEALTKTFNSTAIVSSGSSTTITIAAHELQTGYKIRVLDNPQSTIATVNVDGVATSFAANTEWYVIKVDNDTIKLAKSRYAALRLQELQFSTNGNSADITIETHYAAAGNFPSELITTIITPTPTSYDIDDNYVVGGKPVIIPGDTFSTTVQKQNQTTSGTYSVPAPTADELPLTSIAVTLGGAGGYGATTDSAPGGGGNTTYTFSASGYTYEVRATGGSGGTRGDSGGNGGGGGAGFIYVKQGGTTVQTVSLSTITPGTTNALTGGVEYTLVSYYAGQSGTGGSSSQGGTGGASSYIGGAGGDGSRTLFTGSNDVTQSFTSPSSSYFSYNIPNDWPLDQLQAEVKGGGGGSGGRGDGGNWFPGNGNGGKRVTANINPGNNGTLRVYVGGGGNAGGNRSGGSGGVGFASGGNGGNGTGGGGGGGGGGASAVGTPSAIIIGAGGGGGGGAAGDATQGSDQNGQLNSNDAVQNLSALFSGTGSNGGNSVCSGGGGGGGGGGVGVGSGIGGGGGGGNGSNARRDGFGGRRGQSAVKSSGTGPTASLVSEGGAGNATSVSAGNTQNGNAGSVVFVATENQTFYGNGGGGGGSGAYFELQFTEVGNGSAGTLVVGDGYSDGRGIIGYQVPQSSGDTAGTSSTIGIFDAASTSVDYVESGTGSGTTGGFVSPDGFKYLRFFGNEANRWARSIGINASASNSKGTVVEALRFNVIVGDNSNGGEAPSAPLELFASNDAGGSYTKIGTVASTSGPSVWTDVDVALPADYQEPGMLFELRQSRSSSGNPNNDNYGVSAVYLIHAEGEVTTITTSSGKVDLGVEYITEVIPPQGDPINSAGIDVNDGIFTLSSAVKLSVTSELQPEIDIPLLTRYHLVKYLIKAY
Physico‐chemical
properties
protein length:1406 AA
molecular weight: 140438,66420 Da
isoelectric point:4,43898
aromaticity:0,08464
hydropathy:-0,17802

Domains

Domains [InterPro]
IPR037053
303–372
IPR037053 G3DSA:2.60.120.260
IPR011083
320–352
IPR011083
SSF88874
320–387
SSF88874
CAR63408.1
1 1406
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-RSM4
[NCBI] 		555387 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAR63408.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
FM207411 [NCBI]
CDS location
range 155418 -> 159638
strand -
CDS
ATGTCCAGAAATATCCGCTCTAATTATCTAACAGATAAAGTAACTTTTGGTGCATCTACTATGCCGATTGGATCTATTGTTCCAATCTTCAAAGCAGATGATGATAAGGTTGCAGATAATGGTGTTGTAACTCAACTTGGATCAGTTGTCGCTGGTGCTGGTGGGGGAAGTGGGTATTTTACTGACCTTGGAACAATCTCTGGGTATCCAACAGGACCAGTTGAGTTAACTATTGCTCCTGGCAATCTTTCGGTTGGAAATGATGAGATTACTTATCCTAATCATCCATTTATTGATGGCGATAAGATTACGGTAGTGGAAGCAGAACAAGCACCAAACATTGCTAAACTTGGTGGTTCTATTCAAAGTTTTACGGTAACCAATGGTGGATCTGGATACACAACTCCTCCAAATATTCAAGTTACTGATAATGGTAGTGGACCTGTATCCGCTGGATCTTTCTCTGTTGTAATTAACAACGGATCTGTCACCCAAATCAACGTATTGAATGGTGGTGAAGGTTATCAGTTCCCTCAGGTTTCTTTTACTGGTGGTGGCGGTGGTGCAGGCGCAGCAGCTACAGCACAATTATCTCCTGGTGGTGATGGTGGTGTGCAGTTTGAGCGTGGATTTACTTTTTATGTTCAATATGTAGATGCCAGCACTTTTAGAATCGGCAGAAGTAATGCTGACATCCTTGCTGGAAAGTATTATAACGTCACTGATCTTGGATCTGCTGGTACATTTAAACTTGCATCAACAACTGGTTTTGGATTGAGAGTTGGTATTGCCGCAAACTTAGATGGTTCTGTTAATTTTGCTACAATTAAAAGTCCTGGATATGGATATGAAGACGGTGATGTAGTCTATATTCTGCAACCTGGAAGTGATGGTCTTGCTAGAGTAGAAATTGTTTCTACAGTAAGTGATACAGGTGATAATCCAGAAGAACAATATCCTGGATTCTTATATTGTGATGGCGGTGAATATAATGCACAGGACTATCCATTATTGTACGAGATTCTGAGTAATGATTATGGTGGCACTGGAGGAACATATAATCCATCTGATTTTGGTCAGACTAGTGCAGTAACATTTAAAGTTCCTGACTATAAAACTAGAAAACTAGTTGGAGCAGGCGGTGGTGTTTCTGGGGGAGGATCTCCTGTATCAGGTAATGTCATCTCCACAGTTGGTGCTACTGGTGGTAAATGGTTCTTCTCTAAAAATGATCAGGAAGCATTATATGACATTGGTAATATTGTTATCAGTGGATATGATAATGTGACCGATTTTGTTGCTGGTACTTTGACTGGTGATGTTACCATTAAGATTGGACCTTTGCAGGAAAAATTAATTTCTGCAGTTCCAGAACACGAACATGCTATTCTTACATCAGAAGCACCAGAAGCAGGTGCATTTGAGGGTGCTGGATTCTTTGCTGATGATCACTCTGCTGGATTTAAGAATGGTAATGGACAGGTTAACTTCTTCCTGCCATCTGGTGGTGTTCCTTTGTTCCACACTCATGGTATTGTAGATTATGTTATCCCAGATCCTAATGCATCAACATATGGTAATGTTAGTGGAATTGGTGAAGCTTTAACCAAAACTTTTAATTCTACGGCAATTGTCTCTAGTGGTTCATCAACAACTATTACTATTGCTGCTCATGAACTACAGACGGGATATAAAATTAGGGTTTTAGATAATCCACAATCTACAATTGCTACAGTTAATGTAGATGGTGTAGCTACTTCATTCGCCGCAAATACTGAATGGTATGTAATTAAAGTTGATAACGATACAATTAAATTAGCAAAGAGTAGATATGCTGCTCTTCGTCTGCAAGAGTTGCAGTTCTCTACAAATGGCAACTCTGCTGATATTACTATTGAGACACACTACGCAGCTGCTGGTAATTTCCCATCGGAACTTATTACAACGATTATCACACCAACTCCAACTTCATATGATATTGATGACAACTATGTAGTTGGTGGCAAACCAGTTATCATTCCTGGTGATACATTCTCGACAACTGTTCAAAAACAAAATCAAACAACTTCTGGTACATATTCTGTTCCTGCACCTACAGCAGATGAACTCCCACTAACATCTATTGCGGTAACTCTTGGTGGTGCTGGTGGTTATGGTGCTACTACTGATTCTGCTCCTGGTGGCGGAGGAAATACAACCTACACATTTAGTGCTAGTGGATACACCTATGAAGTGAGAGCGACTGGTGGTAGTGGTGGAACTAGAGGAGATTCTGGTGGTAATGGTGGTGGAGGTGGAGCAGGTTTCATCTATGTTAAGCAAGGTGGAACTACAGTACAAACTGTTAGTCTTTCTACAATTACTCCTGGCACAACAAATGCACTTACAGGCGGTGTTGAATATACACTAGTTTCATATTATGCAGGTCAGTCTGGAACTGGTGGTAGTTCATCTCAGGGTGGTACTGGTGGTGCTTCTTCTTATATCGGTGGAGCAGGTGGTGATGGATCTAGAACATTATTTACTGGAAGTAATGATGTAACGCAGTCATTTACATCACCATCATCTTCATACTTTTCTTATAACATTCCAAACGATTGGCCACTAGATCAACTTCAGGCAGAAGTTAAAGGTGGTGGCGGTGGATCTGGTGGTCGCGGTGATGGCGGCAACTGGTTCCCTGGAAATGGTAATGGTGGTAAGAGAGTTACTGCTAACATTAACCCTGGCAACAATGGTACTTTGAGAGTATATGTTGGTGGTGGTGGTAATGCTGGTGGCAACAGATCTGGTGGTTCTGGTGGTGTAGGTTTTGCTTCTGGTGGTAATGGTGGTAATGGTACTGGCGGCGGTGGCGGCGGCGGTGGAGGTGGTGCATCTGCTGTTGGAACACCTTCTGCTATCATTATCGGTGCTGGAGGCGGTGGCGGTGGTGGTGCTGCTGGAGACGCTACCCAAGGATCTGACCAAAATGGTCAATTAAATTCTAATGATGCGGTTCAAAATCTGTCTGCATTGTTCTCTGGAACTGGTTCCAATGGTGGCAACTCAGTCTGCTCTGGAGGCGGCGGAGGCGGCGGCGGAGGCGGCGTTGGCGTAGGTTCTGGCATCGGTGGTGGTGGAGGCGGTGGAAACGGATCCAACGCCCGTAGAGATGGTTTTGGTGGCAGGAGAGGTCAGTCTGCTGTTAAGAGTAGTGGAACTGGTCCAACAGCATCTCTCGTTTCTGAGGGTGGAGCAGGAAATGCTACTAGTGTTAGTGCAGGAAATACACAAAATGGTAATGCTGGATCTGTTGTCTTTGTTGCTACTGAGAACCAAACATTCTATGGTAATGGTGGCGGCGGTGGTGGTTCGGGTGCTTACTTTGAACTGCAATTTACTGAAGTTGGAAATGGTAGTGCTGGCACACTAGTTGTTGGTGATGGATATAGTGATGGTAGAGGAATCATTGGATATCAGGTTCCACAATCTTCTGGTGATACAGCAGGAACATCTTCTACTATTGGTATCTTTGATGCTGCAAGCACTAGCGTAGATTATGTTGAGTCTGGTACTGGTAGTGGAACTACTGGTGGATTTGTTTCTCCAGATGGATTCAAATATCTAAGATTCTTTGGTAATGAAGCAAATAGATGGGCAAGAAGTATCGGTATCAATGCATCTGCTAGCAACTCAAAAGGAACTGTTGTTGAAGCATTGAGATTTAATGTAATTGTTGGTGATAATTCTAATGGTGGTGAAGCACCATCTGCTCCTCTTGAACTATTTGCAAGTAATGATGCTGGTGGAAGTTATACTAAAATTGGAACCGTTGCATCTACTTCTGGTCCATCAGTTTGGACAGATGTTGATGTTGCGTTGCCAGCAGACTATCAAGAACCAGGAATGTTGTTTGAACTAAGACAATCACGTTCATCTTCTGGCAATCCAAACAACGATAACTATGGTGTATCTGCTGTCTATTTGATTCATGCTGAGGGTGAGGTTACAACTATTACCACATCTTCTGGTAAAGTTGATCTTGGTGTAGAATACATTACAGAGGTTATTCCACCACAGGGAGATCCAATTAACTCTGCTGGTATTGATGTTAATGATGGTATTTTCACACTATCCTCTGCTGTGAAGTTAAGTGTTACATCTGAGTTGCAACCAGAGATTGACATTCCGCTCTTAACACGCTATCATCTAGTTAAGTATTTGATTAAGGCGTACTGA

Tertiary structure

PDB ID
74f53b08c4e498273e51c6f7b57b41ed67b46553f74aca8bb4a2117b4b7808cf
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7152
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50