Protein

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Genbank accession
QBQ74923.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,86
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,53
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MSLTRLKNIITSRTGRIIYVNPDDFDASDAIDNRGNSALRPFKSIQRAFLEVARFSYRVGLSNDEFDAFSIMLYPAEYVVDNRPGDVLYTNVAPIDENSNLDLTSPNNVLYKYNSVEGGIIVPRGCSLVGTDLRRTKIIPKYVPYPTVNSSLGITNETLVPPRTAIFKVTGGTYFWQFSFFDGAEEGVYYKPDSSATLAPKFSHHRLTCFEFADGLNPLSTLIANGTVPNEDYSAVPNIQERTDLEIYYQKVSKAFATIPDTSGDPATDQIQARVEENRIVGPISDEYRILQITRNGQTATAVTVDEFDNPREHGFSVGVNINVSGVTGSTGPQSELDASTYNGSFTVTSASGNVFTYQMQNEPTGNAVGSNITVKTEIDTVDSASPYAFNLSLRSVWGMNGMHADGSKATGFKSMVVAQFTGLSLQKDDRAFVRYNATTGSYDVATAGDGAHLDGFAEYRKGWAHEHIKCSNDAFIQAVSVFAVGYGTHFTAESGADMSITNSNSNFGNTALRSAGFKAKSFSKDKAGEITHIIPPKALSVISTTATGTTGQNSITLANDGSIEGVLEGMPVTGTGIGSGATVGSVNTNTRVVTLTASNTTTINGNVIFGDEISVNWVNIDIQRTKDINAALAGQGISPGTRLYLYGYTAETSPPSSRVQGYTIGARQDGAGVNAIADKINCLLVAQGASEASIQSASITPYGPSVSGIDAGENGSPLQYDSTQYTINGVANQVGGWYLSVSATNNEIYTTLSNNTQYNTVNFTPTTFIKRIPDSRDLSDRTYRIRYVIDKDKSNPLPRPPISGYVLQPLNTDTTSYKLNRTFYIYDIEEVQEFERGVNDGIFYLTLLCASIAPSTSNFNNRKFSQNVNEVYPTFDRDNPLADPIASVSVADNETIGLVYSTDGATPTPNKDDQRSITKECIEFLLTDTGWAQPGTTPNYDSVNERLSGIRLTARAGNEETRKINVRQNNDGTVAPIPIELRRHSILRSGNHTFEYLGFGPGNYSTAFPQTQVETLSQDQVRFSQSIKEEAGVAFYSGLNSNGDLFIGNQVINPVTGQITNEDIAQLNVVGEENTTIETFSELVLTDKLTVIGGAANQLESIFAGPVTFQKQTTFTDNILAKKITYNNQDGTVIKQTLLAPQQGNGDPDLTNITGYTTPADGDLVYNINWTPGKSLGWIYYNGAWKEFGLTDTGEINIDTFNNTQHIGIGTAAISTHRVNIDGNARVDGNLTVTGRGAVGPDKYVTRTYNGDGVTLTFTITTYTGTQHSDDSNLVFLNGVVQVAGVDYTVDANGANIVFTTAPATTDVVHIIELPI
Physico‐chemical
properties
protein length:1317 AA
molecular weight: 142330,62360 Da
isoelectric point:4,79604
aromaticity:0,09036
hydropathy:-0,29727

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage S-RIM4
[NCBI] 		2530169 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBQ74923.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK493321.1 [NCBI]
CDS location
range 28069 -> 32022
strand +
CDS
ATGTCTCTAACTAGACTTAAGAATATTATTACGTCCCGCACGGGACGTATTATTTACGTTAACCCAGACGACTTTGATGCTTCTGATGCTATTGACAATAGGGGTAACTCTGCACTGAGACCCTTTAAGTCTATTCAGAGAGCATTTCTTGAGGTTGCTAGATTTTCGTATCGAGTTGGTCTGTCAAACGACGAATTTGACGCCTTCTCGATTATGCTGTATCCAGCAGAATATGTTGTAGACAACAGACCTGGCGATGTGCTATACACAAACGTAGCACCTATTGATGAAAACTCTAACTTAGACCTAACATCGCCCAACAACGTATTATATAAGTATAACTCTGTAGAAGGTGGTATTATCGTCCCCAGAGGTTGCTCTCTGGTTGGCACTGATCTTAGACGCACAAAGATCATTCCTAAGTATGTGCCATATCCTACAGTTAACTCCTCTCTCGGTATCACAAACGAGACACTTGTCCCACCTCGCACTGCAATCTTCAAGGTAACTGGTGGTACTTATTTCTGGCAATTCTCTTTCTTCGATGGTGCTGAAGAGGGTGTATATTACAAACCTGATTCTTCTGCAACTCTTGCACCTAAATTCTCTCACCATAGACTAACTTGCTTTGAGTTTGCTGATGGTTTGAATCCTCTTTCTACACTGATTGCTAACGGCACTGTCCCCAACGAAGATTATTCTGCGGTGCCTAACATTCAGGAAAGGACAGATCTGGAGATCTACTATCAGAAAGTATCGAAGGCATTTGCAACTATTCCCGATACATCTGGTGATCCTGCAACTGACCAAATTCAGGCAAGAGTTGAAGAAAACAGAATCGTTGGTCCTATCTCTGACGAATATCGTATTCTTCAAATTACTCGTAACGGTCAAACTGCAACTGCTGTTACTGTTGACGAGTTTGATAACCCAAGAGAGCACGGTTTCTCTGTTGGTGTTAACATTAACGTTTCTGGTGTTACAGGATCGACTGGTCCACAATCTGAGTTGGATGCATCAACTTATAATGGATCTTTCACCGTAACATCTGCATCTGGTAACGTATTTACCTACCAAATGCAAAACGAACCTACAGGTAATGCTGTTGGTAGTAATATCACAGTTAAGACTGAGATTGATACTGTTGACTCTGCATCTCCTTATGCGTTTAACTTGTCCCTGAGATCTGTCTGGGGCATGAATGGTATGCACGCAGATGGTAGCAAGGCAACTGGTTTCAAATCGATGGTTGTTGCACAGTTTACTGGTCTATCACTACAGAAAGATGACCGTGCATTTGTAAGATATAACGCAACAACTGGTAGTTATGATGTAGCAACTGCTGGTGATGGTGCTCACCTGGATGGTTTTGCTGAGTATCGTAAAGGTTGGGCACACGAGCACATTAAGTGCTCTAATGATGCATTTATTCAGGCAGTTTCGGTGTTTGCTGTTGGATACGGCACACACTTTACTGCGGAGAGTGGTGCTGACATGTCGATTACCAACTCTAACTCTAACTTTGGTAATACCGCACTTCGCTCTGCTGGTTTCAAGGCAAAATCATTCTCTAAAGATAAAGCAGGCGAGATCACACATATCATTCCACCTAAGGCACTTTCTGTCATCTCGACAACAGCAACAGGCACAACTGGTCAAAACTCTATCACACTTGCAAACGATGGTAGCATCGAAGGTGTATTAGAAGGTATGCCTGTAACTGGCACAGGTATTGGATCTGGTGCAACAGTTGGATCGGTCAATACAAACACAAGAGTTGTAACTCTGACAGCATCGAATACAACAACGATCAACGGTAACGTCATCTTTGGTGATGAAATCTCTGTCAACTGGGTTAACATTGACATTCAGCGCACTAAAGATATTAACGCTGCACTTGCAGGTCAAGGTATTAGTCCTGGCACAAGGTTGTATCTCTACGGTTATACAGCAGAAACATCTCCACCATCTAGCAGAGTCCAAGGTTACACAATCGGTGCTAGACAGGATGGCGCAGGCGTAAATGCGATTGCAGATAAGATCAACTGCTTATTGGTTGCTCAAGGTGCAAGCGAAGCATCAATTCAATCTGCATCAATTACACCATATGGTCCTAGCGTTTCTGGTATTGATGCTGGAGAAAATGGGTCACCATTGCAGTATGACAGCACTCAATATACGATCAATGGTGTCGCTAATCAAGTTGGTGGTTGGTATCTATCTGTGAGCGCAACCAATAACGAAATCTATACAACTCTATCTAATAACACACAATATAATACAGTCAACTTTACTCCAACCACCTTTATTAAGCGTATTCCTGACAGTAGAGACCTTTCTGACAGGACATACAGAATTCGTTATGTAATTGACAAGGATAAGTCTAATCCTCTGCCCCGTCCACCTATCAGTGGTTATGTATTACAACCACTGAATACTGATACAACTTCTTATAAGTTGAATAGGACATTCTACATCTATGATATTGAGGAAGTACAAGAATTTGAAAGAGGTGTCAATGACGGAATCTTCTATCTTACCCTGCTTTGTGCATCTATTGCACCTTCGACTTCTAATTTCAACAACAGAAAATTCAGTCAAAACGTCAACGAAGTCTATCCTACGTTTGACAGAGACAACCCTCTTGCTGACCCTATTGCTTCGGTATCCGTCGCTGACAACGAAACTATCGGTCTAGTATATTCTACTGATGGTGCAACTCCAACTCCTAACAAGGATGATCAGAGATCTATTACTAAGGAGTGTATTGAGTTCCTTCTGACTGATACAGGTTGGGCACAACCAGGCACCACACCTAACTATGACTCTGTGAATGAAAGATTGTCTGGTATTCGACTCACTGCCCGTGCAGGTAATGAGGAAACTAGAAAGATCAATGTCCGTCAGAATAATGATGGCACTGTTGCACCTATTCCCATTGAGTTACGCAGACACTCGATTCTGAGATCTGGTAACCACACTTTTGAATATCTTGGTTTCGGTCCTGGTAACTATTCGACTGCATTCCCCCAGACTCAAGTAGAAACACTGTCGCAAGATCAGGTTAGATTCTCTCAGTCTATCAAGGAAGAAGCAGGCGTTGCTTTCTACTCTGGTCTTAACTCTAACGGTGACCTATTCATTGGTAACCAAGTTATCAACCCAGTTACAGGTCAAATCACAAACGAAGATATTGCACAACTGAATGTCGTTGGTGAAGAGAATACTACCATTGAAACATTCTCTGAGTTGGTCCTCACTGACAAACTCACAGTTATCGGTGGTGCTGCTAACCAGTTAGAATCTATCTTCGCTGGTCCTGTTACATTCCAGAAGCAAACTACCTTCACTGATAACATCCTGGCGAAGAAGATTACTTACAACAACCAGGACGGCACAGTTATTAAACAAACCTTACTTGCACCTCAGCAAGGTAATGGTGATCCTGATCTTACCAACATCACAGGATATACAACTCCTGCTGATGGTGACTTAGTTTATAACATTAACTGGACTCCTGGTAAGTCTCTTGGTTGGATTTACTATAACGGTGCATGGAAAGAGTTTGGTCTGACTGATACTGGTGAGATCAATATCGATACCTTCAATAACACTCAGCACATCGGTATTGGCACTGCTGCTATCTCTACACACAGAGTTAATATTGATGGAAATGCAAGAGTTGATGGTAACTTGACTGTAACTGGTAGAGGTGCTGTTGGTCCTGATAAGTATGTCACTCGCACATATAATGGTGATGGCGTTACTTTAACCTTCACGATTACCACATATACAGGCACACAACACTCTGACGATTCCAACCTTGTATTCTTGAATGGTGTCGTCCAAGTTGCAGGCGTTGATTACACTGTAGATGCTAATGGGGCAAACATTGTATTTACAACTGCACCAGCAACAACTGATGTTGTCCATATTATTGAATTGCCTATCTAA

Tertiary structure

PDB ID
bdcb9e110d1dd2905f00736e7c72e3c697c1cb62d75304fac7ac4e1665faefcf
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,3738
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Diversity in Cyanophage Genomes from Southern New England Coastal Waters Marston,M.F. 2013-04-03 — GenBank