Protein

Genbank accession
AZV01373.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,82
Protein sequence
MAKIPRIQFKRTKTPGTKPSKDILAEGELAINLADRTLFTKSGDDIIDLGFAKGGTVNGDINQEAGNFTTNGSMTAKTYIDIKNSLNDKKIFRLSYEGDRGALLSVNEGDNKWKTILVPLDEDGTKTIATREHVGKMVSTNDGETKLRAPNQTNLLIAKDNKELVWYDGSTNNRMVNFGAGGLDLAHKGSDIVGVSLYKKDGNQVRIETHAHSSALMLAFAYKDSAGNNSYVINMPKENGILATQGWTDAKYYKRNDSPSFKEYVNVFHNTTGSYTQLGYGNAGATWSVNTGGNWYILKHPLANGTVASQEWSQATHYNKSESDNRYVKIGIGGGYPLHNYNAGGHGYSTWNEKGVRQAYIGFANDGSTEFTISNEKGSNSTINLKAGNVLVNGVTIASQNWVISNFYKKTETYNKSEIDGKVNGRLTQAQGDARYYTKTDSDGRYLRMNITNKTSMPVFYRTANYGDDANQRDLNYAGFYRTNGLNSLPSLIIHVPHSSGLAHGRGIGFDYGSAGYGIYTYAYDANGKYQGQKSIALSEYHYSKTVSDDRYYQKSQTYSRAEVDSRVNGRLTQATADGRYAYKGGANAQNFGANIVDAADVNIRSDLTVKSNLVKINNAIQTVKTLTGYTYDLKLNDNTYKQSAGIIAQDVQKVLPALVTEDSLGLLSVNYNGLTAVLVNAINELSERLERLERGV
Physico‐chemical
properties
protein length:697 AA
molecular weight: 76540,96270 Da
isoelectric point:8,97356
aromaticity:0,09756
hydropathy:-0,59211

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage vB_SdyM_006
[NCBI]
2500762 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AZV01373.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK295204 [NCBI]
CDS location
range 155168 -> 157261
strand +
CDS
ATGGCAAAAATTCCAAGAATACAATTTAAAAGAACTAAAACACCAGGAACAAAGCCTTCAAAAGATATTTTAGCTGAAGGTGAATTAGCAATTAACTTAGCTGATAGAACTCTTTTTACAAAATCCGGAGATGATATTATTGATCTTGGCTTTGCTAAAGGCGGCACAGTTAATGGAGATATTAATCAAGAAGCTGGAAATTTTACAACCAATGGGTCAATGACTGCTAAAACATACATTGATATAAAAAATAGCTTAAATGACAAAAAAATATTTAGGCTTTCTTATGAAGGAGATCGTGGCGCTTTATTGTCTGTTAATGAAGGCGACAATAAATGGAAAACTATACTTGTTCCATTAGACGAAGATGGGACTAAAACTATAGCTACTCGTGAACACGTAGGAAAAATGGTTTCTACTAATGATGGAGAAACCAAATTAAGGGCTCCAAACCAGACTAACTTATTGATTGCAAAAGACAATAAAGAACTTGTTTGGTACGATGGATCCACTAATAATAGAATGGTTAATTTTGGTGCAGGTGGTTTAGATTTAGCCCACAAAGGTAGTGATATTGTCGGAGTTAGTTTATACAAAAAAGATGGCAATCAGGTTCGAATAGAAACCCATGCCCATTCATCGGCCCTTATGTTAGCTTTTGCATATAAAGATTCTGCAGGAAATAATTCATATGTAATCAATATGCCAAAAGAAAATGGTATATTAGCTACACAAGGATGGACAGATGCCAAATACTATAAAAGGAATGACAGCCCATCGTTCAAAGAATACGTTAATGTTTTTCATAATACCACAGGGTCTTATACTCAATTAGGATATGGTAATGCAGGTGCTACATGGTCAGTTAACACAGGCGGCAATTGGTATATATTAAAACATCCCCTAGCTAATGGTACAGTTGCTTCTCAAGAATGGAGTCAAGCTACGCATTACAATAAATCAGAATCTGATAATAGATATGTTAAAATTGGTATAGGTGGTGGTTACCCACTACATAATTATAATGCAGGTGGCCATGGCTATTCTACTTGGAATGAAAAAGGTGTACGTCAAGCTTATATAGGATTCGCAAATGATGGTTCTACAGAATTTACCATTAGTAACGAAAAAGGATCTAATAGTACTATTAACCTTAAAGCGGGTAATGTTTTAGTTAATGGTGTAACTATCGCCTCTCAAAACTGGGTAATTTCTAATTTTTATAAAAAAACAGAAACATATAATAAATCTGAAATTGATGGCAAAGTTAATGGACGATTAACACAGGCCCAAGGTGATGCTAGATATTATACTAAAACCGATTCTGACGGTCGTTACTTACGAATGAATATCACCAACAAAACTAGTATGCCGGTATTCTATAGAACAGCAAACTATGGAGATGATGCAAACCAACGTGATTTAAATTACGCAGGATTTTATAGAACTAACGGATTAAACAGCTTACCGAGTCTCATAATTCATGTTCCTCATAGTAGTGGGCTAGCTCATGGAAGAGGTATAGGATTTGACTACGGTTCAGCCGGATATGGGATTTATACTTATGCATATGATGCGAATGGAAAATATCAAGGTCAAAAATCTATCGCATTGAGCGAGTATCACTATTCAAAAACTGTATCAGATGATAGATATTACCAGAAGTCTCAAACATATTCTAGAGCAGAAGTTGATTCTAGAGTAAACGGAAGATTAACTCAAGCCACGGCGGATGGAAGATACGCGTATAAAGGTGGTGCTAATGCTCAAAACTTTGGTGCTAACATAGTTGATGCTGCTGACGTTAATATTCGTTCAGATTTAACTGTAAAATCAAATTTAGTTAAAATAAATAATGCTATACAAACTGTTAAAACATTAACAGGGTATACATATGATTTAAAATTAAACGATAATACATATAAACAATCTGCAGGTATAATAGCACAAGATGTACAAAAAGTTCTACCAGCATTAGTTACAGAGGACTCTTTAGGATTATTATCTGTTAATTATAATGGTTTAACTGCAGTTCTTGTTAATGCTATAAATGAATTATCTGAAAGATTAGAAAGATTAGAACGAGGTGTATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.