Protein

Genbank accession
AJB43735.1 [GenBank]
Protein name
tail spike protein
RBP type
TSP

evidence: DepoScope

probability: 0,9997

TSP

evidence: RBPdetect

probability: 0,9489

Protein sequence
MNEMFSQGGKGSTGILTNKQAIARKFGVKQNEVVYFSVGVDLGGYKVIYDKTTQRAYSLPVLPVGTTAVSLSEHAVLVHSAGTVDLGELAAARREFVCLSDSFTTGLVVNTRNELLMHNGIGYTYLGSLPVTIVEGANPVGNTDWKSQTDPNLRAQLASQDGMTLIGSVPDVTALASVGATVGSSIMLDSYSGSSVGGGIMIAVPNTTPVDEVVTFTGAGVVWKRKFFDGTATVYDAGYTGTGDIAPFINKVNSAGYDCLVPTSGTISTPILLDVAKGALVGANKCTLTEMEGVTGEYYLTVINSNTDYTARDAINATALLTGISFVGKGTRKMCLGSSTGGEIAELRISNCGFISTAGIEFKDNAYRILFDKCTISRSFTNSVIFNSPVNAGEVIKFNHCWMVDNGGPFTFENGQFIFDSCSLPAGKKAGYFDPVVALSDNATLVFANGNIEYQPGQSFVGFTVSGSSRLSIKDSTILLPEGYSTVPIVSNGDGVVSLNNCSLPLYGNTTIATGFATRQLIGGASKKVMSRGCFPRAGFITTNWNLGSIVSPYINSISNGSGQFGNTSNWTLSQTGTGAVTATTANDVPNDLMFTTSFVLSVPSADAAANFTQTIIDCEPGRYFQFGFWAKNTTTTLASIRFLDQQGNAVADSIGYIIPVVNTFNFYALVDCVPPGAYKAEINFNVSSVVGGVVIHNAVYGLI
Physico‐chemical
properties
protein length:704 AA
molecular weight: 74082,78460 Da
isoelectric point:5,15356
aromaticity:0,09659
hydropathy:0,16349

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage Bp4
[NCBI]
1458848 Uroviricota > Caudoviricetes > Schitoviridae > Gamaleyavirus > Gamaleyavirus Bp4
Host Escherichia coli
[NCBI]
562 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AJB43735.1_KJ135004.2_8484_10598 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ135004.2 [NCBI]
CDS location
range 8484 -> 10598
strand +
CDS
ATGAACGAAATGTTCTCACAAGGCGGTAAAGGCTCTACTGGTATTCTTACCAATAAGCAAGCCATTGCCCGTAAGTTTGGTGTTAAGCAGAATGAAGTAGTCTATTTTTCTGTAGGTGTAGACTTGGGTGGATACAAAGTCATTTATGATAAGACTACTCAACGCGCTTACTCATTGCCCGTACTTCCAGTAGGAACCACTGCTGTAAGTCTTAGTGAACATGCAGTCTTGGTTCATTCGGCAGGTACAGTTGATTTGGGTGAACTGGCTGCTGCACGTAGAGAGTTTGTATGCTTATCTGATTCATTTACTACGGGCTTAGTAGTAAATACTCGAAATGAGCTTTTGATGCATAATGGTATTGGTTATACCTACTTAGGTTCTCTACCCGTAACTATTGTTGAAGGGGCCAACCCTGTTGGCAACACGGATTGGAAGTCCCAAACGGATCCTAATTTGCGTGCTCAGTTGGCATCTCAGGATGGTATGACTTTAATTGGTAGTGTACCCGACGTAACTGCCCTGGCTTCTGTTGGAGCAACAGTAGGGTCTAGTATAATGCTAGATTCGTACTCAGGCTCTTCCGTTGGTGGGGGTATTATGATTGCGGTTCCTAATACTACTCCTGTAGATGAAGTTGTAACTTTCACCGGTGCAGGAGTGGTCTGGAAGCGTAAGTTCTTTGATGGCACTGCTACGGTATACGATGCAGGTTATACTGGTACGGGGGATATTGCCCCATTCATTAACAAGGTAAACTCTGCCGGTTACGATTGTCTTGTACCTACATCAGGGACTATTAGTACACCTATCTTACTGGATGTAGCTAAGGGGGCTTTAGTAGGAGCCAATAAGTGTACCCTTACGGAAATGGAAGGTGTAACAGGAGAGTATTATTTAACCGTAATCAATTCTAATACAGATTACACAGCCCGTGATGCCATTAATGCTACTGCCCTATTAACAGGTATTTCCTTTGTAGGTAAAGGTACTCGAAAGATGTGCTTGGGCAGTAGTACTGGAGGGGAGATAGCAGAATTACGTATATCTAACTGCGGGTTTATATCTACCGCAGGTATTGAGTTTAAAGATAATGCATACCGTATCCTGTTTGATAAGTGCACCATTTCTCGCAGTTTTACTAACTCTGTAATCTTTAATTCCCCGGTTAATGCTGGTGAGGTTATAAAATTCAACCACTGCTGGATGGTTGATAATGGGGGTCCATTTACATTTGAGAATGGGCAGTTCATCTTTGATTCATGCTCATTACCAGCAGGTAAAAAGGCAGGCTACTTCGATCCAGTAGTGGCATTAAGTGATAATGCTACCTTAGTATTTGCTAACGGTAATATTGAGTATCAACCCGGGCAGAGTTTTGTAGGCTTTACTGTGAGTGGAAGCTCACGCCTCAGTATTAAAGATTCTACTATTCTGCTTCCAGAAGGCTACAGTACAGTGCCTATTGTTAGTAATGGTGATGGGGTAGTTAGTTTAAATAACTGCTCATTGCCCCTCTACGGTAACACAACGATTGCTACTGGATTTGCTACAAGACAGTTGATAGGCGGTGCAAGTAAAAAAGTAATGTCCAGAGGGTGCTTCCCTCGTGCAGGATTTATTACAACTAACTGGAATCTAGGGAGCATTGTAAGCCCATATATTAATAGTATTAGCAATGGCTCAGGACAGTTTGGAAATACATCTAACTGGACACTCTCGCAAACTGGAACAGGTGCTGTCACTGCTACTACAGCAAATGATGTTCCTAACGATTTAATGTTTACAACTTCTTTTGTTTTATCTGTACCATCAGCAGATGCAGCAGCTAACTTCACTCAAACAATCATTGATTGTGAACCGGGTCGTTATTTTCAGTTTGGTTTTTGGGCTAAAAATACAACAACCACCTTGGCGTCAATTAGATTCCTGGACCAGCAAGGAAATGCTGTTGCGGATTCCATAGGATATATCATTCCAGTAGTAAACACGTTCAACTTTTACGCTTTGGTGGATTGCGTTCCTCCAGGAGCTTACAAAGCTGAAATTAATTTTAATGTTTCTTCAGTTGTTGGAGGCGTCGTAATACACAATGCAGTTTATGGATTGATTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID: 65

Method: ESMFold

Resolution: 0,8089

Evidence: 0,8577

Literature

No literature entries available.