Protein

Genbank accession
XCZ60127.1 [GenBank]
Protein name
lateral tail fiber protein [Escherichia phage VB-EcoM-WM]
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,87
Protein sequence
MADIKVVRIESLPATTAVTEDDYLVVQQPDLTRRVKIGDVVHVDGTVSHVISFKEGGKLNGPMDFAYFEEEDLYLRWKGEFPHTVPALSSPYSDGGITDAAWMVYTDPSLREELESTIGASMIMTAEGQSVQDVMDVTVQTANDAKALAQRVDFGTVHTVGDVIHLDNFVGPAVIEEGRTTNYPSVAAGEKFLNGVVSRRDTTTVDGIFRGATSGAMYTIAVTNGVATTKRIALRDEFKRLEANNQTRTIIRAGDDLNTAGYLQLDATGRWGMWNQQTASWQPLAIEQGGTGARDAAGIRTNIGAFYKQRAALEPNFNINNLTGNQDGIYYQPMTAYATEANGYPAGSGAGHLIVWQNNANGGTGCRQEYYPFSNVDVWYLRTYQANTNQWTAWQPMVRPRNDDTFRAHIGLGSRNSPTFGHLYLSQSSADVKSASGIVNGDKYNADGVLEHGYRIYSEVRNDNKAWLTIHLHKGAKGSETHRYLGFREDGVLDCPKYMQVGDLNGQMANWGLGEWIRSSGAERGFWGSKKAAKMVIWDGGMDEQGEGTLEWGVYNNRKAKWEPLPIACGGTSARTVGDAQAQFRIPLAAGTRPYVNLPRTAAMQDGKYYPIIVRTDPNFAVTIGTDLTIVTRSSSGGDPMNCATLQCHYRTGGWTDRGDSFQGVINFYQNEKAILGCVSPTRGKQEYVAFYVEARAFPVTVYAGATVIEVSTREVDWQVGNVEGNQDGVKFCAPLASADLSLAIKGDDVTNTRPLVEFKGTSGFYTGGGTMWHYLGTPERYAVMSKMNMPKVELWADGIDYICPGSQTTRKALFSNAGFQAASEGTEDLINNTFTSKCGNGARLQGQAEFRSTPEAGQVIVRDVVGTAHRFYNFNKDGTFSAPGGFVCHTGADWNNQFGPNNPSKIMAGNVNGPEGSMVVGGLSVAFSGNYAFQMAGRLDQLYTRSIEGGNHRAWNKVIQHRGQGLGTEDLNDYDGSREGFYHQGSNADALVIARHYPAPYAGTLLVYKNTANRPQGCVQEYITYFGDRYTRAGNYVGDVFTWEEWRHDAGKGIQLRPNYTFGENSTQLEIHVGANGLPSNADNLPTNNAILHYWGNGSAGTRPNVLEFKVLDESQSAYVWHCGTLPDKSRYLSVNGAVNCTSVNQSSDRDLKDNIAVIPDALEAIRKMRGYTYTLKENGMPYAGVIAQEVLEALPEAVSSFVQRKEIPNPDQDGTPLITEERFYSVDYAAVTGLLVQVCREQDDKITALEEQVKKLTEVVTGLQEKLK
Physico‐chemical
properties
protein length:1270 AA
molecular weight: 139235,47540 Da
isoelectric point:5,50198
aromaticity:0,09921
hydropathy:-0,42567

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage VB-EcoM-WM
[NCBI]
3230418 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XCZ60127.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ014731.1 [NCBI]
CDS location
range 4031 -> 7843
strand +
CDS
ATGGCTGATATTAAAGTTGTCAGAATTGAATCTCTTCCTGCCACTACCGCAGTGACAGAGGATGATTACCTGGTTGTTCAACAACCAGACCTGACCCGTCGTGTAAAAATTGGCGATGTTGTCCATGTTGATGGGACTGTTTCTCATGTAATCTCCTTTAAGGAAGGTGGTAAGTTAAACGGCCCAATGGATTTTGCCTACTTCGAAGAGGAAGACCTCTACCTGCGTTGGAAAGGCGAATTTCCGCACACTGTTCCTGCACTATCTTCACCGTACTCCGATGGCGGGATTACTGACGCTGCATGGATGGTATATACTGACCCGTCCTTAAGGGAGGAGCTGGAATCTACCATTGGCGCATCCATGATCATGACAGCCGAAGGGCAGTCTGTCCAGGATGTAATGGATGTTACTGTTCAGACAGCTAACGATGCCAAAGCACTTGCACAGCGTGTAGATTTTGGTACAGTGCACACTGTAGGCGATGTTATTCACCTTGATAACTTTGTTGGCCCTGCAGTTATTGAAGAGGGAAGAACTACCAACTACCCTTCTGTAGCAGCTGGTGAAAAATTTCTGAACGGTGTGGTATCTCGTCGTGATACTACAACTGTTGATGGTATTTTCCGTGGCGCTACCTCCGGAGCAATGTATACCATTGCAGTAACCAACGGTGTAGCAACAACAAAAAGAATAGCACTTCGTGATGAATTTAAACGCCTGGAGGCAAACAACCAAACAAGAACAATTATCCGTGCTGGAGATGATTTAAACACGGCAGGGTACTTGCAGCTTGATGCAACAGGCCGTTGGGGTATGTGGAACCAACAAACAGCTTCTTGGCAGCCTCTTGCTATAGAGCAGGGCGGCACAGGGGCTAGAGATGCCGCTGGAATCCGTACCAATATCGGTGCTTTCTATAAGCAACGTGCAGCCCTTGAGCCAAATTTCAATATCAATAACTTGACTGGTAATCAGGATGGTATATACTACCAGCCGATGACTGCTTATGCAACTGAGGCAAATGGTTATCCTGCAGGTTCTGGTGCTGGTCACTTGATTGTTTGGCAGAACAATGCTAACGGTGGTACAGGTTGTCGTCAGGAATACTATCCATTCTCCAACGTAGATGTTTGGTATTTGAGAACCTATCAGGCCAACACAAATCAGTGGACTGCATGGCAGCCGATGGTCAGACCTCGTAACGATGATACCTTTAGAGCGCACATCGGTCTCGGGTCTAGAAACTCCCCTACCTTCGGGCACCTTTACCTGTCTCAAAGCTCTGCGGATGTTAAGTCAGCATCAGGTATTGTTAACGGAGACAAATACAACGCTGACGGTGTCCTTGAGCATGGGTATAGGATCTACTCTGAGGTAAGGAACGACAATAAGGCTTGGTTGACAATCCACCTGCACAAAGGTGCAAAAGGATCTGAAACTCATAGATATTTAGGCTTCCGTGAGGATGGGGTCTTAGATTGTCCTAAATATATGCAGGTTGGTGATCTGAACGGTCAGATGGCAAACTGGGGACTTGGAGAATGGATCCGCAGTTCAGGAGCAGAAAGAGGTTTCTGGGGATCTAAGAAAGCCGCCAAGATGGTCATCTGGGATGGCGGTATGGACGAGCAAGGTGAAGGAACGCTTGAGTGGGGTGTTTATAACAACCGGAAAGCCAAATGGGAACCACTACCGATAGCTTGTGGTGGTACCAGTGCCAGGACTGTAGGGGATGCTCAAGCACAATTCAGAATCCCTCTGGCAGCAGGTACTAGACCATATGTAAACCTGCCTAGAACTGCAGCTATGCAGGACGGTAAGTATTATCCTATTATCGTCAGAACTGACCCCAACTTTGCAGTAACTATCGGGACAGATTTAACCATTGTCACCAGATCTTCTTCTGGCGGCGACCCAATGAACTGTGCTACACTACAGTGTCACTACAGAACTGGTGGCTGGACAGACAGAGGTGATTCTTTCCAAGGGGTTATTAATTTCTACCAAAACGAGAAAGCAATCCTCGGATGTGTATCTCCAACCAGAGGTAAGCAGGAGTATGTTGCATTCTATGTAGAGGCACGTGCATTCCCTGTTACAGTATATGCTGGCGCTACTGTAATAGAAGTGTCAACCAGGGAGGTTGATTGGCAGGTAGGCAACGTGGAAGGTAACCAAGATGGTGTCAAGTTCTGTGCTCCTCTGGCATCTGCAGATTTGAGTCTTGCAATCAAAGGTGATGATGTAACAAACACTAGACCTCTGGTTGAGTTCAAAGGGACATCAGGTTTCTACACTGGTGGTGGAACTATGTGGCACTACCTGGGAACTCCTGAACGCTATGCAGTGATGAGCAAAATGAACATGCCTAAAGTCGAGCTTTGGGCAGACGGTATTGACTACATTTGTCCTGGTAGTCAGACCACTAGAAAAGCACTGTTCTCTAACGCAGGGTTCCAAGCTGCATCGGAAGGAACAGAGGATCTGATCAACAACACCTTTACCTCTAAATGTGGTAATGGTGCAAGACTGCAAGGCCAGGCAGAGTTCAGATCTACTCCAGAGGCTGGTCAAGTTATTGTTCGTGATGTTGTAGGCACAGCTCATAGATTCTATAACTTCAACAAAGATGGCACTTTCTCAGCCCCTGGTGGTTTTGTATGTCATACTGGTGCAGACTGGAACAACCAGTTTGGGCCTAACAACCCTTCTAAAATAATGGCAGGCAATGTCAACGGACCTGAAGGATCGATGGTTGTTGGTGGGTTGTCTGTGGCGTTTTCTGGAAACTATGCCTTCCAAATGGCTGGTCGCCTTGATCAGTTATACACCAGATCTATCGAGGGTGGTAACCATAGGGCATGGAACAAAGTTATTCAGCACCGTGGTCAAGGTCTGGGGACAGAAGACCTTAATGACTACGATGGTAGCCGTGAAGGTTTCTATCACCAGGGTTCAAACGCTGACGCACTTGTAATAGCTCGTCACTACCCTGCTCCGTACGCTGGTACGCTGCTTGTTTACAAAAACACAGCCAACAGACCGCAAGGTTGTGTGCAGGAATACATTACCTATTTTGGTGACAGATATACTCGTGCTGGTAACTACGTTGGCGATGTCTTTACTTGGGAAGAATGGAGACACGATGCTGGTAAGGGCATTCAGTTAAGACCTAATTACACTTTCGGTGAAAACAGTACTCAGCTGGAAATTCATGTTGGTGCTAATGGTCTTCCATCCAACGCCGATAACTTACCTACCAACAATGCTATACTCCATTATTGGGGTAACGGCAGTGCAGGGACTCGTCCAAACGTGTTAGAGTTTAAGGTTCTTGACGAGTCTCAATCGGCTTATGTATGGCATTGCGGTACCTTGCCGGATAAATCAAGATATCTTTCTGTAAACGGTGCTGTGAATTGCACATCTGTCAATCAGAGTTCTGACAGAGATCTGAAAGATAACATAGCTGTTATTCCTGATGCGTTAGAAGCTATCCGGAAGATGAGGGGTTATACTTACACTCTTAAAGAGAACGGTATGCCTTATGCAGGTGTTATAGCACAAGAAGTTCTTGAAGCGCTGCCGGAAGCAGTTAGCTCTTTCGTGCAAAGAAAGGAAATCCCAAACCCTGATCAGGATGGAACTCCTTTAATAACAGAGGAAAGATTCTACAGCGTGGATTACGCAGCTGTAACAGGCTTGCTTGTCCAGGTTTGCAGGGAACAGGATGATAAAATAACCGCCCTTGAGGAGCAGGTTAAAAAATTGACAGAGGTTGTTACTGGGTTGCAAGAGAAACTGAAGTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.