Protein

Genbank accession
ADO99066.1 [GenBank]
Protein name
fiber [Prochlorococcus phage P-SSM7]
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,89
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,78
Protein sequence
MALTRLKNIITSRTGRIIYVNPDDFDASDAIDNRGNSALRPFKTIQRAFLEVAKFSYRVGLSNDEFDAFSIMLYPSEYVIDNRPGEVLYTNVPPIDSNSNLDITSSSNVLYKYNSIEGGVIVPRGCSLVGTDLRRTKIIPKYVPYPTTYAAKGINTEADIPSRSALFKVTGGTYFWQFSFFDGAEEGVYYKPDSTDTLAPKFSHHRLTCFEFADGLNPLSTLIANGTVPNSDYTAVANIQERTDLEIYYQKISKAFAAVPDTSGDPDTDQIQARVEENRIVGPISDEYRVLQITRNGQTATAVTVDEFDNPRDHGFSVGVNINISGVTGSTGPSSEADAGVYNGSFTVTSASGNVFTYQMQSEPTGNAVGSNITVKTEIDTVDSASPYAFNLSLRSVWGMNGMHADGAKATGFKSMVVAQFTGLSLQKDDRAFVRYNASTGNYDVATAGDGAHLDGFAEYRKGWGHEHIKCSNDAFIQAVSVFAVGYYAHFSAIGGADMSITNSNSNFGNTALRSAGFKAKSFSKDKAATITHIIPPKALSVISTTATGTAAATTITLADDGSVNGLVQGTAVSGTGIAGGATIVSFNTNTRVVTLSAANTGTVSGNVIFGQETSVNWVNLDIQRTKVINQALASGGGTPGTRLYLYGYTVEASPPTSKVQGFTVGARQDGTGGSAVPDKLNCLLVASGASEATVQTATISPYGPSVSGKSPGTVGSPLQYDSGTYTIGGVAGTVGGWYITVSDTDNNIYTAINTNTQYNNVSFTPTTFIKRISDGRDLQDRTYRVRFVIDKDKANPLPRDPLSGYVMQPLNTDTTSYSLSKCYYVYDIEVVQPFVRGVDDGIYYITLLCGSIAPTTSNFNDRKFSQNVNEVYPTFDRDNPVADPDAAVSVADNEVIGLVNATDGATPTPAKDPKLSVTKEGIQFLLADNGWTQPGTTPGWDAVNKELSDVELTARAGDEEVRKINIRENNDGSVAPIPVEFRRHSILRSGNHTFEYLGFGPGNYSTAFPQTQVETLDANQIKFSQSIKEEAGVAFYSGLNSNGDLFIGNQVINPVTGQITNEDIAQLNVIGEENTTIETFSEIVLTDKLTVIGGASNQLESIFAGPVTFQGQVSSTDNLIAKKLTYNNQDGTVIKQTLLAPEDANGNPDFNNVIGYDTPGDGDLVYNINWTPGKSLGWIYYSATWHQFGLTDTGDINIATFSNEQHLGIGKVATTDYRVDVLGSVKVDGDLVVTGQGGVSAANYNTREYNGDGTQLTFAITTYSGSIKHTANSVLVFLNGVAQVGGTDYTVDGTGANVVFAAGSAPLASDDVHIVEMPI
Physico‐chemical
properties
protein length:1320 AA
molecular weight: 141016,26420 Da
isoelectric point:4,73284
aromaticity:0,09318
hydropathy:-0,21780

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Prochlorococcus phage P-SSM7
[NCBI]
445688 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADO99066.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071103.1 [NCBI]
CDS location
range 26138 -> 30100
strand +
CDS
ATGGCACTCACCAGGTTAAAGAATATTATTACGTCCAGAACTGGACGTATCATATATGTCAACCCAGATGACTTCGATGCTTCTGATGCTATTGACAATAGAGGAAACTCAGCACTGCGACCTTTTAAAACTATTCAAAGAGCGTTTCTAGAAGTTGCTAAATTTTCATATAGAGTTGGTTTAAGTAATGACGAGTTTGATGCTTTCAGTATCATGCTCTATCCATCTGAATATGTTATTGATAATCGTCCTGGTGAGGTTCTTTATACTAATGTTCCCCCTATTGATTCAAACTCAAACTTAGACATCACATCATCTAGTAATGTACTATACAAATACAACTCCATTGAAGGTGGTGTCATTGTACCTAGAGGTTGTTCTCTTGTTGGTACTGACCTTAGAAGAACTAAAATAATTCCAAAGTATGTACCTTATCCAACAACGTATGCTGCGAAAGGTATTAACACTGAAGCAGACATTCCTTCTCGTTCAGCATTATTTAAAGTAACTGGTGGTACTTACTTCTGGCAATTCTCATTCTTTGATGGTGCAGAGGAAGGTGTGTACTATAAACCTGATAGTACGGATACTTTAGCACCTAAGTTCTCACATCATAGACTTACATGTTTTGAGTTTGCTGATGGTTTAAATCCATTATCAACTCTTATTGCAAATGGTACAGTTCCTAACTCAGATTATACTGCTGTTGCAAATATTCAAGAGAGAACTGATCTAGAAATTTATTATCAAAAAATATCAAAAGCATTTGCTGCTGTTCCTGATACATCTGGTGATCCTGATACTGACCAGATTCAGGCAAGAGTAGAAGAAAATCGTATTGTTGGTCCTATTTCTGATGAATATAGAGTCCTACAGATTACAAGAAACGGACAGACTGCTACTGCTGTTACTGTTGATGAATTTGATAACCCAAGAGATCATGGATTCTCTGTTGGTGTTAACATTAACATTAGTGGTGTTACTGGATCAACTGGTCCATCATCCGAAGCAGACGCAGGAGTTTATAACGGATCTTTCACGGTCACATCTGCATCTGGTAACGTCTTTACTTACCAAATGCAATCAGAACCAACAGGTAATGCTGTAGGTTCAAACATAACTGTTAAGACAGAAATTGATACAGTCGACTCTGCATCACCTTATGCTTTCAACCTATCACTAAGATCAGTGTGGGGTATGAACGGTATGCACGCTGACGGTGCAAAGGCAACTGGTTTCAAATCAATGGTTGTGGCACAGTTTACTGGATTGTCACTACAGAAGGATGACAGAGCATTTGTAAGATATAACGCATCAACTGGAAACTATGATGTAGCAACTGCTGGAGATGGTGCCCACTTAGATGGTTTTGCTGAATACCGTAAAGGATGGGGTCATGAGCATATTAAATGTAGTAATGACGCATTTATTCAGGCGGTCTCGGTGTTCGCTGTTGGATACTATGCTCACTTCTCTGCTATTGGTGGTGCTGACATGTCAATTACCAACAGTAACAGTAACTTTGGTAACACTGCATTAAGGTCTGCTGGATTTAAAGCAAAATCATTCTCAAAAGATAAAGCAGCAACGATTACTCACATCATACCACCTAAAGCGTTAAGTGTTATTTCAACAACTGCTACTGGTACTGCTGCTGCTACAACAATTACACTTGCTGATGATGGTTCGGTTAATGGACTTGTTCAGGGAACTGCAGTTAGTGGTACTGGTATTGCTGGTGGTGCAACAATCGTTTCTTTTAACACAAATACTAGAGTAGTTACTCTTTCAGCAGCAAATACTGGAACTGTTAGTGGTAATGTAATATTTGGTCAAGAAACTTCCGTCAACTGGGTAAACCTTGATATTCAAAGAACTAAAGTAATTAATCAGGCACTCGCAAGTGGTGGTGGAACACCTGGAACTAGACTTTACTTATATGGTTATACTGTTGAAGCATCTCCACCAACAAGTAAAGTACAAGGTTTCACAGTTGGTGCAAGACAAGATGGTACAGGTGGTAGTGCTGTACCTGATAAATTGAATTGTCTGTTAGTTGCTAGTGGTGCTAGTGAAGCAACTGTTCAAACAGCAACAATCTCTCCTTATGGACCTTCTGTCTCTGGTAAATCACCAGGCACTGTAGGTTCACCATTACAATATGATTCTGGTACATATACTATCGGTGGAGTAGCAGGTACTGTTGGTGGTTGGTATATAACTGTGTCGGATACTGATAATAATATCTACACAGCAATCAACACAAATACACAATATAATAATGTAAGTTTTACTCCTACAACTTTCATTAAAAGAATTTCTGATGGTAGGGATCTTCAAGATAGAACATATCGTGTTAGATTTGTAATCGATAAGGATAAGGCAAATCCATTACCAAGAGATCCTCTATCTGGTTATGTAATGCAACCTTTGAATACTGATACAACATCATATTCATTATCTAAGTGTTACTATGTGTATGACATTGAAGTAGTACAACCATTTGTTCGAGGTGTTGATGATGGTATCTATTATATAACTCTCCTATGTGGATCTATTGCACCCACAACTTCTAACTTTAATGATAGGAAGTTTAGTCAAAACGTCAACGAAGTCTATCCTACATTTGATAGAGACAACCCTGTTGCTGACCCTGATGCTGCTGTATCTGTTGCTGATAATGAAGTTATCGGTCTTGTAAATGCAACTGATGGTGCAACACCAACTCCTGCTAAAGATCCTAAGTTATCTGTTACTAAAGAAGGAATACAATTCTTACTTGCTGATAATGGATGGACTCAACCAGGTACAACTCCTGGATGGGATGCAGTTAATAAAGAACTTTCTGATGTTGAATTAACTGCTCGTGCTGGTGATGAAGAAGTTAGAAAAATTAATATTAGAGAAAATAATGATGGTTCTGTAGCACCTATTCCTGTTGAGTTTAGACGACACTCTATTCTAAGATCAGGTAACCATACGTTTGAGTATCTTGGTTTTGGTCCAGGTAACTATTCAACTGCGTTCCCTCAAACACAGGTTGAGACTCTAGATGCTAATCAAATTAAGTTCTCTCAGTCTATTAAGGAAGAAGCGGGTGTTGCTTTCTACTCTGGTCTTAACTCTAATGGTGACCTATTCATTGGTAACCAAGTTATTAACCCAGTTACAGGACAGATCACTAACGAGGATATTGCACAGTTGAATGTTATTGGTGAAGAAAACACAACTATCGAAACATTCTCTGAGATTGTTCTTACTGATAAACTCACAGTTATTGGTGGTGCATCTAACCAGTTAGAATCTATATTCGCTGGTCCTGTTACTTTCCAAGGTCAAGTATCATCTACTGACAATCTTATTGCAAAGAAATTAACTTATAATAATCAAGATGGTACTGTAATTAAACAAACATTACTAGCACCTGAAGATGCAAATGGAAATCCTGACTTTAATAATGTTATAGGATACGATACTCCTGGTGATGGTGACTTAGTTTATAATATTAACTGGACTCCAGGTAAATCACTAGGTTGGATATACTACAGTGCAACGTGGCATCAATTTGGTCTAACTGATACTGGAGATATTAATATTGCTACGTTCAGTAATGAACAGCATCTTGGTATTGGTAAGGTAGCAACTACTGATTATAGGGTTGATGTTCTTGGTAGTGTAAAAGTTGATGGTGACTTAGTTGTTACTGGACAAGGTGGTGTTTCTGCTGCCAACTATAATACTAGAGAATATAATGGTGATGGAACACAATTAACATTTGCAATAACAACATATTCTGGTTCTATTAAACATACAGCAAATTCTGTTCTAGTATTCTTGAATGGTGTTGCTCAGGTTGGTGGAACTGACTATACAGTTGATGGTACTGGTGCAAACGTTGTGTTTGCGGCAGGATCAGCACCACTTGCAAGTGATGATGTTCATATTGTAGAAATGCCTATCTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.