Protein

Genbank accession
AVZ45312.1 [GenBank]
Protein name
colanic acid-degrading protein
RBP type
TSP

evidence: DepoScope

probability: 1,0000

Protein sequence
MATFPTYPATSLEQGVDLVIFSSNQLHDVINGSATESIETESGLIPTLRKALVDNFFFKSPLDWAQGTNETVFNQLRYFQNGVLSGYYYAPNATLVNPIPMQGTPVGDNNWVLWGLKTEQLATEVTPWVYSGATGYETVISPPYIFDSAIVTINGVIQVLGEAFRIEDSKIILSEPLGHDPATGLPNKLFAYIGKIVASADTDPNLENRLVSLETKTEELTESMDKVPLQTIARKYGLLDDEVAYATAGQSLTGIKALYDPVAQSSYTLPPNITGTLTSLSVSGVMTYSGGSVDLSALAVERGQFVHLPTSFGNNVTLTAKNQTIGRGAGRYRWAGSLPKSILASDTLETSGGLGPNAWVLTNTEGLLTPRGGTYNDLFDVVYLSEFANNTTTYTTPEAAFQAALLAAKASKSKILDAYGCDMTFTTSSFDIQGITLRGGVFRGQRDYRVQNATVEGTTFRNSRVMYWGGAVRMFDCLWDGAPRAGQVGSLVFQGNPISGTFEIDNCTFKNGLYGILQQGTGEPVTRGVFRNLTFMDMQGDAIELNVINKHYDDGCVIENIYLSNIDGTNAPIPLSNWGIGIGVAGKGPYGYGIPDDQYCKNITIRNVFAKRCRQIVHVEVGRNISIENIHGDPDQTVSVGTGLATGAVVMYGSKDFTIDGVYGEPKTDGSTLASNIRMIYLEWGTNAVLDEEGNPVVPAQGRPSNPCFNYSVRNIHTKTGRVFAGVSAGPGYENRVSFENIRCAALQLFGIASWLSMSNITCNIFDCVGQPESGPGTFYDGFFRREKSVLEMVNVNCYPDGKTMVTGRPQWSRCRYSDIHRVNCNVEANMYTNIAGGIGAIVGTTGKVYYLEPNPSRNIDGMHFPTGKEFDKGDMIVKADNTFFLVTTSGAYIPDIPAFGIRATQAGDTFLTQNLTPNGTATNASWLYHYPLSAGTRIRIPGAGVGGADLDTVITRAPYQDNDTWTNPVKIDIADPIVTPTSAGVRIKTIPNDSSNVSVGNTAVIRPTPVVDVPTT
Physico‐chemical
properties
protein length:1017 AA
molecular weight: 109867,27630 Da
isoelectric point:5,02504
aromaticity:0,09538
hydropathy:-0,13845

Domains

Domains [InterPro]
IPR040775
302–361
IPR040775 IPR011050
IPR012334
488–642
IPR012334
AVZ45312.1
1 1017
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM-Ro121c4YLVW
[NCBI] 		2144176 Uroviricota > Caudoviricetes > Stephanstirmvirinae > Phapecoctavirus Ro121c4YLVW >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AVZ45312.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH051333.1 [NCBI]
CDS location
range 30705 -> 33758
strand -
CDS
ATGGCAACATTCCCAACATATCCAGCAACGTCTCTCGAACAGGGCGTAGACCTGGTTATTTTCTCATCTAACCAACTCCATGATGTTATTAATGGAAGTGCTACAGAGAGTATTGAAACAGAATCAGGGTTGATACCAACCCTGAGAAAAGCCCTTGTTGACAACTTTTTCTTTAAAAGCCCATTGGATTGGGCGCAAGGCACAAACGAAACAGTTTTTAACCAACTTCGTTATTTCCAGAATGGAGTATTGAGCGGTTATTACTATGCCCCTAACGCTACATTGGTTAACCCAATCCCTATGCAAGGGACTCCAGTAGGAGATAACAACTGGGTATTGTGGGGACTGAAAACAGAACAATTAGCAACAGAAGTCACCCCGTGGGTATACTCTGGTGCAACGGGTTATGAAACAGTAATTAGTCCTCCTTACATCTTTGATAGTGCTATTGTTACGATCAATGGTGTTATTCAGGTTCTGGGGGAAGCTTTCCGTATAGAAGATAGTAAGATCATCTTATCTGAACCTTTGGGACACGATCCTGCAACAGGACTACCAAACAAGCTTTTTGCTTATATTGGTAAAATCGTAGCTTCAGCAGATACAGATCCTAATCTAGAGAACCGTCTTGTTAGTTTAGAAACAAAAACGGAAGAACTAACAGAAAGCATGGATAAAGTCCCTCTGCAAACTATTGCTCGTAAATATGGTTTGTTAGATGATGAGGTGGCTTACGCAACAGCAGGTCAATCATTAACAGGGATTAAAGCTCTGTATGATCCAGTAGCACAGTCTTCCTACACATTACCTCCTAACATCACAGGAACTTTAACATCCTTGTCTGTTTCTGGAGTAATGACTTATTCTGGGGGGTCTGTAGATCTTTCTGCACTAGCTGTTGAACGTGGACAGTTTGTTCATTTGCCTACAAGCTTTGGTAATAACGTAACTCTGACAGCTAAAAATCAGACGATTGGACGTGGTGCTGGTCGTTATCGTTGGGCTGGAAGTTTACCAAAAAGTATTTTGGCCTCCGATACATTGGAGACAAGCGGTGGATTAGGTCCAAATGCATGGGTTCTGACCAATACAGAAGGACTGTTAACCCCTCGTGGTGGAACATACAACGATTTATTCGATGTTGTCTACTTGTCAGAATTTGCTAACAACACAACAACATATACCACACCAGAAGCAGCTTTCCAAGCGGCACTGTTAGCAGCAAAAGCTTCGAAAAGCAAGATTCTCGATGCTTACGGTTGCGATATGACTTTCACGACAAGCTCTTTTGATATTCAAGGTATCACTTTGCGTGGGGGTGTGTTCCGTGGTCAACGCGACTATCGTGTGCAAAATGCTACAGTAGAAGGCACAACTTTCCGTAACTCTCGTGTTATGTATTGGGGTGGTGCTGTGCGCATGTTCGATTGTTTGTGGGACGGTGCTCCTCGCGCAGGTCAAGTTGGTAGCTTGGTATTCCAAGGCAACCCAATATCAGGTACTTTTGAAATTGATAATTGTACTTTTAAAAACGGGTTGTATGGCATCCTTCAACAAGGAACAGGGGAACCAGTAACACGTGGTGTCTTCCGTAACCTTACCTTCATGGATATGCAAGGTGATGCAATAGAACTGAACGTCATCAATAAACATTATGACGATGGTTGTGTGATTGAGAATATTTACCTGTCTAATATCGATGGGACTAACGCTCCTATTCCTCTGTCCAACTGGGGTATCGGTATCGGTGTAGCTGGTAAAGGACCATATGGTTACGGAATCCCTGATGATCAATATTGCAAGAATATTACAATTCGTAACGTTTTTGCAAAACGTTGTCGTCAGATTGTCCACGTAGAAGTTGGTCGTAATATCTCTATCGAAAACATTCATGGCGATCCAGACCAGACTGTATCTGTTGGGACAGGTTTGGCAACTGGCGCAGTTGTAATGTATGGAAGTAAAGATTTTACGATTGACGGTGTTTACGGAGAGCCTAAAACAGACGGTAGCACACTTGCAAGTAATATCCGTATGATTTATTTGGAGTGGGGAACTAACGCAGTTCTGGACGAAGAGGGTAATCCGGTAGTTCCGGCACAGGGTAGACCTTCAAACCCATGCTTTAACTATTCTGTTCGTAATATTCACACCAAAACTGGGCGTGTTTTTGCAGGAGTTTCCGCTGGGCCAGGTTATGAAAACAGAGTTAGCTTTGAAAATATTCGTTGCGCTGCATTGCAGTTGTTCGGTATAGCTTCTTGGCTTTCAATGTCTAACATCACCTGTAATATCTTCGATTGTGTTGGTCAACCTGAATCTGGTCCAGGGACATTTTATGATGGATTCTTCCGTAGAGAAAAATCTGTTCTTGAAATGGTTAACGTGAACTGTTACCCAGATGGCAAGACGATGGTTACTGGTCGTCCACAGTGGAGCCGTTGCCGTTACTCGGATATTCATCGTGTCAACTGTAATGTTGAAGCTAATATGTATACCAATATCGCAGGTGGTATTGGAGCTATTGTAGGGACAACGGGCAAAGTTTATTACTTAGAACCTAATCCTAGTCGAAACATTGATGGAATGCATTTCCCAACAGGGAAAGAGTTTGACAAAGGTGATATGATAGTCAAGGCGGATAATACGTTCTTCCTTGTAACAACAAGTGGGGCATATATTCCAGATATCCCAGCTTTCGGTATTCGAGCTACACAGGCAGGAGATACCTTCCTGACACAGAACTTGACTCCTAACGGGACAGCAACAAATGCTTCTTGGTTGTATCATTACCCTCTGTCAGCAGGGACACGTATCCGTATTCCTGGTGCTGGCGTAGGTGGAGCAGATTTGGACACAGTTATTACTCGTGCACCTTATCAAGATAATGATACGTGGACTAACCCAGTTAAAATAGACATTGCAGATCCAATTGTAACGCCTACAAGTGCTGGAGTTAGAATTAAAACCATACCTAATGATTCCAGTAATGTTTCTGTAGGTAATACTGCGGTTATTCGCCCAACGCCAGTAGTAGATGTGCCAACAACCTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.