Protein

Genbank accession
AGN12239.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein PRTG_00081 [Prochlorococcus phage P-SSM5]
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,82
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,92
Protein sequence
MANIKKTFNFRNGVQVDDDNLIVNQTGLVGIGTTVPTEALDVRGKVKVLVDPNVAGSGEINATTGIITSLTVTNLTVSGNNYSGGVIGVGISVGTAGIITATEPTGIVTYYGDGKELLNLPTSQWLDKDVGLGYTSIYAQGGVGVGTVDPRFTFQVSGNNDLTNFEEGVGINDKGGIVATGVITATTFKGHVDGSVSSGLSTITQLQSTNANVTGVVTATEFKGDVTGDVVSGVSTITTLQSTTINAGLINATGAGFTGALSGDVTGNVTGNVNGNINAVTGISTLNILKILGTIDGDTVSGILTTGRLTAATSTIGVATAASLNVQGKLGVGINNPIGDIQVYKSGISTVNVVGEEFAVLQLGQRDSIGIGASTAQFKFGETSQELDIINGDPGSINSIIHGGGSAGINTGSFNWIYGVNNSTLMSLDYTGKLGVNKPDPEYPLDVSGIGTFSSDVYVRNSLDVGVLLTVGGNATVAGTLGVTSSVTVGGDLTVTGVFNYPSDIPADKLPEEIDVRISSAGVSTFLGGVNLGAVQIGGGNGVISGVSTIGILTSAENIPLAMGVYSPTAKAVFNRLGVGNTDPINALDVTGTIQATQYLGVGNQPIGAAVDFSNAGRGLTVPSLQNRNFMLPPKVTTTERSNLAGLAAGAIIYNTTTNKLQVYNGSSWQNLH
Physico‐chemical
properties
protein length:673 AA
molecular weight: 68086,25880 Da
isoelectric point:4,50758
aromaticity:0,05349
hydropathy:0,18321

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Prochlorococcus phage P-SSM5
[NCBI]
536454 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGN12239.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ632825.1 [NCBI]
CDS location
range 50675 -> 52696
strand -
CDS
ATGGCTAATATTAAGAAGACATTTAATTTCCGTAATGGTGTTCAGGTTGATGATGATAATCTGATCGTAAACCAAACGGGTCTGGTTGGTATCGGAACTACTGTTCCAACTGAGGCTTTGGATGTCCGAGGAAAAGTTAAAGTTCTTGTAGACCCTAATGTTGCTGGATCTGGAGAGATTAATGCAACTACAGGTATAATTACATCTTTAACTGTAACCAATTTAACCGTTAGTGGAAATAATTATTCTGGTGGTGTAATTGGTGTTGGTATTAGTGTTGGAACAGCAGGTATTATAACTGCAACAGAACCAACTGGTATTGTTACTTATTATGGTGATGGTAAAGAATTATTGAATCTTCCCACATCACAGTGGTTAGATAAAGACGTAGGATTAGGATATACAAGTATATACGCTCAAGGTGGCGTAGGTGTGGGGACAGTAGATCCTCGATTTACCTTCCAAGTTAGTGGAAATAATGACTTAACTAACTTTGAAGAAGGTGTAGGTATTAATGATAAGGGTGGTATTGTAGCGACAGGTGTTATTACTGCTACTACCTTTAAAGGACATGTTGATGGATCTGTATCTAGTGGATTATCAACTATTACACAGTTACAGTCTACAAATGCAAATGTTACTGGTGTAGTTACTGCTACTGAATTTAAAGGAGATGTTACTGGTGATGTAGTTAGTGGTGTATCAACAATCACTACCTTACAATCAACCACGATAAATGCAGGTCTTATAAACGCTACTGGTGCAGGATTTACTGGTGCTTTATCGGGTGATGTTACTGGTAATGTTACTGGTAATGTTAATGGTAATATTAATGCGGTAACAGGTATTTCAACACTTAATATACTTAAGATACTTGGAACTATTGATGGTGATACTGTTTCTGGTATTCTTACTACTGGAAGATTAACTGCTGCTACTTCAACTATAGGTGTGGCAACAGCAGCATCATTAAATGTTCAAGGTAAATTGGGAGTTGGTATCAATAACCCAATAGGTGATATTCAGGTATATAAGTCAGGAATTTCTACTGTTAATGTTGTTGGTGAAGAGTTTGCTGTTCTACAATTAGGTCAGAGAGATTCGATTGGTATTGGAGCAAGCACAGCACAGTTTAAGTTTGGTGAAACTAGTCAAGAACTTGATATTATTAATGGAGATCCTGGTAGCATCAATAGTATTATTCATGGTGGTGGATCTGCTGGTATTAATACTGGATCATTTAACTGGATATATGGTGTAAATAACAGCACACTAATGTCACTAGACTATACTGGAAAGTTGGGTGTTAATAAACCTGATCCAGAATATCCTTTAGATGTAAGTGGTATTGGAACATTCTCAAGTGATGTTTATGTAAGAAATTCTTTAGATGTTGGTGTTTTACTGACTGTTGGTGGTAATGCAACTGTTGCTGGAACATTAGGAGTTACTAGTAGTGTGACTGTTGGTGGAGATTTGACGGTTACTGGAGTATTTAATTATCCTTCAGATATTCCTGCCGATAAATTACCAGAAGAAATTGATGTTAGAATATCTTCTGCTGGAGTATCTACATTCTTAGGTGGTGTTAATCTTGGAGCAGTTCAAATTGGTGGAGGAAATGGAGTTATCTCTGGTGTATCCACGATTGGAATCTTAACTTCTGCGGAAAATATTCCATTAGCTATGGGTGTTTATTCACCAACAGCAAAGGCAGTTTTCAATAGACTGGGTGTTGGTAATACTGATCCTATAAATGCGTTGGATGTTACTGGTACTATTCAAGCAACTCAATATCTTGGAGTTGGTAATCAACCAATAGGTGCTGCGGTTGACTTCTCTAATGCTGGTAGGGGACTTACTGTACCATCTTTACAGAATAGAAACTTTATGCTCCCACCAAAAGTTACTACAACTGAGAGAAGTAACTTAGCAGGATTAGCTGCTGGTGCAATAATATACAATACTACTACAAACAAACTTCAAGTTTATAATGGATCTTCGTGGCAGAACCTTCACTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.