Protein
View in Explore- Genbank accession
- YP_007517930.1 [GenBank]
- Protein name
- baseplate wedge initiator
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MPTALQLRRGSTSQNNSFTGAVGEVSVDTDKDTLRVHDGSTAGGFEVITATATQTLTNKTLTSPNISGASFTGASFTFEGATDDSFETTLTVVDPTADRTVTIPNATTTLVGTDVSQTLTNKTLTTPVIAEIDSGGSITLDATADIILDADGANVTIKDGGTTTLDFVSNGATDITLDAPGDVKIDADGGDIIFMDGGAVYGSATNNSGNLIIKSGTTTAATFSGANVTLAGTVASGAITSSGSFTGTQAILSNASPLVFEGATADSFETTIAVTDPTADRTLTLPDATDTLVGRATTDTLTNKTLTTPVIAEIDSAGNFTVDAATDIILDADGGDVFLKDAGTTYGSLTNTGGNLIIKSGTTTAMTMSGANVTIAGNLTVSGSTTTVDSSTVNLQTGFVFEGSTADSFETTLVATDPTADRTVTIPDLTGTVSLITATETLTNKTLTTPVIAEIDSGSTITLDATTDIILDADGDNITLKAGGTTALDFVLNGTTDITLDAPGDIKIDADGGDIFFLDAGTTYGSATNNSGNLIIKSGTTTAATFSGANVTLAGTVASGAITSSSTVTATGAVLSGSVVFEGATNDSFETTLGVVDPTADRAVNIANVAGTLQPFAAASTDAITATPAELNLIDGGTARGTTAIADGDGVLINDGGTMRMTTVETLAAYMDDEITAMPNLVTTGALNSGSITSGFGTINNGSSTITTTGQITGGIIQSTNNMLIGAGYSLVFEGSTNDSFETTLGVVDPTADRTVNIANVAGTLQPFASASTDQITATVAEINLIDGGTARGTTAVADGDGILINDAGTMRMTNVQTVSAYMSAESVGGSNIVTTGALNSGSITSGFGNIDNGSSTLDTGALTATTIAGTTITASTGVETKNGATGAGFVKFFEDSDNGTNAVTLVGPASTGDITITLPTQAGTVVVSNTTDGNDVQLDSLGLNTAASGTAGELRATNDITAFYSSDIALKENIINIPSPLEMIKKINGVFFDWKDSFIESKGGEDGYFVRKRDVGVIAQDVEKVMPEIVGTRPDGIKAVKYDRLVSVLIEAVKELTDEVTELKKKQ
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1068 AA molecular weight: 107670,18510 Da isoelectric point: 4,05003 aromaticity: 0,04401 hydropathy: 0,08755
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Pelagibacter phage HTVC008M [NCBI] |
1283076 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062 [NCBI] |
335992 | Bacteria > Proteobacteria > Alphaproteobacteria > Pelagibacterales > Pelagibacteraceae > Candidatus Pelagibacter |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_007517930.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_020484
[NCBI]
CDS location
range 51699 -> 54905
strand +
strand +
CDS
ATGCCAACAGCATTACAATTAAGACGAGGATCAACGTCTCAAAATAATAGTTTTACAGGTGCTGTAGGTGAGGTAAGTGTAGATACTGATAAAGATACTCTTAGAGTCCATGATGGCTCGACAGCAGGCGGTTTTGAAGTAATAACGGCAACTGCTACACAAACACTCACAAACAAAACCTTAACGAGCCCAAATATTTCAGGCGCCTCTTTCACAGGTGCAAGTTTCACTTTTGAAGGTGCAACAGATGACAGTTTTGAAACAACTCTAACAGTTGTAGATCCAACAGCTGACAGAACAGTAACTATTCCAAATGCAACTACTACACTAGTTGGTACGGATGTTTCACAAACTCTTACGAACAAAACTTTAACTACACCAGTTATCGCTGAGATAGATAGTGGTGGTAGTATAACTTTAGACGCAACAGCAGATATTATATTAGACGCTGATGGTGCTAACGTAACTATAAAAGACGGCGGTACAACAACATTAGACTTTGTTAGTAACGGTGCAACAGATATTACACTAGACGCTCCAGGCGATGTTAAAATAGACGCTGATGGCGGAGACATAATCTTTATGGATGGTGGTGCTGTCTATGGTAGTGCAACAAACAATTCAGGTAACTTGATTATCAAATCAGGAACTACAACAGCTGCAACATTTAGTGGTGCAAATGTAACATTGGCAGGTACAGTTGCTTCAGGTGCAATTACATCATCTGGTTCATTTACTGGTACTCAAGCAATATTATCAAATGCAAGTCCATTAGTATTTGAAGGTGCAACAGCAGATAGTTTTGAAACAACTATTGCAGTTACAGACCCAACAGCAGATAGAACACTTACATTACCAGACGCAACAGACACATTAGTGGGAAGAGCAACAACAGATACGTTGACTAATAAAACACTAACTACTCCAGTTATTGCTGAAATAGATAGTGCTGGCAACTTTACAGTTGACGCAGCTACAGATATCATATTAGACGCAGATGGCGGAGATGTTTTCTTAAAAGACGCTGGTACTACTTACGGTTCATTGACGAACACAGGCGGTAACTTGATTATAAAATCAGGTACAACTACTGCTATGACCATGTCAGGTGCAAACGTAACAATCGCAGGTAACTTAACAGTATCAGGTTCTACAACTACAGTTGATAGTTCAACAGTTAACTTACAAACAGGTTTCGTTTTTGAAGGTTCAACAGCAGACAGTTTTGAAACAACACTAGTTGCTACTGACCCAACAGCAGATAGAACAGTAACTATACCAGATTTAACTGGTACAGTTTCTTTAATAACTGCTACAGAAACATTAACAAATAAAACACTTACAACTCCTGTAATTGCAGAAATAGATAGTGGTTCAACAATCACACTTGACGCAACTACAGACATTATCTTAGACGCTGATGGTGATAACATCACTTTGAAAGCGGGTGGTACAACTGCCTTAGATTTTGTTTTAAATGGTACAACTGATATTACATTAGACGCTCCAGGTGATATTAAGATAGACGCTGATGGCGGAGATATTTTCTTCCTAGACGCAGGTACTACTTATGGTAGTGCAACTAATAACTCTGGTAACTTAATTATAAAATCAGGTACAACTACAGCTGCAACATTTAGTGGTGCAAATGTAACATTAGCAGGGACAGTTGCTTCAGGTGCAATCACATCATCAAGTACAGTAACAGCAACAGGCGCAGTATTAAGTGGTTCTGTAGTATTTGAAGGTGCGACAAACGACAGTTTTGAAACAACATTAGGTGTAGTTGATCCAACTGCTGACAGAGCAGTCAACATCGCCAATGTTGCAGGTACATTACAACCATTTGCTGCTGCTTCAACAGACGCAATCACAGCAACACCGGCAGAATTAAATTTAATTGACGGTGGTACTGCTAGAGGCACAACAGCAATTGCAGACGGTGATGGTGTACTAATCAATGACGGCGGTACAATGAGAATGACTACAGTTGAAACTCTTGCTGCCTACATGGATGACGAAATTACAGCAATGCCAAATCTTGTGACAACAGGTGCATTAAACTCAGGTTCAATCACATCAGGTTTTGGTACTATAAACAACGGTTCATCTACAATCACAACTACAGGTCAGATAACTGGTGGTATTATTCAATCTACTAACAACATGTTAATAGGTGCAGGTTACTCACTTGTATTTGAAGGTTCAACAAATGATAGTTTTGAAACAACATTAGGTGTAGTTGACCCAACTGCTGATAGAACAGTTAATATTGCAAATGTAGCAGGTACTTTACAACCTTTTGCTTCTGCTAGTACAGACCAAATTACGGCAACAGTTGCTGAAATTAATTTAATAGATGGTGGTACTGCTAGAGGTACTACTGCTGTAGCAGACGGTGATGGTATTCTAATCAACGATGCTGGTACAATGAGAATGACGAATGTTCAAACTGTTTCAGCGTATATGTCTGCTGAAAGTGTTGGTGGTTCAAACATAGTTACTACTGGTGCATTAAACTCAGGTTCAATCACTTCAGGTTTTGGTAACATAGATAACGGTTCATCTACATTAGATACAGGTGCCTTAACGGCAACTACAATTGCAGGTACAACAATTACTGCTTCTACTGGAGTAGAAACAAAAAATGGTGCTACTGGTGCCGGTTTTGTTAAATTCTTTGAAGATAGTGACAACGGTACTAATGCAGTAACTTTAGTAGGTCCTGCTTCAACAGGTGATATAACGATTACTTTACCAACTCAGGCAGGTACAGTTGTTGTATCAAACACAACAGACGGTAATGATGTACAGTTAGACAGTTTAGGTCTTAATACTGCCGCTTCAGGTACTGCTGGTGAGTTAAGAGCAACAAACGATATTACTGCCTTCTACAGTTCAGATATAGCGCTTAAGGAAAACATTATCAACATTCCTTCTCCACTTGAAATGATTAAGAAAATCAACGGTGTATTCTTTGATTGGAAAGATAGTTTCATTGAGAGTAAAGGTGGCGAAGACGGATACTTTGTAAGAAAAAGAGATGTTGGTGTTATCGCACAAGATGTTGAAAAAGTTATGCCAGAAATCGTTGGTACAAGACCAGACGGTATCAAAGCAGTTAAATATGACAGACTAGTATCAGTATTGATTGAAGCTGTTAAAGAATTAACAGACGAAGTTACAGAATTAAAGAAAAAACAATAA
Tertiary structure
PDB ID
1e18d38906e5a543622474a0209319a7d8ec1a256fc43ee94acc40a59cf23fdf
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50