Genbank accession
WMM95019.1 [GenBank]
Protein name
tail tubular protein B
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,75
Protein sequence
MGSVVSQSIPNFLNGMSQQTPTQRGINQGEDQINLQNGLVDGLSKRPPLDYVATVDNTNIYSNKTKFWQIQRDADNQYIVALYNGGVKVFGLDGTEKTVTVASGSGYLTSTNPRENFKLVNIADYTFVANTGTTVAADSTTSAAKVEEFLIVCKLTNYGREYKVALKHPSMAQELEVVFQLPSGNDASTDSKFRDTNKITDILLYGTSSTHWDSAANGIGFNVRRTDTNASVSTTQGLANYSGFTSYFTFEAYDSVIYGKPTDQNANYEITTSDGSGNTAMYAVRDEIQDFSKLPFYGKEGVIIKITGEEGDTLSDYYVKFSGKSGVWNETIAPATSVGLDNSTMPHALINNNDGTFTFQELDWTDRVCGDADTNPDPTFVGKKINNLTYYKNRLGILSGENLVLTENASFFNYFATTSTQVLDTDPIDIAASGTEVNTLKNSVGFNESLLLFSDTAQYKLDSSGETISPTSAILNQVSSFEHDDKVTPVSAGKFAYFAQARTNNTAIREYFADDDTLTNDGLDISVSVQNLIPSNCYQIISNTTEDTLIFLTSDTADTQTAPYSGTASTTYANTMYIYKYFFDGGEKVQNAWSKWTFEGVKIIGAMSLESFIYVLASEGTTTKLLKIDLRNLKDTTIGHGVYIDLKTSVTGTYDSATDLTTFVSPYGTKTGLIAVDKTNGNNYAVTNTSGSTYTIVGDHTSLFIGIPYESKYTMSTQYVRENTGRGLIAVTSGRYQIRNISFNFENSGYFQVEVTPTNRNTSTAIMNGYIIGTSTSIVGQPAIATGTLRVPVQCKNTEFTLDIKSSSHLPMYIAGAEVEGYYHNRARRI
Physico‐chemical
properties
protein length:830 AA
molecular weight: 90759,29790 Da
isoelectric point:4,78138
aromaticity:0,10723
hydropathy:-0,31723

Domains

Domains [InterPro]
WMM95019.1
1 830
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pelagibacter phage HTVC304P
[NCBI]
3072839 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WMM95019.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR420736 [NCBI]
CDS location
range 22064 -> 24556
strand +
CDS
ATGGGAAGTGTTGTTTCACAATCTATTCCTAACTTCTTAAATGGTATGTCTCAACAGACGCCAACACAAAGAGGTATTAATCAAGGAGAAGACCAAATAAATTTACAAAATGGTTTAGTAGATGGTTTATCAAAAAGACCTCCTTTAGATTATGTAGCAACAGTAGATAATACTAATATTTATTCTAACAAAACAAAATTTTGGCAAATACAAAGAGATGCTGATAATCAATATATTGTAGCGTTATACAATGGAGGTGTAAAAGTATTTGGTTTAGATGGTACAGAAAAAACCGTTACTGTAGCAAGTGGGTCAGGTTATTTAACTTCTACAAACCCTAGAGAAAATTTTAAATTAGTTAACATAGCAGATTACACTTTTGTAGCAAACACAGGAACTACAGTTGCGGCTGATAGCACAACGTCTGCGGCTAAAGTAGAAGAGTTTTTAATTGTTTGTAAATTAACAAACTACGGTAGAGAATACAAAGTTGCATTGAAACACCCATCAATGGCACAAGAGCTAGAAGTTGTCTTTCAGTTACCTTCAGGTAATGATGCGTCAACTGATAGTAAATTTAGAGATACAAATAAAATAACAGATATACTTTTATATGGCACATCAAGTACACATTGGGACAGTGCCGCAAATGGTATAGGATTTAATGTTAGAAGAACAGATACAAATGCGTCTGTCTCTACTACACAAGGTTTAGCAAATTATTCTGGTTTCACATCATATTTTACTTTTGAAGCATACGACAGTGTAATCTATGGAAAGCCTACTGACCAAAATGCTAACTATGAAATTACTACATCTGACGGTTCTGGTAACACAGCCATGTATGCTGTTAGAGATGAAATACAAGATTTTAGTAAATTACCTTTTTATGGGAAAGAAGGAGTAATAATAAAAATTACTGGAGAAGAAGGTGATACACTTTCAGATTACTATGTAAAATTTTCAGGAAAGTCTGGTGTATGGAATGAAACTATTGCACCCGCTACATCTGTTGGTTTAGATAATTCTACAATGCCACACGCATTGATTAATAACAATGATGGAACTTTTACATTTCAAGAATTAGATTGGACAGATAGAGTATGTGGTGATGCTGATACAAACCCTGACCCAACTTTTGTTGGTAAAAAAATAAATAACTTAACTTATTATAAAAATAGATTAGGAATATTATCAGGAGAAAATTTAGTATTAACAGAAAATGCTTCGTTCTTTAATTATTTTGCTACAACATCAACACAAGTTTTAGATACAGACCCTATTGATATTGCGGCTTCAGGAACGGAAGTTAATACACTTAAAAACTCTGTAGGATTTAATGAGAGTTTATTATTATTTTCTGATACTGCACAATACAAACTAGATAGTTCAGGTGAAACAATTTCACCAACTTCAGCAATACTTAATCAAGTATCTTCATTTGAACATGATGATAAAGTTACACCAGTATCAGCAGGTAAGTTTGCATATTTTGCACAAGCAAGAACAAACAATACTGCAATAAGAGAATACTTTGCAGATGATGATACCTTAACAAATGATGGACTAGATATAAGTGTATCAGTACAAAATTTAATACCATCTAATTGCTATCAAATAATTAGTAACACTACTGAAGACACTTTAATATTTTTAACTTCAGATACGGCAGATACACAAACTGCTCCTTATAGTGGAACAGCGTCTACAACATACGCTAACACAATGTATATCTATAAGTATTTCTTTGATGGTGGAGAGAAGGTTCAAAACGCATGGTCTAAATGGACATTTGAAGGTGTAAAAATTATTGGTGCTATGTCATTAGAAAGTTTTATTTATGTCTTAGCTTCAGAAGGCACTACAACAAAATTATTAAAAATAGATTTAAGAAATTTAAAAGATACAACAATAGGTCATGGAGTTTACATTGACCTTAAAACTTCTGTTACAGGAACGTATGATAGTGCTACCGATTTAACAACATTTGTATCACCTTATGGTACAAAAACAGGTTTGATTGCAGTAGATAAAACTAACGGCAATAACTATGCTGTAACTAATACTTCAGGTTCAACTTATACTATTGTAGGAGACCATACATCATTGTTCATAGGCATTCCTTATGAAAGTAAGTATACAATGTCTACTCAGTATGTAAGAGAAAATACAGGAAGAGGATTAATAGCAGTAACTTCAGGTAGATACCAAATACGAAACATATCATTTAATTTTGAAAATAGTGGATACTTTCAAGTTGAAGTTACACCAACTAATAGAAACACATCTACAGCTATTATGAATGGTTATATTATTGGAACGTCTACATCTATTGTAGGACAACCTGCTATTGCTACAGGAACTTTAAGAGTGCCTGTTCAATGTAAAAATACAGAATTTACTTTAGATATTAAATCGTCATCTCACTTGCCTATGTATATCGCAGGGGCAGAAGTTGAAGGTTATTATCATAACAGAGCAAGAAGGATTTAA

Tertiary structure

PDB ID
cf526d2df33d7dcd3403c5a358988eaeb8eb5d61848fe988ade66e4935064291
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2465
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50