Protein

Genbank accession
ADO97307.1 [GenBank]
Protein name
fiber [Synechococcus phage S-SM1]
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,87
Protein sequence
MSLTRLKNIITSRTGRIIYVNPDDFDASDAIDNRGNSALRPFKSLQRAFLEVARFSYRVGLSNDEFDAFSIMLYPAEYVVDNRPGEVLYTNVAPIDENSNLDLTSPNNVLYKYNSVEGGIIVPRGCSLVGTDLRRTKIIPKYVPYPTTYAAKGINNESQVPPRTAIFKVTGGTYFWQFSFFDGAEEGVYFKPDSVETIPPKFSHHRLTCFEFADGLNSLSTLITNNTVPNADYSAVANILERTDLEIYYQKISKAFATIPDTSGDPTADQIQARVEENRIVGPISDEYRVLQITRNGQTATAVTVDEFDNPRDHGFSVGVNINVSGVTGSTGPQSEADAGVYNGSFTVTSASGNVFTYQMTSEPSGNAVGSNITVKTEIDTVDSASPYAFNLSLRSVWGMNGMHADGSKATGFKSMVVAQFTGLSLQKDDRAFVRYNASTGNYDVATAGDGAHLDGFAEYRKGWGHEHIKCSNDSFIQAVSVFAVGYQGHFTALSGGDMSITNSNSNFGNTALRSAGFKKKAFSKDKAGAITHIIPPKALNVISTSATGANGANTITLTNDGSINGVIQGMTITGTGIGAGAVVGSINTNTRVVTLTVNNSGVVNGNVIFGEETSVNWVNVDIQRTKVINSALAGQGGTPGTRLYLYGYTVEASPPTTRVQGFTVGARQDGTGGSAVPDKLHCLLVANGATEATTQTAKISPYGPSVSGKAAGTTGSPIQYDSSTYTIGGVAGSVGGWYLTVDSTDNEIYTTLSTNTQYNNVNFTPTTFLKRIPDPRDLQDRTYRVRYVIDKDKSNPLPRDPISGFVMQPLNSDTTSYNLSRAFYIYDIEVVQEFERGVNDGIYYLTLLCASISPSTSNFDDRKFSQNVNEVYPTFDRDNPVADPLAAVSVADNETIGLVSATDGASPTPAKDPKRSITKEATVFLLTDTGWTQPGTTPNYDSVNNRLSSVELTARAGDEETRKIAVRETNDGDVSPINVEFRRHSILRSGNHTFEYLGFGPGNYSTAFPQTQVETLSADQIKFSQSIKEEGGVSFYSGLNSNGDLFIGNQVINPVTGQITNEDIAQLNVVGEENTTIETFSEVVLTDKLTVIGGASNQLESIFAGPVTFQGLTTFTNNLQAKKFTYFNQDGTVLKQTLLAPEDASGNPSFANITGYDTPGDGDLVYNINWTPGKSLGWIYYGGTWHEFGLTDTGDIDIATFTGEQHIGIGAAAQSGYRVNVDGSVRVDGDLVVTGRGAVSADKYITKTYTGDGSTLTFAVTTYSGGIQHTDDSLLVFLNGVAQIAGTNYTVDSLGANVVFSSGDAPLASDTVHIVEMPI
Physico‐chemical
properties
protein length:1320 AA
molecular weight: 141585,79950 Da
isoelectric point:4,82082
aromaticity:0,09394
hydropathy:-0,25212

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-SM1
[NCBI] 		444859 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADO97307.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071094.1 [NCBI]
CDS location
range 25688 -> 29650
strand +
CDS
ATGTCTCTAACTAGACTTAAGAATATTATTACGTCCCGCACGGGGCGTATTATTTACGTCAACCCCGATGACTTTGATGCTTCTGATGCTATCGACAATAGGGGTAACTCGGCACTGCGACCCTTTAAGTCTTTGCAAAGAGCATTTCTTGAGGTTGCTAGATTTTCGTATCGAGTAGGTCTGTCAAACGATGAATTTGATGCCTTCTCGATCATGCTGTATCCAGCAGAATATGTAGTTGATAATAGACCAGGTGAAGTTCTCTATACTAACGTTGCTCCTATTGATGAGAACTCAAACCTCGATTTAACATCTCCTAATAACGTATTATATAAGTATAACTCCGTCGAAGGTGGTATCATTGTTCCCAGAGGTTGTTCTCTGGTTGGAACTGATCTTCGTCGAACAAAAATTATTCCCAAGTATGTCCCATATCCTACGACATACGCTGCAAAGGGTATTAACAACGAATCACAAGTTCCTCCCCGCACTGCAATCTTCAAAGTAACTGGTGGAACATACTTCTGGCAGTTCTCTTTCTTTGATGGTGCTGAAGAAGGTGTATATTTCAAACCTGATAGTGTTGAAACAATTCCTCCTAAGTTCTCTCACCATAGATTGACTTGTTTTGAATTTGCTGATGGTCTGAACAGTCTGTCTACTCTGATTACTAATAACACAGTCCCTAACGCAGATTATTCTGCTGTTGCTAACATCTTAGAAAGGACAGACCTAGAGATTTATTATCAGAAGATCTCTAAAGCATTTGCTACTATCCCTGATACATCTGGTGATCCCACTGCTGACCAAATTCAGGCAAGGGTTGAAGAAAACAGAATCGTTGGTCCTATTTCCGATGAATACAGAGTCCTTCAGATCACAAGAAATGGTCAGACAGCAACGGCAGTCACTGTTGACGAGTTTGATAACCCCAGGGACCACGGATTTTCCGTTGGTGTTAACATTAACGTTTCTGGTGTTACTGGATCAACTGGACCGCAATCCGAGGCTGATGCAGGAGTTTATAACGGATCTTTCACCGTCACTTCGGCAAGCGGTAATGTCTTCACTTACCAAATGACATCAGAACCATCAGGTAATGCTGTTGGTTCTAACATTACTGTTAAGACTGAGATTGATACTGTTGACTCTGCATCACCATATGCGTTTAACCTGTCACTGAGAAGTGTCTGGGGTATGAACGGTATGCACGCAGATGGCAGTAAAGCAACAGGTTTCAAATCGATGGTTGTTGCACAGTTTACGGGTCTATCCTTGCAGAAAGATGATAGAGCGTTCGTAAGATATAACGCTTCTACTGGTAACTATGACGTAGCAACTGCTGGTGATGGTGCTCACCTGGATGGTTTCGCTGAGTATCGTAAAGGATGGGGACATGAACACATCAAGTGTAGTAATGACTCATTCATTCAGGCAGTTTCTGTGTTCGCGGTTGGATATCAAGGTCACTTCACTGCATTGAGTGGTGGTGACATGTCAATTACCAACTCTAACTCTAACTTTGGTAATACTGCACTTAGATCTGCTGGATTCAAAAAGAAAGCATTCTCGAAAGATAAAGCGGGTGCAATCACACACATCATTCCACCTAAAGCACTGAATGTTATCTCAACTAGTGCAACAGGTGCTAATGGTGCAAATACTATTACTCTTACCAATGATGGTTCGATTAATGGTGTTATTCAAGGTATGACAATTACTGGCACAGGTATTGGTGCTGGTGCAGTAGTTGGATCTATTAATACAAATACTCGTGTTGTAACACTAACTGTAAACAATAGTGGTGTTGTTAATGGTAATGTTATCTTCGGTGAAGAAACATCCGTCAACTGGGTTAACGTTGATATTCAAAGAACAAAAGTAATCAATTCAGCACTTGCTGGACAAGGAGGAACCCCTGGAACACGACTCTATCTGTATGGATATACTGTTGAAGCGTCGCCTCCTACAACTAGAGTGCAGGGTTTCACCGTTGGTGCACGTCAAGATGGCACGGGTGGTAGTGCTGTTCCAGACAAACTGCACTGCTTATTAGTAGCAAATGGTGCTACTGAAGCAACAACACAAACAGCAAAGATTTCTCCATATGGTCCTTCTGTATCTGGTAAAGCAGCGGGAACAACTGGATCACCTATTCAATATGATAGCAGCACATATACAATTGGTGGTGTTGCTGGATCTGTTGGTGGTTGGTATCTCACAGTAGATTCAACTGACAATGAAATCTATACAACGTTGTCAACCAACACACAGTATAATAATGTAAACTTTACTCCTACCACATTCCTTAAGAGGATTCCTGACCCTCGTGACTTACAAGATAGAACCTATCGTGTTCGCTATGTAATTGACAAGGATAAGTCTAATCCCCTGCCGCGAGATCCTATTTCGGGTTTTGTTATGCAACCCCTTAATAGCGACACTACATCATATAACTTGTCTAGAGCCTTCTATATCTACGATATTGAAGTCGTCCAAGAATTTGAGAGAGGCGTTAACGATGGAATCTACTATCTTACCTTGCTTTGTGCATCTATTTCACCTTCAACTTCTAATTTCGACGACAGAAAGTTCTCTCAAAACGTCAACGAAGTCTATCCTACGTTTGACAGAGACAACCCTGTTGCTGACCCTCTTGCTGCGGTATCCGTCGCTGACAATGAAACTATCGGTCTCGTAAGTGCAACTGATGGTGCATCACCGACTCCAGCAAAAGATCCTAAGAGATCTATTACTAAGGAAGCAACTGTATTCCTTCTGACTGATACAGGTTGGACACAACCTGGCACAACACCAAACTATGACTCGGTAAATAATAGACTATCGAGTGTTGAACTTACTGCCCGCGCTGGAGATGAAGAAACTAGAAAGATTGCTGTTCGAGAGACAAACGATGGTGATGTTTCTCCGATCAATGTTGAGTTTAGACGCCACTCTATTCTTAGGTCTGGTAATCACACATTTGAATACCTCGGTTTCGGTCCTGGTAACTACTCAACAGCGTTCCCTCAGACTCAGGTAGAAACTCTGAGTGCAGATCAGATTAAGTTCTCTCAATCTATCAAAGAAGAAGGCGGTGTTTCTTTCTACTCTGGTTTGAACTCTAATGGTGACCTGTTCATTGGTAACCAGGTTATTAACCCTGTTACTGGTCAGATTACAAACGAGGATATTGCACAATTGAATGTTGTTGGTGAAGAGAATACTACTATTGAAACATTCTCTGAGGTTGTTCTTACTGATAAACTCACAGTTATTGGTGGTGCATCTAACCAGTTGGAATCTATTTTCGCTGGTCCTGTTACTTTCCAAGGACTTACAACCTTTACCAATAATTTGCAAGCGAAGAAGTTTACTTACTTCAACCAGGACGGCACAGTTCTAAAGCAAACCTTATTGGCACCCGAAGATGCAAGCGGAAACCCCAGTTTTGCTAATATCACAGGATACGATACCCCTGGCGATGGTGACCTTGTTTATAATATCAACTGGACACCTGGTAAGTCGCTTGGTTGGATATACTACGGTGGAACTTGGCACGAATTTGGTCTCACGGATACTGGGGACATTGATATTGCTACTTTCACTGGCGAGCAACATATTGGTATTGGTGCTGCTGCTCAATCTGGCTATAGAGTTAATGTAGATGGTTCAGTAAGGGTAGATGGTGACCTGGTTGTTACTGGTCGTGGTGCTGTTTCTGCTGATAAGTATATTACTAAGACATATACTGGTGATGGATCAACCTTAACATTTGCTGTTACTACTTACTCTGGTGGTATTCAACACACAGATGATTCACTCCTCGTGTTCTTGAATGGTGTCGCACAAATTGCAGGCACAAACTACACTGTAGACTCTTTAGGTGCTAACGTAGTATTCTCCTCTGGAGATGCACCTTTAGCATCAGATACAGTCCATATTGTTGAGATGCCCATCTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.