Protein

Genbank accession
ADO98425.1 [GenBank]
Protein name
fiber [Prochlorococcus phage P-RSM4]
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,87
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,82
Protein sequence
MSLTRLKNIITSRTGRIIYVNPDDFDASDAIDNRGNSALRPFKSLQRAFLEVARFSYRVGLSNDEFDAFSIMLYPAEYIVDNRPGDVLYTNVAPIDANSNLDLTSPNNVLYKYNSVEGGIIVPRGCSLVGTDLRRTKIIPKYVPYPTTYAAKGINTEDQVPPRTAIFKVTGGTYFWQFSFFDGAEEGVYFKPDSTETLAPKFSHHRLTCFEFADGLNPLSTLISQGTVPSADYSAVSNILQRTDLEIYYQKVSKAFATIPDTSGDPATDQIQARVEENRIVGPISDEYRVLQITRNGQTATAVTVDEFDNPRDHGFSVGVNINVSGVTGSTGSQSDLDAGVYNGSFTVTSASGNVFTYQMQSVPSGNAVGSNITVKTEIDTVDSASPYAFNLSLRSVWGMNGMHANGAKATGFKSMVVAQFTGLSLQKDDRAFVRYNASTGNYDVATAGDGAHLDGFAEYRKGWGHEHIKCSNDSFIQAVSVFAVGYQGHFTALSGGDMSITNSNSNFGNTALRSAGFKAKAFSKDKAGTITHIIPPKALNTISTTATGTNGSLNITLANDGSVNGLIQGMTVSGTNIATGAIVSSINTNTRVITLSAANTGTVNGNVIFGEETSVNWVNIDIQRTKVINTALSGQGGTPGTRLYLYGYTVEASPPTSRVQGFTVGARQDGTGNSAIADKINCLLVAQGASSATVQSASISPYGPSVSGLAAGVTGSPLQYDSNTYTINGVAGSVGGWYLSVSSTNNSIYEALANNTQYNTVSFTPTTFLKRIPDPRDLQDRTYRVRYVIDKDKTNPLPRDPISGFVLQPLNSDTTTYNLQRAFYIYDIETVQKFERGVSDGIYYLTLLCGSIAPTTSNFDDRKFSQNVNEVYPTFDRDNPVADPPAAVSEASNVTIGLVNSTDGATPTAALDPQRSITKEAIIFLLTDTGWQNPGSTPAYDSVNGRLAGIELTARAGDEETRKINIRQDNSGVVAPINVEFRRHSIMRSGNHTFEYLGFGPGNYSTAFPQTQVETLSPEQIRFSQSIKEEGGVAFYSGLNSNGDLFIGNQVINPVTGQITNEDIAQLNVVGEENTTIETFSELVLTDKLTVIGGASNALESIFAGPVTFQGQSTFTNNITAKKFTYNNQDGTVIKQTLLAPENASGLPDFSNITGYDTPGDGDIVYNINWSPGKSLGWIYYGAAWYEFGITDTGQINVINDSGVTRIGLGVAPTSPYRANINGSVRIDGDLVVTGTGGVTAAKYKKKQYTGDGNQLTFAVSTYTGGIQHTENSLIVFLNGVAQIPGTNYTVDSNGANVVFSGGDAPLSTDIVHILELPI
Physico‐chemical
properties
protein length:1320 AA
molecular weight: 141410,00930 Da
isoelectric point:4,98793
aromaticity:0,09318
hydropathy:-0,22182

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Prochlorococcus phage P-RSM4
[NCBI] 		444862 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADO98425.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071099.1 [NCBI]
CDS location
range 26471 -> 30433
strand +
CDS
ATGTCACTAACTAGACTAAAGAATATTATTACGTCCAGAACTGGACGTATCATATATGTCAACCCTGACGATTTCGATGCATCAGATGCTATTGATAACAGGGGAAACTCTGCTTTGCGTCCGTTTAAAAGTTTGCAAAGAGCATTCTTAGAAGTAGCAAGATTTTCATATAGAGTTGGTTTGAGTAATGACGAGTTTGATGCTTTTAGTATCATGCTCTACCCTGCTGAATATATTGTAGACAATAGACCAGGTGATGTTTTATACACGAACGTTGCACCTATTGATGCAAACTCAAACTTAGACTTAACTTCTCCTAACAATGTTCTATACAAATATAATTCAGTAGAAGGTGGTATTATCGTTCCTAGAGGTTGTTCTTTAGTTGGAACTGACCTTCGTCGTACAAAAATTATTCCAAAATATGTTCCATATCCTACAACGTATGCTGCAAAAGGCATTAACACAGAAGATCAAGTTCCTCCAAGAACAGCAATCTTCAAAGTTACTGGTGGTACTTATTTCTGGCAATTCTCTTTCTTCGACGGTGCTGAAGAGGGTGTATACTTCAAACCTGATTCCACTGAAACATTAGCACCTAAGTTTTCACATCATAGACTGACTTGTTTTGAGTTTGCTGATGGTCTTAATCCATTATCAACTCTTATTTCACAAGGAACAGTTCCCTCTGCTGATTACTCTGCTGTATCTAATATCCTGCAGAGAACTGATTTAGAGATTTATTATCAGAAAGTGTCGAAAGCTTTCGCAACTATCCCTGATACATCTGGAGATCCTGCAACTGACCAGATTCAAGCAAGGGTAGAAGAAAACCGTATTGTAGGTCCTATCTCCGATGAATACCGAGTCCTTCAGATCACAAGAAATGGACAGACAGCTACGGCTGTCACTGTTGACGAGTTTGATAACCCCAGAGACCACGGATTTTCTGTTGGTGTTAACATCAACGTTAGTGGTGTTACAGGATCAACTGGATCGCAATCCGATCTTGATGCAGGAGTTTATAACGGGTCTTTCACCGTCACTTCGGCATCGGGTAACGTCTTCACTTACCAGATGCAATCAGTCCCCTCAGGAAACGCAGTCGGATCAAACATAACTGTTAAGACTGAGATTGATACTGTTGACTCAGCATCACCGTATGCATTTAACCTATCACTTAGATCAGTGTGGGGTATGAATGGTATGCACGCAAACGGTGCAAAAGCAACTGGTTTCAAATCAATGGTTGTGGCACAGTTTACTGGACTGTCACTACAGAAAGACGATAGAGCATTTGTAAGATATAACGCATCAACTGGTAACTATGATGTAGCAACAGCAGGTGATGGTGCACATTTAGATGGTTTCGCTGAATATAGAAAAGGATGGGGTCATGAACACATCAAGTGTAGTAACGACTCATTCATACAGGCAGTTTCCGTGTTCGCTGTGGGATACCAAGGTCACTTCACTGCACTAAGCGGTGGTGACATGTCAATCACCAACTCTAACTCTAACTTTGGTAACACTGCTCTCAGATCAGCAGGATTCAAAGCAAAAGCATTTTCAAAAGATAAAGCGGGTACGATTACACATATCATTCCCCCAAAAGCACTCAATACAATTTCAACAACTGCAACAGGAACTAATGGTTCTTTAAATATTACTCTTGCTAATGATGGATCAGTGAATGGTCTGATTCAAGGTATGACTGTATCTGGAACAAATATTGCTACTGGTGCAATCGTTAGTTCAATTAACACAAATACTAGAGTAATCACACTTTCTGCTGCAAATACGGGAACTGTTAACGGGAACGTAATCTTTGGTGAAGAGACATCTGTTAACTGGGTAAACATTGATATTCAAAGAACTAAAGTAATTAATACTGCACTTTCTGGACAAGGTGGAACACCAGGCACAAGACTATACTTATATGGTTATACTGTTGAAGCGTCTCCTCCAACCAGTAGAGTTCAAGGTTTTACAGTCGGTGCAAGACAAGACGGAACTGGTAATAGTGCTATAGCAGATAAAATTAACTGCTTGTTAGTTGCTCAAGGTGCATCTTCTGCAACTGTACAGTCAGCAAGCATATCACCTTATGGTCCTAGTGTATCTGGTCTTGCAGCTGGTGTAACTGGATCTCCATTACAATATGATAGTAATACATATACTATCAATGGTGTTGCAGGTTCAGTCGGTGGTTGGTATCTAAGTGTATCTTCTACTAATAACAGTATTTACGAAGCGTTAGCAAATAATACACAATACAATACAGTCAGTTTTACTCCTACTACATTCCTCAAGAGAATCCCTGATCCAAGAGACTTACAAGATAGAACATATCGTGTACGTTATGTAATTGATAAGGATAAGACTAATCCACTACCTAGAGATCCTATCTCTGGTTTCGTATTACAACCTCTTAACAGTGATACTACAACATATAACTTACAACGTGCATTTTATATTTACGATATCGAGACTGTTCAAAAGTTTGAAAGAGGTGTTAGTGATGGAATATATTATCTAACATTACTATGCGGTTCTATTGCACCTACTACATCTAACTTTGATGATAGGAAGTTCTCACAGAACGTTAACGAAGTTTATCCTACATTCGACAGAGATAATCCAGTTGCTGATCCTCCTGCTGCAGTCTCTGAAGCTTCCAATGTTACCATAGGTCTTGTTAATTCTACTGATGGTGCAACTCCAACTGCTGCACTTGACCCCCAGAGATCTATTACTAAAGAAGCAATTATATTCTTACTGACTGATACTGGTTGGCAGAATCCAGGTTCAACTCCTGCGTACGATTCAGTTAACGGACGTCTTGCAGGTATTGAACTGACTGCACGGGCAGGAGACGAAGAAACCCGTAAGATTAATATTAGACAAGATAACTCTGGAGTGGTTGCACCAATCAACGTAGAGTTTAGACGACACTCAATCATGCGTTCTGGTAACCATACCTTTGAATATCTTGGTTTTGGTCCAGGTAACTACTCAACTGCGTTCCCTCAAACTCAGGTAGAAACATTATCACCTGAGCAGATCAGATTCTCACAGTCTATTAAAGAAGAAGGAGGAGTTGCATTCTACTCTGGTTTAAACAGTAATGGTGATTTATTCATTGGTAACCAGGTGATTAACCCTGTTACGGGTCAGATCACTAACGAAGATATTGCACAGTTGAATGTTGTTGGTGAAGAGAACACAACCATTGAAACGTTCTCTGAATTAGTATTGACTGATAAACTGACTGTTATTGGTGGTGCATCTAACGCACTTGAATCAATCTTTGCAGGTCCTGTCACATTCCAAGGTCAATCTACATTTACAAACAACATAACCGCTAAGAAATTTACCTATAATAACCAAGATGGTACAGTTATTAAACAAACCTTACTAGCACCAGAAAATGCAAGTGGACTCCCCGATTTTAGTAATATCACAGGATACGATACGCCTGGTGATGGTGATATTGTTTACAACATCAATTGGTCACCTGGTAAGTCTCTTGGTTGGATTTATTACGGAGCTGCGTGGTATGAGTTTGGTATCACGGATACTGGTCAAATCAATGTTATTAATGACTCTGGTGTCACGAGGATTGGTCTTGGTGTTGCTCCTACGTCTCCTTACAGGGCAAACATCAACGGTTCAGTAAGGATTGATGGAGACTTAGTTGTTACTGGAACTGGTGGTGTAACAGCTGCCAAATATAAAAAGAAACAATACACAGGAGACGGTAACCAATTAACTTTCGCTGTTAGCACATACACTGGTGGCATTCAACACACTGAGAACTCTTTAATAGTATTCTTAAATGGTGTTGCACAAATTCCAGGCACTAACTACACTGTTGATTCAAATGGTGCAAACGTGGTGTTCAGTGGTGGAGACGCACCTCTTTCAACAGATATTGTGCATATTCTCGAATTACCTATCTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.