Protein
View in Explore- Genbank accession
- XHB27081.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTF
- Protein sequence
-
MQITFYDKNMFETAVADNALLNAIKIKKASLTSLFEEATHQVEFEFSKEFGEWWGIRENGYLAFKFRGRFFRFSIVKFKENAKNKTIEIVGDYFNLEMLNENCSTYEKQPARTIVQHFTAMEILPYANFEIGVNELASSTRTLTYTGDEVKYKRLISIINNFGGECEFEIRQKANGQFDKLVLNIYRANDGINYQGVGRNRRDFEITIDNSNDVSRTVDSTAIKTSIEPIGRDGLRIGNRGTIWKNSEGQVEFYQKNNRIYAPLAAEEMPRVLESDKFLLWKLQVDTDTIPKLEAEGLKWLRNVCYAKEIIEVSGSFDVEVGDTVILNHKGIGRYGILGSLRVMKVTWDLLTETSEVTFANFKRLASKISAQGLALQNSIESPASYDITFNTTAGTVFKNNTGSSNVSFNFSKNGAQTAVLGQRWYKGTQLLSNGLEVMIKPNMLTEGKLNLRLEVDVTSAITFSKELTFINVNDGVNGSDGRGITSTEDYYMVSANKMDITSATSGWIKDIPQIATPANKYHWHYHVDVYTDGTRKETVPAIIGIYGSKGSDGATSWTAWANSKDGKVDFSITEAKNRRFIGTYTGLTQSTNYLDYKWIDMSANVVIGTQNLLDGTKSFSGSWFTEGTIFETTKISEYPFEFKKWKSGNKVSHTIEFDVKAGVTYTFTAAIARENAGRLYFYLYDLFANHITSNTPRETIIENVTTDIQMFKVTFVPLRDGKIKPRFAMLASDAGWFMTGGYMLVKGNKSGDWQESEVDRINNLDTKADQELTQAQILALEERTAIARENAIAEAMQNTLSEVETKWKLWYDLNTIDEKQKVANDIAQLFDRTTEFKQLLGEASARFSFINNETLIGEEGVAIGDKGGKAKLFLSNDSISFVTNGVAQMTLTGDTLTIKNGLFTERIQIGNFVEEVYDRNPLFNVIRAIRNS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 933 AA molecular weight: 105169,32180 Da isoelectric point: 5,62759 aromaticity: 0,11147 hydropathy: -0,34855
Domains
Domains [InterPro]
Coil
787–807
787–807
1
933
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Streptococcus phage phiGBSVK-F1_GBSInt11.2 [NCBI] |
3345078 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XHB27081.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP766240.1
[NCBI]
CDS location
range 28962 -> 31763
strand +
strand +
CDS
GTGCAGATTACATTTTATGACAAAAATATGTTTGAAACTGCGGTTGCAGACAATGCATTGTTAAATGCTATTAAAATAAAAAAAGCATCCCTAACCTCATTATTTGAGGAGGCAACTCACCAAGTTGAATTTGAATTTTCAAAAGAGTTTGGTGAGTGGTGGGGTATCAGGGAAAATGGCTATCTAGCTTTTAAATTTAGAGGAAGATTTTTTAGATTTTCGATTGTTAAGTTCAAAGAGAACGCTAAAAATAAGACAATTGAAATTGTTGGTGACTATTTTAACTTGGAGATGTTAAATGAAAATTGCTCTACTTATGAGAAACAACCAGCTAGAACAATTGTGCAACACTTTACCGCAATGGAGATTTTGCCTTATGCCAATTTTGAAATTGGAGTAAATGAACTGGCAAGTAGCACAAGAACTTTGACATATACAGGTGATGAGGTCAAATATAAAAGGCTCATATCGATCATTAATAACTTTGGTGGCGAATGTGAGTTTGAAATTAGGCAGAAAGCAAATGGTCAATTTGACAAGCTTGTGCTCAATATTTATAGAGCAAATGATGGTATTAATTACCAAGGTGTTGGACGAAATAGACGAGATTTTGAAATAACTATTGACAATTCAAATGATGTTAGCCGAACAGTTGACTCAACAGCAATCAAGACATCAATAGAGCCTATTGGAAGGGATGGTTTAAGAATTGGTAATAGAGGTACAATTTGGAAGAATAGTGAAGGGCAAGTTGAATTTTATCAAAAAAATAATAGAATTTATGCCCCACTGGCTGCCGAAGAAATGCCAAGGGTTTTAGAGTCTGATAAGTTTTTACTTTGGAAATTACAAGTTGATACTGATACTATACCAAAACTAGAAGCCGAAGGGCTAAAATGGCTCAGAAATGTTTGTTATGCAAAAGAAATCATTGAAGTCTCAGGCTCATTTGATGTAGAAGTTGGCGACACAGTCATACTTAATCACAAAGGTATAGGAAGATACGGCATATTGGGTTCACTTAGAGTTATGAAAGTTACTTGGGATTTACTAACAGAAACAAGCGAAGTAACATTTGCTAACTTTAAACGTTTAGCATCTAAGATTTCTGCTCAGGGTCTAGCTTTGCAAAATAGCATCGAAAGTCCAGCGAGCTATGATATTACATTTAACACAACAGCTGGAACTGTGTTTAAAAATAATACAGGCTCATCAAATGTATCGTTTAATTTCAGCAAAAATGGAGCCCAGACGGCCGTTTTAGGTCAAAGATGGTATAAAGGAACCCAACTGTTATCAAATGGCTTAGAAGTGATGATAAAGCCTAATATGCTTACTGAGGGAAAACTCAATTTGAGGCTTGAGGTTGATGTCACATCTGCAATTACATTTAGCAAAGAATTAACTTTTATCAATGTAAATGATGGTGTTAATGGCTCTGACGGTCGTGGTATCACATCGACAGAAGATTATTACATGGTTTCAGCTAACAAGATGGATATCACATCTGCAACATCTGGATGGATTAAAGATATACCTCAAATTGCAACTCCTGCAAATAAATATCATTGGCACTATCATGTTGATGTTTATACAGATGGAACAAGAAAAGAAACAGTACCAGCAATTATTGGTATTTATGGTTCAAAGGGTTCTGATGGTGCTACATCATGGACAGCGTGGGCCAATTCGAAAGATGGAAAAGTTGACTTTAGTATTACTGAAGCTAAAAATAGAAGATTTATCGGTACTTATACTGGATTAACGCAATCAACAAATTATCTTGACTACAAGTGGATTGATATGTCTGCTAATGTTGTCATTGGTACTCAAAATTTACTTGATGGTACAAAATCATTTTCTGGAAGTTGGTTTACCGAAGGTACAATATTTGAGACTACAAAAATCAGCGAATATCCATTTGAATTTAAGAAATGGAAGTCTGGAAATAAGGTTAGTCACACTATCGAGTTTGATGTTAAAGCTGGTGTAACATACACTTTTACAGCTGCTATAGCAAGAGAAAATGCTGGAAGATTGTACTTCTATTTGTATGACTTGTTTGCAAACCATATCACAAGTAACACACCTCGTGAGACGATAATTGAAAATGTCACTACAGATATCCAGATGTTTAAAGTTACATTTGTACCGCTCAGAGACGGTAAAATAAAACCACGCTTTGCCATGCTTGCCAGTGATGCAGGTTGGTTTATGACTGGTGGATATATGCTTGTCAAAGGTAATAAATCTGGAGATTGGCAAGAGTCCGAAGTTGATAGAATAAACAATCTCGACACAAAAGCTGATCAAGAATTAACCCAAGCACAAATTCTAGCTCTTGAAGAAAGAACTGCTATAGCAAGAGAAAATGCAATTGCTGAGGCTATGCAGAATACACTCAGTGAAGTTGAAACTAAGTGGAAGCTTTGGTATGACTTAAATACGATAGACGAAAAGCAAAAAGTTGCAAACGACATCGCTCAATTGTTTGATCGTACAACTGAGTTTAAACAACTATTAGGTGAGGCAAGTGCAAGATTTAGCTTTATCAACAATGAAACGTTGATTGGTGAAGAGGGCGTTGCTATCGGTGACAAAGGCGGAAAAGCAAAGTTATTTCTATCAAATGACAGCATTTCATTTGTGACAAATGGTGTTGCTCAGATGACATTGACAGGTGATACCTTAACAATAAAAAATGGACTGTTTACAGAGCGTATACAAATTGGAAATTTTGTTGAAGAAGTCTATGACAGAAATCCATTATTTAATGTTATCAGAGCAATTAGAAATAGTTAG
Tertiary structure
PDB ID
660bf0286e03b1f4865575cb58f3472702fa1fd2a18c9a098057343add86473e
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50