Protein

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Genbank accession
AHB80342.1 [GenBank]
Protein name
prophage protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MITQTTAATAAWKAPQRTLDTVAMIDGTDYHTSDITSIAYDGGAFTGDTFSIGSTYENSVTITFSHLIEGFVQGQLVAPKVGVKLADGTFEYSPLGIFVISDDIEMDRNNDVTTIKAYDLMCMLEGTYTSKITYPAKMTDVIAEIASLSGVPLNSDDIARLPLMNNLAKAITGQTYRNAIGWIAQFYSGFALFDRDGKLTIRTINDTDYAIDAGQYLQGGLTKNEAAYVIGGIQCQVTTTTTDSDGNSTDDTVTLQSGSSAGSQVQLTNNVMTQERLDAIWTKLQNLAFYPFSLNWFGNPAIEAGDWFALQDTKGNRFNVPNCSYTMTFDGSFSSVSSAQQTSTSSDIYSYNGDLTSAINKLKSQTAGLNSYTHIAYADDATGKGFSQDPTGKTYLGVYTDSNSIDSTDPAKYVWMKTKGSDGTAGEKGDTGPAGPQGIKGDTGSNGQTSYLHIAYADSADGKTNFSITSAGLRQYIGTYTDFTSTSSSDPTKYVWQQTKGDTGAQGPAGTDITAITYGSTAPSSPKEGDVWYKPNGNSIQIEIYHNGSWVLDIDDSIGQRITDATKDVLASAKTYTDDTAKNVIAELSSANKIVNSEFDTDTAQKNVVESSTTVPTPNSKGYADQTIVGRNLLRNTSAFANTDHWSNSGGGSSLAIVSHAFYQNGQGKLLKLSTSGTTEVFLMSEHFSVQAGESYTFQIKAFNNSNVASMDFFALGRPTGSTSDYTKVVASKLNMQPSISGIGTFSFSFTVPDGIGELYIRIDNNGSKVSGSSADLYVAEMKLEVGFLTPYIKAPEDLAIANWQDTIVHDPVDGTYVVSGTTSTKASTVQVKNSAGTIVASQDLSQPKNSDQTFTQGSFSVVTHDNDDGTGTASIPTPAAGTSLIVVDELNKNIYSNNNMSVPNLAKDSEMLLGLSGTDSDPHFSYNLAGFVSIVANGYNGHNVLDIKRSSGSGTLVAITAYQNSVPGDAWSMGFYYRVLTDTTFSNDSSCYFDPRTSTGTAATVQGKTILTAGTAWRHVKVEDAVMPSTTAKVRFRFDMLGTGHIQIALPMMVKAVKAVDYVSDTIDVSKWAATLPADGKSYKATIKAPKDTTATILNFNMLTAIDRYNFSFSFPAIMGNYTLALSEATYSFAVQQNLFPVTSNGYVVSKTGVISGKAPNNTSVIYLLSSSAGSYSTGVQSDGSFAIAVNTDGSSYTIHAEYQQSYLGLTDWHDFSPDLPASSYISANELVSGSKVIEVTNNTLYADDIPSFANVAISVGAQFKLISGTAKLAVVFYKNDGTNLGTQSVSIAGSDWTNFSLINIVTPANVDYIRVMVQALSGTVRFTRAILVFSASLPAYTPGIGISGKGVLGLFNNNYVLGMLSNAGAVVSGINGNADGLRLTGKTISLDGDTVATGDFWASQINAIKINAANIVAGELDANIIHVIHLDVSSLTGDITSFIKSNWADPYGNNIDIEGSEISLHDNQKNYEMLIKASEIDINNLNDGSYTKISNGNIEMANSSPTGHIESVGGLLLGENVVDERLNGIYLIANTYGKGGTNHNIDSDSYWAADDVGIAYRNDSTNENFGVAYRYNVTSGLNLFFAPVDFNGYKFNIQGAGETFNLTWVSWSDLSSGWKYPAIHSYGSAAKGGIAIGGNAVYAFGLAGRTQLI
Physico‐chemical
properties
protein length:1655 AA
molecular weight: 176363,08230 Da
isoelectric point:4,69913
aromaticity:0,09789
hydropathy:-0,16604

Domains

Domains [InterPro]
IPR012892
1369–1450
IPR012892
AHB80342.1
1 1655
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Oenococcus phage phiS11
[NCBI] 		1432847 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AHB80342.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KF183314 [NCBI]
CDS location
range 27737 -> 32704
strand +
CDS
TTGATTACACAAACTACAGCCGCCACGGCTGCCTGGAAAGCACCCCAAAGAACGCTTGATACAGTGGCGATGATTGACGGAACGGATTATCACACATCTGATATAACATCGATTGCCTACGACGGCGGGGCATTTACCGGCGATACATTTTCGATCGGGTCGACTTATGAAAACAGTGTCACGATAACTTTTTCCCACTTGATCGAGGGTTTTGTTCAAGGACAATTAGTGGCGCCAAAAGTCGGTGTCAAATTGGCGGATGGAACTTTCGAGTACAGTCCGTTGGGAATATTCGTTATTTCAGACGATATCGAAATGGACCGGAACAATGATGTAACGACTATCAAAGCTTACGACTTGATGTGTATGCTGGAAGGAACTTATACCTCAAAAATCACTTATCCTGCCAAAATGACAGACGTTATTGCCGAGATTGCGAGTTTGTCCGGAGTACCGTTGAATTCTGACGATATTGCCCGTTTGCCTCTTATGAATAACCTGGCCAAAGCAATTACCGGACAGACTTATCGAAATGCGATCGGGTGGATAGCCCAGTTTTATAGCGGTTTTGCCTTGTTTGATCGTGACGGCAAGCTGACAATCAGAACGATTAACGATACGGATTATGCGATTGATGCTGGCCAGTATTTACAAGGTGGCCTGACCAAAAATGAAGCTGCCTATGTGATCGGTGGGATTCAATGCCAGGTCACGACCACTACGACTGATTCGGACGGTAATTCGACTGACGACACGGTCACTTTACAGTCCGGTAGCAGTGCGGGCTCGCAGGTTCAATTGACTAATAACGTCATGACCCAAGAACGGCTTGACGCAATCTGGACCAAACTGCAGAATCTGGCTTTCTATCCTTTTAGTCTGAATTGGTTCGGTAATCCAGCGATTGAAGCAGGCGACTGGTTTGCTTTGCAGGACACGAAGGGCAATCGATTCAACGTACCGAATTGTTCTTACACGATGACCTTTGATGGTAGTTTTTCTTCTGTTTCGTCGGCCCAACAGACTTCGACATCGTCCGACATTTATTCTTACAATGGCGATTTAACATCGGCTATCAATAAATTAAAATCGCAAACGGCCGGGTTAAATTCCTATACGCATATTGCTTATGCTGATGACGCTACTGGAAAAGGTTTCTCACAAGACCCCACTGGCAAAACCTATTTGGGCGTTTACACGGATTCCAATTCTATCGATAGTACGGATCCGGCTAAATACGTTTGGATGAAAACAAAAGGTAGTGATGGAACAGCTGGAGAAAAAGGAGACACCGGACCCGCCGGGCCGCAAGGCATTAAAGGCGATACGGGTTCCAATGGCCAAACTTCTTATCTTCATATTGCTTACGCCGATTCTGCCGATGGAAAAACGAATTTCAGTATTACTTCTGCCGGATTAAGGCAGTATATCGGAACTTATACGGATTTTACATCGACAAGTAGTTCTGATCCGACTAAATATGTATGGCAGCAGACTAAAGGAGATACTGGTGCACAGGGACCCGCCGGAACTGATATCACAGCGATCACTTATGGATCGACTGCTCCAAGCAGCCCTAAAGAAGGGGATGTTTGGTATAAGCCCAACGGCAATTCTATTCAGATTGAAATTTATCATAACGGTTCATGGGTGCTCGATATCGATGATTCGATCGGGCAGAGAATTACCGATGCAACCAAAGACGTGCTGGCCAGTGCCAAAACTTATACCGATGATACGGCAAAAAATGTAATTGCCGAATTAAGTTCGGCCAACAAAATTGTCAATTCGGAGTTTGATACAGATACAGCTCAAAAGAATGTTGTTGAAAGTTCAACAACTGTGCCGACTCCTAATTCAAAAGGATATGCCGATCAAACAATTGTCGGACGCAATCTGCTGAGAAACACGAGTGCTTTTGCTAATACGGATCACTGGAGCAATTCCGGTGGCGGTTCTTCTTTAGCAATTGTTTCTCATGCTTTTTATCAAAACGGTCAAGGCAAATTACTAAAACTTTCGACTTCCGGAACTACGGAAGTATTTTTAATGTCCGAGCACTTTTCCGTTCAAGCCGGTGAAAGCTATACCTTTCAGATTAAAGCCTTCAATAACTCCAATGTTGCTTCAATGGATTTCTTTGCTTTGGGACGCCCAACGGGCAGCACTTCCGATTATACGAAGGTTGTCGCAAGTAAATTAAACATGCAGCCTTCGATCAGCGGTATTGGCACTTTCTCATTTTCTTTTACAGTTCCCGATGGTATCGGAGAACTTTATATAAGGATTGATAACAACGGTTCTAAGGTTTCCGGCAGCAGTGCCGATCTTTATGTTGCTGAAATGAAATTGGAAGTAGGATTTTTGACTCCTTACATTAAAGCGCCTGAAGATTTAGCTATTGCCAATTGGCAGGATACGATTGTTCATGATCCGGTAGATGGAACTTATGTTGTTTCCGGTACGACATCAACTAAAGCCTCAACGGTTCAAGTAAAGAACTCAGCCGGTACAATTGTTGCATCTCAGGATCTTAGCCAGCCTAAAAATTCCGATCAGACATTTACCCAAGGCAGCTTTTCGGTTGTGACTCACGATAACGACGATGGGACCGGCACGGCCAGTATTCCTACTCCGGCTGCTGGTACTTCTTTGATAGTTGTCGATGAATTAAATAAAAATATTTATTCGAACAACAATATGAGTGTTCCTAATCTAGCTAAGGATAGCGAAATGCTATTGGGACTGAGTGGAACTGATTCGGATCCGCATTTTTCTTATAACTTGGCAGGCTTTGTATCGATTGTTGCCAACGGATATAACGGCCACAATGTCTTGGATATCAAAAGATCCAGCGGTTCCGGAACTTTGGTGGCGATTACGGCATATCAAAATTCGGTTCCAGGAGATGCCTGGTCGATGGGATTTTATTACCGGGTTCTCACTGATACAACTTTTTCAAATGATTCTTCCTGTTACTTTGATCCAAGAACATCAACCGGGACCGCAGCAACTGTACAAGGGAAAACCATTTTAACCGCTGGAACCGCATGGAGGCATGTAAAAGTCGAAGATGCAGTAATGCCAAGTACGACTGCCAAGGTACGCTTTCGTTTCGATATGTTGGGGACTGGTCATATACAGATCGCACTCCCAATGATGGTTAAAGCTGTAAAAGCAGTCGATTATGTATCGGATACAATTGACGTTTCCAAGTGGGCGGCAACACTGCCAGCAGATGGAAAAAGCTATAAAGCTACGATCAAAGCGCCTAAAGATACGACAGCAACAATTTTGAATTTTAATATGCTGACAGCGATTGATCGATATAATTTTTCGTTTTCTTTTCCGGCGATTATGGGAAATTACACGCTGGCTTTGTCGGAGGCGACTTATTCTTTTGCAGTTCAGCAGAATCTTTTTCCAGTTACTTCGAACGGATATGTAGTTTCAAAGACTGGTGTCATTTCCGGAAAAGCACCTAATAATACTTCTGTGATTTACCTTCTGTCCAGTTCGGCAGGAAGCTATTCGACCGGCGTTCAATCAGATGGCAGTTTTGCTATTGCAGTCAACACGGACGGCAGCAGCTATACGATTCATGCCGAATACCAGCAAAGCTATCTTGGCCTGACCGACTGGCACGATTTCAGTCCGGACCTGCCGGCTTCTTCCTATATATCAGCTAATGAACTTGTTTCTGGATCCAAAGTTATCGAAGTGACTAACAATACACTTTATGCTGATGATATTCCGAGCTTTGCCAATGTTGCGATCTCTGTTGGCGCTCAGTTTAAATTGATTTCTGGGACGGCTAAATTGGCCGTTGTTTTTTATAAAAACGATGGAACCAATCTGGGAACCCAATCGGTTTCGATTGCTGGCAGCGATTGGACGAATTTTAGTTTGATAAATATCGTTACACCGGCAAACGTCGATTATATCCGGGTTATGGTCCAGGCACTATCCGGGACCGTTCGCTTTACTCGGGCCATTTTGGTATTTTCGGCCAGTCTGCCGGCTTATACGCCGGGCATCGGGATTTCCGGCAAAGGCGTTCTTGGTTTGTTCAACAACAATTATGTGTTGGGGATGTTAAGCAATGCCGGAGCTGTGGTTTCCGGTATCAACGGCAATGCAGACGGTCTGCGTTTGACAGGCAAAACAATTTCTTTGGATGGCGATACGGTGGCCACTGGCGATTTTTGGGCAAGCCAGATTAATGCGATCAAAATTAACGCTGCCAACATCGTAGCCGGTGAGCTCGATGCCAATATTATTCACGTTATCCACCTGGATGTTTCCAGTCTGACCGGCGATATTACTTCGTTTATTAAATCTAATTGGGCAGATCCTTATGGAAACAATATTGATATTGAAGGATCGGAAATTTCTCTGCATGACAACCAAAAAAACTACGAAATGCTTATCAAGGCCAGCGAGATCGATATCAATAACCTAAACGACGGTTCCTACACGAAAATAAGTAATGGAAATATTGAAATGGCTAATAGTTCGCCAACTGGTCACATCGAAAGCGTCGGCGGTTTATTGCTCGGAGAAAATGTTGTCGACGAACGCTTGAATGGCATCTATTTAATTGCCAACACTTATGGCAAAGGCGGGACAAACCATAATATCGATAGCGATAGTTATTGGGCTGCCGATGATGTCGGGATTGCATATAGAAACGATTCCACAAATGAAAATTTCGGTGTCGCTTATCGCTACAACGTCACCAGCGGGCTCAACCTGTTTTTTGCTCCGGTCGATTTCAATGGCTATAAATTCAATATCCAGGGAGCTGGGGAAACTTTTAATCTGACATGGGTATCATGGTCCGATCTTTCTTCCGGCTGGAAGTACCCAGCCATTCATTCTTATGGTTCAGCAGCTAAAGGCGGTATCGCAATTGGCGGAAATGCCGTCTATGCATTTGGATTAGCCGGGCGTACGCAATTAATTTAA

Tertiary structure

PDB ID
c943b3dfbc5af78d365ddc7c09f7120b1dfab671051b601229df29c93d343a6b
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6635
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Expanding the diversity of oenococcal bacteriophages: Insights into a novel group based on the integrase sequence Jaomanjaka,F., Ballestra,P., Dols-Lafargue,M. and Le Marrec,C. 2013 23994162 GenBank