Protein
- Genbank accession
- AJB43735.1 [GenBank]
- Protein name
- tail spike protein
- RBP type
-
TSP
evidence: DepoScope
probability: 0,9997
TSP
evidence: RBPdetect
probability: 0,9489
- Protein sequence
-
MNEMFSQGGKGSTGILTNKQAIARKFGVKQNEVVYFSVGVDLGGYKVIYDKTTQRAYSLPVLPVGTTAVSLSEHAVLVHSAGTVDLGELAAARREFVCLSDSFTTGLVVNTRNELLMHNGIGYTYLGSLPVTIVEGANPVGNTDWKSQTDPNLRAQLASQDGMTLIGSVPDVTALASVGATVGSSIMLDSYSGSSVGGGIMIAVPNTTPVDEVVTFTGAGVVWKRKFFDGTATVYDAGYTGTGDIAPFINKVNSAGYDCLVPTSGTISTPILLDVAKGALVGANKCTLTEMEGVTGEYYLTVINSNTDYTARDAINATALLTGISFVGKGTRKMCLGSSTGGEIAELRISNCGFISTAGIEFKDNAYRILFDKCTISRSFTNSVIFNSPVNAGEVIKFNHCWMVDNGGPFTFENGQFIFDSCSLPAGKKAGYFDPVVALSDNATLVFANGNIEYQPGQSFVGFTVSGSSRLSIKDSTILLPEGYSTVPIVSNGDGVVSLNNCSLPLYGNTTIATGFATRQLIGGASKKVMSRGCFPRAGFITTNWNLGSIVSPYINSISNGSGQFGNTSNWTLSQTGTGAVTATTANDVPNDLMFTTSFVLSVPSADAAANFTQTIIDCEPGRYFQFGFWAKNTTTTLASIRFLDQQGNAVADSIGYIIPVVNTFNFYALVDCVPPGAYKAEINFNVSSVVGGVVIHNAVYGLI
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 704 AA molecular weight: 74082,78460 Da isoelectric point: 5,15356 aromaticity: 0,09659 hydropathy: 0,16349
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
Escherichia phage Bp4 [NCBI] |
1458848 | Uroviricota > Caudoviricetes > Schitoviridae > Gamaleyavirus > Gamaleyavirus Bp4 |
Host |
Escherichia coli [NCBI] |
562 | Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AJB43735.1_KJ135004.2_8484_10598
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ135004.2
[NCBI]
CDS location
range 8484 -> 10598
strand +
strand +
CDS
ATGAACGAAATGTTCTCACAAGGCGGTAAAGGCTCTACTGGTATTCTTACCAATAAGCAAGCCATTGCCCGTAAGTTTGGTGTTAAGCAGAATGAAGTAGTCTATTTTTCTGTAGGTGTAGACTTGGGTGGATACAAAGTCATTTATGATAAGACTACTCAACGCGCTTACTCATTGCCCGTACTTCCAGTAGGAACCACTGCTGTAAGTCTTAGTGAACATGCAGTCTTGGTTCATTCGGCAGGTACAGTTGATTTGGGTGAACTGGCTGCTGCACGTAGAGAGTTTGTATGCTTATCTGATTCATTTACTACGGGCTTAGTAGTAAATACTCGAAATGAGCTTTTGATGCATAATGGTATTGGTTATACCTACTTAGGTTCTCTACCCGTAACTATTGTTGAAGGGGCCAACCCTGTTGGCAACACGGATTGGAAGTCCCAAACGGATCCTAATTTGCGTGCTCAGTTGGCATCTCAGGATGGTATGACTTTAATTGGTAGTGTACCCGACGTAACTGCCCTGGCTTCTGTTGGAGCAACAGTAGGGTCTAGTATAATGCTAGATTCGTACTCAGGCTCTTCCGTTGGTGGGGGTATTATGATTGCGGTTCCTAATACTACTCCTGTAGATGAAGTTGTAACTTTCACCGGTGCAGGAGTGGTCTGGAAGCGTAAGTTCTTTGATGGCACTGCTACGGTATACGATGCAGGTTATACTGGTACGGGGGATATTGCCCCATTCATTAACAAGGTAAACTCTGCCGGTTACGATTGTCTTGTACCTACATCAGGGACTATTAGTACACCTATCTTACTGGATGTAGCTAAGGGGGCTTTAGTAGGAGCCAATAAGTGTACCCTTACGGAAATGGAAGGTGTAACAGGAGAGTATTATTTAACCGTAATCAATTCTAATACAGATTACACAGCCCGTGATGCCATTAATGCTACTGCCCTATTAACAGGTATTTCCTTTGTAGGTAAAGGTACTCGAAAGATGTGCTTGGGCAGTAGTACTGGAGGGGAGATAGCAGAATTACGTATATCTAACTGCGGGTTTATATCTACCGCAGGTATTGAGTTTAAAGATAATGCATACCGTATCCTGTTTGATAAGTGCACCATTTCTCGCAGTTTTACTAACTCTGTAATCTTTAATTCCCCGGTTAATGCTGGTGAGGTTATAAAATTCAACCACTGCTGGATGGTTGATAATGGGGGTCCATTTACATTTGAGAATGGGCAGTTCATCTTTGATTCATGCTCATTACCAGCAGGTAAAAAGGCAGGCTACTTCGATCCAGTAGTGGCATTAAGTGATAATGCTACCTTAGTATTTGCTAACGGTAATATTGAGTATCAACCCGGGCAGAGTTTTGTAGGCTTTACTGTGAGTGGAAGCTCACGCCTCAGTATTAAAGATTCTACTATTCTGCTTCCAGAAGGCTACAGTACAGTGCCTATTGTTAGTAATGGTGATGGGGTAGTTAGTTTAAATAACTGCTCATTGCCCCTCTACGGTAACACAACGATTGCTACTGGATTTGCTACAAGACAGTTGATAGGCGGTGCAAGTAAAAAAGTAATGTCCAGAGGGTGCTTCCCTCGTGCAGGATTTATTACAACTAACTGGAATCTAGGGAGCATTGTAAGCCCATATATTAATAGTATTAGCAATGGCTCAGGACAGTTTGGAAATACATCTAACTGGACACTCTCGCAAACTGGAACAGGTGCTGTCACTGCTACTACAGCAAATGATGTTCCTAACGATTTAATGTTTACAACTTCTTTTGTTTTATCTGTACCATCAGCAGATGCAGCAGCTAACTTCACTCAAACAATCATTGATTGTGAACCGGGTCGTTATTTTCAGTTTGGTTTTTGGGCTAAAAATACAACAACCACCTTGGCGTCAATTAGATTCCTGGACCAGCAAGGAAATGCTGTTGCGGATTCCATAGGATATATCATTCCAGTAGTAAACACGTTCAACTTTTACGCTTTGGTGGATTGCGTTCCTCCAGGAGCTTACAAAGCTGAAATTAATTTTAATGTTTCTTCAGTTGTTGGAGGCGTCGTAATACACAATGCAGTTTATGGATTGATTTAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID: 65
Method: ESMFold
Resolution: 0,8089
Evidence: 0,8577
Literature
No literature entries available.