Protein

Genbank accession
WNO23963.1 [GenBank]
Protein name
long-tail fiber proximal subunit [Escherichia phage fDHCT2]
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,61
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYNVLDDGVNVEFFIDENTIQAYDETRGYKKGFAVIHDQRIWVAQRDIAAPAGTFVPGYWTATRTDPKWITVASPTRQLASGEYIAVDSAASFTTFTLPPNPTDGDTIVIKDIGGRVGYNEIKLQSSSAPGGGNQKIVRFGNQFTETLITKPFSYNMIIFANRLWHFWEAANEERGIRVEPNTAQFQSQAGDNVLRRYTSGAVIKFTLPKYANQGDMIKTVDIDGLGSKFHLIVETFDASSSLGKLGQHSMEFRTSGDGFFVYNSTEKLWYVWDGDRQTRLRVIRDDVELLANESVIVFGPNNTTPQTINITLPTGVAQGDVVKIALNYLRKAQTVNIKAAVGDKIASSVQLLQFPKRSEYPPDTEWVLNDVLTFNGNLSYTPVIELSYIEDSTTGGKYWVVAQNVPTVERVDSKDDLTRARLGVIALASQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVATESRRGIARIATTAQVNQNTTFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEIATQVETDAGVDDTTIITPKKLQTRQGTESLSGIVKYVSTTGTTPADSRATVGTNVYNKNTTTLVISPKALDQYKADQNNQGAVYLATQAEVNAGATNPGFSNSVVTPETLGARRSTDTNHGLIEIATQAETDTGTDYTRAVTPKTLNDRNATQTLTGIARIGTQVEFDAGVLDNVISTPLKVKTRFNDTARTSVSAASGLIESGTLWNHYTLDIREASNTQRGTARLATQTEVNTGTDDKTIITPLKLQAKKATENAEGIIQLATQAEVIAGTISNKAFSPKHYKYVVQQEKSWEATSARRGYVKLTTGTATWEGDDTNGSVANLAKFEDDGFAISPLQMNTALTHYLPIKGKAFDSDKLDNLDSSQFVRRDIDQIVEGTLTLRKNIRVDGQLATGGTGEFGGSLAANSTFTLRNTGTATRIIFEKGPQTGTNPVQSMSIRVWGNQYGGGSDTSRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKDGNIAFSINGTVMPINVNASGLMNVNGVATFGRSVTAQGEFITYSANAFRAISGQYGFFIRNDNSNIYFMLTNANDQTGGFNGLRPLAISNTSGQVTIGESLIIAKGATINLGGLTVNSRIRSQGTKPADLYSRKPNADNTGFWSVDVNDSATYNQFPGYFEMVEKVNEVTGLPYLERGAEIKSPGTLTQFGNTLNSLYQDWITYPANANARTTRWTRTWQQSKNAWSGFVQVFDGGNPPQPSDIGALPADNASMSNLTIRDWLRIGNVRIVPDPVTRSVKFEWIDTP
Physico‐chemical
properties
protein length:1299 AA
molecular weight: 141651,99420 Da
isoelectric point:5,78635
aromaticity:0,08391
hydropathy:-0,38722

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage fDHCT2
[NCBI] 		3075956 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WNO23963.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR427838.1 [NCBI]
CDS location
range 42252 -> 46151
strand +
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCTGCATTCCGTGCTACATCCGGACTCGATGCTGCGGGCGAGAAAGTTATCAATGTTGCCAAAGCCGATTACAATGTATTAGATGATGGCGTCAACGTTGAATTCTTTATAGATGAGAACACCATCCAGGCGTACGACGAGACGCGCGGATATAAGAAAGGGTTTGCAGTAATCCATGACCAACGTATCTGGGTTGCTCAACGTGATATCGCTGCACCAGCCGGAACTTTTGTGCCTGGTTATTGGACCGCTACCCGTACTGACCCTAAATGGATTACCGTAGCGTCTCCTACACGCCAGCTGGCTTCCGGTGAATATATTGCGGTGGATTCTGCTGCTAGCTTTACTACATTTACCCTGCCTCCGAACCCTACTGACGGTGATACAATCGTAATCAAGGATATTGGTGGTCGTGTAGGTTATAATGAAATTAAGCTCCAGTCTAGTTCTGCTCCAGGCGGCGGTAATCAGAAAATTGTTCGTTTTGGTAATCAGTTCACTGAGACCTTAATTACGAAGCCTTTTTCTTATAATATGATTATCTTTGCCAACCGTTTATGGCATTTCTGGGAAGCAGCTAATGAAGAACGTGGTATTCGTGTAGAACCGAACACCGCTCAGTTCCAATCACAAGCGGGTGATAACGTTTTGCGCCGTTATACTTCAGGTGCAGTAATTAAGTTTACTCTTCCTAAGTATGCGAACCAAGGCGATATGATTAAAACCGTTGATATTGATGGTTTAGGAAGTAAGTTCCATTTAATCGTTGAAACGTTTGATGCTTCATCTTCATTAGGTAAGCTCGGCCAACATAGCATGGAATTCCGTACTTCCGGTGATGGATTCTTTGTTTATAACTCTACTGAAAAATTATGGTATGTTTGGGACGGTGATCGTCAAACTCGTTTACGCGTAATTCGTGACGATGTTGAACTCTTGGCTAACGAAAGCGTTATTGTTTTTGGCCCTAATAATACAACACCGCAGACGATTAATATCACTTTACCTACAGGCGTAGCCCAGGGTGATGTAGTTAAGATTGCTCTGAACTATCTCCGTAAAGCTCAGACGGTAAATATTAAGGCCGCTGTAGGAGATAAAATAGCTTCTTCGGTTCAATTGCTCCAGTTCCCTAAACGTTCTGAATATCCGCCAGATACTGAATGGGTATTGAATGATGTATTGACCTTCAATGGTAACTTAAGTTATACTCCGGTTATTGAACTGAGTTATATTGAAGACTCCACTACAGGTGGCAAATATTGGGTTGTTGCTCAGAACGTTCCTACTGTAGAACGTGTAGATTCTAAAGATGATTTAACCCGTGCTCGTCTTGGTGTTATTGCTCTGGCGTCTCAGACCCAAGCAAACGTCGACCATGAAAATAATCCTGAAAAAGAACTGGCTATCACCCCACAGACTTTAGCCAATCGTGTAGCTACCGAATCACGTCGTGGTATTGCTCGTATTGCTACTACTGCTCAGGTAAACCAGAACACAACTTTCGCGTTCCAGGACGATTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTAAACGAACGTACTGCAACCGAAACTCGTCGTGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAAGTTGAAACTGATGCCGGTGTTGATGATACAACCATTATCACTCCTAAGAAGCTACAGACGCGCCAGGGAACTGAAAGCCTGTCTGGTATAGTAAAATATGTATCTACCACAGGAACCACTCCTGCGGACTCCAGAGCAACTGTAGGTACTAACGTTTATAATAAGAATACAACTACTTTAGTTATTTCTCCTAAAGCTTTAGACCAGTATAAAGCCGACCAAAATAACCAAGGTGCTGTATATCTTGCTACGCAAGCCGAAGTTAATGCGGGTGCTACTAACCCAGGTTTTAGTAACTCGGTTGTCACACCTGAAACATTAGGTGCTCGTCGTTCTACTGATACTAATCATGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAGACTGATACTGGAACTGATTATACTCGTGCGGTAACGCCTAAGACGTTAAATGACAGGAATGCTACTCAAACACTTACTGGTATTGCTCGTATTGGTACTCAAGTAGAATTTGATGCAGGTGTATTAGATAATGTTATTTCAACTCCGTTGAAAGTTAAAACAAGATTTAATGATACTGCTAGAACTTCTGTCTCAGCAGCCAGTGGTTTGATTGAATCAGGAACCTTATGGAACCATTATACACTAGATATCCGTGAAGCAAGTAATACTCAACGTGGTACAGCTCGTTTGGCGACCCAAACTGAAGTTAATACTGGTACCGATGATAAAACAATCATCACTCCGCTTAAGCTTCAAGCTAAAAAGGCTACCGAAAACGCTGAAGGTATTATCCAACTCGCTACTCAGGCCGAAGTTATTGCGGGTACGATAAGTAATAAAGCGTTTAGTCCCAAGCATTACAAATATGTCGTCCAACAGGAAAAATCCTGGGAAGCTACTTCTGCTCGTAGAGGATATGTTAAATTAACCACAGGTACCGCCACTTGGGAAGGCGATGATACTAATGGCTCTGTTGCTAACCTGGCTAAATTTGAAGACGATGGTTTTGCTATTTCACCACTTCAGATGAACACCGCATTAACTCACTATCTTCCTATTAAAGGTAAGGCTTTTGACTCCGATAAATTGGACAACCTGGATAGCTCTCAGTTCGTCAGGAGAGATATCGACCAAATAGTTGAAGGAACATTAACCCTTCGTAAAAACATCAGAGTGGATGGCCAGTTGGCTACAGGCGGTACCGGTGAATTTGGTGGTTCTTTAGCAGCTAATAGTACATTTACCCTCCGTAATACAGGAACGGCTACTCGTATAATATTTGAAAAAGGTCCTCAAACAGGAACTAACCCTGTTCAATCTATGAGTATTCGCGTATGGGGTAACCAGTACGGCGGTGGTTCTGATACATCCCGTTCTACGGTATTTGAAGTCGGCGATGAAACATCTAATCACTTTTATTCTCAACGCAATAAAGATGGTAATATAGCATTTAGCATTAATGGTACTGTAATGCCAATAAATGTTAATGCTTCAGGCTTGATGAATGTGAACGGCGTTGCAACATTTGGTCGTTCAGTGACTGCACAGGGCGAATTTATAACCTATAGTGCAAACGCATTTAGAGCTATTAGTGGACAGTACGGGTTCTTTATTCGTAATGATAACTCGAACATCTATTTCATGCTTACAAATGCAAATGACCAGACTGGTGGCTTTAACGGATTAAGACCATTAGCTATTAGTAATACATCTGGCCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTTGGGTGGTTTAACAGTTAACTCGAGAATTCGTTCGCAAGGTACTAAACCCGCTGACCTTTATTCGAGAAAACCAAATGCTGATAACACCGGGTTTTGGTCTGTTGACGTTAATGATTCAGCCACATATAATCAGTTCCCTGGTTATTTTGAAATGGTCGAAAAAGTTAACGAAGTAACAGGATTGCCTTACTTAGAACGTGGTGCAGAGATTAAATCCCCTGGCACATTGACCCAGTTTGGTAATACCCTGAATTCGTTATACCAAGATTGGATTACTTATCCTGCTAATGCCAACGCACGTACTACTCGTTGGACCCGTACATGGCAGCAAAGTAAAAATGCATGGTCGGGTTTTGTTCAGGTGTTTGATGGCGGTAACCCTCCTCAACCTTCTGATATCGGCGCCCTTCCGGCGGATAACGCTTCGATGAGTAACTTGACCATTCGTGATTGGTTACGTATTGGTAACGTTCGTATAGTTCCTGACCCGGTAACTCGTTCTGTTAAATTCGAATGGATTGATACACCATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.