Protein

Genbank accession
AGF88392.1 [GenBank]
Protein name
tailspike protein
RBP type
TSP

evidence: DepoScope

probability: 1,0000

TSP

evidence: RBPdetect

probability: 0,9129

Protein sequence
MIRTTNSCCGNEAGLVEKFIGTAYDVVKTVYENLGELQFIYDFLNKYGVLITVSSVQELQTLPTTAKYTRVYSTSTAGERIYTDYLYVEGDRTGVLPSDPTATGSWVVVGTSTSGGSGSSGGYIPFVYNNGSALGGETTITVPEGTVGVPFIIVGGYTNYVGRGFTYSVADLEVTLAQPLETGDEVVLLLTGVPAVPDNPNVDNWTVINWLYNQGAAVGGEQVIQIPYTFQDIPAVYKNGLRFYKGLTTNSYTIDADNQRIILTEPLATNDRLIVQIGGEVQVVIVSDHTIEEVARTLNIKDSEVILSTDTTQTLNGKKVVYSVTEQFSYGLPTLPTNVYIVSVANGKLVYAPGNVEVDLLPAPYPSLTALAQYKALLASKQGTSNIGHMSPLAASIERSLQLKLADVLNIKDFGAIGDGELHPLSEKFSTLSAAQMVYPFVTDLSQSQDYAGTQAAIIAAKIGYAVFAPSGEYEINKTVLADYALCMYGEGAQGLRTVDSTMHSPSPVRGTVFNSHVSTGRMLSVDSGSAYSFGLTLRDFAIWGVDGQCDVGLYLNGIGWMGIVEGINIQFFPNQALEIGYIQDTYFTNCSFLQSGNVNNPAVTMIQDSNYVYFTGCHFELTPYMIKFGNPWFVFFNHCHFEVARPVSDGSTAADRFYYTKAPIDLGTSYRVFFNNNVFIPTDVEYLASKLSVPRKDVPYFITGSGSVMSFTGDTFMAPEGTIKSAYLSGTDIDFNGVKFIRCDPSNFGLYVQNGKVNGCSYGIDVTADAVNLNGIKVVTGSISNTKFGFYESDSHGKRTAGGLIIGGAHCVGNELPVDSRINIYVDSGATVNGFDGGKPFFVDITDAGDIDLTKLHPAANLRITGAAVSIYHVYGSPYGRDLMIASNTTDGIVKFAMNNLIPKGSVDYAIPQYHHTLWRCIDDGTATMYQIS
Physico‐chemical
properties
protein length:934 AA
molecular weight: 100890,41240 Da
isoelectric point:4,76677
aromaticity:0,11135
hydropathy:0,03683

Domains

Domains [InterPro]
IPR012334
369–681
IPR012334
IPR011050
450–781
IPR011050
AGF88392.1
1 934
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage FSL SP-076
[NCBI] 		1173762 Uroviricota > Caudoviricetes > Schitoviridae > Ithacavirus > Ithacavirus SP076
Host Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin
[NCBI] 		98360 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Salmonella

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGF88392.1_KC139520.1_55517_58321 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KC139520.1 [NCBI]
CDS location
range 55517 -> 58321
strand -
CDS
ATGATTCGAACTACGAATTCATGCTGCGGTAATGAAGCTGGTCTGGTGGAGAAATTCATTGGTACTGCTTATGACGTAGTAAAGACTGTTTATGAAAATCTCGGTGAACTTCAGTTCATCTATGATTTCTTAAATAAGTATGGAGTACTTATTACCGTTAGTTCTGTACAGGAGTTACAGACACTACCTACAACTGCTAAATACACAAGAGTCTATTCCACCTCTACTGCTGGGGAACGAATTTATACAGATTATTTGTATGTAGAAGGTGACCGTACTGGAGTATTACCAAGTGACCCTACTGCTACTGGTAGTTGGGTAGTTGTTGGTACTTCTACTTCAGGGGGTAGTGGTTCCTCTGGTGGGTACATTCCATTTGTATATAACAATGGTTCAGCCCTTGGGGGAGAAACTACTATTACAGTTCCTGAAGGTACTGTAGGTGTTCCATTTATTATTGTAGGTGGATATACCAACTATGTAGGAAGAGGGTTTACCTATTCTGTAGCTGATTTGGAAGTAACTTTAGCTCAACCATTGGAAACTGGTGATGAAGTAGTATTACTTCTGACTGGTGTCCCTGCTGTACCTGATAACCCTAATGTGGATAATTGGACTGTTATTAACTGGCTATATAACCAAGGTGCAGCAGTAGGTGGTGAGCAGGTAATTCAGATTCCTTACACCTTCCAAGACATTCCTGCTGTATATAAGAATGGTTTGAGATTCTATAAAGGACTCACTACTAATTCGTATACTATTGATGCTGATAACCAACGAATCATTCTTACTGAACCATTAGCTACCAATGACCGTTTGATTGTTCAGATTGGTGGTGAAGTTCAGGTAGTAATTGTATCTGACCATACTATCGAAGAAGTAGCACGTACCCTTAATATTAAAGATTCTGAGGTAATTTTAAGTACAGATACTACTCAGACTCTTAATGGTAAAAAAGTTGTTTATTCTGTAACTGAACAGTTTTCTTATGGATTACCAACTTTACCTACCAATGTATATATAGTTAGTGTTGCAAATGGTAAGCTTGTTTATGCACCAGGCAATGTTGAAGTAGATTTATTACCTGCACCTTATCCGTCACTCACTGCACTTGCTCAGTATAAGGCGTTACTTGCGTCTAAACAGGGTACATCTAATATTGGGCATATGTCTCCATTAGCTGCATCAATTGAGCGCAGTCTTCAACTCAAATTGGCAGATGTTCTTAATATTAAGGACTTTGGTGCAATTGGAGATGGAGAGTTACACCCATTAAGTGAGAAGTTCAGTACTCTGTCTGCTGCACAAATGGTTTATCCATTTGTAACTGACTTATCTCAGAGTCAGGATTATGCAGGTACTCAGGCAGCAATTATCGCAGCTAAAATAGGTTATGCTGTATTTGCTCCTTCCGGTGAATATGAAATTAATAAAACTGTATTAGCAGATTATGCTTTATGCATGTATGGCGAAGGTGCTCAAGGCTTGAGGACTGTAGACTCTACAATGCATTCTCCCTCTCCTGTACGTGGTACTGTATTCAATTCCCATGTATCAACAGGTCGAATGCTATCTGTAGATTCTGGTTCAGCATACAGTTTTGGTCTTACCTTGCGTGACTTTGCTATTTGGGGAGTTGACGGTCAATGTGACGTTGGTTTGTACCTTAATGGTATTGGTTGGATGGGTATTGTTGAAGGTATCAATATACAGTTCTTCCCTAACCAAGCATTAGAAATCGGGTATATTCAAGATACATATTTTACTAATTGTTCATTCTTACAAAGCGGTAATGTTAATAATCCTGCTGTAACTATGATTCAAGATAGTAATTATGTTTATTTCACAGGTTGTCATTTTGAACTTACTCCTTACATGATTAAATTTGGAAATCCGTGGTTTGTATTTTTTAACCACTGTCATTTTGAGGTTGCTAGACCTGTCAGTGATGGTTCTACTGCTGCTGACCGATTCTATTATACGAAGGCTCCTATTGACCTTGGTACTAGCTATAGAGTTTTTTTCAATAATAATGTATTTATTCCTACTGATGTTGAGTATCTTGCATCTAAACTATCTGTGCCTCGCAAGGATGTTCCTTATTTCATTACTGGCTCTGGTAGTGTAATGAGTTTTACTGGAGATACATTTATGGCTCCAGAAGGCACAATTAAATCAGCATATTTATCAGGTACAGATATTGATTTTAATGGTGTTAAATTTATTCGCTGTGACCCATCTAATTTTGGGCTATATGTTCAAAATGGTAAGGTAAATGGATGTTCTTATGGTATCGATGTTACTGCTGATGCAGTAAACCTAAATGGTATTAAGGTAGTAACTGGGTCGATATCTAATACCAAATTTGGATTCTATGAGTCTGATTCTCACGGAAAGCGTACTGCTGGAGGACTTATTATAGGTGGTGCACATTGTGTCGGTAATGAGTTACCTGTTGATTCTCGTATTAATATTTACGTGGATTCTGGTGCTACAGTTAACGGGTTTGATGGTGGTAAACCATTCTTTGTTGATATTACCGATGCTGGAGATATTGACTTAACTAAGCTTCACCCTGCTGCAAATCTTCGCATTACTGGTGCTGCTGTAAGTATTTATCACGTGTATGGTTCACCTTATGGTAGGGACTTAATGATTGCATCCAATACAACCGATGGGATTGTTAAGTTTGCTATGAATAATTTAATACCAAAAGGGTCTGTGGACTATGCAATACCTCAGTATCACCATACACTGTGGCGATGCATTGACGATGGTACGGCAACTATGTACCAAATTAGTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.