Protein

Genbank accession
ADO98035.1 [GenBank]
Protein name
fiber [Synechococcus phage S-SSM5]
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,86
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,79
Protein sequence
MSLTRLKNIITSRTGRIIYVNPDDFDASDAIDNRGNSALRPFKSLQRAFLEVARFSYRVGLSNDEFDAFSIMLYPAEYVVDNRPGEVLYTNVAPIDANSNLDLTSPNNVLHKFNSVEGGIIVPRGCSLVGTDLRRTKIIPKYVPYPTTYAAKGINTEDQVPPRTAIFKVTGGTYFWQFSFFDGAEEGVYFKPDSTETLAPKFSHHRLTCFEFADGLNPLSTLITNGTVPSGDYSAVSNILQRTDLEIYYQKVSKAFATIPDTSGDPATDQIQARVEENRIVGPISDEYRVLQITRNGQTATAVTVDEFDNPRDHGFSVGVNINVSGVTGSTGPQSEVDAGLYNGSFTVTSASGNVFTYQMQGEPTGNAVGSNITVKTEIDTVDSASPYAFNLSLRSVWGMNGMHADGSKATGFKSMVVAQFTGLSLQKDDRAFVRYNASTGNYDVATAGDGAHLDGFAEYRKGWGHEHIKCSNDSFIQAVSVFAVGYQGHFTALSGGDMSITNSNSNFGNTALRSAGFKAKAFSKDKAGAITHIIPPKALNTISTTATGTSGALTITLANDGSVNGIIQGMTITGTNIGSAATVASINTNTRVVTLSVANTGTVNGNVIFGEETSVNWVNIDIQRTKTINTALSGQGGTPGTRLYLYGYTVEASPPTSRVQGFTVGARQDGTGNSAVADKINCLLVAQGASSATVQSASISPYGPSVSGLAAGVTGSPLQYDSATYTINGVAGSVGGWYLSVSATNNSIYDALANNTQYNTVSFTPTTFIKRIPDPRDLQDRTYRVRYVIDKDKTNPLPRDPISGFVMQPLNSDTTSYNLQRAFYIYDIEVVQKFERGVADGIYYLTLLCASIAPTTSNFNDRKFSQNVNEVYPTFDRDNPIADPAAAVSVADNVTIGLVNATDGATPTPAADPKRSITKEAVQFLLTDTGWTQPGTTPNYDSVNERLSGIELTARAGDEETRKINVREDNTGTVAPINVEFRRHSILRSGNHTFEYLGFGPGNYSTAFPQTQVETLSPEQIRFSQSIKEEGGVSFYSGLNSNGDLFIGNQVINPVTGQITNEDIAQLNVVGEENTTIETFSELVLTDKLTVIGGASNALESIFAGPVTFQGQTTFTNNITAKKFTYNNQDGTVIKQTLLAPEDANGNPSFANITGYDTPGDGDIVYNINWSPGKSLGWIYYNGVWYEFGLTDTGQINVVNDSGVTRIGLGVAPTSPYRANINGSVRVDGDLVVTGRGSVSASKYITKTYTGNGSQLTFAVTTYSGGIQHTDDSLLVFLNGVAQIAGTNYTVDSNGANVVFSSGDAPQSTDTVHILELPI
Physico‐chemical
properties
protein length:1320 AA
molecular weight: 141350,72900 Da
isoelectric point:4,94899
aromaticity:0,09242
hydropathy:-0,23250

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-SSM5
[NCBI] 		445685 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADO98035.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071097.1 [NCBI]
CDS location
range 24311 -> 28273
strand +
CDS
ATGTCCCTTACTAGACTAAAGAATATTATTACGTCCAGAACTGGACGTATTATCTATGTCAACCCTGACGACTTCGACGCCTCTGATGCCATTGACAACAGGGGCAACTCTGCGTTAAGACCGTTCAAATCTTTACAAAGGGCATTTCTTGAAGTTGCAAGATTTTCATACCGAGTAGGTCTGTCAAACGACGAATTTGATGCCTTCTCCATCATGCTGTATCCAGCAGAATATGTTGTTGATAATAGACCTGGTGAAGTATTATATACAAACGTTGCACCCATTGATGCTAACTCAAACTTAGATCTTACATCACCAAACAACGTATTACATAAATTCAATTCCGTCGAAGGTGGTATTATCGTTCCTAGAGGTTGCTCTCTAGTTGGAACTGACCTTCGTCGTACAAAAATTATTCCTAAGTATGTTCCATACCCTACTACTTACGCTGCAAAGGGTATCAATACTGAAGATCAAGTTCCTCCTCGCACTGCTATCTTTAAGGTAACTGGTGGTACATATTTCTGGCAGTTCTCCTTCTTTGATGGTGCTGAAGAAGGTGTATATTTCAAACCTGATAGCACTGAGACACTTGCACCTAAGTTCTCTCACCATAGATTGACTTGTTTTGAGTTTGCTGATGGTCTTAATCCATTGTCAACTCTTATCACTAATGGCACTGTTCCTTCTGGTGATTATTCTGCTGTATCTAATATTCTGCAGAGAACTGACTTAGAAATCTACTATCAAAAAGTATCTAAAGCATTCGCGACTATTCCTGACACTTCTGGTGATCCTGCAACTGACCAGATTCAGGCAAGAGTTGAAGAAAACAGAATCGTTGGTCCTATTTCAGATGAATACAGAGTCCTTCAGATCACAAGAAATGGTCAGACAGCAACGGCAGTCACTGTTGACGAGTTTGATAACCCCAGAGACCATGGATTTTCCGTTGGCGTTAACATTAACGTTAGTGGTGTTACTGGATCAACTGGACCGCAATCCGAAGTTGATGCAGGACTTTATAACGGAAGTTTCACAGTCACATCCGCATCTGGTAACGTCTTCACATACCAAATGCAAGGGGAACCAACAGGAAACGCTGTAGGTTCTAATATTACTGTTAAAACTGAAATTGATACTGTTGACTCCGCATCACCATATGCATTTAACCTATCACTGAGATCGGTGTGGGGTATGAACGGTATGCACGCTGATGGTAGCAAAGCAACTGGTTTCAAATCGATGGTTGTTGCACAGTTTACTGGTCTATCTCTACAAAAAGATGATAGAGCATTCGTAAGATATAATGCATCAACTGGTAATTATGATGTAGCAACTGCTGGTGATGGTGCTCACTTAGATGGTTTCGCTGAGTATCGTAAGGGTTGGGGACATGAGCACATTAAGTGTTCTAATGACTCCTTCATTCAGGCAGTTTCGGTGTTCGCTGTTGGATATCAGGGTCACTTCACTGCACTTAGCGGCGGTGACATGTCAATTACTAACAGTAACTCTAACTTTGGTAACACTGCACTTAGATCTGCTGGATTCAAAGCAAAAGCATTCTCTAAAGATAAAGCAGGTGCAATCACTCATATTATTCCACCGAAAGCACTCAATACAATTTCAACAACTGCAACAGGTACATCTGGTGCATTGACCATTACACTTGCCAATGATGGATCTGTTAATGGTATCATTCAAGGTATGACAATCACTGGAACTAATATTGGTTCTGCTGCTACTGTCGCTTCTATTAATACAAATACAAGAGTAGTTACACTCTCTGTTGCAAACACAGGAACAGTTAATGGTAACGTTATTTTTGGTGAAGAAACTTCCGTTAACTGGGTAAACATTGACATTCAAAGAACAAAGACAATCAACACAGCATTGTCTGGACAAGGAGGAACACCTGGCACACGACTCTATCTTTATGGGTATACGGTTGAAGCGTCACCTCCTACATCTAGAGTCCAAGGTTTCACCGTTGGTGCTCGTCAAGATGGCACGGGTAATAGTGCTGTCGCGGATAAAATCAACTGTCTCTTAGTAGCACAAGGTGCAAGTTCAGCAACAGTTCAGTCTGCAAGTATTTCACCTTATGGTCCTAGTGTATCTGGTCTTGCTGCTGGTGTAACTGGATCTCCATTGCAATATGATAGTGCAACATATACTATCAATGGTGTTGCAGGTTCAGTTGGTGGTTGGTATCTTAGCGTATCTGCTACTAACAACAGCATTTATGATGCTCTCGCAAATAATACACAGTATAATACTGTTAGTTTCACACCTACAACGTTCATTAAGAGGATTCCTGACCCTCGTGACTTACAAGATAGAACCTATCGTGTACGTTATGTAATTGATAAGGACAAAACGAATCCCCTGCCTAGAGATCCTATCAGTGGTTTCGTGATGCAACCTCTGAATAGTGATACTACATCCTATAATTTACAACGTGCCTTCTATATCTACGATATTGAGGTTGTTCAAAAGTTTGAAAGAGGTGTTGCCGATGGAATCTATTACCTTACCTTGCTTTGTGCATCTATTGCACCTACAACTTCTAACTTCAACGACAGGAAGTTCTCTCAAAACGTCAACGAAGTCTATCCTACGTTTGACAGAGACAACCCTATTGCTGACCCTGCTGCTGCGGTATCCGTCGCTGACAATGTTACTATCGGACTAGTTAATGCTACCGATGGTGCTACACCAACACCTGCTGCAGATCCTAAGAGATCTATTACTAAAGAAGCAGTACAGTTCTTACTTACAGATACAGGTTGGACACAACCAGGCACAACGCCAAACTACGATTCTGTTAACGAACGTCTTTCGGGTATCGAACTTACTGCCCGTGCAGGTGACGAGGAAACCCGTAAGATCAATGTCAGAGAAGATAATACAGGAACAGTTGCACCTATCAATGTAGAGTTTAGACGACATTCTATTCTCAGATCTGGTAACCATACATTTGAATATCTTGGTTTCGGACCAGGTAACTATTCAACTGCGTTCCCTCAAACTCAGGTAGAAACATTATCACCCGAACAGATTAGATTCTCTCAATCTATCAAAGAGGAAGGTGGAGTTTCATTCTACTCAGGTCTTAACTCTAACGGTGACCTGTTTATTGGTAACCAAGTTATCAACCCTGTTACAGGTCAGATTACTAACGAAGATATTGCACAGTTGAATGTTGTTGGTGAAGAAAATACTACAATTGAAACATTCTCTGAGTTGGTTCTTACCGATAAACTAACAGTTATTGGTGGTGCATCAAACGCATTAGAATCTATTTTCGCTGGTCCTGTTACTTTCCAAGGACAAACTACATTTACAAATAATATTACTGCTAAGAAGTTTACCTACAACAACCAAGATGGTACAGTAATTAAGCAAACCTTACTAGCACCTGAAGATGCAAACGGAAACCCCAGTTTTGCTAATATCACAGGATACGATACGCCTGGTGATGGTGATATTGTTTATAACATCAACTGGTCACCTGGCAAGTCTCTTGGTTGGATTTACTACAACGGCGTCTGGTATGAGTTTGGTCTCACGGATACTGGTCAAATTAATGTTGTTAATGACTCTGGTGTCACGAGGATTGGTCTTGGTGTTGCTCCTACGTCTCCTTACAGGGCAAACATCAATGGTTCCGTAAGGGTGGATGGTGACTTAGTTGTTACTGGTCGTGGTTCTGTTTCTGCAAGCAAATATATTACCAAAACATATACAGGTAATGGATCTCAATTGACATTTGCAGTCACTACTTATAGTGGTGGTATTCAACATACTGATGATTCACTCTTAGTATTCTTGAATGGTGTTGCACAAATTGCGGGAACTAATTACACAGTAGACTCTAATGGAGCAAACGTAGTATTCAGTTCTGGAGATGCACCACAATCTACAGATACGGTGCATATTCTTGAATTGCCTATCTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.