Protein
View in Explore- Genbank accession
- AWD91036.1 [GenBank]
- Protein name
- long tail fiber distal subunit
- RBP type
-
TSPTSPTF
- Protein sequence
-
MATLKQIQFKRSKVAGVRPTPAQLAEGELAINLKDRLLFTKDDTGAIIDLGFAKGGNIDGNVIHNGNYNQTGDYALKGAFTQTGSYTTSGSITANGDITAKSRLMTDNGEVLVRGAGTTHVRFQDLADARERGIIYSQNRAGDTKQILNVRVQDYTNSTSNIFAFNGDGLFYAPSISGGTSVKSPIIYTNKVITDGKAAGDYDISSLSNNTPLAESETAINHLRVMRNAVGAGIFHEVNVNDGIAWYSGDGLDTYLWSFTWSGGLKAGHSISVGLPGGPKGYSELGTASIALGDNNTGLKWKQDGQFHTVNNGAYTLLTTPTEVTSLKQLVAGYSTNGSDLILPTAQNYPLVIVNTTNDKNGFGDGQTLLGYHQSGKYHHYFRGKGVTNVNTDGGLLVTPGNVEVRGGSVNIDGRGNASTVIFKGSTTGYSSVDNIELKGWGDTFNTVGGSRKNVLETSDATGWMHYIQRTTAGKVESYLNGTMNIVEGLSVSQDTSLKRNLYVSNEIKVRAASGLRIWNDKYGVIFRNSEDQLHIIPTNANAGESGGLSPLRPLSIMLDTGRVKIPNLEADQVYFRGNGALEFPNSNGASYANQNTTKAPLYQALDAATQAFYPITKQKNIDSNVTVTQGMDRATSEYRIVAQGDLLGDGDATGLKYWRFTKEGNFMAQNRLYAGTAYMNTDGNIAGSIWKKYSGATNLDAAVNTRVGKGGDTMTGRLTLKTNSDAIVINSAATESGYLKGQKAGIDNWYVGNGGADNAVSIYSFQTNSGVNINADGDIALNPQGSATFNFNRDRLFINGSVWASHQAGDWGNQWKQEAPVFVDFGNVGNDSYYPIIKGKSGITNEGFISGVDFGMRRITNNWAQGIIRVGNQENGSDPQAIYEFHHNGVLYVPNMVKTGARLSAGGGDPVWAGPCLVIGDNDTGLVHGGDGRINMVANGMHIASWSSAYHIHEGLWDTTGALWTEQGRAIMSYGHLVQANDSYSTYVRDVYVRSDIRVKKDLVKFENASDKLSKINGYTYMQKRGMDEEGNQKWEPNAGLIAQEVQAILPELVEGDPDGEALLRLNYNGVIGLNTAAINEHTAEIAELKSEIEELKKLVKSLLK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1106 AA molecular weight: 119133,95640 Da isoelectric point: 6,03576 aromaticity: 0,08680 hydropathy: -0,38436
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Enterobacteria phage vB_EcoM_IME281 [NCBI] |
2163887 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AWD91036.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH051913
[NCBI]
CDS location
range 12595 -> 15915
strand -
strand -
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAGATACAATTTAAAAGAAGTAAAGTAGCTGGTGTACGTCCTACGCCAGCGCAGTTGGCTGAAGGCGAGCTGGCTATTAACTTAAAAGACCGTTTGTTATTTACCAAAGATGACACTGGAGCGATTATCGACCTTGGCTTTGCTAAAGGTGGTAATATCGACGGAAACGTTATTCATAACGGTAACTACAACCAGACCGGCGATTATGCCCTGAAGGGTGCTTTTACCCAAACAGGTAGTTATACGACATCCGGAAGTATAACAGCAAATGGCGATATCACAGCAAAATCTCGCCTAATGACAGATAACGGTGAAGTTCTTGTACGGGGTGCAGGAACTACCCACGTTCGATTCCAGGATTTGGCTGATGCGCGTGAAAGAGGCATAATTTATTCTCAAAACCGTGCTGGGGATACCAAGCAAATCTTAAATGTTCGTGTTCAGGATTACACTAATTCAACATCTAATATTTTTGCATTCAACGGTGACGGTTTATTTTATGCTCCATCTATTTCTGGTGGAACATCGGTAAAATCTCCAATAATTTATACTAATAAAGTTATTACCGACGGTAAAGCCGCCGGCGATTACGATATATCTTCATTATCAAATAACACTCCATTGGCAGAAAGCGAAACGGCTATTAACCACCTCCGTGTTATGCGAAATGCTGTAGGAGCAGGTATTTTCCACGAAGTTAATGTTAATGACGGAATAGCCTGGTATTCCGGAGATGGCTTAGACACTTATCTTTGGTCGTTTACCTGGTCCGGTGGATTGAAAGCCGGTCATTCTATTTCTGTAGGTCTTCCAGGTGGCCCTAAAGGATATTCTGAATTAGGGACGGCTTCAATTGCTCTTGGTGACAATAACACAGGTTTGAAATGGAAACAAGACGGCCAGTTCCATACAGTTAATAATGGAGCTTATACTTTACTTACAACTCCGACTGAAGTTACAAGCCTTAAACAGTTAGTTGCTGGTTATTCAACCAACGGTTCTGATTTAATTCTTCCTACAGCTCAAAACTATCCATTAGTTATTGTTAATACTACTAATGATAAAAACGGCTTTGGTGATGGACAGACTCTTTTAGGTTATCATCAGAGTGGTAAATACCACCATTATTTCCGTGGTAAAGGTGTAACAAACGTTAACACTGATGGTGGGTTGTTGGTTACTCCTGGTAACGTTGAAGTCCGTGGTGGTTCGGTTAATATTGACGGTCGTGGTAACGCTTCCACTGTGATTTTTAAAGGAAGTACCACAGGATATAGTTCAGTTGATAATATAGAGCTCAAAGGTTGGGGTGACACTTTTAATACGGTAGGTGGTTCTCGTAAAAACGTATTGGAAACATCTGATGCTACCGGCTGGATGCACTATATTCAACGAACTACAGCAGGTAAAGTCGAATCTTATTTAAACGGCACGATGAACATCGTCGAAGGATTGTCTGTCAGTCAAGATACATCCTTAAAACGCAATCTGTATGTTTCCAATGAAATTAAAGTCCGCGCTGCTAGTGGTCTTCGTATTTGGAATGATAAGTATGGTGTTATTTTTCGAAATTCAGAAGACCAGCTGCATATTATCCCAACCAATGCTAATGCTGGTGAAAGTGGCGGATTGAGTCCATTACGCCCATTAAGTATTATGTTAGACACTGGTCGGGTTAAAATCCCCAACTTAGAAGCAGACCAGGTTTATTTTAGGGGTAATGGTGCATTGGAATTCCCTAATAGTAACGGCGCATCTTATGCCAACCAGAATACGACTAAAGCTCCGTTGTATCAAGCACTCGATGCTGCAACCCAAGCATTTTATCCTATTACTAAGCAGAAAAATATCGATTCGAATGTAACTGTTACTCAAGGTATGGACCGCGCTACGAGCGAATACCGAATTGTTGCTCAAGGTGATTTGCTTGGTGATGGTGATGCTACAGGATTAAAATATTGGCGCTTTACCAAAGAAGGTAACTTCATGGCTCAGAACCGCTTATATGCCGGTACAGCTTACATGAATACCGATGGTAATATTGCAGGTTCTATTTGGAAAAAGTATAGCGGTGCTACTAACCTTGATGCTGCGGTGAATACTCGTGTAGGTAAAGGCGGCGACACGATGACAGGCCGTTTAACTCTTAAAACCAACTCGGATGCCATTGTTATTAACAGTGCTGCAACCGAATCTGGCTATTTGAAAGGACAAAAAGCAGGTATTGATAACTGGTATGTAGGTAACGGCGGTGCCGATAATGCTGTATCAATTTATAGTTTTCAAACTAATTCAGGCGTAAATATTAATGCAGACGGCGATATTGCTTTAAACCCACAAGGTTCAGCCACTTTTAATTTTAATAGGGACCGTCTTTTTATTAATGGCTCTGTCTGGGCATCCCACCAGGCTGGCGATTGGGGAAACCAATGGAAGCAAGAAGCACCGGTATTTGTTGATTTTGGTAATGTTGGTAATGATAGTTATTATCCGATTATCAAAGGAAAATCTGGTATTACTAACGAAGGATTCATATCAGGTGTAGATTTCGGTATGCGTCGTATCACTAATAACTGGGCGCAAGGTATTATTCGTGTAGGTAACCAGGAAAACGGTTCTGACCCACAAGCTATCTATGAATTCCACCACAATGGAGTTCTGTATGTTCCTAACATGGTTAAAACTGGAGCAAGATTATCAGCTGGCGGCGGTGACCCTGTGTGGGCCGGACCATGTCTTGTTATTGGTGATAATGATACCGGATTAGTTCATGGTGGCGATGGCCGAATCAATATGGTTGCCAATGGTATGCATATTGCATCTTGGTCTAGCGCTTATCATATCCATGAAGGTCTTTGGGATACCACTGGCGCTTTATGGACTGAGCAAGGAAGAGCTATTATGTCTTATGGTCATCTTGTTCAGGCAAACGACAGCTATTCTACATATGTCCGTGACGTTTATGTCCGTTCTGATATTCGTGTTAAAAAGGACCTCGTTAAATTTGAAAATGCTTCTGATAAGCTTTCTAAAATTAACGGTTACACTTATATGCAGAAACGTGGAATGGACGAAGAAGGTAATCAGAAATGGGAACCTAACGCTGGTTTAATTGCTCAAGAAGTTCAAGCTATTTTACCAGAATTAGTTGAAGGTGACCCTGACGGTGAAGCTTTACTTCGTTTGAACTACAACGGTGTAATTGGTTTAAATACAGCTGCAATCAACGAGCATACTGCAGAAATTGCAGAACTCAAATCAGAGATTGAAGAGCTTAAAAAATTGGTTAAATCATTGTTGAAATAA
Tertiary structure
PDB ID
6193986a42071625e5b70d637720ade548e8ef66e0f854c6fd924de3f5c3ebaa
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Complete genome sequence analysis of Enterobacteria phage IME281 | Li,P., Wang,J. and Tong,Y. | 2016-02-25 | — | GenBank |