Protein

Genbank accession
AGH26128.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein CPMG_00027 [Prochlorococcus phage MED4-213]
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,87
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,81
Protein sequence
MATRIKLKRSTTATVVPTTSNLEDGEVALNIQDRKLYARNGSNIIEVANQKPNTGEVTTTMFATDVTNGPGNTFFVASTGNNNTTLANGGANGKHADTPFLTITKALETATSGDTIHIAAGEYQEVFPMTVPDGVTLRGANLRSTSVKPTGATNTNNAFILSGDCHVSDLTIKEFFYDSGNDKGYAFVVVSNMNSTQSPYVERVTVNTKGSVVSGSDPYGYTQGDAGRGALLDGANIAAASQHSSVLFNECTFITPNQVGLKITNGMRVEWLNCFNYFASIGIEGAQGATGKSGTGSTRLKFGGTSGTFSSSEVAYQLEDSFQSGTYARSGSTVTLTRTGHGLVTGDYIYADHISGGATDGFYQVTLVDANNVTYSSGSGTISSSNVTYKKAVATGTVASNDGTYVFITGKGTGEFTTVNKPTKTLSRFGDSQLSTAQKKFGTASILLDGTEDNVKVPTDEDFGFGSANFCIEAFIRPGSVTGTQRIFDLRDNSATDTAPTVYLDGTTLHYAVGNTSQINGGTLSTNTWYHVAVARSNGTTRLFLDGTQLGTYTDNNDYGSTKPVIIGSNYAASPVEAFNGYVDEVRISKASARFTAAFTPTTTEYGSDLNTVLLLHANGDNASTTFTDVSGGISDIRSSGGDSATSVITADYSAFGAELRSVASACVYGQKGVQADGSGVKLILTAHNFGYVGSGDDFTNDPSLAIQANEVVELNGGKVLYSSTDQDGDFRVGDAFTVDQETGNVQFQATSSAQSAANITLSDATGTTNIFPAYIETGNLRFAGNSMTSTAGQVIVDPAGEEDFVVNAETIVKEAVYFDVNKSISFGSTIQGALKIAGFGGSTVFGSSEASSFSTRSFVLLKNGLGTVNLTGAGSGYLSGQQTVDVTTNPFQTAQATAVLGTSGGLKTFTVTNRGIGYTALPTVTIDGSGNGAATAAFGVSGDIRSVTIGNGGSNYASPTGAIDAPPTNVFTGGATYEDANEVSYPVVDTSANTIYIPSHTFETGMEAIFDASTLDATATPVGGLTSSQSYYAIRVDQNLLKLASSLSDANAGNAISLTGQGTGDQFFQGRQATVNVGQTGGVIDTVTVTDIGSGYGAQPDLTITDSAGSNATFTVNVGRAINAVTVDTIGSYSSVPNITFTNASGDTTGSGAAATVALGYAVASVTLNNQGLGYRNLPTLSADGTPVAAAAFTVVLNEQEGRIGSIVVQNGGSGYDTAPTLTFTGGGGSGGQLLADVQSLTGNISANGSGYAPGVYPDVGFTVVTAAGTVSTVATATFTVPGFDGTITTAGSGYADGTYTSVPLVNTPTATYTVTVVTRDKN
Physico‐chemical
properties
protein length:1324 AA
molecular weight: 135796,85010 Da
isoelectric point:4,53316
aromaticity:0,08384
hydropathy:-0,09350

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Prochlorococcus phage MED4-213
[NCBI] 		889956 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGH26128.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ634174.1 [NCBI]
CDS location
range 38645 -> 42619
strand -
CDS
ATGGCAACGAGAATCAAGCTAAAGAGATCGACAACAGCAACAGTAGTCCCGACGACTTCTAACCTAGAAGACGGTGAGGTCGCTCTTAATATACAAGACCGAAAACTGTATGCTAGAAATGGATCAAATATAATAGAGGTCGCCAACCAGAAACCTAATACTGGTGAGGTGACTACAACTATGTTTGCTACGGACGTGACGAACGGTCCTGGCAATACTTTTTTTGTTGCGTCTACTGGAAATAATAATACAACTCTTGCTAATGGTGGTGCTAATGGTAAACATGCAGATACACCATTTTTAACTATTACAAAAGCACTTGAGACTGCTACATCTGGCGATACAATTCACATTGCAGCTGGAGAATATCAGGAAGTCTTCCCAATGACAGTTCCTGATGGTGTCACATTACGTGGAGCAAACTTAAGATCAACATCTGTAAAACCTACAGGTGCTACAAACACTAATAACGCATTTATATTATCTGGAGACTGTCATGTTTCCGACTTAACAATCAAAGAATTTTTCTATGACAGTGGCAATGATAAAGGATATGCCTTTGTTGTAGTATCAAATATGAACTCTACACAGAGTCCTTATGTTGAGAGAGTAACAGTCAATACAAAAGGTAGTGTAGTATCTGGTTCAGATCCTTATGGATATACACAAGGAGATGCAGGACGTGGTGCTTTATTGGATGGTGCAAATATTGCAGCTGCATCACAACATAGTTCTGTTCTATTCAACGAGTGCACCTTTATAACACCTAATCAGGTTGGTCTAAAAATTACCAATGGTATGCGTGTAGAGTGGTTGAATTGCTTCAACTATTTTGCATCTATTGGTATTGAGGGTGCTCAAGGTGCTACAGGTAAATCTGGCACAGGTAGCACTAGATTAAAGTTTGGTGGAACTAGTGGAACATTCTCATCATCTGAGGTTGCGTATCAATTAGAAGATAGTTTTCAGTCAGGAACTTATGCAAGATCTGGATCTACAGTTACATTAACAAGAACTGGACATGGTTTAGTAACAGGCGATTACATATATGCAGATCATATCAGTGGTGGTGCTACAGATGGATTTTATCAAGTCACTTTAGTAGATGCTAATAATGTAACTTACTCTAGTGGATCTGGAACTATATCATCTAGCAATGTAACTTATAAAAAAGCAGTAGCAACTGGAACTGTTGCTAGTAACGATGGCACATATGTATTCATTACTGGTAAGGGAACTGGAGAATTTACAACAGTCAATAAACCAACTAAGACTCTAAGTAGATTTGGTGACTCACAATTAAGCACAGCACAAAAGAAATTTGGAACAGCATCCATATTATTAGATGGAACTGAGGATAACGTAAAAGTTCCTACTGATGAAGACTTTGGATTTGGTTCTGCAAACTTCTGTATAGAAGCATTTATTAGACCTGGCAGTGTAACAGGCACACAAAGAATATTTGATCTTAGAGATAATTCTGCTACAGATACAGCACCTACAGTATATCTTGATGGAACTACTCTACATTATGCAGTAGGAAATACATCACAAATTAATGGTGGAACTTTATCAACTAACACATGGTATCATGTTGCTGTTGCTAGAAGCAATGGAACTACAAGACTATTCTTAGATGGAACTCAATTAGGAACATACACAGATAATAATGACTATGGATCTACAAAACCAGTTATCATAGGATCTAACTATGCTGCATCTCCTGTAGAAGCATTCAATGGATATGTTGACGAAGTAAGAATTAGTAAAGCATCTGCTCGTTTCACTGCAGCATTTACTCCTACAACAACTGAGTATGGTTCTGACTTAAATACTGTTCTATTACTACATGCAAACGGTGACAACGCCTCTACGACCTTTACAGACGTCTCTGGTGGTATATCTGATATTAGATCTAGCGGTGGAGATTCTGCTACATCTGTTATCACTGCTGACTACTCAGCATTTGGTGCTGAACTACGTTCTGTAGCATCTGCATGTGTTTACGGACAGAAAGGTGTACAAGCAGATGGTTCTGGTGTAAAACTCATACTTACTGCACATAACTTTGGTTATGTTGGATCTGGTGATGATTTCACCAATGACCCATCATTAGCAATACAAGCAAATGAGGTAGTAGAACTTAATGGTGGTAAAGTATTATATTCATCTACAGACCAAGATGGTGACTTCCGTGTTGGTGATGCATTTACAGTAGATCAAGAAACTGGTAATGTTCAATTCCAAGCAACATCTTCAGCTCAATCAGCAGCAAACATTACGTTAAGTGATGCTACTGGAACAACTAATATATTCCCTGCATATATTGAAACTGGCAACTTAAGATTTGCGGGTAACAGTATGACTTCTACAGCGGGTCAGGTAATTGTTGACCCAGCTGGTGAAGAAGATTTCGTTGTTAACGCTGAAACAATCGTTAAAGAAGCAGTTTATTTTGATGTTAATAAGTCAATATCATTTGGTAGCACAATTCAAGGTGCTCTAAAAATTGCAGGATTTGGTGGATCTACAGTATTTGGATCTTCAGAAGCATCCAGTTTTTCTACTAGATCATTTGTTCTACTCAAGAATGGATTAGGAACTGTCAACCTAACAGGTGCAGGATCAGGTTATCTTAGTGGACAACAAACAGTAGATGTAACCACAAACCCATTTCAAACTGCACAAGCAACAGCAGTTTTAGGCACTTCGGGTGGATTAAAAACATTTACAGTAACCAATAGAGGAATTGGATACACCGCACTTCCAACAGTAACAATTGATGGATCTGGAAATGGAGCTGCAACCGCAGCGTTTGGTGTCAGTGGTGATATTCGTTCAGTAACGATTGGTAATGGAGGAAGCAACTATGCATCTCCTACAGGAGCTATAGACGCTCCACCAACTAATGTATTTACAGGTGGTGCTACATACGAAGACGCAAATGAAGTTAGTTATCCAGTCGTTGATACATCAGCAAACACAATTTATATCCCAAGTCATACTTTTGAGACAGGGATGGAAGCAATTTTTGATGCATCAACATTAGATGCAACTGCTACTCCCGTAGGTGGTTTAACCTCCAGTCAATCTTACTATGCTATTCGAGTTGACCAAAATCTCCTTAAATTAGCATCTAGTCTATCAGATGCAAATGCAGGAAATGCAATATCATTAACAGGTCAAGGAACAGGAGATCAGTTCTTCCAAGGTAGACAAGCAACAGTTAACGTTGGACAGACTGGTGGTGTTATTGATACCGTGACTGTTACTGATATTGGTTCTGGTTATGGTGCTCAACCAGATCTTACAATTACCGACTCTGCAGGATCAAATGCTACATTTACAGTTAATGTTGGACGTGCAATTAATGCAGTCACTGTAGATACTATTGGATCTTATTCATCTGTACCAAACATCACATTTACAAATGCATCAGGAGATACCACTGGATCAGGTGCTGCTGCTACTGTTGCATTAGGATACGCTGTTGCATCGGTTACATTAAACAATCAAGGTTTAGGTTATAGAAATCTTCCAACTTTAAGTGCTGATGGAACTCCAGTTGCAGCTGCAGCATTCACTGTAGTTTTAAACGAACAAGAAGGTAGAATTGGATCTATAGTTGTTCAAAACGGAGGATCAGGATATGACACTGCACCAACACTAACATTTACTGGTGGAGGTGGTAGTGGTGGTCAACTATTAGCAGATGTTCAATCACTAACTGGAAATATCTCAGCAAATGGATCTGGATATGCACCTGGCGTTTATCCTGACGTAGGATTTACTGTTGTTACCGCTGCAGGTACAGTCTCAACCGTTGCAACTGCTACGTTCACAGTTCCTGGTTTTGACGGAACTATTACAACAGCTGGATCTGGTTATGCAGACGGAACTTATACTAGCGTTCCACTCGTAAACACTCCAACTGCAACTTATACAGTAACTGTTGTAACGAGAGACAAAAATTGA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.