Protein
View in Explore- Genbank accession
- AHB80592.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber-like protein
- RBP type
-
TSPTSPTF
- Protein sequence
-
MADRFPLIVNAVSKKIEEIVAGDNLELTNNGIVISGDSGAGKYLYSDGTTVLWSSPGDVYLTQSQTITNKTFDSCTISGTSNTLTNIPNTSLINSGITVNGVTVSLGGSITTPDNDTTYTIGAADAISPQEKIIRITGSDTSTDEVKITAGTNMNIARTGDTLILSSSYVDTDTVTRLQAYTGGAFQDGDVTIRGAGGTTVTQDTQSKTILVTSTDADTITRLRATAGQVYNSGDFTLLASGATSIAQGIDGNGDPTITYSSTDTITRLKGGGAGSFTSGDITVTGGTNVTVSQSGSTITVASQDNDTVTQFAANSTSLAAGDFRLTASGATTLTETSSGGVTTIEISSVNSDTGASLTASGGILLASDDFSLKNSTNFTGNTLVKWDSGNSQLANSLISDNGSEVTIGGDLIVTGTQTILETSTLIVEDNIIELRKGSSLVGADGGIQVNRTTDSNGTVVSYQQMQWYEAGSYWRSWDGSVEKRLVTETDTQVLSNKTLVSPTLTGPTLGAATATSINGLGVVSTASASININSAKSLEVQRSCLFTTDNNSGTVTVNFRNGGNVAYRSDTLASFSSTTSTQLRGLISDSTGLDRLVFQTSPNILTSLNTTSSTFNLLNSGAAAINFAGATTVLSIGSTTGTTTVNNDTVLSKDLTVGTTVGDIITLNGTVNSENADIVIRGSGSDPMSIGRGSGNVTTNTRVGVRALNAVTSGSQNTAFGYEAGYTINAGAANLAIGNRALRSCGIGNNNIALGRDVLLGCTDGSKNIAIGNNTLESATSGEANVCIGHYAGYAALGSGNVLIGPATNENTSDATYRPPNPGGDRQLVIGSGTEAWIEGNSDFKVTIPNEFAVTGDCTITGDLTVNGTTTSVNSNVMTVDDKEIELASVVNVVVQATAVNGNSTITGITPTTGLIPGMAVNSQTGGIDFGTDCIIVSITGNSAVLSNSVTGSGSVTFEAIGPSDTAANGGGLRLKGTTDKTITYDDSRADKYWTFSENLEVAFGKKFVIGNQLALSTTSIGSTVVNSSLTSVGTLVNLTVDGFLTIGGVVTEKVFNNYATTLTPASNVLTINVAGANNICGSPATQAINEWAFTGVSLSNGQSKTITLILDANTAATYGDDCTVDGNSVTNGVQWSGGSPPIATSNTDILTFIIMKDNAGITKVFGQGNTDFS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1175 AA molecular weight: 119960,36130 Da isoelectric point: 4,28631 aromaticity: 0,05021 hydropathy: -0,02562
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Synechococcus phage ACG-2014h [NCBI] |
1340810 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Synechococcus sp. WH 7803 [NCBI] |
32051 | Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AHB80592.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KF156338
[NCBI]
CDS location
range 161718 -> 165245
strand +
strand +
CDS
ATGGCTGACCGTTTCCCATTAATTGTTAACGCAGTTTCCAAAAAAATTGAGGAAATTGTAGCAGGTGACAATTTAGAGTTAACCAATAATGGCATTGTCATTAGTGGCGACTCTGGTGCAGGAAAATACTTATACAGTGATGGAACCACTGTTTTGTGGAGTTCTCCTGGTGATGTATACCTAACGCAAAGTCAAACTATTACGAACAAGACGTTTGATTCTTGTACAATTTCTGGTACTTCAAATACTCTAACAAATATTCCGAATACATCACTAATCAATAGTGGTATCACGGTTAATGGTGTTACAGTTTCACTTGGTGGAAGTATTACAACCCCAGATAATGATACAACGTATACTATTGGTGCTGCGGATGCAATTAGTCCACAGGAAAAAATAATTCGTATTACAGGATCTGATACATCTACGGATGAGGTAAAGATTACTGCTGGAACAAACATGAATATCGCTAGAACAGGCGATACATTGATTTTAAGTTCTAGTTATGTTGATACTGATACTGTAACTAGACTTCAGGCATATACTGGTGGTGCATTCCAAGATGGTGACGTTACTATCCGAGGCGCTGGTGGCACCACTGTTACTCAGGATACACAATCAAAAACTATTCTAGTCACATCTACTGATGCTGACACAATCACCAGACTCAGAGCAACTGCTGGTCAGGTTTATAACTCTGGTGACTTCACATTACTTGCTAGCGGAGCAACTAGCATTGCACAGGGTATAGATGGCAATGGTGATCCTACTATTACCTATAGTTCTACCGATACTATTACTAGACTTAAAGGTGGTGGTGCAGGATCGTTCACATCTGGTGACATTACTGTTACTGGTGGTACAAATGTAACAGTATCTCAATCTGGTTCAACAATCACTGTTGCATCTCAGGATAACGATACAGTTACACAATTTGCTGCAAACTCTACGTCTCTAGCTGCTGGAGACTTTAGACTAACTGCTTCTGGTGCTACTACTCTTACGGAAACTTCTAGTGGTGGAGTAACCACAATTGAAATCAGTTCAGTTAACTCTGATACTGGTGCTTCTCTAACAGCATCTGGTGGTATTCTTCTTGCATCGGATGACTTCTCACTTAAGAACAGCACAAACTTTACTGGAAATACACTTGTAAAATGGGACAGTGGTAACTCTCAACTAGCAAACAGTCTTATTAGTGACAACGGATCTGAAGTAACTATCGGGGGTGACTTGATTGTCACTGGAACCCAAACGATCCTTGAAACATCTACTCTAATTGTAGAGGATAACATTATCGAACTTAGGAAGGGAAGTTCCTTGGTTGGTGCTGATGGTGGTATCCAAGTAAACAGAACTACTGACTCAAATGGAACAGTTGTTTCATATCAGCAAATGCAGTGGTATGAAGCTGGTTCATATTGGAGATCTTGGGATGGATCTGTTGAAAAGAGATTAGTAACAGAGACTGACACTCAAGTTCTTTCAAACAAAACTCTCGTATCTCCTACATTAACTGGTCCAACTCTTGGCGCTGCTACTGCAACTAGTATCAATGGATTGGGTGTTGTTAGCACAGCATCAGCATCTATCAATATTAACTCTGCAAAGAGTTTAGAGGTACAAAGATCTTGTTTGTTCACCACTGATAATAATAGTGGTACGGTTACAGTTAACTTTAGAAACGGTGGTAATGTAGCATATAGATCTGATACTCTTGCTTCATTCTCTTCTACAACATCAACACAACTTCGTGGTCTCATTAGTGATAGCACTGGACTTGATCGTCTCGTATTCCAGACTAGTCCAAACATTCTAACTTCACTTAATACTACATCTTCAACATTTAATTTACTAAATTCTGGTGCAGCAGCTATCAACTTCGCTGGAGCAACAACTGTTCTAAGCATTGGTTCAACTACAGGAACAACCACAGTCAATAATGATACTGTCTTATCAAAAGACCTTACAGTTGGTACAACAGTTGGTGATATTATTACACTGAATGGTACAGTCAACTCTGAGAATGCTGACATTGTAATTCGTGGCAGTGGTTCTGATCCAATGAGCATTGGCCGTGGATCTGGTAATGTAACTACAAACACACGAGTCGGAGTAAGAGCTTTAAACGCAGTCACAAGCGGATCTCAGAACACAGCATTTGGTTATGAAGCTGGTTACACAATTAATGCTGGTGCTGCTAACCTTGCTATAGGTAATAGAGCACTTAGAAGTTGTGGTATTGGCAACAATAATATTGCGTTGGGTCGTGATGTATTGCTAGGTTGTACAGACGGATCTAAGAACATTGCCATCGGTAACAATACTTTAGAGTCAGCAACTTCAGGTGAGGCTAACGTTTGTATTGGACATTATGCAGGTTATGCAGCACTTGGTAGTGGTAACGTTCTGATCGGTCCTGCTACTAATGAGAACACTTCTGATGCTACCTATCGTCCACCAAATCCAGGTGGTGATAGACAACTTGTCATCGGTTCTGGAACTGAGGCATGGATTGAAGGTAACAGTGACTTCAAGGTAACAATTCCAAACGAATTTGCCGTTACTGGAGACTGTACAATCACAGGTGACTTGACAGTTAATGGAACCACCACTAGCGTGAACTCTAATGTCATGACAGTGGATGATAAAGAGATTGAACTTGCTTCTGTTGTCAACGTTGTTGTTCAAGCAACAGCAGTAAATGGTAACTCCACAATTACAGGTATTACACCAACTACTGGATTGATTCCTGGAATGGCTGTAAATTCACAGACTGGTGGTATTGATTTTGGTACAGATTGTATTATTGTTTCTATCACTGGAAACAGTGCAGTCCTATCTAACTCTGTTACTGGATCTGGTAGTGTTACCTTTGAAGCAATAGGTCCTAGTGACACCGCAGCTAATGGCGGTGGATTGCGATTGAAAGGAACAACAGATAAGACTATCACATATGATGACAGCAGAGCAGATAAGTATTGGACATTCTCTGAAAACTTAGAGGTTGCATTTGGTAAAAAGTTTGTTATTGGTAACCAATTAGCATTGAGTACAACATCTATTGGATCTACTGTTGTCAACTCTTCACTCACTTCTGTTGGAACTTTAGTCAATCTAACTGTTGATGGATTCCTTACGATTGGTGGTGTGGTTACTGAAAAAGTATTCAATAACTATGCTACAACTTTGACACCAGCATCAAACGTTCTTACTATCAATGTTGCTGGTGCAAATAATATTTGTGGATCACCTGCAACACAAGCGATCAATGAGTGGGCATTTACTGGAGTAAGTTTGAGCAACGGTCAGTCTAAGACAATCACCTTGATCTTGGATGCAAACACTGCTGCTACTTACGGTGATGATTGTACAGTTGATGGTAACTCTGTAACTAATGGTGTACAGTGGTCTGGTGGTTCGCCACCAATTGCTACTTCTAACACAGACATTCTGACATTTATTATTATGAAAGACAACGCTGGTATTACCAAAGTGTTTGGTCAAGGCAACACAGACTTTAGTTGA
Tertiary structure
PDB ID
a381fcfb42cecce8d38ef01107aa1daeb336d3702da7313b0c3db99dd1db64da
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50