Protein
View in Explore- Genbank accession
- BAO47146.1 [GenBank]
- Protein name
- tail morphogenetic protein
- RBP type
-
TSP
- Protein sequence
-
MANFLKNLHPLLRRDRNKKDNQDPNFALIDALNEEMNQVEKDAIESKLQSSLKTSTSEYLDKFGDWFGVYRKTDENDDVYRARIIKYLLLKRGTNNAIIDAIKDYLGRDDIDVSVYEPFTNIFYTNKSHLNGEDHLMGYYYRFAVINVSIGDYFPVEIIDVINEFKPAGVTLYVTYDGASTIRGGAIIKWLEGLPKIETYQEFDRFTGYDDTFYGHINMNQSKDTDNSSSDIFKTNHSLINSLDVLTGSSSVGRQYINYGYVTSYVYNPGMTSSVNQISASTEGRGQEVPTDYYMYTSTKNNNTVELSMQTTSGVSYLYNNFNFRDYMSKYRPQVDLQSDEARRIVSDYIKELSIDYYLSAVIPPDESIEIKLQVYDFSINRWLTVSINNLSFYEKNIGSNIGYIKDYLNSELNMFTRLEINAGKRDSVDIKVNYLDLMFYYYEQGIYTIKPYKALIENYLDVSRETYVEAFKIASLSNGDIITKTGFQPIGYLKLVGNYENTIPSTINIVAKDTDNNPIESNELDVYNTLENRNLLQSYKGVNTIAREITSTKEFTVSGWAKEIYSTNYLSKVLKPGKVYTLSFDMEITGNDPTLKSYSDNHGIYLYSNTKGIVVNGVKSMERTIGNKVSVTQTFTAPTITDHRLLIYTGRYTSDGKASTPPVFFNTVKITELKLSEGSSKLEYSPAPEDEPNVIEKGIKFNNILTNIQTLSINSDTILKNVTLYYSYYGDNWVELKTLGNISTGETTETNNLIDLYGLQTVDYSNINPMSKVSLRSIWNVKLGELNNQEGSLSNMPNDYFNAVWQDIDKLSDIEIGSMRMVKDTEGGVFDGATGEIIKATLFNVGAYTDLDMLSYTLTNYTEPLTLGSSRLISELKEELLTSESFNVDNRIKVIDSIYEELPNTSIIKNGFVEREVTGSKYLDYGLYEPIEDGTRYKLIVEGEFKDNIEFISLYNSNPNFNETFIYTSEIINGVAEKEFIAKPSTEDKPRLNTDVRIYIRPYDSTISKVRRVELRKV
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1019 AA molecular weight: 116281,79830 Da isoelectric point: 4,84867 aromaticity: 0,11678 hydropathy: -0,43916
Domains
Domains [InterPro]
Coil
29–49
29–49
1
1019
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Staphylococcus phage phiSA12 [NCBI] |
1450142 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Staphylococcus aureus [NCBI] |
1280 | Bacteria > Firmicutes > Bacilli > Bacillales > Staphylococcaceae > Staphylococcus |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
BAO47146.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
AB903967
[NCBI]
CDS location
range 69946 -> 73005
strand +
strand +
CDS
GTGGCTAATTTTTTAAAGAATCTTCATCCACTATTAAGAAGAGATAGAAATAAAAAAGATAATCAAGACCCTAACTTTGCTCTCATAGATGCACTCAATGAAGAGATGAATCAAGTAGAGAAAGATGCTATAGAAAGTAAACTACAATCTTCTCTAAAGACATCTACAAGTGAATATTTAGATAAGTTTGGGGATTGGTTTGGAGTTTATCGTAAGACCGATGAGAACGATGATGTTTATAGAGCAAGAATTATAAAATATTTACTCTTGAAAAGAGGAACTAATAATGCTATAATAGATGCTATAAAAGATTATTTAGGTAGAGATGATATTGATGTAAGTGTATATGAGCCCTTTACAAATATTTTCTATACGAACAAATCACATTTAAATGGTGAAGACCATTTAATGGGATACTATTATAGATTTGCTGTTATTAATGTATCTATAGGTGATTATTTTCCTGTAGAGATTATAGATGTAATTAATGAATTCAAACCTGCAGGTGTAACTCTATATGTCACTTATGATGGGGCTTCTACTATTAGAGGAGGAGCAATTATTAAGTGGTTAGAGGGGTTACCTAAAATAGAAACATACCAAGAGTTTGATAGATTTACAGGCTATGATGATACATTCTATGGTCATATTAATATGAATCAAAGTAAAGATACTGATAACAGTTCATCAGATATTTTTAAAACAAATCATAGCTTAATTAATAGTTTAGATGTTTTAACAGGTTCCTCTAGCGTAGGTAGACAGTATATTAACTATGGATATGTAACATCATATGTTTATAATCCAGGTATGACATCCTCTGTAAACCAAATAAGTGCTAGTACAGAAGGTAGAGGTCAAGAAGTACCTACTGACTACTATATGTATACTAGTACTAAGAATAACAATACAGTAGAACTTAGTATGCAAACTACTTCCGGTGTGTCTTATTTATATAATAACTTTAATTTTAGAGATTATATGAGTAAATACAGACCTCAAGTAGATTTACAATCTGATGAGGCTAGAAGAATTGTATCTGATTATATAAAAGAATTAAGTATTGATTACTATCTTAGCGCTGTGATACCTCCTGATGAAAGTATAGAAATTAAATTACAAGTTTATGATTTTTCTATTAATAGATGGCTTACAGTATCAATTAATAATTTATCTTTCTATGAAAAAAATATCGGTAGCAATATAGGATATATAAAAGATTATCTAAACAGTGAATTAAATATGTTTACTAGGTTAGAGATAAATGCAGGTAAAAGAGATTCAGTAGATATTAAAGTTAATTACTTAGATTTAATGTTTTATTACTATGAACAAGGTATTTATACAATAAAACCTTATAAAGCATTAATAGAAAATTATTTAGATGTATCTAGAGAGACTTACGTAGAGGCATTTAAAATAGCATCATTATCTAATGGAGATATTATAACTAAAACAGGTTTTCAGCCTATAGGGTATTTAAAACTAGTTGGTAATTATGAAAATACAATACCTAGCACAATAAATATAGTAGCTAAAGATACAGATAATAACCCTATAGAATCTAATGAATTAGATGTATATAATACATTAGAGAATAGAAATTTATTACAATCTTATAAAGGTGTAAATACGATAGCTAGAGAAATAACTTCTACAAAAGAGTTTACTGTATCAGGATGGGCTAAAGAGATATACTCAACTAATTATCTTTCTAAAGTATTAAAACCAGGTAAAGTGTATACGTTATCTTTTGATATGGAAATAACAGGTAATGACCCAACTCTTAAATCTTATTCTGATAATCATGGTATATATTTATACAGTAATACTAAGGGAATTGTTGTTAATGGTGTTAAATCTATGGAACGTACTATAGGTAACAAAGTATCTGTAACTCAAACTTTTACAGCCCCTACTATTACTGACCATAGATTATTAATATATACTGGAAGATATACATCTGATGGTAAAGCATCAACTCCTCCAGTGTTCTTTAATACAGTTAAAATTACGGAATTAAAATTGTCTGAGGGTTCCTCTAAGCTAGAGTACTCACCTGCTCCGGAAGATGAACCTAATGTAATAGAAAAAGGAATTAAATTTAATAATATCCTAACTAATATACAGACTTTAAGTATTAATTCGGATACTATCTTAAAAAATGTAACTTTATATTATTCTTACTATGGTGATAATTGGGTAGAACTAAAGACTCTAGGAAATATTAGTACTGGAGAAACAACAGAAACCAATAACTTAATAGATTTATATGGATTACAGACAGTAGATTATTCTAATATAAATCCAATGTCTAAAGTATCATTACGTTCCATTTGGAATGTTAAGCTAGGTGAATTGAACAATCAAGAAGGTTCTTTATCTAATATGCCTAATGATTACTTTAATGCTGTATGGCAGGATATAGATAAATTATCAGATATTGAGATAGGTTCTATGAGAATGGTTAAAGACACTGAGGGTGGAGTATTCGATGGAGCTACAGGTGAAATTATTAAGGCTACTCTATTTAATGTAGGTGCTTATACTGATTTAGACATGTTATCTTATACTTTGACTAACTATACTGAACCGTTAACTTTAGGCTCTAGTAGATTAATAAGTGAGTTAAAAGAAGAACTACTAACATCAGAATCATTTAATGTTGATAATAGAATTAAAGTAATTGACTCAATATATGAGGAGTTACCAAATACAAGCATTATTAAAAATGGATTTGTTGAAAGAGAAGTTACAGGTTCTAAATATTTAGATTATGGTTTATATGAGCCTATAGAAGATGGTACTAGATATAAACTTATTGTCGAAGGAGAATTTAAAGATAATATAGAATTTATATCTTTATACAATTCTAACCCTAATTTTAATGAAACATTTATATATACATCAGAGATAATTAATGGAGTTGCTGAAAAAGAATTTATTGCAAAACCATCCACCGAAGACAAACCAAGGTTAAATACAGATGTTAGAATATATATACGACCTTATGATTCAACTATCTCTAAAGTAAGAAGAGTAGAATTAAGGAAAGTTTAA
Tertiary structure
PDB ID
f09f2e0d3cfc76088c82846312ff962ffd7012186cbe75488bb7b7471e7ebafa
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Genomic analysis and determination of host recognition proteins in staphylococcal Twort-like phages | Takeuchi,I., Osada,K., Asakawa,H., Miyanaga,K. and Tanji,Y. | 2016-10 | — | GenBank |