Protein

Genbank accession
CAF34150.1 [GenBank]
Protein name
virion structural protein [Synechococcus phage S-PM2]
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MAAIQVYKTDTFEIQRQKINQIGEAISNFSGGGNDFAAGNLKLGDGSILDPSLAFTSDPKLGFYKSFPQTLGIVSDNKKVVEFSSSKITNLIDSVVQQNSLLNAQTRVNSFGKEYDSGNYENVSIIGGSGTNATASFEVISYNGSVITDGVNYPEGNFTLINLSGGTGSGASCNFDVDGIEGNVSNTGSGYTFGAYENVPLTGGSGTGARADILVTIDQIVTTVIIVNDGIDYQNGDILSVNSADVGGTGSGFQYTITSNPGTPIDFSIASYGDGYSAGDILSVTDYGTTNLQYQISQIGQVKNFQFQNGGSGYIQGDILTVDSQDLAGVISYSVENKELHKITFVNNISPSVVPVGATVKYNNNIGFIQYVKSSGGIVQYIYTDRIGATPGILLTIETEGGENTYDVDQSIDIFRWFIDNNGIPNLTFVPNQTYRFNYIPDEAHIFSLSRFPGGIWGRSRIENLSTNLISSSNVISVSSSTGILPGMDVIFVSGEGQLVSGTKVSEINGNDVTLSKTPLLSGSAVLTFVGSEYTSNVSRDESSLTIRVTEDTPSPLYYYCATQSQDHADEGGEENQESIITIDYLNPRTLFGSEFEIEIAEIESVDFIKLDSITGGITSVSVSSENADFNTGDITILDSFLITSDELSISTITSSNLNEEIELTANNFIVDSNFRISNKLFINNLTGNLTSSGTIKGNDLNINDTINITNNTISTASGNNLVLSPAPLRTAKVNATTALVIPVGTNNQRPQAAVVETGAIRFNTDTQQYEGYNATAASWSSLGGVRDVDGNTYIIAEASVGSNDNTLYFYNNGLNTARLNNTYFDFRSTKRIRSENMSAPSYTEWRANTPVSVGQYLKHKNNIYEVTIAGTTAGSANPPIHTTGIAINGSATLLWSALSISTLTFEEISEVRIGPDGTTPLVISDELVLQNNQISSKLNDINIKPSVGKKVFVDSNSSLVLPVGDNNQRGAAVIGSVRFNTSISQYEGYDGSNWSSLGGVRDVDGNTYIIPETSAGSNENILYFYNDDNNTLQLSSGGLDFVSTDNITSSTTDTLNLNASVVNFDNLSLSIDNTGTSTILSSIKDSLDINLSVGLNVDNLLSLTSNGEISVNTGFALGSESKINILDSTLKYFELSDSIISTFVIDLEKNVVDTGSDIIYDPSVHRAARMTIIVDNTTKDEREVIDFNICHKGTDIFYTEYGNITTSVKLIQTSFDFTAGNEVRATFTANQNNSANDIINIVVHKTIIKK
Physico‐chemical
properties
protein length:1251 AA
molecular weight: 134096,96380 Da
isoelectric point:4,29904
aromaticity:0,08313
hydropathy:-0,14732

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-PM2
[NCBI] 		238854 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAF34150.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
AJ630128.1 [NCBI]
CDS location
range 49179 -> 52934
strand +
CDS
ATGGCAGCAATTCAAGTCTATAAAACAGATACCTTTGAAATTCAAAGGCAAAAAATCAATCAGATAGGAGAAGCTATATCTAACTTCTCTGGTGGTGGTAATGATTTTGCTGCAGGAAATTTAAAGTTAGGTGATGGTTCTATCTTGGATCCATCTCTTGCTTTTACTAGTGATCCTAAACTAGGATTTTATAAGTCATTTCCCCAAACTTTAGGAATTGTATCTGATAATAAAAAAGTTGTCGAATTTTCTAGTTCAAAAATAACAAATTTAATAGATTCTGTAGTACAACAGAATTCACTTTTAAATGCACAAACTAGAGTAAATAGTTTTGGTAAAGAATATGATTCTGGTAATTATGAAAATGTAAGTATTATAGGTGGTTCTGGGACTAATGCTACTGCATCATTTGAAGTAATTTCTTATAATGGTTCTGTAATTACAGATGGGGTTAATTATCCTGAGGGAAATTTTACTTTAATAAATTTATCTGGAGGAACTGGAAGTGGAGCATCTTGTAATTTTGATGTAGACGGAATAGAAGGAAATGTTTCAAATACAGGAAGTGGATATACATTTGGTGCTTATGAAAATGTTCCTTTAACTGGTGGTTCTGGAACTGGAGCAAGAGCAGATATTTTAGTTACAATTGATCAAATTGTTACTACAGTAATTATTGTTAATGATGGAATCGATTATCAAAATGGAGATATTTTATCTGTAAATTCTGCTGATGTTGGTGGTACTGGTTCTGGATTTCAATATACTATAACATCAAATCCAGGAACTCCTATTGATTTTTCTATTGCTTCTTATGGAGATGGTTATTCTGCTGGAGACATTCTTTCAGTAACTGATTATGGAACTACAAATTTACAATATCAAATATCTCAAATTGGTCAAGTAAAGAATTTTCAATTTCAAAATGGTGGTTCTGGTTATATTCAAGGGGATATATTAACAGTAGATTCGCAAGATTTAGCTGGTGTAATATCTTATTCTGTAGAAAATAAAGAGCTTCATAAAATTACTTTTGTCAATAACATTTCTCCATCCGTTGTACCAGTTGGTGCTACTGTAAAATATAATAATAATATTGGTTTCATTCAATATGTCAAATCTTCTGGAGGAATTGTCCAATATATTTACACAGATAGAATAGGTGCTACACCAGGAATTCTCCTAACAATAGAAACAGAAGGTGGAGAAAATACTTATGATGTTGATCAATCGATTGATATTTTTAGGTGGTTTATAGACAATAATGGAATACCAAATTTAACTTTTGTACCAAATCAAACATATAGATTCAATTATATTCCAGATGAAGCACATATTTTTTCTTTGAGTAGATTCCCTGGTGGAATATGGGGAAGAAGTAGAATTGAAAATTTATCTACAAATCTTATTTCATCTTCTAATGTAATTTCAGTTTCATCATCTACTGGTATTTTACCTGGAATGGATGTAATTTTTGTTTCTGGGGAAGGTCAATTAGTAAGCGGTACTAAGGTAAGTGAAATTAATGGAAATGATGTAACCCTATCAAAAACACCGCTTTTATCTGGTTCTGCTGTACTTACATTTGTTGGATCAGAATATACATCAAATGTAAGTCGTGATGAATCGTCTTTGACGATAAGAGTTACAGAAGACACACCATCTCCATTATATTATTATTGTGCTACTCAATCACAAGATCATGCTGATGAAGGTGGTGAAGAAAATCAAGAGTCCATTATTACGATTGATTATCTCAATCCAAGAACATTATTTGGTTCAGAATTTGAAATAGAAATTGCTGAAATTGAATCTGTTGATTTTATTAAATTGGATTCAATTACTGGAGGAATAACATCAGTATCTGTTTCTTCAGAAAATGCAGATTTTAATACTGGAGATATTACAATTCTTGATTCTTTTCTGATTACATCAGATGAATTATCTATTTCCACAATTACTTCATCAAATCTAAATGAAGAAATTGAACTAACTGCCAACAATTTTATAGTTGATTCAAATTTTAGAATATCTAATAAACTATTTATTAATAATTTAACTGGAAATTTAACTTCATCTGGTACTATTAAAGGAAATGATTTAAACATTAATGATACTATTAACATCACAAATAATACTATCTCTACTGCATCTGGAAATAATTTAGTATTATCTCCAGCACCTTTAAGAACTGCTAAGGTAAATGCAACCACTGCTTTGGTTATCCCAGTGGGAACAAATAATCAAAGACCTCAAGCAGCGGTAGTAGAAACAGGAGCAATTAGATTTAATACTGATACACAACAATATGAAGGTTACAATGCTACGGCGGCTAGTTGGTCTTCTTTAGGTGGCGTTAGAGATGTTGATGGAAACACATATATCATAGCAGAAGCTTCTGTTGGATCCAACGATAATACTTTATATTTTTATAATAATGGATTAAATACTGCTAGATTAAATAATACTTATTTCGATTTCAGATCAACCAAAAGAATACGATCTGAAAATATGTCTGCTCCTTCTTACACAGAATGGAGAGCTAATACGCCAGTAAGTGTTGGACAATATTTAAAGCACAAAAATAACATCTACGAAGTAACAATTGCTGGAACCACCGCTGGATCCGCAAATCCACCTATTCATACTACAGGTATCGCAATAAATGGATCAGCAACATTACTATGGAGTGCTTTATCAATATCAACATTAACATTTGAAGAAATATCTGAGGTTAGAATTGGACCAGATGGAACTACTCCCCTTGTGATTAGTGATGAGTTGGTTTTGCAAAATAATCAAATATCATCAAAACTTAATGATATTAACATAAAACCATCTGTAGGTAAAAAAGTTTTTGTTGATTCAAATTCTTCACTTGTTTTACCAGTAGGAGATAATAATCAAAGGGGTGCTGCTGTAATTGGATCTGTTAGATTCAATACTTCTATCTCCCAATACGAAGGTTATGATGGTTCTAACTGGTCTTCTTTGGGTGGTGTTAGAGATGTTGATGGCAACACTTATATTATTCCAGAAACATCTGCAGGATCTAATGAAAATATTTTATACTTCTATAATGATGACAACAATACATTACAATTATCTTCGGGCGGTCTAGATTTTGTTAGCACCGACAATATCACATCGTCTACAACAGATACCCTCAATTTAAATGCATCGGTTGTAAACTTTGATAATTTGAGTTTATCGATTGATAATACTGGAACTTCAACTATTTTATCATCTATTAAAGATTCCTTAGATATTAATTTATCAGTTGGTTTAAATGTTGATAATTTATTGTCACTTACTTCGAATGGAGAAATTTCTGTTAATACTGGGTTTGCTCTTGGATCTGAATCGAAAATAAATATTCTAGATAGCACTTTAAAATACTTTGAATTATCTGATTCTATTATATCAACATTTGTTATAGATTTAGAAAAAAATGTTGTAGATACTGGATCTGATATCATTTATGATCCTTCTGTTCATAGAGCAGCTAGGATGACTATTATTGTTGATAATACCACAAAGGATGAGAGAGAAGTAATTGATTTCAATATTTGTCATAAAGGAACTGATATATTCTACACAGAATATGGAAATATTACAACATCAGTTAAACTGATTCAAACATCTTTTGATTTTACTGCTGGCAATGAAGTTAGAGCAACATTTACTGCAAACCAAAATAATAGTGCCAATGACATAATTAATATTGTTGTCCATAAAACCATAATCAAGAAGTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.