Protein

Genbank accession
AGH56449.1 [GenBank]
Protein name
fiber [Cyanophage Syn2]
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,86
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,67
Protein sequence
MSLTRLKNIITSRTGRIIYVNPDDFDASDAIDNRGNSALRPFKSIQRAFLEVARFSYRVGLSNDEFDAFSIMLYPAEYIVDNRPGEVLYTNTAPIDANSNLDLTSPNNVLHKFNSVEGGIIVPRGCSLVGTDLRRTKVIPKYVPYPTIYAAKGINTEDQVPPRTSIFRVTGGTYFWQFSFFDGAEEGVYFKPDSTETLAPKFSHHRLTCFEFADGLNPLSKLISDGSVPNADYSAVPNILERTDLEIYYQKVSKAFATIPDTSGDPSTDQIQARVEENRIVGPISDEYRVLQITRNGQTATAVTVDEFDNPRDHGFSVGVNINVSGVTGSTGPQSELDASVYNGSFTVTSASGNVFTYQMQSEPTGNAVGSNITVKTEIDTVDSASPYAFNLSLRSVWGMNGMNANGSKATGFKSMVVAQFTGLSLQKDDRAFVRYNASTGNYDVATSGDGAHLDGFAEYRKGWGHRHIVCSNDSFIQAVSVFAVGYDTHFTAESGGDMSITNSNSNFGNTALRSAGFKAKSFSKDKAGAVTHIIPPKALSVISTTATGTSGASSITLANDGSINGIIQGMNVTGSGVGVGATVGSVNTNTRVVTLTATNTAAINGNVIFGEETSVNWVNIDIQRTKVINQSLAGSGGSPGSRLYLYGYTVEASPPTNKVQGFTVGARQDGTGANAVADKINCLLVANGAATATTQSATISPYGPSVSGLKAGVDGSPLQFDSATYTINGQAGSVGGWYLSVTADADPNSDTYNRIYNTLTTNNDYNNVNFTPTTFLKRIADGRNLQDRTYRIRLVIDKDKTNPLPRDPLSGYVMQPLNSDTTSYNLQNTFYIYDIEVVQEFERGIADGIYYITLLYASVAPSTSNFNNRKFSQNVNEVYPTFDRDNPVADPLAAVSVADNQTIGLVNATDGATPPAKDPKLSITKEAIVKMLTDTGWTQPGTTPGYESATARLSNVELTARAGDEEERKINIRNNNDGTVSPIPVEFRRHSILRSGNHTFEYLGFGPGNYSTAFPQTQVETLSADQIKFSQSIKEEAGVAFYSGLNSNGDLFIGNQVINPVTGQITNEDIAQLNVVGEENTTIETFSELVLTDKLTVIGGASNQLESIFAGPVTFQGQTTFTNNLSAKKISYFNQDGTVVKQTLLAPADANGQPSFANITGYTTPADGDLVYNINWTPGKSLGWIYYGGAWKEFGLTDTGQINIDTFNNNQHIGLGVAPTADYRVNVNGSARVDGDLIVTGRGGVGPDKYITKTYTGDGTTLTFAITTYTGVQHVDDSVLVFLNGVAQIAGTNYTVDSNGANVVFSSGDAPLASDTVHIVEMPI
Physico‐chemical
properties
protein length:1325 AA
molecular weight: 142049,38760 Da
isoelectric point:4,89244
aromaticity:0,09208
hydropathy:-0,25834

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage Syn2
[NCBI]
536473 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGH56449.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ634190.1 [NCBI]
CDS location
range 136699 -> 140676
strand +
CDS
ATGTCCCTTACTAGACTTAAGAATATTATTACGTCCAGAACTGGACGTATCATCTATGTCAACCCTGACGACTTCGATGCCTCTGATGCTATTGACAACAGAGGTAACTCTGCACTGAGACCGTTTAAGTCTATCCAGAGAGCATTTCTTGAAGTTGCAAGATTCTCCTATCGAGTGGGTCTGTCGAACGACGAATTCGACGCCTTCTCGATTATGCTGTATCCAGCAGAATATATTGTAGATAATCGTCCTGGTGAGGTTCTGTATACTAATACAGCACCTATTGATGCAAACTCAAACCTTGACTTAACTTCTCCTAATAATGTTCTTCATAAGTTCAATTCTGTAGAAGGAGGGATCATTGTTCCCAGAGGTTGTTCGCTGGTTGGAACCGATCTTCGTCGTACCAAGGTTATTCCTAAGTACGTTCCTTATCCTACGATCTATGCTGCTAAGGGTATCAATACAGAAGATCAAGTACCTCCCCGCACCTCGATCTTCAGGGTTACTGGTGGAACATACTTCTGGCAGTTCTCCTTCTTCGATGGTGCTGAGGAAGGTGTATACTTCAAACCTGATAGCACAGAAACATTAGCACCTAAGTTTTCACATCACAGACTCACTTGCTTTGAGTTTGCTGATGGTCTTAATCCCCTTTCTAAGTTAATCTCTGACGGCAGTGTTCCTAACGCAGATTATTCTGCTGTGCCTAACATCTTAGAAAGAACTGACCTGGAGATTTATTATCAAAAGGTATCTAAAGCATTCGCTACAATTCCTGATACATCTGGTGATCCCTCAACTGACCAGATTCAGGCAAGGGTCGAAGAAAACCGTATTGTTGGTCCTATTTCCGATGAGTACAGAGTCCTTCAGATCACAAGAAATGGTCAGACAGCAACGGCGGTCACTGTTGACGAGTTTGATAACCCCAGGGACCATGGATTTTCCGTTGGTGTTAACATTAACGTTAGTGGAGTTACTGGATCTACTGGACCGCAATCCGAACTTGATGCATCAGTTTACAACGGATCTTTCACAGTCACATCCGCATCTGGTAACGTCTTTACTTACCAAATGCAATCTGAACCAACAGGTAACGCAGTCGGATCAAACATCACTGTAAAGACTGAGATTGATACTGTTGACTCTGCATCTCCATATGCGTTCAACCTGTCACTCCGCTCGGTGTGGGGTATGAATGGTATGAATGCTAATGGTAGCAAAGCAACTGGTTTCAAATCAATGGTTGTGGCGCAGTTCACTGGTCTGTCACTGCAAAAAGATGATAGAGCGTTCGTAAGATATAATGCCTCTACTGGTAACTATGATGTAGCAACATCTGGCGACGGTGCTCACTTAGATGGTTTTGCTGAGTATCGTAAAGGTTGGGGACACAGACACATTGTCTGCTCTAATGACTCATTCATTCAGGCAGTTTCGGTGTTCGCTGTTGGATATGACACACACTTCACTGCTGAGAGTGGCGGTGACATGTCAATTACAAACTCTAACAGTAACTTTGGTAATACCGCTCTTAGATCTGCTGGATTCAAAGCAAAATCATTCTCGAAAGATAAGGCAGGCGCAGTCACTCATATCATTCCACCCAAAGCATTATCGGTTATTTCTACAACTGCAACGGGTACTTCTGGTGCATCATCGATCACTCTCGCTAACGACGGTTCGATCAATGGTATCATCCAAGGCATGAATGTTACAGGATCTGGTGTTGGCGTTGGTGCCACCGTTGGTTCTGTGAATACAAACACTAGAGTCGTCACGTTAACTGCTACAAATACTGCTGCAATTAACGGCAACGTTATCTTTGGTGAAGAAACATCAGTTAACTGGGTAAACATTGACATACAAAGAACAAAAGTCATCAACCAATCCCTTGCAGGATCTGGAGGATCCCCTGGATCTAGACTCTATCTCTACGGATATACTGTTGAGGCATCACCTCCAACAAATAAAGTCCAAGGTTTCACCGTTGGTGCTCGTCAGGACGGCACGGGCGCTAATGCTGTCGCGGACAAGATTAATTGCTTGCTTGTAGCAAATGGTGCAGCGACTGCTACAACACAATCTGCAACTATCTCACCATATGGACCTAGTGTTTCTGGTCTAAAAGCAGGTGTTGATGGTTCACCGCTTCAATTTGATAGTGCTACTTATACTATCAATGGTCAGGCAGGTAGTGTTGGTGGTTGGTATTTGTCTGTAACAGCAGATGCTGATCCTAATAGTGATACTTACAATAGAATTTACAATACACTTACTACAAACAACGATTATAATAACGTAAACTTCACTCCTACTACATTCCTGAAGCGTATTGCTGACGGTAGAAACCTTCAGGATAGAACGTATCGCATTCGCCTGGTTATTGATAAGGATAAGACTAATCCTCTGCCTCGTGATCCCCTCTCTGGTTATGTAATGCAACCATTGAATAGTGATACGACATCATACAATCTGCAAAATACTTTCTACATCTACGATATTGAAGTTGTACAAGAGTTCGAGCGAGGTATTGCCGATGGAATCTACTACATTACCCTCCTTTATGCATCTGTTGCTCCTAGCACAAGTAACTTCAACAACAGGAAGTTCTCTCAAAACGTCAACGAAGTCTATCCTACGTTTGACAGAGACAACCCTGTTGCTGACCCTCTTGCTGCTGTATCCGTCGCTGACAACCAAACTATCGGTCTAGTAAATGCTACCGATGGTGCTACACCACCTGCAAAAGATCCTAAGTTGTCTATCACTAAGGAAGCAATCGTTAAGATGCTGACTGATACTGGATGGACACAACCAGGTACAACTCCTGGATATGAATCTGCAACAGCGAGACTATCTAATGTTGAATTGACTGCTCGTGCAGGTGATGAAGAAGAGAGAAAGATTAACATCCGTAATAACAACGATGGAACTGTTTCTCCTATCCCCGTTGAGTTTAGACGCCACTCGATTCTGAGATCTGGTAACCATACATTTGAATATCTTGGTTTCGGTCCTGGTAACTACTCGACTGCATTCCCGCAGACTCAGGTAGAAACTCTGAGTGCTGATCAGATTAAGTTCTCTCAGTCAATTAAAGAAGAAGCAGGTGTTGCTTTCTACTCTGGTCTTAACTCTAACGGTGACCTGTTTATTGGTAACCAGGTTATCAACCCTGTTACGGGTCAAATCACAAACGAAGATATTGCACAACTGAATGTTGTTGGTGAAGAGAATACAACTATTGAAACATTCTCTGAGTTGGTTCTTACTGACAAACTCACGGTTATCGGTGGTGCATCTAACCAGTTAGAATCTATCTTCGCTGGTCCTGTTACATTCCAAGGACAAACTACCTTCACAAATAACCTTTCTGCTAAGAAGATTTCGTACTTCAACCAGGATGGCACGGTCGTCAAGCAAACCTTATTGGCACCAGCAGATGCAAATGGACAACCCTCTTTTGCTAATATCACGGGATACACTACGCCCGCTGATGGTGATCTTGTTTATAACATTAATTGGACACCAGGCAAGTCGCTTGGTTGGATATACTACGGTGGAGCATGGAAAGAATTTGGTCTCACAGATACTGGTCAGATTAATATTGATACTTTCAATAACAATCAACACATTGGTCTTGGTGTTGCTCCTACAGCTGATTATCGCGTAAATGTAAACGGTAGTGCAAGAGTTGATGGTGACTTGATTGTCACTGGTCGTGGCGGTGTTGGTCCCGACAAATATATTACTAAGACATATACAGGTGATGGAACAACCCTAACCTTTGCTATTACTACCTATACAGGTGTTCAGCACGTTGACGATTCTGTTCTGGTATTCCTGAACGGTGTTGCTCAAATTGCAGGAACAAATTATACTGTGGACTCTAATGGTGCAAACGTTGTATTCTCTTCTGGAGATGCACCTTTGGCATCGGATACAGTTCATATTGTCGAAATGCCTATCTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.