Protein
View in Explore- Genbank accession
- WCF58911.1 [GenBank]
- Protein name
- cadherin repeat domain-containing protein
- RBP type
-
TSPTSPTSPTF
- Protein sequence
-
MALNIVINKSVATPPVSYPAGAIVATAIASGGTAPYTYSLATGSDKFAINSTTGVVTTIAEMNIDSIASFSVAATDSTSTPVTGISTVVYPDIQAKVQNKFNRTNVIYKITKNIDLRKGVLTIPEGCTLDLSEGNGIIFNGSIYISDNVTFKANKNIVLENLLIIFASSVSNVTLESLNLKGTVEPITTNKDLGTRAISVKNSSVIVSNISIRDCVISSYNAGIVLNGNNIIIEDNLLYNNGYSGMSSDASVDITASNASTTLENNNFIISRNRCLSRYVHRNIDIGELSSENNIIISENICVSSSGITTEDTTARKSHCIMVGYTGEKIINKVAFIVNNICKNSIWSGIYVRGGGSTEAEENNRYIALIRGNYIENVNPVPGVSYFGAIAPKLKDGSIISDNTIINCNVAMDLGFTFNKSLVKVCNNSIIDCNTGIKNDTFAYQIEIDNNTIKGSNIGIGIGETTSGVTELDDNRAILIQNNNIILDKNGSRGIQLYTNNTNNINVVNNTIKALSGVTETSGIFIRTSLNSGYNVLRNNFINLDTGFKDDLFNLKRNTNQNLNYNTFVNNTTGILITANSSSQLYIIEGNIFNSCVNNYGSQSWLKMIYEGKKLNNGTFHIICDNSLYDYSNSTYGYITKAEPCFLIKTFKAGDKISSHNNFTQALCLNDSSGTVDNDTKWRMDNVRLSTTARGICAVVGQMLWDNTLKKVLWYDGTNWIDSTGATA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 728 AA molecular weight: 78901,86200 Da isoelectric point: 5,79953 aromaticity: 0,07555 hydropathy: -0,07184
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Bacteroides phage PhiCrAssBcn19 [NCBI] |
3023101 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WCF58911.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ221554
[NCBI]
CDS location
range 88189 -> 90375
strand +
strand +
CDS
ATGGCATTAAATATAGTAATAAATAAGTCTGTAGCAACTCCTCCTGTTAGTTATCCAGCAGGAGCTATAGTTGCAACAGCAATAGCATCAGGGGGGACTGCCCCTTATACTTACAGTTTGGCTACTGGCTCTGATAAGTTTGCTATTAATAGTACTACAGGAGTAGTAACTACTATAGCAGAAATGAATATAGATAGTATAGCATCATTCAGTGTGGCTGCTACAGACAGTACTTCTACTCCAGTTACAGGAATTTCCACTGTGGTATATCCTGATATACAAGCAAAAGTTCAGAATAAATTCAATAGAACTAATGTTATCTATAAAATAACTAAAAATATTGACTTAAGGAAAGGTGTCCTTACTATTCCAGAAGGATGTACTTTAGATTTAAGTGAGGGTAATGGTATTATTTTCAATGGAAGTATTTACATATCAGATAATGTAACATTTAAAGCAAACAAAAATATTGTATTAGAGAACCTTTTGATAATATTTGCATCAAGTGTATCAAATGTAACACTTGAAAGTCTTAATCTGAAAGGAACTGTAGAACCTATTACAACAAACAAAGACTTAGGAACAAGAGCTATATCAGTTAAAAATTCTTCTGTAATAGTAAGTAACATAAGTATTAGAGATTGTGTTATTAGTTCCTATAATGCAGGAATAGTTTTAAATGGAAATAATATTATAATAGAAGATAATCTTTTATACAATAATGGTTACAGTGGTATGAGTTCAGATGCCTCTGTAGATATTACTGCAAGTAATGCTTCTACAACTCTTGAAAATAATAACTTTATAATTTCAAGAAATAGATGTTTATCAAGATATGTACATAGAAATATTGATATTGGTGAATTAAGTTCTGAAAATAACATTATCATATCTGAAAATATATGTGTGAGTAGTTCTGGTATAACAACCGAAGATACAACTGCAAGGAAATCACATTGTATAATGGTTGGATATACAGGAGAAAAGATAATAAATAAAGTAGCATTTATTGTAAATAACATTTGTAAAAATTCTATTTGGAGTGGTATATATGTTAGAGGTGGTGGAAGTACAGAAGCAGAAGAGAATAATAGGTATATTGCTTTAATCAGAGGAAATTATATTGAAAATGTTAATCCAGTTCCAGGAGTATCCTATTTTGGAGCTATTGCACCTAAATTAAAAGATGGTTCTATAATATCTGATAATACAATTATTAATTGTAATGTTGCAATGGATTTAGGATTTACCTTTAATAAGTCCTTAGTAAAAGTATGTAATAATTCCATTATAGATTGTAATACAGGTATTAAGAATGATACCTTTGCTTATCAAATAGAAATTGATAATAACACAATTAAAGGTTCTAATATTGGCATTGGTATAGGAGAAACTACAAGTGGAGTTACAGAGTTGGATGATAATAGAGCAATCTTAATACAGAATAATAATATAATTCTTGATAAGAATGGAAGTAGAGGTATTCAGTTATACACAAATAATACCAATAATATTAATGTAGTAAACAATACTATAAAAGCACTTTCAGGAGTCACTGAAACAAGTGGTATCTTTATTAGAACTTCATTAAATTCTGGATATAATGTATTAAGGAACAACTTCATCAATCTTGATACTGGATTTAAAGATGATTTATTTAATTTAAAGAGAAACACGAATCAAAATCTAAATTATAATACATTTGTAAATAATACTACTGGTATATTAATTACTGCCAATTCAAGTTCTCAATTGTATATAATTGAGGGGAATATATTTAATTCGTGTGTTAATAATTATGGTTCTCAGAGCTGGCTTAAAATGATATATGAAGGGAAAAAATTAAATAATGGAACATTTCATATAATATGTGATAATTCATTATATGATTACAGTAATAGTACTTATGGTTATATAACAAAAGCAGAACCTTGCTTTCTTATTAAAACCTTTAAAGCAGGAGATAAAATTTCTTCTCACAATAATTTCACACAGGCACTATGCTTAAATGATAGCTCTGGAACTGTGGATAATGATACTAAGTGGAGAATGGATAATGTAAGATTATCTACTACTGCAAGAGGTATCTGTGCTGTAGTTGGACAAATGTTATGGGATAATACCTTGAAAAAGGTACTGTGGTATGATGGAACTAACTGGATAGATTCAACTGGAGCAACTGCATAA
Tertiary structure
PDB ID
62d700c6a44d82a158fcfac01247666d88f3786d517c133a6dd47d95593da89d
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50