Protein

Genbank accession
XJW10029.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein [Salmonella phage SLAM_phiST56]
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
Protein sequence
MADYKLSELNSIGTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKTVFDPTGSSEINIGDVLKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNTFSGTQNIQGDANLLRLRNQNANNAQYIEGVNLDGSARWWVGIGSNGSDEVKLYNNKYNSVLTVASNISVNKSLAITGQVQPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLAANNTFSGLNTFSTSVSISSNAAAIMLKNKAVDESLFIQAKDVENNNLWYIGKGGANDNITFYDYKGDTSIVLNSSGAAFNKTVKITGQVQPSDWDNIDSRYIPAATLSTIARTNAQNTFKSGQTIVADGQALLLRSATDSPSLYVRGQNQSGTNKWYVGFSTSNVLGLSNEASGTTLTLDSAGINSNKNLNITGQVKPSDFSNLDARYFTQSASDSRYLRIRSTNFNNGNDDKWAKIATVVMPPSASTAVIEVFGGSGYNYGFPYQASKTEIVLRAGGDSPKGLNIVAWKNSENLIITDIGYVNTSGDTYDIYCRVGPFQNDTTSRVQSSSNASVQLFEAPQTFDDAPQGIVKGTIARYYTSMQKPTPSDIGAYTKAETDQKIAQAVSGSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKTTNTTGAHTHQFGGYINSFYGDSSHTSFQPGGGAWTQAAGDHSHSVGIGAHSHTVSGNTGSTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:812 AA
molecular weight: 87276,25260 Da
isoelectric point:7,70256
aromaticity:0,09236
hydropathy:-0,37155

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage SLAM_phiST56
[NCBI] 		3373400 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XJW10029.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP948675.1 [NCBI]
CDS location
range 37288 -> 39726
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATCGGTACAATCCGTTCAGATGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGATTTCTTAGCATCTTTTAAACTTGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGCACTATGACAGGTGACTTAGGAATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGACAGTATTTGACCCAACAGGCTCTTCTGAGATTAATATTGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATTAATGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCTGCAACTGTCTATCATACTCTTAATAAGCCAAGTCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGACGCAAGATATGCAAGACTTGCTGTTACAAACACATTCTCTGGGACTCAGAACATTCAAGGTGATGCTAACTTACTTCGCCTTAGAAACCAAAATGCAAATAATGCACAATATATTGAAGGTGTAAACCTAGATGGTTCGGCTAGATGGTGGGTTGGTATTGGTAGTAATGGCTCTGACGAAGTAAAGCTGTACAATAACAAATACAACTCAGTCTTGACTGTTGCAAGTAATATCTCTGTTAATAAGTCTTTAGCAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCAGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACAGTTGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGCTAATAACACTTTTAGTGGTTTAAATACATTCAGTACTAGTGTTAGTATTAGCTCTAATGCTGCTGCTATCATGCTAAAAAATAAAGCTGTTGATGAGTCTTTGTTCATCCAAGCAAAAGATGTTGAAAACAATAACCTGTGGTATATTGGTAAAGGTGGTGCAAATGACAATATCACATTTTATGATTACAAGGGCGACACTTCTATTGTATTAAACTCGTCTGGTGCTGCATTCAACAAGACTGTAAAAATCACTGGTCAAGTCCAACCTTCAGATTGGGATAACATTGACTCTAGATATATTCCGGCAGCAACATTAAGTACGATTGCAAGAACTAATGCACAAAATACTTTTAAATCTGGGCAGACAATTGTAGCAGATGGTCAAGCACTATTGTTAAGAAGTGCAACTGATAGTCCCTCTCTCTATGTTAGAGGCCAAAACCAATCTGGAACTAATAAATGGTATGTTGGATTTAGTACTTCAAATGTTCTTGGATTATCAAATGAAGCCTCTGGCACGACATTGACATTGGATTCAGCAGGTATTAATTCTAATAAGAATTTAAATATCACTGGTCAAGTTAAACCTTCAGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAAAGTGCTAGTGATAGTAGATACCTGAGAATCAGAAGTACTAACTTCAATAATGGAAACGATGACAAGTGGGCTAAAATTGCTACTGTTGTAATGCCGCCTTCCGCATCTACTGCGGTGATTGAAGTGTTTGGTGGGTCAGGTTATAACTATGGTTTCCCTTACCAAGCTAGTAAAACGGAAATTGTTCTCAGAGCAGGGGGTGATAGCCCAAAAGGTTTAAATATTGTTGCTTGGAAAAACTCGGAGAATCTCATTATTACGGATATCGGTTATGTTAATACATCTGGTGATACTTATGACATTTACTGTAGAGTTGGTCCATTCCAAAATGACACAACATCAAGAGTTCAATCTTCTAGCAATGCAAGTGTGCAATTGTTTGAAGCCCCACAAACATTTGATGATGCTCCACAAGGTATTGTAAAGGGTACAATTGCAAGATACTACACAAGTATGCAAAAACCAACCCCTTCAGATATCGGTGCATACACTAAAGCTGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGGTTCAACAGACCTTAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACCGCACTTCCTGGATTAACTTGGACGTACCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCAGGATTGCAGCAGCGAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGAGGTTCAGATTCTGTTACATTAGCAGTTGGAAACTTGCCTTCACACACTCATAGTTTCTCTGCGACAACCTCTAGCTTTGACTACGGTACTAAAACCACTAACACTACTGGTGCTCATACTCACCAGTTCGGCGGTTATATCAACTCGTTCTATGGAGACTCCAGTCACACCTCATTTCAGCCTGGAGGTGGTGCGTGGACACAGGCCGCTGGCGACCATTCCCACTCTGTAGGTATTGGTGCTCACAGCCACACAGTTAGTGGTAACACTGGTAGTACAGGCTCTGGTTCGGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTACAAGTTAATGGCTTGGGTGAGAACTGCTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.