Protein
View in Explore- Genbank accession
- AHB80936.1 [GenBank]
- Protein name
- virulence associated protein
- RBP type
-
TSP
- Protein sequence
-
MAQNTNLNVTPYYDDFDKDRNFYRVLFRPGFPIQARELSTMQSILQNQVESVGSHLFKDGAMVIPGQVGYDLNVQAILLQESFLGSDVETYRTQLTGTIIEGLTTGVKAKVLYSISASESERGYVTLYVKYIDSGDTTSESALNTFQINEQLIASKEITFGTTLIEIGTPFAQLLPVNATAVGSTAYISDGVYFIRGHFVNVPSSYLILNQYDTNPSYRIGLEILESIITPEDDESLNDNAAGTSNYSAPGAHRFKIGTQFVKRLITDEADKNFIELLRINNSNVESFVERTAYSELEKSMARRTYEESGDYVIDTFDVTPREHLNDGFNNGVYSANQTSSNGNLATDSKVALEVSPGTAYVRGYRTEFITPQYIDVDKPRDFDTRQNGIINFNLGNFLKVYDVYGWPEVSGDGVTDAYQILDLYDDYAANATSSVKAGANRIGRCRTVQLQKSSTALAATSPFGISPNITGGVYDLWVFDVQMFTVLNIANAVTPYTAGTRIVGKTSGAAGYIADTGNGSHYIYLEQVNGVFINSEILEVNGRTVGTLEAAWSYQLSDTRSCFGKDSGSNIIFGSNFILNDSRPVEASTVDIDDTTDDEITGFRTRFEKDLRPGDVVTPTISDFEGVNTHRILRVDPTAIATTAANKKSTVSAGNEIFDFAEQTAKIDGSLLNGTVTDGEYSELIRLRPFIFQKDYQNGELSFDLPEDTMKSLDDESFFVYRNFSSKTVTTGSITFTVPETESFAALSSDNYVLTVVSNGGSGTYSNGQNIDIDAEVDAANLTASFGANNQSFTVSGLGSVATVTLTALVSKNTVSKKLKTASKMQALKVFKTVEDLVEQPTGLTFSALYGTRVEDEDLSFGIQDVYRVHAVYESYDENDASAPYVVLTESVFFAGGTLIIGKTSGARGRVISFSNADLKLYYVGLNDIPFVQGETINGFNSANEDITGIIDDSDSSIFAGSKVVTNQFELEAGQKTNYYDVSRLRRLSTAVPPTRRLLVIFDYFAHASSGDYFSSQSYSGINFKEIPNYKLDGSIKFIRDQIDFRPGIKNLRNGSGTISAPYFVNCTTFDFVSRVFDNTGSTIFDIMQVNSSFRADYAWYLPRIDKLFLSHDGALRIAKGVSGYYLIPPADVQNSMLLATIEYKPYVFDPERDILITPEVLRRYTMKDIGDIEQRLTHVEYYTSLSMLESQADNTKTYDENGFDRLKNGYVVDDFTDHTTGDVLNVDYKCSLDFREGQLRPQHYTTNVGLRYNPTASTNVVRTNGNVVMLPFDDVAIVTQPYASRTENVNPFNVFTFIGRVDLTPASDDWIDIERLPARVENVEGDFSAVSRDLNVDQNGFAPIQWQSWQTTWKGETIRSRNRFTSRSGTYGVGRQLGRAGHGQRRQGLFYLHERRTIRVVNNQARQGIRTRVIPKIEQKSLGDTILSRTVIPWIRSRNIGFNVDRMKPRTRFYAFFDGDNVTNYITPKVVELIKNSTTDNRTNETPFVVGETVTGQTSGCQLKVVAPDDGYKTNPYGKGTETLPTSYSSQTVYLNHDITEISENISPNHFGNVQVGELLVGQTSGAIAVVKDRRILTDNVGNVQGTLFIPSPKNDANPRWATGTRSLRFTTSETNLKTPGTVDSSAQTTYSATGTLQTVRENILAVRNAEIVTDTVSEERVVQTTRTETRQVGWYDPLAQSFIIEEEGGMFLTGVDIFFNTKDANIPISMQIRTMENGYPTKTILPFSDVTITPDDIEISESAAVPSRFSFKAPVYIKSSVEYCFVLLSDSNEYQVWISRMGDVDVTGTRTISEQPYAGVLFKSQNASTWTADQYEDLKFTIYRANFTSTTGTVTLENAPQGKGNNGIHRLIENPIQTIKPKQVLSLGPAVTQYTFSQGARLLQQTTAAQATIISTTTSSSVSDTLTINDASGSWLQGTANTYLVRSSESLATIVAGSSSGTLEVGDIVTGATSNSVGIVKTWDGSTNLVLHYITGAFTDTETLSEPGGWTATVTSSAESGDSYGAYLTAAPTFDSDQTEVLVYHQNHGMYNRSNNVSVEGVISEISPTTLTGALAAGATSISVLDANTFHTTVNGSVVSGSNPGYIRINSELIQYSAISSDGKTITVATSGRGSNSTTDTTHPSGSVVECYNLDGIPLIDINKTHTSVSCPWLDTYMLHITGVANSGIRGGGINVYASQNIQFETLTPSVSVMDLPETDITARVNTTSATSIGDGSTSVDQASFVNDGSYVPVTLNDLNLFNNPRMICSEVNELAKLSGQKSFTMKVDLSTEKDTLSPVVDLDRCSLITTSNRINQWPGGPDAYGQQSQIDTSQDVSTLPFGDRNDAVYITRLARLIRESRSLRIDLQMSRPPEADVRIYYRAFSSGTNDDFDSIGWTLIDTPLQYDASPNEEILWKDYYYEVSGLNFNAFQIKIVMRSSNQARVPLIADLRCIALAT
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2442 AA molecular weight: 268414,81880 Da isoelectric point: 4,79002 aromaticity: 0,09623 hydropathy: -0,27854
Domains
Domains [InterPro]
IPR032096
12–67
12–67
1
2442
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Synechococcus phage S-MbCM100 [NCBI] |
1340812 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Synechococcus sp. WH 7803 [NCBI] |
32051 | Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AHB80936.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KF156340
[NCBI]
CDS location
range 77502 -> 84830
strand +
strand +
CDS
ATGGCACAAAATACCAATCTAAACGTTACACCTTATTACGACGACTTCGATAAGGATAGGAATTTTTATCGAGTTCTGTTCCGCCCTGGATTTCCAATTCAGGCGAGGGAACTTAGCACAATGCAGAGTATTCTGCAAAATCAAGTCGAATCGGTTGGTTCTCATCTATTTAAAGATGGTGCTATGGTCATCCCTGGACAAGTGGGATATGACTTAAATGTACAGGCAATTTTGCTGCAAGAATCTTTTCTTGGTAGTGATGTTGAGACATACAGAACTCAATTGACTGGTACTATCATTGAGGGTTTGACGACAGGTGTTAAGGCAAAAGTATTGTATAGCATCTCTGCCTCTGAATCTGAGAGGGGATATGTCACACTATATGTAAAGTATATTGATTCTGGGGATACAACTTCCGAATCTGCATTGAATACTTTCCAAATCAATGAACAGTTGATTGCAAGTAAGGAAATTACTTTTGGTACGACGCTGATTGAAATTGGCACTCCATTTGCTCAATTGTTGCCTGTTAATGCAACTGCAGTCGGATCGACAGCATACATTAGCGATGGTGTTTATTTCATTAGAGGTCATTTTGTTAATGTACCTTCTAGTTATTTGATTCTGAATCAATATGATACTAACCCTTCTTATAGAATTGGTTTAGAAATTTTAGAATCTATTATCACCCCCGAAGATGATGAATCTTTGAATGATAATGCTGCTGGAACATCAAATTATTCTGCACCTGGTGCCCATAGATTTAAAATTGGTACTCAGTTTGTAAAACGATTAATTACTGATGAGGCAGATAAAAACTTTATTGAACTTCTCAGGATCAATAACAGTAATGTAGAAAGTTTTGTTGAGAGAACAGCATATAGCGAACTTGAGAAGTCGATGGCTCGTAGGACTTATGAAGAGTCTGGCGATTATGTCATTGATACTTTTGATGTAACTCCTCGCGAGCATCTCAATGACGGATTTAATAATGGTGTGTATAGTGCGAACCAGACTTCTAGTAATGGAAACCTTGCTACAGATTCTAAGGTAGCATTAGAAGTTTCTCCTGGAACTGCATATGTTAGGGGTTATAGAACAGAGTTTATTACACCTCAATACATTGATGTTGATAAACCAAGGGATTTCGATACTCGTCAAAATGGAATTATCAACTTTAACCTTGGCAATTTCCTGAAAGTTTATGATGTTTATGGTTGGCCAGAAGTTTCTGGTGATGGAGTAACAGACGCATATCAGATTCTAGATCTTTATGATGATTATGCTGCGAATGCAACATCATCAGTAAAGGCAGGTGCTAATAGAATTGGTAGATGTAGAACTGTTCAGTTACAGAAGTCTTCTACTGCTCTTGCTGCAACGTCACCATTTGGAATTAGTCCTAATATAACTGGTGGTGTTTATGATCTATGGGTATTTGATGTTCAGATGTTCACCGTTCTGAACATTGCTAATGCTGTAACACCATATACAGCAGGAACTAGAATTGTAGGTAAAACATCTGGAGCAGCTGGTTACATTGCTGATACTGGAAATGGTAGTCACTACATTTATCTTGAGCAGGTCAATGGAGTATTCATTAATAGTGAAATTCTAGAAGTAAATGGAAGAACAGTTGGTACTCTTGAAGCAGCATGGTCTTATCAGTTAAGTGATACTAGATCGTGCTTTGGTAAGGATAGTGGCAGTAATATTATCTTTGGTTCTAATTTTATTCTGAATGACTCTCGACCTGTTGAGGCATCTACAGTTGATATTGATGATACAACAGATGATGAAATTACTGGTTTCAGAACTAGGTTTGAAAAAGATCTTCGTCCTGGAGACGTTGTTACTCCAACAATTTCTGATTTTGAGGGAGTAAATACTCATCGCATTTTAAGAGTTGATCCTACTGCTATTGCAACAACAGCAGCTAATAAGAAATCTACAGTTAGTGCTGGAAATGAAATCTTTGATTTTGCAGAGCAAACTGCAAAAATTGATGGCAGTCTGTTGAATGGTACAGTAACTGATGGAGAATATAGCGAACTAATTAGATTGCGTCCGTTTATCTTCCAAAAAGATTATCAGAATGGAGAACTTTCATTCGATCTTCCAGAAGATACTATGAAGTCTCTTGATGATGAATCATTCTTTGTATATAGAAACTTCTCTTCAAAAACAGTAACCACTGGTTCTATTACCTTTACTGTTCCTGAAACCGAATCTTTCGCAGCATTATCTTCTGATAATTATGTCTTAACTGTCGTTAGTAATGGTGGTTCTGGCACATATAGTAATGGTCAAAATATTGATATTGATGCTGAGGTAGATGCTGCAAATCTAACTGCTTCTTTTGGTGCTAATAATCAATCATTTACGGTTAGTGGATTAGGTTCAGTTGCAACAGTCACTCTGACCGCATTGGTTTCTAAGAACACTGTTTCTAAGAAACTGAAGACTGCTTCTAAGATGCAGGCATTAAAAGTATTCAAAACAGTAGAAGACTTAGTAGAACAACCTACAGGACTTACATTTAGTGCTCTATACGGAACCAGAGTTGAAGATGAAGATCTCTCGTTTGGTATTCAAGATGTATATAGAGTTCATGCAGTATATGAATCGTATGATGAGAATGATGCGTCGGCACCATATGTAGTTTTAACTGAATCAGTCTTCTTTGCAGGTGGAACATTAATTATTGGTAAGACTTCTGGTGCTAGAGGTCGTGTAATTTCATTCTCTAATGCAGATTTGAAGTTGTACTATGTTGGACTAAATGACATTCCATTCGTTCAGGGTGAAACTATTAATGGTTTCAATTCTGCTAATGAAGATATTACTGGTATTATTGATGACTCGGATTCTTCAATTTTTGCTGGTAGTAAAGTAGTTACAAATCAATTTGAACTTGAAGCGGGACAGAAAACTAATTACTATGATGTTTCACGATTAAGAAGATTAAGTACTGCTGTACCTCCGACAAGAAGACTGCTGGTAATCTTTGATTATTTCGCACATGCATCTTCTGGTGATTACTTCTCATCACAATCTTATAGTGGAATTAATTTCAAAGAGATTCCTAACTATAAATTAGATGGTTCTATTAAGTTTATTAGAGATCAAATCGATTTCCGTCCTGGTATTAAGAACTTAAGAAATGGATCAGGCACAATCAGTGCTCCATACTTTGTAAATTGTACTACGTTTGATTTTGTATCCAGAGTATTTGATAATACTGGATCAACAATCTTCGATATCATGCAAGTCAATTCTTCATTCCGTGCAGACTATGCTTGGTATCTTCCTAGAATTGACAAACTATTCTTATCGCATGATGGAGCACTTAGAATTGCTAAGGGTGTTTCTGGTTACTACTTGATTCCACCAGCAGACGTTCAAAATTCAATGCTTTTAGCGACTATTGAATACAAACCATACGTCTTTGATCCTGAAAGAGATATTCTGATTACTCCAGAAGTTCTCAGACGTTATACAATGAAGGACATTGGTGATATTGAGCAGAGATTGACTCATGTTGAATACTATACATCATTGTCTATGCTTGAGTCTCAAGCAGATAATACTAAGACCTATGATGAAAATGGTTTCGACCGTCTGAAAAATGGTTATGTTGTTGATGACTTTACTGATCACACCACTGGCGATGTATTAAACGTCGATTATAAGTGTTCTTTAGACTTTAGAGAAGGTCAGTTGCGTCCTCAGCACTATACTACTAATGTAGGACTTAGATATAATCCTACAGCATCTACTAATGTCGTTAGGACTAATGGTAATGTAGTAATGCTTCCCTTTGATGATGTTGCAATTGTTACACAACCATATGCATCTAGAACTGAGAACGTCAATCCATTCAACGTCTTTACCTTTATTGGTCGTGTTGATTTAACACCTGCATCTGATGACTGGATTGATATTGAGCGTCTTCCTGCTCGTGTTGAAAACGTTGAAGGTGATTTCTCTGCTGTTTCTAGAGATCTCAATGTTGATCAGAATGGTTTTGCTCCTATTCAATGGCAGTCTTGGCAGACAACTTGGAAGGGTGAGACAATTAGATCTAGAAATAGATTTACATCTAGATCTGGTACATATGGTGTTGGTCGTCAGTTAGGTCGTGCAGGTCACGGTCAGCGTCGTCAAGGTCTATTCTATCTTCACGAACGTCGCACTATTCGTGTTGTTAATAATCAAGCACGTCAGGGTATTCGTACTAGAGTTATTCCTAAGATTGAACAGAAGTCTTTGGGAGATACAATCCTGTCACGTACAGTAATTCCTTGGATTCGCTCTCGTAATATCGGTTTCAACGTTGATCGTATGAAACCCCGTACAAGATTCTATGCATTCTTTGACGGTGATAATGTCACTAACTACATCACACCAAAAGTTGTTGAACTTATCAAAAACTCCACCACTGATAATAGAACCAACGAAACTCCTTTTGTTGTAGGTGAAACTGTTACTGGACAAACCTCTGGTTGCCAACTTAAAGTTGTTGCACCTGATGATGGATATAAAACTAATCCATATGGTAAGGGTACAGAAACTCTTCCAACTTCATACTCATCCCAAACAGTATATCTAAATCATGATATCACTGAAATTTCTGAGAATATATCACCAAATCATTTTGGTAATGTTCAGGTTGGGGAACTTTTAGTTGGTCAAACGTCAGGTGCAATTGCGGTGGTAAAAGATCGTCGCATCCTCACTGATAACGTTGGTAATGTTCAGGGTACATTATTCATTCCTTCCCCTAAGAATGATGCCAACCCACGTTGGGCAACAGGTACTCGCTCTTTGCGTTTCACAACTTCGGAAACTAATCTGAAGACACCTGGTACTGTAGATTCTTCTGCACAAACAACGTATTCGGCAACAGGTACTCTTCAAACTGTTCGTGAAAATATTTTGGCAGTTAGAAATGCTGAAATTGTTACCGATACTGTTAGTGAAGAAAGAGTTGTCCAGAC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Tertiary structure
PDB ID
1e9efa1c1dc98b96df2ca44158eeea8532a637df1048c107e2198f0ca5ca8814
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50